XLOC_039996 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_039996
Unique NameXLOC_039996
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_400:238641..244046+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039996 ID=XLOC_039996|Name=XLOC_039996|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=5406bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_400:238641..244046+ (Clytia hemisphaerica)
CATAATAAGACGACCAGCTCCTTTGCTACCAGACGGTTTTAGGCatctca
aaattgacaatttcataatATTGAAGAGGAGAATGACACAGCACATATCT
ATTAAAGTACGTTTCTCGAATCTTTGGTAATTTTGGTTCATTTGGAACAT
CTCTATCTCTCCTATTTTTCGTTCGGAACCTGACCCTGTGACAGATCTGT
ATGATaaaggcaactgcatacactttattTAAAACTATTGGCTGAAACTC
TTAAGCAAGCTTTGAAAATAGAACTACTGACTTTCTACCACAACAGTTTT
GGAATATTGTTGATTTCGGGGTGCTAATTTTGGCTGATTGTTCAattttt
cccatgttcaaaataCGAACCTTGGaaacatactctttcttattcaaata
agaaaatgatctgttatgattTATTAAACaaccttccaaaaacaatatGT
AACACATATTACCAAAGCAACTCAGTAAACTCTGTGTCATTGAGGCCCTG
AAGTTAACAATATACCATATAAATCAATTACATCAGTATTTAGCATTCCA
ATGAAAAGCTTGCAATATTCGAGTTTTCATTTCTGAAAGTGAtgtctttt
tctaacttttctagAGACACTCACCTGAAAAAGcctttaatttgtaaaaa
ttttgctCCCACGTGATAAACCTTGTTTGCGAATGgataaataaactttt
aaaaactatgGGGACTTTTTTATCCCAAAAACGATTCATcctttctatgt
ttatcaaaaacAGTGTGCTTTTCTGGCTTttcttctcaattttatttAGG
GTGATAGACGTCAATAGGAATGATCAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNAACTTGACAATTTCATAATATTGAAGAGGAGAATG
ACACAGcacatatctataaaagtaAGTTTCTCGAATCTTTGGTAATATTG
GTTCATGTGGAATATCTCTATCCCTCCTATTTTTCGTTTCGGAACCTAAC
CCTGTGACAGATTTGTATGAGaaggcaactgcatacactttatttaaaac
ttttggaTGAAACTCTAAagcaagctttgaaaataaaactactGACTTTC
CACCACAACAGTTTTGGAATGTTGTTGATTTCTGGGTGctatttttggct
gattgttTCATTTATCCCATGTTTAAAAtacgaaccgtggaaacatactc
tttcttattcaaataagaaaatgatctgttataatttattaaacaatctt
ccaaaaacaataTGTAACACATATTACCAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAATATACCATATAAATCAATTACATCA
GTATTTAGCATTCCAATGAAAAGCTTGCAATAttcgagttttcatttttg
aaagtgatgtctttttctaacttttctaaAGAAACTCGCCCGAAAaagca
ttttatttgtaaaaacggTGCTCCCACATGATGAACCTTGCTTGCGAATT
cataaataaacttttaaaaaatatggCAATTTTTTTATCCTAAAATGATT
TAGCTGTTCTATATTTGTCAAAGACAGTCTGCTTTTCTggcttttctttt
taattttatttagggTGATAGACGTCAATAGGAATGATCAACATCAAATA
GATTTTGCTCAGAAAAGTATCCGAACGAGGAATGACGATAGTTCATAATA
AGACGACCAGCTCCTTTGATATCAGGCGGTTTTAGNATCAAATAGATTTT
GCTCAGAAAAGTATACGAACGAGGAATGACGATAGTTCATAATAAGACGA
CCAGCTCCTTTGATATCAGGCGGTTTTAGGCatctcaaaattgacaattt
cataatATCGAAGAGGACAATGACACAGCACATATCTATAAAGGTAAGTT
TCTCGAATCTTTGGTAATATGGGTTCATTTGGAATATCTCTATCCCTCCT
ATTTTTCGTTTCGGAACCTGACCCTGTGACAGatttgtatgagaaaggca
accgcatacactttatttaaaacttttggctgaaactctaaatcaagctt
tgaaaataaaagtactGACTTTCTACCACAACAGTTTTGGAATGNgctTT
GAAAATAAAACTACTGACTTTCTACCACAACAGTTTTGGAATGTTGTTGA
TTTCGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00063800TCONS_00063800Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_400supercontigscaffold_400:238641..244046 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.78	1.59	4.03	4.18	0.3	0.47	0.29	0.27	0	0.46	0.85	0.61	0.48	0	0.18	0.44	1.3	0	1.16	1.01	0.77	0.01	0.25	0.79	0	0.21	0.61	0.32	0	0.59