XLOC_039976 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_039976
Unique NameXLOC_039976
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_40:30066..46507-

Legend: gene
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>XLOC_039976 ID=XLOC_039976|Name=XLOC_039976|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=16442bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_40:30066..46507- (Clytia hemisphaerica)
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GTAATATCCAAACTTTCTCATTCCAGACTATCAGGCAAAATGGTGGTCGC CTTGACAACCGGTCACAATTAGTCACCGTATGCGAGATGGGTTTACAGGT CTTTTTGAATTGTGCCGGCTTCATCCGTATTGAGCCGAGTGAAGCCAACG ATGACCGGTATGAAGTATTGGACGGGACACGTATTCATCCGGAAACGTAC GACTGGCCGCGTAAAATGGCTGTCGACTCTGCGGACGATAATGACGTAAG CTTTTGTTTCTTAGCTTCCATAAGTAAAGCCCATTTTTTGCCTTCTTTGA CTTTCAAAGCCTAGAGTTTCGTTTTTTTATATAGCTGAATTCCAATAATC TATCCATTAATTCTGCGATCAAGAAGGTCGAAGTTGAATAGCTTTGTGAA TCTTGACAGGACTTTATGCTTCTCTCGCTTTTCTCTTTGAACTTTTACCA TCCGAACTATTTCTCTGTCAAGTAAAATAGATTTCAGTTGAATTTCTCTG ATGATTGTCTTTATCTATTGTGATCTACTAGGTTCCAGAAAATCCAACAA TGGCAGTAGAAGAGGTCATGACAGATCCTGGACGTCTTAAAGATTTAGAT CTTGATGCCTTTGCTGAAGAATTGGCTCGACAAGGATACGGTATCCATTC ATCATTCTTTCGGTTTTCCCTTCTCTTGAATAGGAAATGGAATGGCTTGC GCGCAAATTAAAAAATTCCGATTAGATCGCGGTTGTTACATTTTGTTCAG AAGACAAGCATGCGCTTATTAGCCTAAAAGAACTGGGTTGTTTCATGTCA GTAGAGAATCATCTTTAAAACATGCACCCAAAATGGGGTGAAAGCGTCGA ATCGCGTAGCCACGGCCTCGAGTGCATTTTTGCCATATCCGGAACAGTCA CGATCTGCACGAAGATTCGCACTACTCTTCAATACTCTTCTAGAATCCCC TTTTCTACATGAAGCACTGCGATTCTATTTATTAACAACAAACTCTCCTT CTTTCTCGCTCTCTTTCTCTTGCTGCGTTTCTGCGTACCCTATTCTCGTA CATACTTCGCTTCTCGATAAGAAATTATTTTTCTTGTTCTTATTTTCCAC CCTTTAATTTTTTTCAACAGGTAACAAGCAAATCACATTATATGATATTC GTGACGAATTAAGTTACCGTTTCAAAGACCATCGACCGCCGTTCAGAGGT CTTGGTTTCCAAGAGAAATTCGAACTGTTGACGGGCGAAACACAACAAAC TTTGTATTACGGTAAACTGATCACGTGTCTGGCCACAGGGTTCGCTTTCA AGAAGGCGACCAGAGATGAATTGGATTCGGCAAACCCTACCAGGAATGAT GAGACGAATCTATGGAAATGTCCCTTCTGTTTGAAAGACACTTTCCTGGA CCTCAGTGAAGTAATATTCTTGTTTAAAATTTTTCATGCTTCTTCCGAAT AGCTCCTTATAGAAACTATTTGGAAATTTCCTCTCTGAAATTGTTTTGAC TGAAATTAAAGTCAATTGGCTATAAGCTAGCACTAGTTCCTGTTTTACTT GTTGTGATACTATAATTTTTGAAATAAAAATTTTTTTTTTTGGTATAGAC AAACTTTGAAGTCTCTTGATTTCAATTACATGATTACATGATTATTTTCT CCTTGAAACACTTACACCTCAAGTTACAGATTCTAGAAGATGACCCATTG AAGTTAAACCCACCAGAAACAGGGCTTTTCGACTCCAATGATGAAAACAA CTTTAAATGCAAAAAATTAATTATGTAATTAAAATAATTCTATTGAANTC GACTCCAACGAAAGCAACTTTTGATGCAAAAACTTTTGATGAAAATTAAT TCTATTGAACCCTTTATATCTTGATATTCTTTTCTCTACAGGTTTGGACT CACTTCGATAACGGAAGTTGTCCGGGTCAAGCAGTCGGTGTACGGACACG TCTAGATAACGGAATATCCGGGTTCATTTCCAATAAAAATATTAGCGATA AAGGGGTACGAAGACCCGAAGAGCGAGTCAGAGTAAGGATAGTCTACTTC TGATTCTTCAGCTCATGAATTTACTCTTTTCATATTGGGCTTTTCACGAA AAAAACTGTATACCCACTGTTGAGTGGGTGGAAGTGCTGTTACCCCCCTG