XLOC_015044 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_015044
Unique NameXLOC_015044
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000587:2869..11080-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_015044 ID=XLOC_015044|Name=XLOC_015044|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8212bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000587:2869..11080- (Clytia hemisphaerica)
CAGCTACAAATTTTGTACAACCTTGACGTAAGATCACTATGTGTAATGGC TCGTACAGGGCACGATATGAGTAACATTTGTCAAAGTGAAACGGTTTGGA AGAAAATAATTCAACGGGACTTTGGTAAGCTCGATATTATTATTAAAATC ATATATTTCTATGACAATATACTCTTAGGTTCCAAATAAACGGGGGGGGG GGAGGTTGGAAAGTTTTCGAGGTTTCAATAAACTGTACTTCTGAAAACCC AAAAAGGTAAATATAGGCTAAATTGGTCTTCTCCTTTCTCGGATTTTCTT CAGAAATGAGATTTGTCGTAGAAAGTGCTATTTTCGGACCTACCTCCGGG TACCCCGGTGGAGGTCCCATAAATTAACCCCTGTCCGTCCGTTCGTCCGT TTGTCCGTCCGTCTGTTACCAGCTTTTCTCAAGATTGGCTCATTAGTTTT TTCTGATTTTTTGCACAATGATACAAAATGGCAATGCCCAGAACGTGACG GAGCCCGATTTTCGAGAAAAAATTCATTTGGGCAAATTTGGGCCAAAAAG TACCTAAAAATAGGGTTTTTTGGACGTTGCAAAATCCTGTCATTACTTTT TTCTGATTTTTTGTAAAAAGATGGAGGGCAAGATTCTCTAAAGAATGGCT TTTCTTATAATCGGTTGTATTTTCATTCAAAAACATTATTGATAGCAATG CCCACCATCAAGCATGTTTCAATTTTCAAAAAAATTGATTTTTGAAGCCG GAACTATTAAAAATTCGCCGGAACAACCTATTTTCGCCGGAAAGATAGTA TTTCTTGAATTTCTTAAGCTATACTTTATATTTTTTTATGAAATTTTGCA CACTGATGTAAAATGATAATACCTAAAATGTGACGGAACCCGATTTTTGA AAAACATTTTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAACATGTATGCCGGAAAAA 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GCTTGTTTAATCTATTATAATTAAATATTATTTTTAACAGGTACCAAGTG CGAAGAATATTCACCAAATGTAAGTCCGTCTATAATGAAATAGGTAAACA TTTTAAACAGGAGGATATTATTTTCAAGATTTGAATTTTTCCAAACAGTA TTCCGAAAACTATTTTTAAAATATTTTATGTTGTCTTTTTTGGATGGTGG AAGCCCTATCCATTACACTGAACTAAGTGATGGGGTGGTGATCTTTTTGA AAGCGAGCGAAAATCAGTTAGTGCTCATTATGATTTGGAGTAACCCACCT TCTCCGGTCCTTTGGGAGTTTTTCTAAAATTGTTGTCATTTTTCCTAGGC TTATAAAAGATTAAAGAGAGAAGAAAGAAGAGCCAAAGAAGAAATGGAGA GACAAAGACGTGAGGCTGATGAGCTGAGAAACATGAGGCCAGAATTTATT CCCATGCGTGAAGATTCACCTGACTATCTACGTCTCGTCGCTCCCAATTC TAGAATCCCTGGGATGATAGGTAAAATTGTAACAAATATCAGTATTATGC CTTTTACACTTTTTCTTATTAAGAACAAACTATATAAGAACAGGGGAGAA AAAATTGATTCAACAAGTGATTCAGCTCATCCTATCTATTTTCTTATCAC TGAACAAGAGTGACATGTTAAATATTTTCGAGATCCGTGGTTAACTCGGG TTTTTTTAACTCGGGTTTTCCGGGTCTCGTTAAATAAGGGTATGCCGAAG