TCONS_00006236 (transcript) - C. hemisphaerica

transcript sequence

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aattaaaaagataagcAATAATAAGAAAATGAAACTGGAATAGAAAATGT
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gaatatttaaaatttaaaacaggTTAGACCTTGAaggttattttaaattt
ttgcacttttaggtaaaaaaattaCATGTGAACG

protein sequence of TCONS_00006236-protein

>TCONS_00006236-protein ID=TCONS_00006236-protein|Name=TCONS_00006236-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=523bp
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transcript from alignment at sc0000066:262586..272606+

>TCONS_00006236 ID=TCONS_00006236|Name=TCONS_00006236|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10021bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066:262586..272606+ (Clytia hemisphaerica)
ATTCCAGCGAACAGTCAAACTGACACTATTCTTTTTTTACTGTTCAggta
aattaaaaagataagcAATAATAAGAAAATGAAACTGGAATAGAAAATGT
AGGTTTCAAGTTGCCTTGGGCTGCTACTGCAAGGCAACTGTGCCAAGCTC
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ATTTCTGCTCGGGTAGCCATTATccctttctttatttttctttcagattc
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CCCTTCATGAAGTAGCTTATCTTCTAGACTACACAAAAGAACAAGATTAT
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aaaaatctaagccattttttatcaaaatattcttCGTCCTTCATGGCtac
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TTTATACCTTGTGTTGACAATAATCCACCCTTCGAATCCTTTTTCAGATT
GTGGCAAATCATGTGGCAATTGGACCAATGGGTATACTTTCAAACGTGAT
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tctaaatgaaTTCCTGGGAAAGATGTAAATTAATGATACCAGCCGTGGCA
TTATTGAAAAGGTCTGCTCCTCGATTACAACATGACACAAGCTTTTTTTA
ACCACAAGTGATCAGGGGCTATGACCTACAGTGTTTCATATGGTAAAAAT
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GAATTGAATAACTATTTCAAGAAGAATGACTTGTGTTATGTTTCACAACT
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GTGAATTTAAACTAGGTATGGTTTAACTTTGATTTAAATTTAATAAAGGA
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GTATTTTCAGACCAGCTTTAGCCAAAAGTTTTAATTTAAATCAACGAAGC
CTGTCACAAATCTCTGCATCGTTACATTGGAATCTCTTTCAGTTTTAAAC
AGTTAAACTAACAGTTCACCACTCATTTACCATTAAATTTTGAACAGTCT
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AAAGTATAATAAATCATGGGAGGAAAGTCATGACTGGCTAGGTCAAGTGA
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ATATTTGTTGTCAGGTTTTAGGTAAAGTAAGACTAGCGTGAATATACTCT
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ccttccatggactaaaatttcataaatcgccaaaataaaaaagaattccG
AGCGActgacccacctccaaaatctagggtcgggtgacggcaaaccaaca
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aaagaatTGGAAAATCCTGTTTTTTTGATACGATTTGTCCTGtattttcc
tgtatttttgaattttttcgtCCTGTATTCCTGTTTTATTTTACATAATT
GAGGCTGGGAGGCCTGCAACTGGATTAAacccttttttcaattttttgcc
atATATTTGGCTTCATTGCAGATTAAACTAAAGAGAAGTCGTTCTTTCAA
ATTTCAACTGTTTCTATTCAaccttttgctttttttttaaccaaaagtgA
