XLOC_016911 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_016911
Unique NameXLOC_016911
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000757:36857..45722-

Legend: gene
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>XLOC_016911 ID=XLOC_016911|Name=XLOC_016911|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8866bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000757:36857..45722- (Clytia hemisphaerica)
CTACCAAACCCCGGGTTTTCAGTTTTCATAGAATCCGTCTACCATTACTA CGACATCAAAAAATTAAGAAAACGCGGGCTGTCGGTATATCGTCTTTGAT CGCATTTTAGTAGATAATAGAGCTTTAGAATAACACGGATATATGAAATA ATGTATATACGGTCGATTCGCAACTGATAATTTGCCATGAATGTAACACA AGGTAATCAGTACTACTTTGGCAATCAACTTGCTAACACCGAATTGTTAA ACTTCTCCAGAACGTTCATTTGTTAATTTTGTTGTGAGAGACGTACGGAT TTGACAAATTCTCACATCATTTGATTGTTGTTTTGGATTGTGCAAAATTT GGTATTGCATTTTTCAAGGTAAAAAAACTTGATCAATTTAACAATCTTGT TCCCTTGTACACCATGGTAGCTTTATGGGATTCTTGATGACACCAGTGTT TAATCTTTGTAATACCTAGTGCCCCAAATTAAGTACATATCAGTGCACAC AACGTTTTTTTAACGTTTATCTAACGCTCAAAACGTCCATATAACGTAAG ATGAACGTTGAAACAACATTGTGTGCCAGCTTGGTAGGATCTAAGGAGGA TTCAAAATTCATTGCAAAATTTATGTTATTTTTGGCCATGCTCCTTACAA GAAAATGAAGACTGTACGAAGTAAATTTTGAGCCCCCCTCAGATCCGCTA TTGATGTTAGAAGCCCGATAATTATATAATTGGGTACAAGGTTGTCTATT CTTTAATGTTGGATTGTCATTGGTTGTTTGGCTTTTTTACGAGACACCAA AATACACAGCATTTGCATAGAGCTCGTTTTCCTAATTAATGTCAACATAT TTTTAATTAGTGTAATGACAAACAACGTTATTTATAAGGCGCCTTCATAT TTATTTTTGCGATTTCATCAAGATTTATGACTTAATGGGGAGACAACATT 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CATGGGCGCAACGACGTGCGGAGCCGAAAAACTTTTAATGAGGCATCACC CGTATTCTAGACCCACATCATGTAAGTATTTTACTAACTCGAATGTCTCT TTAATTCGAACAAGTTTTATGATCTCTTCAGTGAATGTGTTAAAATTTTC TTAACTCGAACAAATTTTTGTGTTCCCCGTGCGGGTTCGAGTTATGGAGA CTTCGATGTGTAAAATTCATACGAGATTGATACATGAGATATTAACAAAT TCTGCCTTGAATTTGAAGTTAAAGATCTTAGAAATTTGACTGGGTAGTTA ACAATATCTCTTAACTAACCAGAAAAAAATTACACAAACGATTCTGCCTT GAAGTCATAACTGTTGCTTCAAAATACCTAAAATTTCTTTGAAATATAAC ATTCAAATCCAATAATAACATTCATCAATTGTTCTTTTACAGATTACCCA TCATACAATCGTTCAAGATCAACCACATTCTCCGATATCCCTTCACCAAC CAAAAGTTCACCATTAAGTTCATCCTACCCCACAACACACTTCAAGTATG ATGACGATATTCACCGTCATTCTATTTCTCCGCCCATATCTACCCGCCAT TCACCGCCTACACTGATTCGCAGCGATGTATTATCTTACCAAGATCAACT GAGAATTAAACTAGAAGCTTCAAACATTCATCATCGCTTTCATCAAAATA ACATAAACCCTAACGGACAAATTGAACTTAGACATACAGCAATTTCTAGA TAATTTAATTTTCAATTTTTCAGTCTCCCATACTTTGTATATACTTTTTC TTAGAGATAATTTTTTCTTATCGTTCTTTTTTAAATTCTTCTAAAACACT TTTTTAAACAGGTCCTCTATTGCAAAAAACCTTCATGGTAATTTTTCGGA AAAGTGAGTTTACTTCTCAATTTTCTTACCAGTTTTGGTTGTAAATATCT TTCTCGACTTTCTTTGAAGGAAAAGATCCCAATAGTTACCGAAGAGAGGA TTCTACATGGCTTAAATAGATAAAAATATTATTTTTGAAGAATATTTTGA TGACACTTGTAAATAACAAAAGGAACAAACAAAGCTTTTACAATGTAAAT ATAATTAATTGAACAAAACGACTAATTTAAAAAAAGATGCACAAATTCAC AAACAAACATAAACAAAGGAAATATTGNTTGTAAATATAATTAATTGAAT AAAACGACTAATTTAAAAAAAGATGCACAAATTCACAAACAAACATAAAC AAAGGAAATATTGTTG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00029607TCONS_00029607Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00029606TCONS_00029606Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Bra2 brachyury transcription factorTCONS_00029607-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000757supercontigsc0000757:36857..45722 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.08 0 0.02 0 49.75 35.22 53.27 55.87 27.54 29.72 10.95 19.73 14.29 13.87 3.7 10.59 3.16 2.94 24.7 15.88 2.49 3.07 2.02 2.26 2.6 3.31 0.48 0.57 0 0.09