TTAGACCAATTTGCAATAACTAGCAAGCTTGAAGTGTAAGGATTTGAGTG TGGCTGAAAATCTATTATGCAATTTTTCCGGACAAAGTTGGGCAGAAAGT ATATGCATGGATGAAAATCAAAATCACAATTTTATGCAATTTATTTTATT TTGATTATTCAATGGCATTTTCCAAATATCCATTTTAATTACCTCGACAA 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GCACCCTGTATTTTATCACAGAATATGTCCGAATATATTTTGCGTCATTA AACATCGTTTTTGTTCATTTCATTGCATAAAAGATTGTAACACGAAAACT TTTTTGATATTTGCAACCAAGAAATTATTATGATTTATAGACAGGTCTCG AATTTCGCGTTCTATATCTGTGTTTGTGTCCTGTTTGTTGCTCCCATAAG TAAAATGCTCTCATGGTTTAATTACACTGACATGTTTGTTCGATATCTGT ATACTTTTGATCAAATATTAATCGTAGCAATCGCTTTTGCTTTTGGTGAG AGGTCAACACTGTCTTAAAAAAGTACACGCTTCTTTTTTATAAGAATGGT GTTTTTCCATTTCATCATGGATATTCTTAAAACTTTTTGGGAAAAATCAT CCTGAAATATTCTGACAGTATTCTTAGGCTAGGTCGCAAACCCAGCCTAA ATCTAACATGCAATATATACCTCAAGCAAGAATTCGGCTTTTTTTGTAAA ACTTCTTAGCGTTGCTAATGGAATAATTGGCAATTTACAGGTAAAAGGCT ACATATTTTATATTCTTATAAAAGAAAAAGCTTGTATAGTTAACGATAGC AACTAAACAAAACAAATATCAAAGTCCGCAAAAATCACGATTTTCATTTG CGTATTTGAAGTAAACCACGTTTATGTGCACGTGTTACTGGTTTGAGAAT TCAGGCTCAGATTAGTGACCAAAAGCTTGTCATAACTGATGTGGTTAATT TTTATTTTTATTTGTTCTTTATTTAACGTTGGTAATAAAAAATAGTGGTT GAAGTTGATTATTTCTAGGCTACCTGAGGGGTAGTAGGTTCGCGGGGGTG ACAGGTATGTCCAAAGCCATAAATTGAAAAAATTACCAATTGAGGTTTTC CCAAAATTTTGACGGTTTTTCAAAAGAAAATTTTCGATTTCAGAGAGTGG GTTGGTTTTTCTAACCCTTAGAGAGATTTTCAAGGCATTCGTTTCTGCCC TGGCATAATAGGTACCTATTTTGTTTAATAACCTTTGGGAGGTTACTTAG TGTTTCCTAATCTTTTTATACAACTAAGACATATATCTGGTATGAAATTT TATTTGACAAATGATTTGAAGAGATCAACTTTCATCGAATCAAATTCAGA CAAATGACACCTTGAAGTTATTAATAATGTAATAACTTTCGAAAGAGCAG ATTTAAAATTCTAGATTCATCGTTTGTCTTCCAAAGTATTGCGTAGGCTT TCTTTCCAGACTGCAATCTCTTACACATTTAGACAGCTTCAAGTCCCTTA AGATACAAACCTATAACTAACATAGTTTTTATATTATTCAGGTCAATGGA ACCAAGATGAACTTTATACGTTAGAATGACAACATTCTGGGTTTCCAATT TCAACATTTCAGGACTTTGATCAAAATGACACGATTTGTATTTAAACAAC AAAGAATCAAACTAGTTGTTGTTTGAAGGAATATTTAAATGCGATAAAAC CAGTTGGTCGATCAACATACGTACTTTAAAGATTTTCAAGAAAGGCAGCG ACGAATTTTTTAAGAAGGATAAAATTATTCATTTTGCTTTGGCAACGATT CTTGCAGTTCACACTTCCAAAGAAATCTACAATCACAAAATTGTCCTCAT CTCTGGATTGGATCATCAGTGAGGATTTAAAAAGTACGCAGAAATTGGTG CGTCTTTTAACAACATTCCAAAGGAAACCAACATTGCAGCATATGAACAA AGAGCTTCACCACCGTTACATCAATACTACACCAGTGAAATGAACCAATC AACGCAAAGCTCAACATCTACCAACAATGCTGTAAAAAGCACATCTCTGT CTTCCAATAATGTTGGAATGTCTTCGATGAACGGTAAACGAAATGTCGGT GGATTTGGAAATACGAAGACTGTTAAATCTTGTTTTTCTTCAATGAACGC