XLOC_033976 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_033976
Unique NameXLOC_033976
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_234:336021..352466-

Legend: gene
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>XLOC_033976 ID=XLOC_033976|Name=XLOC_033976|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=16446bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_234:336021..352466- (Clytia hemisphaerica)
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TTTAGGGAACCATTCACTCTGGAACAAGTCGAAGAAAACAATTCCCAATT GCTATTATTCTTGCACCCACAAGAGAGTTAGCATCTCAAATCTATGATGA ATCTAGAAAGGTAAGTCTAAATTATTTAGTGAAAATTATGGATTGAAATA TTCCATTTTCTACTGCCCTTTTTGTATCATTGTACCACTTTTAAAGCTTT TTCATTTTGTTTAAGTAGTACTTTATAATGAATCCAGGTTGAGTTTGCTT GAAATGACAATGACTTCTACAAGGTCATAAAGTTCCATAACAAACTTTTT TGAAAAATGTTTCCTTGGGCGATTAATTTAATGATAAAAAGAATAACCAG AGGCTTCGTGTTTTTAATGTTGTTAAAAACTACATATTCGACACTCACTA CAAGAGGCCATCTTCAGAGTGAAGAAAGAAACTTTTTTGGGATTAAATTT AGTCACTATATCAAAATTTTCTCACCACTGAGCTCACAATGACTAGAAAA GATTTTCATCCCCTAAACATCAGTCATATTTTAATGATTAAAAAAAATTG TCATATTCACTTTAGTTCACTTATCGCTCACACATGCGTCCATGCGTTGT TTATGGTGGTGCTGATGTTGGTACTCAAATGCGTGACATTGACCGTGGAT GTCATTTACTTGTTGGTACTCCTGGACGTTTGGTAGATATGATTCAGAGA GGAAAAATTGGACTAGAGTGTGTTCAATTTTTATGTTTGGATGAGGCAGA TCGTATGTTGGACATGGGTTTTGAGCCACAGGTATGCCACAGTAATCTAG CTCTTACTCTTTTCTGATATACTGATGGCAAGAGAGCCAGATAACATCTA CACACCCTTTCTCATAACGTTATGAAGTATCACAATTATAAACTTTTTGT TGAAAAAATGCTTGAAAAATATTTTCATCTCTAAGATTTCATTAAGCATG 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TTTTTGTATTGGACGTTAATGTTCAAGATTTGTTGTTTATTCGAGATAAT TTTCTTGTTATTTTTCAAAGCGGGGCGAGTTCTGTAGCACTTTATTTGTG TAAATGAATGATATAGTTAAGCAATTGTGGTAATACTCTTGACCATAGTG TCTGCAGAGATTTCTTTTCTTGTTTCGAAATGTAGTGGAAGCTCGTGTTA TCCTATACTCTCCGTCAAGTTATTCTTATTTGCTACATTTGCTTTGTTTT AGCTGCTAGTTCCTTCCATTTGAAAGCTCGTAAGCTGAAATTCTTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053843TCONS_00053843Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053842TCONS_00053842Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
PL10TCONS_00053842-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_234supercontigscaffold_234:336021..352466 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
DDX3YATP-dependent RNA helicase DDX3Y isoform 1 Homo Sapiens
DDX3XATP-dependent RNA helicase DDX3X isoform 1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
76.7 78.56 18.14 12.12 233.67 176.44 111.08 121.32 96.74 138.26 157.71 108.39 180.13 183.17 134.56 158.7 182.7 143.81 109.72 109.86 140.43 129.36 138.11 168.38 159.38 169.88 223.68 235.13 196.39 188.89