XLOC_013766 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_013766
Unique NameXLOC_013766
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000501:13212..38348-

Legend: gene
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AAACCACTAGGTATATGAAAGAATTTCGGCAAAAAGTGGGCGTCAACCGC GAAAAATAGTTCTGCCAAATGCGCCAATTTAGTAAGTTCCGCGAAAATTA GCTTCCTTAAGGGTAGAGCTATTGTTCTGAGGGGGGGGGGGCACTCATAT GATCTGGCCTACGTCATGTGCCGCGCTTAAGGGTGGGGTTTTTCAGCATC CCAAAATGCACTGTAAGGGTGTGTTTTTGTGAGATTGCACTGCAAGGGTC GAATTTCAAAACGAATTCAAAACAATTGTTAAAAAGAAAGATTTTTACTG CTTGTTTGTTTCAAAAAGTTTCTATTGTCTGATAATTACAGCTGACAAGA ATAATTTTCTCAGTTTTTCTTTGAAACAGAAAATTTCCCAAGCTTCTTCT TTCACGCAGATTTACAGCTGAGAAATATGGTGCACTATAAGGCTTGGGTA AATCAAGAGAAAATGCACTGAAAGGGTACCTTTTCAGTCATAATGAACTG CACTTGTAAGGGTACGATTTTGAAAAGCAGATTTTGCGCTGCACATACCG TCGTTTCGGAATCGAGTGCCCGGGTTCTGAGGGCGTAAATCTGAGGCTGA TGTTCTTATAAAATTGTTCTTATAAATAAAAAAACGTATAGTCGAATGTT TGTTCGCAATTCGTACAGGCGTACGTTTTTTCCAAAATGAACTTGAATAA ACAAAGCGCTGCTTCTTCAAAAAACAGACATACAGCACCACGGAGACAGA AAGAAATTTTCTCGACTTCGTATTTTTTACATAATATACTACTTACAGTA TAAATTTGCCATACAATCTGATCTGTAAAATCCATGACTGAAACATCGAT ATGGGTAACATGAGTTCAACTCGTTGCAAATGTCGCGAAAAATCTGCAAG AGACAATTTATATTATGTATTAAACAAGAACTTATACCTTGACGTAACAG CGTTGTGTGTCGTTATCGTATATGCAATGAAGTATAAGCCTGAAGGGCTA GAATCGAATCTCTAACCTTTCTCAGGCAAGAAAAAGTGAAGCCTTAAAAC ATGCGTCGTATTTTTGACGACGGATTGGATCTAGCAATTCTTTTGTTTTC ATGTGATTTTTTTTTTTCGAAATTTAGCAGTAAATTTTAGTTCCAATCTG CCATTTGTGTAAAAACTAGGCGGACCGTGTTAGGCCGCGCAACTTTGGTA GGATTTGTTGGCTTCAAATCCTACCAAGGAGATTCGATTCTAGCCCTTTG GGCTTATACTTCAATGCGTATATGCGCTATTTTACAGCGATGCAGAAACT AACCATTTTAGACGGAATGCGTGAATATTAAGAAGAGGTTAATTTCCTGT AAACTGTTGTCGTTCTTTAGGTCGCGTTAATAACTGAAGAGAAATATTTG ATTCTCTTACAATTCCTGTCACATTTCTATCGAAATTTAAGGTTTCGCAA TAATCAGAGCTCACGTCAAACTGGAAAATATACAATGGGCTATTCCAGAA AAAAATATTACATGGGGGTGGAGGATATAACAATTTTTAGTGATTTACCC CCCGGACAGGGTGACTTTTGGCTCCCCGGACAATAGGTTTTACCCCCCGG ACAAGCATCTGCTGACCCCCCGGACACACCAAATTACCACCGGACAGAGC AAATTTACACCCCGGACAAGGCAAATTTTGATGATTTTTTGCTACCCCCG GACAATATATCCTCCACCCCCCCCCCCCATGTACAATTTTTTTCTGGAAG AGCCCAATTAATACCTTAAAGAAAGAGAAATTGACTTTACCGTATCCATG TAAACACACGAATCCTTGTAATAAAAATCATCTTTTTGTAAAGTTCTCAA