XLOC_016106 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_016106
Unique NameXLOC_016106
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000678:36319..43915-

Legend: gene
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>XLOC_016106 ID=XLOC_016106|Name=XLOC_016106|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7597bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000678:36319..43915- (Clytia hemisphaerica)
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CGTTCATCTTCTGAAGAATATTTCATTGTAAACAAACTATGGTGTTGAAA TGGTGGTTCGAATATATAACTTTCCAATTGTATCACATGATAGAATTTGG ATAAAATCATACAACATTTGGTATAGATAGACAAATATCTTCCAAAAGAT GAAAGCAAGTCCGAGAAAATTCATCAAGCCAAGATATTCAAAGCAAAAGA TGAAATGTTTTTATTTAAAAACAGCTATATTTCGTATAGTATGAATGAAT TTTGCGTAAATGATGTATATGATATTATAAGAAATATAACTGTTTTTAAA TAAAAAATTTCATCTTTTGCTTTGAATATCTTGGCTTGATGAATTTTCTC GCACTTGCTTTTTATCCTTTATAGACAAACGTAGAAATGATGAAGTAGTT TTCAAATACTGGGCAATTTTGTGGATTATCTGGAGTTAAAAGCCTTCTTG AAAAACATGACATTGCCACGGGGAAACGTATTTGGGTAAAAGGACCAATA GGGATGTGCTGCTGGGACAGTTTACCTTTTTCGTCTCTTTTTCAGCTACC ATAAAAACATACAGGGTCGACCCATACAGGGTCATTGAGACTCAAGTCTC ATTCAGGTCCCTTAATACAAGAAAGTTAGCATAGAAATAGGATCCATTTT TTCTTACATCAGCGGCGCATCCCCCGTCGGTCGATAAGTAATACTCCTCC CACGTCCCACGGAGTGTTACCTCAACTTGTTAACCCTATTCAACCTAGGC TTTTAGGGGCGGTTCAGAACTAGGGGGGGGGCTTTTCCTGTACCATCCCT TAACTTTTGATCTAGTGGGTCTTTTTGGATTAAATTTGGCACACAAGATT CTTGTGACGTAAGGTAACTTTTGACAAAAAAATTTTTTCGATGGCGTCAC TCATCATGCCCAAAGTGAGCAAAAACTGAAAATTTCCTTTGTTCTTA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00028433TCONS_00028433Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00028432TCONS_00028432Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
glutamate high-affinity transporter 2TCONS_00028433-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000678supercontigsc0000678:36319..43915 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
SLC1A7excitatory amino acid transporter 5 isoform 1 Homo Sapiens
Expression

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Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
24.19 24.02 16.59 14.85 17.3 11.92 6.54 6.66 11.53 8.43 3.68 5.44 6.87 5.88 1.85 2.83 5.34 6.29 16.82 19.2 5.12 4.44 19.34 19.31 11.86 13.37 159.01 134.85 3.66 4.4