XLOC_013488 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_013488
Unique NameXLOC_013488
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000470:29992..42042-

Legend: gene
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>XLOC_013488 ID=XLOC_013488|Name=XLOC_013488|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12051bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000470:29992..42042- (Clytia hemisphaerica)
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TTTCAAAGCAAACTAACCAAACTCTACTTAAGGCCTTAAAACACTACATA AGCTTAGGGAAATCCCCCGCTCTCTAAGGTCTTAAGTAAAGTTTTACGTG CATGTGAAAAAAGCTTAACAGACATGATTTTCATCTCCATGTTTTCTTTT TGTTTCAGTTGACATGTGGAGTGTAGGTTGCATATTTGCTGAACTACTGG GACGTAAAATTCTCTTTCAAGCTCAATCACCCATTCAACAGGTAATAAGC TTCACCAAATTTTCTCATATTATTTACTGTTTCAATTTGTTGAGCCAATT TTGGTATGTTAAGCTACGAATACATATACAGTTCACTCACTTGATTTTTA CGGGGCAAAGAATTTTTTTTCAAATTAGAGAAAAATTCTAATTATGGAGA GCAGTTTTTTTCCAGCTGAAGAGACCAGTGTCTCTGTTCGAACTACAGAA AGATTGAAATAAAAGAGGTTTTAATTAGATTGACTGTATTTTGAAATTCT ATTGTATTTAACTCTTTATTCAACTTTTTACTTTTGAATTTCAGCTGAAT CAAGTGATTAAACTACTTGGTACACCACATCCAGAAGATATCAGAGAGTC TGGAGCAAGTGAAGGGGCATTTCAATATATTATGTCACAGCCCTACCAAC CACCTGTCATGCACACACTACACAATCTATCACCAAGAGCTAACCACGAG GCAGTCCATTTACTATGCAGGATGCTTGTTTTCAATCCATATAAGAGAAT TTCGGTAACAGATGCATTAACACATCCGTATCTTGACGAGGGCAGACTTC GTTATCATACCTGCATGTGCACTTGCTGTAAAACAACTCCCTCTGGTAGG GTGTATGTTGATGGTATGTTGCTTGATTTTGTTTGTTACTAATGTTCCCT TACTAGTCTAAGACTATTCCAGTCTTTTGCATATCCTCACTGCTCATTTT AATGACAATGCACAATGCAACAGGTACGACCAGGTACGACAGGTACAATG GCTGCTATACCAGATTTTCACAAAAAAAAACCCGAAATTTTCCTTTTCGT CAGTAAGGACATTATGTTGTATGTTCTCAAGAGATAACTTTTTAATTGTT TCTTTTTTAGCACTGGAACCTGCAAATACTCTACCTTATGACCTGAATTA TGAAGAACATCTGTATACTGTACATCAAGTAAAGGAAGCAGTTAGTAATT TTATATCCAATTGGCATCGGCAGAAAGGAGTTGTACCATTGTGTTTAAAT ACAGCATCACCTGTTTATCATCAATTCCAGTCGTAAGTATAAACTTTCAA GCTTGAGGGAACTTAACCAAATTTTGGGTATGGTAATTGCTTCTTTTACA TCTTTTATCACATTAGTTTTTATTATTGATTCATTATTGATACTTGGTCA ACAGTGTGTGGACAACTTATTGTCTTTATCAAGATTCCTAAACCCTACAT TTTAACTCGAATAGNGGACAACTTATTGTTTTTACAGGTTTTTATCAAGA TTCCTAAACCCTACATTTTAACTCAATAAAAAATGGATTTAATGTGTTGA AAATTTTTTTACAGGTCAACAGTTGCTCCACAACCAGAATTGACAGACTC TCCACATCCATGGTGAAGTGGGCCTGAAATTCTTTCAATTTGGTGTAAAT TCGAGAGAGGTGTCTCTATCCTTAGCGGTGCTGCTCAGCTGAAAACCATT GGTTTGTTTGAGCAGAAGGTTGCATGAAGCTGTACTTCATGAGCAATGGA AAGTTTTTTAAGCATTCCTGATAAGAAATCCGTTTTTAAGGAATACCAGA CTACATAGTCCAAGAAAGTAATTTATTTTCATAAAAAGATAATGGTCATC TAATGATCAAATGAGAGAACCCCCCTCTCTCTAACCATCAATGCGTTGAA