GTCTACATCATACAAATGGCATAAATCGGAGTCTGCAAAATAGACTACAG ATAAGCACTGAGCATGCGCCAAACATTTTTCGGCGCACAATGATTGTAAC GCTTGGTTGTGTATCGACGCTAAAGGTGGATTGTTTGCGTGTTTCAAACA TTGACCAAGAGGTGCATTCTCATAGAAAGTTGCTTTTTGTCTCCGAAAAC TTCTGCTGAGCGCTTGACTGAGAACTTGGTTGTAGAAGTGAAGGAAAATG AAAACCTGAGTCAGCAACATTATTGTGTCCTTGAATGAAGAAAAGAGAAA TTTTGTCGAGCAGATATTCCATAGCTGTTCATTAGGTATTGAATGTCAAA ACAAGGAAGAAAGAGAAAATGTCCGGGTGGNATATTCCATAGCTGTTCAT TAGGTATTGAATGTCAAAACAAGGAAGAAAGAGAAAAATGTCCGGGTGGG GTTGAAAAAAATTACCCATTTTGCGCACTTAAAATGGTCATTTACTTACC TTTTCGATATTAGTTTATTAAACGGTTTCTTCAATGCGAGACTACTTCGT ACTTTACATGTTGAGCGAATTAATTTATTTTTCTACGACCGACCGACTCT GTTTTTTTACAAAATCGAAAAGATAATAATATCGAATTTAAACAGCTAGA AGATGTCAAGGCATCTTTCAAATATTTAAACCTATTAATCATTAATGGTA TAGATAAAAATGTCAAAATAAGTTTTCAAAGTAATATTTTGAATATGGCG TATTTTGGGAAAATGTTCGTTTCAATTTAGAGTATTATTCTTACCTCCCA AGAATGTTTATTTTCAATCGTTTCAAAAGAAATATAAACTTTTGATTCAA ATTTTGACAATTTCTATCCGAGTTTACTGCGAATTCATTGAGAATCGGTA CTGCTTGATTCATTATTAATACCTAGGGTCTGTAAACAAAAACAACTTGG GGGTAATATTCAGGGGGTTTGGAGTAGAATTACAAAATTTATAATCTATA CACCTTCCTCTCACTACTCGGCAGGATTTTTTCAGCCAGTGTGGATAAAA ATAAGGGAGTGAAACTCGACGGGGATTCGAATTCCCATATTTTTTATGAC CGGGGATTTCAATTCTTTTGTTTTCAAGTCAGAAAATTCAGTGGGGATGG TAAAAAAGCATTATATTTTGCAGTGAGGTTTGGTTTATTTGATTATTTTC AGTGGGGACAAAAAGTGGAGGATAATTTTCCACCGGGGACGATATCTTGG CCAATTATTCCAGTGGGAAGTGTTCCAAGTGGGTCTGTGAGAAGGGGGTG TATCTATCTAGATGAATTATGTAAAGAAATGATAATAAACCAGCTGCGCT GGAAGCTCCGGCTTAAGAGATTAAAAGATGTGAAAGATGAGTTTGCTGAG TTAGTTGTGTTAGAACGTTGCCCAAAAACTAGTAATCAGAACAGATCAGA AAGCAAAGTAATAATTCTATTGCAGAGCGAGTATGAGAAATAATCTTAAC GAATAAATAAACCAGCTGGAAGTTTAGCTCTTCTAAGTGATTACACATGC ACTTTCTTGCCTCAAGAACCAATCCCACCCCTTGCCCACTCATCCTCCAC TAAAAAATTGGAGCTAAAGGAGATAAACTTTTAGAAGTCAATATTTCCAA GTTCATATAAATTTATTTTTTTCTAAACTTGCCAATAGCGAAGCTATGAT GCGCCGTTGATTTGATTGTCCGGATAAAATTTTGGGGAGAAAAATAGCCT AAATTAGAGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGGGTTTGAAAAATCTTCAAAAGGAACGG TCGCCCCAACCAATGAAATTACGACAAAGTCCAAAAAATATCATTTTCAG TTATAACACTGAAAATTTCTCCAATCTTGTTCAAATTTACACAGGAATCG TGTTTTAGTATCCTTTACTGAATTCTCATAGTGATATAATTTTAAAAAAT CTGTGTCGGGTTTGAAAAATCAAAGGAACGGTCGCCCCAACCAATGAAAT TACAACAAAGTCCAAAAACGATCATTTTCAGCCATAACACTGTGAAAATT