XLOC_012714 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_012714
Unique NameXLOC_012714
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000429:234170..245875-

Legend: gene
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>XLOC_012714 ID=XLOC_012714|Name=XLOC_012714|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11706bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000429:234170..245875- (Clytia hemisphaerica)
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AAATAATCTATTCGCATTCCGAATTTAACACATCTCCTGCCATTTGCTTA CACATCATTTTAAACAAAAGAATGAACAACTTACTCCACTTTCGAACCCA AATCTTGAGAAATTCCGTCGTTAATTCTGCTTTGTCAGCATAGAGGCGCG TCTCCTTTCTATCATAACAAATTATCTTTAATTTTGTTACTTTTAGTTTC GACAAAAAAGACGTTTTGTTCTTGGTTTACGAGAAGTTTTGAAACACACG AAGTTACGACGTATTAAGGCTGTTATTGTGGCTCCAAACCTTGAGAAAAT CTCCAGTGAAGGTTTGTACTTCTTTAAAAGATACAAAAACTTTGCGAGTA AAGAAAGTTTTTCTTCGTTGGAAGATTGGGAGGTTTTGTGAATTTGTAAT TTTATCTACAAGCTTGAAATGTGTTTTCAAACCCCCGTAAATATTATTCC CGTCTTTGTGTTTTTGTGTTTTCGGAACTTGATTAGCTTGATTAGTAAGT TTTATACGAGAGATCTTTAAATTTGAATGGCCAAAGGTTAATACAGTCGT TGGATTTCTAAACCTTTAAGTTAAAAAGTCTAATGCAGTCTGATACCGAA TAAATGGTTGTTGGTTGGTTGTTGCTTTGTTCAATTTTCCACTCAACTGA AGGCCGAAATTTTCTTCAAAATGAATTATGGGGATAATCAACACTGAAGC CATGCTTCCCTCCAAATCAGTGAGAACAAAGGTTTTCAAGGTTCTTTCAT CTCAGACAGGCTCAAAAATTGGCTGTTCTGCCTTAGAATTTTATAAGATT CAAAGATTCTTCACAAACTTAAGCGGCATAATTTATAAATCATTTTTCGG AGAATTCTGAGGGGTCAACAGATCTCAAAGATCAAATTTTTCTGATGAAT TAAAATTCAAGTCAAAGTAGAAACTGTTTTTAAGGAGAATTAAAAGTCTA GTCAGTGGTTCTGAGAGAGCAGAATGCAATTTTGTATTTTTTAGAAAGGT TTTTGGTCGCTATTAGGACCTATAGGCTACTAAACTACAGCTGAGTCTCT ATAACTCGAACCCGCACAAAGAACGCAAATTTATTCGAGCTAAAGAAATT TCGAGTTGTGAAGTAAGGTTTATATGGCATTGTTAATTAAAGATACGAGA AAATTTGTTTTTTATTTCGATTTAAGGAGAAATTCGTATTATAGAGGTTC GAGTTAAAGAGATTCTACTGTATTTTAAAAACAGAAAAATTTGGTTTGTT TCAACAACTGGCTCTTCATTTCTATTTTTATTTTTTTGTAGGTGGCTTGG ACGATTACCTTCGTTCGATTTTATTGTTGTGTGATCAAGATGAGATCCCG AAAATTTTCGCTATGAGCCGCCACGGTCTTGGCAAAACGTTAAAGAAGAA AGCTCCAGTCAGTGTAATTGGCATTTTCAACTACGATGGAGCTCAGGTAA TTGAATCTTTTATTAACATTCCACCGTAAGTAGAAGCAGCCAGTAAGTTC ATTTGTCTACATCCTGCCTGTTTTTTTCTGTCAGATGTAAATTGTAATTG AAAGTCATTCATGTATGCTAATTTAGTTGGTTGATTTTCAAAATTCCACA AGCAAACTCAGAAAAACCTTGGGTCGATATAATGACTTTCCCAAAATATG TGAACTGTTGACAGACTTTCGTTCGATTTTTTGCTCGAAATTTGCTGTTT TTTTTCTATACATTTGTGGGCGGACTAATTTTTTCNGTGTAATTGGTATT TTCAACTACGATGGAGCTCAGGTAATTGAATCTTTATCCACTTATCCACA GCCAGTAAGTTCTTTTGTCTACATCGGCTTGTTTTTTTTCTTCTAGATAT AAATCTTTTAGATGTAAATTGTAAATGAAAGTTATTCATATATGCTAATT TAGTCGGTTCATTTTTAAAGTTCCACAAGCAAACTCAGAAAAACCTTGGG TCGATGGTCGATATAATGACTTTCCCAAAATATGTGAACTGTTGACAGAC TTTGGTTCAATTTTTTACTCGAAATGTTTTGTTTTTTCTATACATTTGTG GGCAGACTAATATTTTTTCAAATTCTTTCAGTCTGCATACCCCAATAAAG ATGAAAAATAAACTTTCTTTTTCAGTTCTGCTCACCTTTTTTATTTCATC