CCCTCAAGCAGTAAAAGAAGACTTGACTGGGCAGAGACCAATGATACTCA ACTACAACAAGATGTAAATATAATAAACAGAACAATATTTTTTATGATCA CCATCCCCTCTTCTAAAAACATGAATTATAATGCAAGTTAGCATAACAAT GCTTTCTTTTTCTGTACTATTTTTACCATAATGTCTCCCTCGTATATCAG AAAACGATCATGTTTAGTTTCATTTTTATCGTGTATTAAGAGATTTTTAG CCAAAAATATTCAAATTTAGAACAACCAGTTTTTTAATCGAGAATAACTC GGCATTGCTAGTTGACTGACTGCAAAAACTTGGTTGTATTTAAAGACGAA TATGCTTATATTTAAAACATTCATTTCAAGAGGAAGAATAAAAGCATTTT TTTAACAATTTTTTTCCTTGCTTTGCAGCGGGAAAGTTTAATAAATTATA GTTGTAAAATATGAGAATTTACAGAAACTACTTTATTTTCATTAGTCAAT GTAATTTGTTTTTTATAAATATTATAAATATTATCATAATTTTTTTCCTC CCTTTCTCAATAAAATGGCTTTAATCCTCCTTTTTCAAATTTTTCAGCCT TGAGATCTTTTTGGAGGTATTTTTCTTTGTCCTCTTTTTTGTATATACTT GAATGGGTATAGATGCTCTTTGTTTTCGTGTTGTGGCTTTTTCTAATTTT CTTAACTCTTTTTTTCAAATCTATTTTTTCTTTTCAATTTATATAATTTT TTTTTTTCATTTTTTAATCAATTAAGATGTCAGAATTTATCGTAAGGATT TTAGAGCAAAAACATTCCTTTAGGTCTACTTTTATACAATTCTTAACATT TAGTTGTATTTTGTGTTTGTTATTTTAAATAAAGTAGTCACTTTTTTTTA TTTTTCGATTATTTCGACAAAATTTGTTATTTCTCACTTTAACGAAAATT TTAAAACAAAATAAGTTTTCTAAGTTCAAGGGTCCAAGTTCTCTATTCTT TGCCACAGAAAGTCACGTGATCCACTATTAACCAATGGGATTCAATCATT TCGTGTGGCAAAGAATCGAGAAAGGAATAGTCACCCTTAAACAAATTGTT GAAACAAATCAACGTCATTATTCATCAAAAGACGTTACTTTTTCTAAATC ATATTCTGGATGACGTCACTAAGTATGCACCACACCTTTCATTTTTATTT AGTTCTCGTGTTGAATTAGCCACGAAATTAGCTTCTTATTTTTTCAAATG ACTAATATTGCAGGAGAACCTTACTAACTGTGTAAGCTGGTAGTGAAATT ACTATTGTAAGCAGTTAAATGTAGAAAATTAGAATTTTTTTATCCCATAA TTATATCGAAAACTTGTCAAATTGTATTTTCTACAAACCAATAAGTACTA ATTATTTGTCATTCGTCATGTTTTTTTTGTTAATTATATCTCTATAATTA CGTTTACCATTTTGTACAGATATTATTGTAAATTACCTTTTCCCCTATTT TTCACACGCCTCAGTGTTGTGGATACGAAATATTGTTTTGTTAAAAACCA ACTAAAATCTCGTTGAAAAACGAGGAGAATAAAAAAAGTTTTAAAAACAA A
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00024009TCONS_00024009Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00024008TCONS_00024008Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00024007TCONS_00024007Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00024008-proteinTCONS_00024008-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000470supercontigsc0000470:29992..42042 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
NLKserine/threonine-protein kinase NLK Homo Sapiens
Expression

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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
5.64 5.75 6.15 6.49 85.54 60.29 36.14 39.35 18.19 20.13 18.21 19.36 30.31 27.2 19.28 18.26 60.6 50.13 25.51 31.72 31.12 32.54 21.02 24.51 18.55 20.06 100.09 81.38 68.32 85.67