TCTCCAATCTTGTTCAAATTTACACAGGAATTGTGTCTCAGTATCCTTTA CTGAATTCTCATAGTGATATGTTTGTAAAAAATCTGTGTTGGGTTTGAAA AATCAAAAGGAACGGTCGCCAGCCGTGATGAAATTACGACAAAGTCCAAA TACGATCATTTTCAGTCATAACACTGTTCAAATTTCTCCAATCTTGTTCA AATTCACACAGGAATTGTGTCTTAGTATCCTTTACTGAATTCTCAAAGTA ATATGTTGGTAAAAAATCTGTGTTGGGCTTGAAAAATCAAAAGGAACGCT CGCCAGCCGTGATGAAATTACGGCAAAGTCCAAATACGATCATTTTCAGT CATAACACTGTTCAAATTTCTCCAATCTTGTTCAAATTCACACAGGAATT GTGTCTTAGTATCCTTTACTGAATTCTCAAAGTAATATGTTGGTAAAAAA TCTGTGTTGGGCTTGAAAAATCAAAAGGAACGGGTCGCCAGTCAACAATG ATGAATATACAAAACAGGATCATTTTACATCATTTTCAGCCATACACATA ACACCACAAAAACTACTCAGATCGTTTTCAAATTTGCACTGTAATGTTGT AATTTTAGTATTTTCTTAAGAATTCCAATAGCTGTGTGTTTGGAAGTTTC ATTGTCAAGTTAGAGTTTTCTGATTTTCAGTGTCTAGAAGAGAAGTTAGC TATATGCAAGATTTAAGCACTCGATCAGCTGGCCAAAATTTCTCTTAAGT CTTTCCACATTGTTAGAAAACCAGTATGCATCAAACTTCTCATAAATCAT GTCCAAAACATCATGAATAATGATGAAAATGATCAATTTTTCACTGAGAT TTGCATTCGCTACACAGTCAGATAGCCCACTTTCGGCAGCCATCTTTTTC TAAATACTTTCGGCCAATCAAATCACAATATTATCAGAATCCAGATAATC CGTTTTTTTTAAATCGGNAGTCAGCTAGCCCACTTTCGGCAGCCATCTTT TTCTAAATACTTTCGGCCAATCAAATCACAATATTATCAGAATCCAGATA ATCCGTTTTTTTTAAATCGGAATAGATCATCGGATTAGATAAACAAAAAA AAATGTCTTGACCGTTGTCGGAAGAGAGAATTAAAGGCTCCTAGGCCGGA GCAATAAGAACCAGCAAATTTTTTTATGTGGCTGGTTATATTATTTTGGC TCCTGAAGTTGTTTATCTGATTCAAAATTCTCGACGAGGATGGGATTCGA ACCCACGCGGGCAGAGCCCAATGGATTAGCAGTCCATCGCCTTAACCACT CGGCCACCTCGTCGTTATAAGACTTGTAAGACTAGCTAGATTTTGAAAGA AAATGTTTTAACATGTTAACTTTGTGTTGCTATGGTGAAGTTTTCAATTT GTTGAAAACAATGTTGTTACTTTGGGAAACAGTAGCTTAACATCTTCTCT TTAAATTCGCGGGAGTTTATTCGAAATCACCGGCAGCCGAAAATATCGCT TCCTTTCAGTAAGATGTTCCTGTGGTATTTAAGACTATTGAAATAAATTT TTCTGATTTTTCAGGGCCACTCACAACTTGTTTATGCTAGTGAACAAACA CACGAGACAAACTCAACCCATCGAAAGCACTACTGAACAACTCAATAAGG TAATGAAACTAAATTCATTTAGAACATTGTTTTTTGTATTCAACTAGAAT CGATCCCTGTTAACATTCACACCTAAAAACCATTAAATTTTGGTTGAGGC TCGATTAGTTTTCCGAGAGCTTTAGGCGCAAATATTCTCACGATATTTTG AATAATTTTTGAGGTTTTTTAATTTTCTCGGGGATCAAATTTCGCGGTTG AGCTCATCCGCGAAATTATAAAAATTCGCAAGGACTTTAATTCGCGGATG ACACTACTGAGAAACAACATTTTCACGACTTTCTACCTTTTTACTGCTAA GTAAAGAACGTGTTTTTATGTTTTGATTTTTGCTCCACATAATCTTTGGT TTTTTATGTTAAAAATTTATTTTTTGAAAAATTTCTTTCTCACAAAAAAT TTGTACGAACAATGCAAGACAGATGACATCTGATACAAACTGGAATTACG