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ctattttttcgtttttttacgAATAACTTTAAAGTTTGAGATTATTTGAA
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AGATTTCTTTTCCAGATTGCTATGAAAATTGCTCAACTTGGGAATTGAAT
AACTATTTCAAGAAGAATGACTTGTGTTATGTTTCACAACTTCGTTACTG
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AACTAGGTATGGTTTAACTTTGGTTTAAATTTAATTAAGGATTAATTCGA
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GTTGtttaaaattaaatgaaattcaaaaacatttatgCATTTTTTGTACA
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AGCTTTTGCTGAAATTAAATAAAAGTTATTATTTATACTCATTACTATCT
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CATTtactataaaaccaaacctaaaCTCCACATTTCACAGATTGCTACAC
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ATGATTCTCATATTTCACAACAACTGTAAAATATTTGCCTGTCTAATTTT
TGAGTCTTAATACCCTTTTAGTTTTTATTCCCTCAGTCCAGCATTGATCG
ACTTTTGAATCGCCTTATACAAACCTGTTTTAAAATTGTAGCTGTCTATT
TTTCCagctttaaattcaaaactgtCGCACCACTTCTAGATTGCGCAGAC
GTTCCATTTTAAGTCTAGGATTGAtcgatgttttgaaattttagctaCGG
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CAGGTATAGTTTTGTTTCTTTATTCTCAGAATCTTTTTTACTTTCCAAGT
TTTAGATTAAAAGGATGTCCTTGCACTTGGCTATTTTTGTAGCAACTATA
GTTTCAAATCTATGTTTCATATTCATCCTTCTACTATATTTCAAGTAGTT
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TTATTTCGTGTCAGTATCTTCAAAATGGCATTATTTGTATCATTATAAGG
AATAACTTCATCGTTATTTGTAattcattttcgtttttctcAGGTGCACC
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TGATTCCTGTGGGAGCTGTTTGTCTTATCATCGGCGTCGCTTTGGGTTGC
ATGGGTCATCGATATCAGAATGTCAAGAATCGATGCAAGAATAATAACGG
TTTGAAATTATGGATTATTATTTGCCTCATAAGCTCTAGACGAGTATCAT
TTGTCATTTGAAGTACTTCACTACTTTTGTAATTCTATAGATTAGATGAT
GTTACCCTTTAATAATACCGGATGTGTCAGAAATAAGTTACCCTGAAGTT
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GAATTTACCTTTCCTCTTTACTATAGAAACATttcgattttttagaaatt
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TCCCGGCATATActtttgaaagatcaaaatgttGGTGGGTATTGGAATAA
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TTCTGACCATTACATTCCAGTGTCACCAGAGATGAACCACAACAATGGAC
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AATGCTATTAGATGTTTAAGAGATTGTgtatctttcaaattttccctACA
ACTCatgtcaaattttgaaatactttgtAGTGCTGCATAACATGAATACT
CATATCACTCTTCAGCATCGAAGCATGATCGTGAACAACTTTGAGTTGAT
TAAATTctgatgaaattttttaaaggaCGAGTTCCTTGTGTGTTTTGGAA
ATTTATATTTCAATCTTTAACTTGAaatcttccttttctttttcttcgta
ATCTCAAATTCTAATTATTTGCACTTTAACAAACAAGACTACTGTATTTA
TTAAGATTGTTTGCAAACGTCTCCTTGACGACCTGTGTAGTCgctacttt
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tctcaatttttttaaactttttcatcaTGTATATACAGGAcctattcttt
ttctttttttatattataaaatcatttttgagttatttatttctttattc
tAAGTTTTACTTGAGGTACTTTTTATACCAACACTACTAGTTGTAAAGAT
TAtcattttttaccaaaattattgtatatattattttgaatatttaaaat
ttaaaacaggTTAGACCTTGAaggttattttaaatttttgcacttttagg
taaaaaaattaCATGTGAACG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000066:262586..272606+