GAATTTCAAGCAAAATTAGGTTTAAACCTCTCTGGAATTCTGAATTTTAG TAGAGGATTTAAAAACGTACTCCCATGGAATTTCAGTTATTTTTGACAGA TCTTTTTGTCTATCCCTATGGAATTCCACAACATATCAAACCTTACCTCC TTGGAACGGAAATGGACCTCCTATACGGTTTTTTTCCGGAAAAGCCCTAT TTAACCTCAATATCTGATAGAAATTTTATGATGCTAAATTTTTGACCCTG TCATCATTGACTGTATTCGTGCTAACATTTCACAAAATCAACATGAGTAA AAAAATAGCAAATTGTGCAAAAAGCGAGATTGTCCTGTCAATCATGTCAT TTCAAATCACCCGACTACTTAGGACTCGGTTAGAATTCTTTAGTTTAGAG CCCATCTTTATTTTTAGTCTTTTCGCAACGCAAACAAAGTTTTCCATTAA AATTGGTAGCCTAGCGTGCTAAACTAATTAACCTGACAAAATTGGCAATA CTGAACTTTGTGTCTTTTTAAAACGACTGTTTATTTATATTCTTGCTAAA AAAATATGTTTCCCTGAAACCGGTATTTTTTAAGACTATGTTCTGATTTT TCCCTTTTTCACTTTTTTCAGTGTCCGGTAGCTACCAGTTACTGCTTCTA CTTTTCGGACTGACTACTTGACTGATGTACATTTTTTATTTTATGTTAAT 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ATTTTAAAGTTAAAGTGAAGTTGACTCTCTCTAATTCGATCTTGTAGGGA CCGAAATTTCGGAATTATTCGAACTACGGAACCATATCTTATAACGACTG GCCAACTAACCCAGCTGGCACACAATGTTGTTTCAACGTTCATCTAATGT TCACAACGTCCATATAACGTTAGATAAACGTTGAAACAACGTTGCGTGCC AGCTAAGGGGACCAATATTTTAATTTCGAATTAGAGGGAGTTGATAGTAT CTTTTGTATTGATCTCATTTTGTGTATGATAGGAATACGAAGATTTGGAT GAAATCATGGCTCGTCACATTTCACCGTTAGCTGCGCATGCGCGAGAAAT AATAACGCACAAATATTACAAAGAGTCTGATGGCACCAAAGCTAAACTGG AAGAGATTCTTATGATGGAAAAACGAAAAGCCCCGGGAAGGATTCCGTAC TTCTTCTCTTGCTCCAAACAATTTCCCGGCAAATTCATGCTAGGTAAGAA TTTTCATTTGTTTCTAAATTGAACTGAGAGACGCTTTTATACCTACTTTA TGACTTGTTAAATCTGTCTCAAAAGTGTGATTGATTATTTTCATGCCAAG ACGACCGTGCTCATAAAAATGAAAAATTTTCTTTGCGCAATTTGGAGTCT CGATTCACTTATCAACTTATTTAAAAAGCAACGCAAACCAAACAAAAATC AATAAAGATTTCGATACGACTTACACTCGAATAATTTTCTTGCCTTGTCA CTCTCTAATTCACTTTTCAATGGAAATCGGAGCTTCGTCGAATAAGGGGA GCGTATCGAATAATAGAGCATCGTTTATGAGAGTTTCTTGTTGACGGTGA ATTTCAATAATACCGAATAACGGAGCGTACGGAATAGTAGAATGTCGAAT TAGAGAGCGTCAACTGTACTATGATGAATTGGCGAGATGTAATTTTTTTA 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TTAATCACTAAACCAATTGCTCACCTAATTTCTTGAATTTAAGACGTTAC TTCTACAAGCTGAGTGTGGTATTGATGCAACATTGGACACATTTACGGTA CGGAAAGCTTAGACCCTGGGTTTTTAAGTAAGTTGATGGACTGCTTGCTC TAAATGATAATAGAATTTTAACATTTTGAAAAAGGCTTTATTGTAAGCTT TTGATGACTTTTAACTTTTGTATTTTGTTTAATTTTTATTGTGTAATGCT ATCATTATCCCCTCTATATCCCAAACGAATTTTTCACTATAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00063759TCONS_00063759Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063758TCONS_00063758Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00063759-proteinTCONS_00063759-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_40supercontigscaffold_40:30066..46507 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
44 38.26 53.03 52.85 129.73 101.42 72.04 81.32 48.68 59.97 50.17 41.5 54.45 59.01 41.17 52.67 50.77 49.33 28.63 32.67 39.66 39.13 55.5 54.68 75.28 81.28 35.44 34.94 53.05 61.54