TAATGAAATCTCAACTCATCGTAATAACTTACTAAACAAGTGCTCTTAAG AATCGTTTTGCTAAGTAAGATTAAGGAAAGTGCTGTCCCGTACCAGTAAT TTGTCCCTACTTAATTTGAATTCCTTTACTCTTGAGAGCTCTCTCAAAAT AAACGGATCTAAGTCTACTCTAAGAGTAATTACATGTTTTTTTTATAAGC ATAACGCTTATAAGCATACGAAGGCTCAGATTTCAAGATTTCCTAAGCAT AGCATAAGCATATATGTCAGCCTGAAATATTTTTCAAGTTGTCATTTCTT ATCTGTTTAAAAAGGTTTGGTAGACAGGTCAAGTAAAAAGAGAAATTCCA CGGCTAGCTACATTCCACTGCTCCCAAAATCTGAAAAATTTTCAGGACAT TTCTGAAATTTCACTAAAAACTTGGCTCAGGGTGAATCATAAGCATGATT CATAAGCATACAATAAGCATAAACTATGCCTGGATGCTTTGAGAACTTAA GCATACTCGAGCCTGACCAAGGGGCAAACACTTGCTTATAAAAAAACAAC ATGTATATCCTTTACCAAAGCCGTAGCCTGGGAATCCAAGCGTTAAACTT TGTTCACGGTCTAGTTTATGATATTTTTTGCTGTTGGTTAAAGGTTTGGT ACAGGTAACTCGTCTGCGGGAGATTTTTCGGCTTGATTCTATTTGTTAGT TTTTCTTAAGCTAGGTGTTATTTATCAATCTTTTTCTTTTTCAGATTCAA ACATTTATTCAAGATTTGACCCAAATCACCAACGAAATCAAACGATCAGA AACGGTTGCAATGTAAAAAGCTCATCAATAAAAAAAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00024516TCONS_00024516Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00024515TCONS_00024515Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00024514TCONS_00024514Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00024513TCONS_00024513Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00024512TCONS_00024512Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00024511TCONS_00024511Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00024510TCONS_00024510Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00024509TCONS_00024509Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00024508TCONS_00024508Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00024512-proteinTCONS_00024512-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000501supercontigsc0000501:13212..38348 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CCDC42coiled-coil domain-containing protein 42A isoform 1 Homo Sapiens
CCDC42BPREDICTED: coiled-coil domain-containing protein 42B isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
87.56 87.19 44.46 49.09 106.3 79.74 49.04 50.86 49.24 40.95 34.37 42.55 12.56 10.29 4.64 7.23 14 17.05 13.9 8.08 23.8 23.52 38.18 35.84 131.04 92.7 22.41 13.28 10.22 13.56