XLOC_014755 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_014755
Unique NameXLOC_014755
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000565:4283..17908-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_014755 ID=XLOC_014755|Name=XLOC_014755|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=13626bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000565:4283..17908- (Clytia hemisphaerica)
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ATAATTGGTTTCCACATTACAAAGTTGGAGATTACATTCTTGTAAAATCA AGTGCAAGAGTTTTTGAGGTAAGTGACAAATAAAAGACAGTAGAAATAAT TAATATTAATAATTAAGCTCGTCAAAAACTNTCATTTAAAATTTGTTGAA GCAAAATATTAAAATCGTAACAAATTTAAATGATTGATACCAAGCTGACT ATTACCATTCAATTCAGTTGTCAGTTTCACTTTATCTATGATTAGATTTG AGCGCGGAGAGGTTACAAAAAAGATGAACGTTGCTGCAACAAGAGACTTC ATAATTGATAATGATCGGTTGTTGAAAATTAACTTTAACATGCCTACACA TGCAAACCCTTTAGATTGGTATTGTACATCTCCGTTGCCAGATGTAACGG TATGTTTTTTTTATTTGAGTTTCGAGGTTCAAAAAAACTCTGAAAATGTA GTATTGTATTGCTGAATCTTTTCTTTAGTGTGAGAACCAATATTGAGATC CTCTCGGAGAGAGGCTAATAATAAGAATGTCTTTAGAGAGCGAAACACTA CTAGAGAGACCCAGAGGCCCTACAATGATTAGTTAACATTACTGATATAG ATTTGACATATTATAGAAACTCTTTTACATTGAAATGTAATGTATCTAAT GGAGCCGTTAGATTTAGATTATAATTATATTATGTATATGTACTTTTTAG CAGCAATACAATGATAATATTAAAGTTCAAAAGAATAGAATCTTATTTTT AATGTCATCATTAACTTAGATTACAGCAAAAGATGCTCCAACAAAAGAGT GTAAGACTACTGGCGATCCTTACATCACTACTTTTGATGGTAAATGGTTT CGACATTACAAAGTTGGAGATTACATTCTTGTAAAATCAGGTGCAAGAGT TTTTGAGGTAAGTGATAAATAAAAAACAATAGAAATAATTAATGTTAATA 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TAGAATATGAAGCTTTTGAAAAACGTTTGTTGCGATTTGTGATTTGCGAT TTAACACAGGTAGATGGCTTTTCCCTTATCCGGCAACCCCAAATTATTCA GAAGAATTATCCAGTCAGCTATTTATTCAGTAGCACAATTATAAGTTGAA TTGAAAATCATCTACAACACTTTCAATTTTACACTAAAGGTGCTTGACGA CTCAAGAACTTCAATAATATCTGCTGTAGCAGCTATGATGGAGGAGTGTG AGGAAGAAACACTTCGAAACGTCACGTTATGGACAGCCGACGATAATGGC AATCTTCAGCCACCGCAAGCTGTCGGTGATGCATTATGTCCAAGTGATTG CAGTGGTAACGGTGGATGTGTGAATTCTACTTGTGTGTGCAATGCTGGAT TCTTATCAGTTGATTGTTCTATCAAAGAAGGTAAACATTACTAGCGTTGC TTTAGATCTTTTCCATTAACATGGTTGTCATGATTTTACGTTTGTGTTAA AAGAAAACGGAAATGTGACATTATCATTGAAACCTTCATCGAATTCAGGT AATCTTCAATCTTAGGCTCTCTTACCCCTGCCATTAATATTGTACAATAT ATCAGCTTTTCCACTCTACTTTCACTGCCAATAATGTGTGTCTGTCTTTT ATCCTGATGTTTTAGGGGATCAACCAGTTCTAGAAAGGGTTGCATCAGAT GGTCTATGTGATATTCGAAAGCAAGATTGTCTAAGGGCCCGTGTTATTGG CCAGAATTATGTGGAATCTGATAAACTTGCGTGTGGAACGAAAAAATTGA AAGTAAGTTTTTTATGGATCTTATCAAATGTTGATACTAGGAGCTGGTGC TGAGTGGAAAAGAAAATATTGTTTTGTTATTTCAAGAGACAATGTTTCAT TCAACAATATTTGAACTAATGCATGATTCAACCGTTTAATGTATATTCTT