TTCAAGCTTTGGTAATAACAAGAAAGTGATTGGGATTAGAAAAGTTGTCG CTTTTAAATGAGAATTGGTTGAGGTTGATTCATTTTATGGATCCATCCAC AATAAAGAACAATCGTTTTGTATAAAGTCACTCACAGAGACAATGGATCA GGAAATTCTTATATCCAAATGTTGATATGCGATAACCCACTGCTTGCTCT AAAGGCGATAAACAAAACTTTAAAGAAGAGTAAAAGACTAAGCTTCCTGC AAAAGACAGTTATTAATATGAAATTATTTCGTAAATTTGTACATTTTTTC AAGTGTGGTCCCTCTTAGAAAATTTTGAGTCTGGTAGTGTGGTCGTGTTA CAAAAGTACAGGCTGTTTGTAGGAAAAAAATAATATATAGCTGAAACTTT CTCCAGACCTTCTCTATAGAATGCTTATGCCTCAGGAAAAAATCCCCTAA AATCCCACTGGTGGAACATCCCTTTTTTGGGTAATTTCTGTTTTCCCCAG GCAAAACCCTAAGGTCAAAAATTTTTGAAAATTTCAAACTCTTTTTGAGA CAACATCATGTATACCATNCATTTTGCTTTGGCAACGATTCTTGCAGTTC ACACTTCCAAAGAAATCTACAATCACAAAATTGTCCTCATCTCTGGATTG GATCATCAGTGAGGATTTAAAAAGTACGCAGAAATTGGTGCGTCTTTTAA CAACATTCCAAAGGAAACCAACATTGCAGCATATGAACAAAGAGCTTCAC CACCGTTACATCAATACTACACCAGTGAAATGAACCAATCAACGCAAAGC TCAACATCTACCAACAATGCTGTAAAAAGCACATCTCTGTCTTCCAATAA TGTTGGAATGTCTTCGATGAACGGTAAACGAAATGTCGGTGGATTTGGAA ATACGAAGACTGTTAAATCTTGTTCTTCTTCAATGAATGCTTCAAGCTTT GGTAATAACAAGAAAGTGATTGGGATTAGAAAAGTTGTCGCTTTTAAATG AGAATTGGTTGAGGTTGATTCATTTTATGGATCCATCCACAATAAAGAAC AATCGTTTTGTATAAAGTCACTCACAGAGACAATGGATCAGGAAATTCTT ATATCCAAATGTTGATATGCGATAACCCACTGCTTGCTCTAAAGGCGATA AACAAAACTTTAAAGAAGAGTAAAAGACTAAGCTTCCTGCAAAAGACAGT TATTAATATGAAATTATTTCGTAAATTTGTACATTTTTTCAAGTGTGGTC CCTCTTAGAAAATTTTGAGTCTGGTAAATAAGTTTACAAAAAGGTTGAAT CTGACTTGATACTTTTTATCTCATGATTCTATTACTGCATATGCTTTACA TGGTGATTTTTCTCAGAAAGGTAATCCTTTGTAACCCAGCTAGAGTGTTC GTACCGTTTGTGATAAAATATTTTTTTCTTCCTGTAAAATTTTGTAATTG AGCAAACTTGTAAAATAAATTATTAATTAAAATTTTCTTCTCATAAAATC TTAAAATTAAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00026780TCONS_00026780Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00026779TCONS_00026779Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00026778TCONS_00026778Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00026777TCONS_00026777Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00026779-proteinTCONS_00026779-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000587supercontigsc0000587:2869..11080 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
18.35 17.42 14.45 13.91 19.38 14.23 21.49 22.5 16.39 16.6 17.86 13.28 30.18 23.27 18.67 28.54 14.05 15.6 15.48 17.03 14.59 14.2 23.31 17.22 19.56 21.99 8.74 7.25 15.11 15.13