TTTTTTAATTTTACAGGACACATACAAAGAACTAATAAACCATGTTGAAA ATGCTAAGAAATTATATTCTGATAAAGTGCATGCCATATTAACACAAAAG AACACATCAAAAACAGCATCTCAAAAACAAACGAAGCCAAAGGATGTTGG CATTAACATATCCAGTAATTCTTCTCCTTCTCAAAGCTCTGAATCAAATC ACCGCTCTCACCAGTCACCAAGGTTACAAAACAATCATCACAATGAGGTT GAAATGTTGAGTCATCAGATACTGACTAAACTTTCGGAACCGTAGCGCTA CCAAATGAAAATGACTGGTTATTATTGTGAATGAAGTTTGATCGAATCGA ATTGAAGTTGTACTAATTATAGACCTTTTATTGCATTTTTTGAAGTGCTG GGAAAGCTGTTCCTCTCATCTTCCTGGTAGCAAAGAGAACGTATCTGGTG CGTATAATATCTGAATTTATGGATTGCTCTCAATATTGTTTTCTTCTTAT CTATCTTGGGAATTTGTGATAGAGTTGTCAAAGCATATTTTCAAAATGCT ATCGGACGAACTCATTTAGGTCGATGTTCGTTAAGCCAATGATTGGGCTC TTTTTGGCTCGTCTCCTTCAATAAAAGCAGGTAAATGGAATTTTTTGTAT ATTCTTCCAATTAATTTTAAACTTTTATTAAAATTTTGCCTCATTTTTAA CACCTATTTTATTTTGAATAGAATTTTTATATTGAATTTTACTTTTCACG ATTTTGCCTTATTTTTTCATATAGTATTATTCAAAATCAATTTTGAATTT TTTATTTGTGTTTCAATTTTGTGTACGCAGTAGATGTGTTTTGTTTTTAT CTTAGTTGGGTCCTATTCATCTTGAATTAATGTCGTTGTAGATAAATGTT ATAAACGATGAATGATAAATCCCTGAGTCTAAAGTGGAACCATATACATT GCCAGGGTGTCTGCGGGACCTTGAAAACCTTGAAACTGGACTAAGCAACC TTGAAAACCTTGAAAGTGAATGTAATGTGAAAGAATTCCTTGAAAACCTT GAAAAAGCTTGATTGTCACAGTATAGTTGTCTTGTTTTGGCTTAGGTCCT CACTGAAGTTTTGGTCCATGCTAAAACTCCAAAAAAATTTCTTGCTCGCA TCGCTCGCAATCATTTTTTATGGACCACTACTGGTAATAGTCTCTCACGC ACCTCGTCAAGAACGGTGATATCGTACTATTTAAATCAATTTGACTTCTA AAAAACCTTGAAAATTCGCTAAAATATTGCCAAAAAAAACTTGAAAACCT TGAAAATGGTGAAAAAAATTCCGTAGACACCCTGATTCCAGTCTTCATAA CTCGAACCTCTATAACTGGAATGTCTCCTTAAAAGTGAAACCATATACCT ACGTTGCAGTCTTCATAACTCGAATGTCTCCTTAACTCGAACAAGTTTTG TGGTCCCTTCAGTTAACAATTTTCTTTAAACCGGTCTCCGTAACTCGAAA TTTCCATAATTCGAACAAATTTCGTGCGTGTTCGAGTTATAGGCCATTTC ACTGTCGCAAAGCGTAATCAGGACCACTGCGCGCTAATGACGACTTACTA TTGGTCCAAAGTTTTGATAAATCTAATCAACCAGAAGTCGTTACTGTAGA GCGCAACCTGTCCTGATTACCCATGATTTATTCTCGACTGTGAAATAACA TAGTAAGACTCCACAGTAGTTAAAGCCATTAAAAAAATCTTAACATTGGT ACAAGATCATACGCCGTATGAATGCTGAATACTTGAAAATATGGTTCAAA ATTACCAGTGGTAAAATATTAAAAAAATATATGGTGTTTGGTTTAAAGGA ATGTTTACGAAAATTTAGATGTAGATATTATATTAATTTGTTTTTTAAGA ATTTGTAATTATATTGCCGTACTAGTAAATGTGTTTGAGTAACACTAAGA ATATAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00022645TCONS_00022645Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00022644TCONS_00022644Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00022643TCONS_00022643Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00022642TCONS_00022642Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00022644-proteinTCONS_00022644-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000429supercontigsc0000429:234170..245875 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.74 2.64 1.06 0.82 12.05 10.08 14.57 15.55 7.72 9.06 9.47 5.99 5.45 5.41 4.94 6.76 7.74 7.04 3.55 4.35 8.01 7.55 4.11 5.91 6.29 7.69 5.41 3.69 4.1 3.3