TATTCGCATCAGGTTGATGGACTTATCTTAGAAGGAAGAAGTACTTCAAA TATGCTATCTTCAAAAAGTGATCTATTAAGCTTCCGAGACTTATCCTGTG AAATTCCCGAACAACATCTACCATTGGTTGACCTTGACTTTTCCCCAGTG CGGCCGGGAAGACCAGTTGGTGGTGTTTCAATTCAATTATCAAATGATGG TGAAACTTTTTCAAATGAGAGTTCAAATTATATAGCGTACGATTCGAAAT GTGTTGAATGCAACAGTACTACTGATTGTCGTTGGAAGGTTAGAAATAGT TCTTTACGAACAAGAAGAAGCTTGAATTTTTATATACAAAGCTTAACTTA TTCCATATAATTTTCAGCCGACCGAAGGCAAAGATTCTAGTTTATTTTTG TTCTTATTCTGGTCGCAGAAATGTGGTTTACATTTTTTCCAAACCTGTTT CTTTTGAACCTCTACAGGTTGATTCTTGCCGAGTAAACAANCTGGTCGCA GAAATGTGGTTTACATTTTTTCCAAACCTGTTTCTTTTGAACCTCTACAG GTTGATTCTTGCCGAGTAAACAATTATTGCATTGCTGTTGGTGAGCCAAA CTTTGAGGATTGGTGTCAAATTTGTCGTGGGAACAACACTTTTATGGAAA GAACTGGTCAGTATACGAATCCGTATTCTTCTTTGAATAATCGTGTTCGT ATAGTAGGAAAGATACTTATTTTTTAAAGCTGTGTTGCTTTGGGGAGTCT TTTTTACTATAGATTTTTAATTGATGGACTTACTTTTGACTTTAGATAAC GTTGCTCCCATTTTCCGACCGAGATCTACACAAAAAGCATTCCATGACCA TACTCTACGTTTCACAGTTCCTGTAACAGACCCTGAACAAAAAATATTGA AATTGAACTTCGTTGGAAGAACTCCTGATAATATGGAAATATCTTCCGCT GGTGTTATAACGTGGACAGCCGCAAAGGAAAACAAAACCTATAATGTCAG AATCAGAGCAACCGACATTTGTGGAACGTTTTCAGAAGCTACATATATGT TCGAGTCAGTTTTTTGTCCATGCGAAAAACTGAATGGTGCTAAATGTGGA GCTTACCCAAGTGTTAATTGTCAATGTCCAAAAGGATGCATGGGAAAAAA GTAAGTACTCTTGTCGAATAGACGTCCCCCCGCTATTGATTGTTAAGAGA AAAAAATCCACCCCCCGCTCTTATTAAGGGCTCTGACCATAGTCGAGAAA TTGACTTTAGTATTTGAACATAAAAGTTATGTTTTTTAGGTTCTTTAACA CTTTAACCAAGAATTGCCTTTATAATTTGCTTTTTAATCAAATCCTTTAA CATTAAGAGTAATTAAGAATTTAATGACAATAATGACGTTATGAACTTTA AAAAGACGTTAATAATATGTTGTACTACCTTCTTTTATAAAAAGTGCTAA GTTTTAATGGGTAATTAACCTTTTTTTTTCGAAGTTTTTTCAAAGTGTTC GCAAAGAATTGAACTGTTTTAAATTTTTCGGAAAAATTTCTAAATTAATG CATCAAAAGTTATGGCTGTTTTTCTATGAAAAATTGGGATGAAAAATTTG TCAAAAAGCACTATTTTCAAGATTTTGAGACAAATAATTTTAATTCCATC TACCGCAAAAGTTTTTTCAAAATGTTTTTTCTCTGCCGAAACTATGCTCT TCAAAGTTGAAATACTCTTCTTGGTAAAAGTCTTCATTTTCTTCTTCATC AAATTTTTTCATTGCGATTCTTGAATCTTCAGACTCAAGGGTAATTGACC TAACAGAAAATGTATAACATGCCACAGTTTTGTGGGCTACATCAAGTAGA ACTTTACATTTTGTAAGTGGCAAATATCAAAAATTCACTATGGTCAGAGC 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GTTTACGTTGGTGAAAAGATGGACTTTGATTTGTCTTTAAATGGAGTTTC TAGTTCTATCAAAACTTCACCTCAAGATTGCTACGCAACTCGATTGGATG GAACCGGAAGATATGATTTGATCAAGAATAAGTAAATATTTAACAAACTT TAATTCTAAAGCTCCAGTTAGCGTTCTCCTGCAACTCTAATACAATGCTA ACTGGTTGATAAGGGATCGATTGAGAAATACTTTTGCTGGGGTCAAGTAA TACCGAGCGCAAATACATAAACTCGCTAATGACTGAGATTGTAAGGTTGC TGCGATTACCAAGGACAATGTTCTTAGTAAAGCCCCAGTAGAGTTTGCTA GTATTATATCCGAGTCTTCCGGCGGTGTATAAGGCGGAAAGAGTTATTTC TGTGTTGGTTTAGTTTTCCTCCAAGAAATTGAAGTCCAAATGAAAACTCC AAGGTCATCATACCAAAAGAACCATATCAATTGCGTTTAAATGTGTACAC ACCTCTAAGTGAATTAGTCTAAAAATACTGCAATGGATTTCAAGTGAAGC CATTTCTCGAGATGATAATACATATTTTAATAACTTTTTTAGATGCAGTG TCGGAGGCGAAACTGGTGTCACCATCACATCAACTCCTCAAGATACAAGT CACTTTTCTTGGGAAATGGAAGCTTTCAGATATTTTGGTGATTCTGATGG CATCATCATTACGTGCCGCATATTGATCTGCCGAAATCGTCCTATTGGTC AATTAACCGATGAATGTAGACGATGTGGGCAAAGACCGTTTCCATTGCGA CGCAAAAGAGATGCAGCCAATGAAGATGAGAGTAATGTTCTAACAGATAA ATCGGTGAAAAGTCTACCCATCTTCATTGCTGTTAGGGACGGTAAGTTGT ATTTATCAATTTTGCAAAAATTGGGCTTTTCCAGAAATAGTCCGTGTCCC CCCTGTGGGGTTTAATCTTTTTCTGGAAAAGCCTATTGTAGACTAAGCAA AATTATGTTTTTCAAGAGACGTACACTGAAGTGTAAATTTTCAGGTTTTC AAATAAACTAAATTCAAGAGTAAAGCAACATAATCTTTTAATTTTAGCAC CTGATAAGGCAGCTTTGAAAGAATCTGGACGCAAATTATCCTCAAATGAT CTTGGTGCTACGGAGACAACTGCACTGATTGTCATAGCTGGGTTGGTCGG TTCGGTGTTGTGCGTGGCTATTGCTAAGAAGGTTTTCTTCAATAACCCAC CAACGAAAGAGGTTCATCTACTTTCACCAAAGGAATAAAATCCTTCTCCC CATGGTCTTAATACTTTTGTAACAGCAAAATTTACCTTATCTCAGTTACC GTTGTAATAAATGAACAAAATCATCTTATTATGNCCTTGGAAAATTGGGG GCGCCATTTAAAAAAAATTGACCTTGGCCACTCCAGAAAAATTCTCCCAC AACGGCACTGCCAGGGGGTAGAGCATACTTATAAGAGTGAATATCCAGGG GGTGTTTACTAATAAAGTAGGATATCCAGGGGTTCGATACTTCGAAAAAT CTTTTTCTGAAAAAGCCTATTGTAGACTAAGCAAAATTATGTTTTTCAAG AGACTTACACTGAAGTGTAAATTTTCAGGTTTTTCAAATAAACGAAATTC AAGAGTAAAGCAACATAATCTTTTCATTTTAGCACCTGATAAGGCAGCTT TGAAAGAATCTGGACGCAAATCATCCTCAAATGATCTTGGTGCTACAGAG ACAACTGCACTGATTGTCATAGCTGGGTTGGTCGGTTCAGTGTTGTGCGT GGCTATTGCTAAGAAGGTTTTCTTCAATAACCCAGCAACGAAAGAAGTTC ATCTACTTTCACCAAAGGAATAAAATCCTGTAAACTTTTATTCTCCGCAT 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00026249TCONS_00026249Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00026248TCONS_00026248Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00026247TCONS_00026247Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00026246TCONS_00026246Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00026245TCONS_00026245Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00026244TCONS_00026244Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00026243TCONS_00026243Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00026242TCONS_00026242Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00026243-proteinTCONS_00026243-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000565supercontigsc0000565:4283..17908 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.01 0 0 0 0.11 0.11 3.85 4.82 9.9 10.13 7.72 7.02 7.45 5.26 10.71 14.53 2.34 3.13 1.36 1.8 0.35 0.25 0.39 0.64 0.26 0.38 0.03 0.09 0.16 0.1