>TCONS_00006236 ID=TCONS_00006236|Name=TCONS_00006236|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=17292bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066:262586..272606+ (Clytia hemisphaerica)
ATGGGTTATCATACTTACAAATTAATAATATGTATAATATGTTTGCTATT
ATGTTTTGAATGGTGTTGTGTTGAGGGACTTGCTGTCATATGGGATCCTT
ATCACCCATTattcTCATGCAAGGATCCTGTCGTAAATGTGAAAGAAACT
GATTTGTTGAAATTTGTATGCCCAGATAAAGATATCTCGTCCAAACCAAA
TGCACATTCTTCAACCCTTCATGAAGTAGCTTATCTTCTAGACTACACAA
AAGAACAAGATTATGCAAATTGCGATGCTAGAGATCATCTATCTGTATTA
CTAAACTGTACAGCCGCATATAGAACTACACAACATCGCATCACTCAAAA
TGCTCTTTCACCTGATGCACCCTCTTTCACACCTGGAAAGACATATTATG
TGATAGcCACAAGCTTTCAAACATCAAATAACATCAACAATCTTGTTGGT
GGTAGTTGTAATTATTCTCAAGATGGAGCACATaatttgaaactcaaaat
tcaTGTTTGTGATGGCTCAGATTCGTCATGCTCTGTGTGTGATAACGAAG
CTTGTTTGTACAAAGATTGTGGCAAATCATGTGGCAATTGGACCAATGGG
TATACTTTCAAACGTGATGGAGGATGTTTCAGTGTGGAGAAAAGATTATG
CAATAATACTTTACTTGGTATAACAAATCATGAAGAGCAGAGGGAGGTAG
CTTTAGATTGCTATGAAAATTGCACAACTTGGGAATTGAATAACTATTTC
AAGAAGAATGACTTGTGTTATGTTTCACAACTTCGTTACTGTAACGACTC
TGTCAATAAAGATTGGAATAAAGTTAATTATCGTGAATTTAAACTAGATT
GCTACACAAATTGCACAGAGTGGGTGACTAGTAACcatttcaagaaaaat
gatttATGTTTTGCAACGCAAAGACGTTTTTGTAATGACACTTTCactaa
tcaaataaacaaagttGAATATCATGAAATTCAGCAAGATTGCCCAAAAA
CATGTTCGGCTTGGGAACAACTCAACCTTTATCAAAAAGGAGACAATTGT
TACAAAGACGAAATTCGTTCATGTAACATCTCAATACTGGAAAGTTTCAA
CAACAAAGAATATCGCCAATCTATATTCGATTGCAAAGACAATTGTACTG
ACTTGATAACTTCATCAACTTTCGAACGTATTGGTTCGTGTTTTCTTTCA
ACAAAAAAGACATGTGTGAATGAAGtattaaatatttcaagaaCTGAATA
CAATGAAACTGAAGTTGATTGTCCTACAATAGTAATTCCCACAGGTGCAC
CAAACAAAGGGGACCCAGGTAGTGATGATGAAGAGCTTTACAAATACATG
TTGATTCCTGTGGGAGCTGTTTGTCTTATCATCGGCGTCGCTTTGGGTTG
CATGGGTCATCGATATCAGAATGTCAAGAATCGATGCAAGAATAATAACG
TGTCACCAGAGATGAACCACAACAATGGACGCAACAGAGGTGGTGTAGCT
AATCCTTCTTACACGCCAGATTCCGTCATTATAAACGATACCCCTGAAAT
GATCCGAAATGGTGGAATTTAAATGGGTTATCATACTTACAAATTAATAA
TATGTATAATATGTTTGCTATTATGTTTTGAATGGTGTTGTGTTGAGGGA
CTTGCTGTCATATGGGATCCTTATCACCCATTattcTCATGCAAGGATCC
TGTCGTAAATGTGAAAGAAACTGATTTGTTGAAATTTGTATGCCCAGATA
AAGATATCTCGTCCAAACCAAATGCACATTCTTCAACCCTTCATGAAGTA
GCTTATCTTCTAGACTACACAAAAGAACAAGATTATGCAAATTGCGATGC
TAGAGATCATCTATCTGTATTACTAAACTGTACAGCCGCATATAGAACTA
CACAACATCGCATCACTCAAAATGCTCTTTCACCTGATGCACCCTCTTTC
ACACCTGGAAAGACATATTATGTGATAGcCACAAGCTTTCAAACATCAAA
TAACATCAACAATCTTGTTGGTGGTAGTTGTAATTATTCTCAAGATGGAG
CACATaatttgaaactcaaaattcaTGTTTGTGATGGCTCAGATTCGTCA
TGCTCTGTGTGTGATAACGAAGCTTGTTTGTACAAAGATTGTGGCAAATC
ATGTGGCAATTGGACCAATGGGTATACTTTCAAACGTGATGGAGGATGTT
TCAGTGTGGAGAAAAGATTATGCAATAATACTTTACTTGGTATAACAAAT
CATGAAGAGCAGAGGGAGGTAGCTTTAGATTGCTATGAAAATTGCACAAC
TTGGGAATTGAATAACTATTTCAAGAAGAATGACTTGTGTTATGTTTCAC
AACTTCGTTACTGTAACGACTCTGTCAATAAAGATTGGAATAAAGTTAAT
TATCGTGAATTTAAACTAGATTGCTACACAAATTGCACAGAGTGGGTGAC
TAGTAACcatttcaagaaaaatgatttATGTTTTGCAACGCAAAGACGTT
TTTGTAATGACACTTTCactaatcaaataaacaaagttGAATATCATGAA
ATTCAGCAAGATTGCCCAAAAACATGTTCGGCTTGGGAACAACTCAACCT
TTATCAAAAAGGAGACAATTGTTACAAAGACGAAATTCGTTCATGTAACA
TCTCAATACTGGAAAGTTTCAACAACAAAGAATATCGCCAATCTATATTC
GATTGCAAAGACAATTGTACTGACTTGATAACTTCATCAACTTTCGAACG
TATTGGTTCGTGTTTTCTTTCAACAAAAAAGACATGTGTGAATGAAGtat
taaatatttcaagaaCTGAATACAATGAAACTGAAGTTGATTGTCCTACA
ATAGTAATTCCCACAGGTGCACCAAACAAAGGGGACCCAGGTAGTGATGA
TGAAGAGCTTTACAAATACATGTTGATTCCTGTGGGAGCTGTTTGTCTTA
TCATCGGCGTCGCTTTGGGTTGCATGGGTCATCGATATCAGAATGTCAAG
AATCGATGCAAGAATAATAACGTGTCACCAGAGATGAACCACAACAATGG
ACGCAACAGAGGTGGTGTAGCTAATCCTTCTTACACGCCAGATTCCGTCA
TTATAAACGATACCCCTGAAATGATCCGAAATGGTGGAATTTAAATGGGT
TATCATACTTACAAATTAATAATATGTATAATATGTTTGCTATTATGTTT
TGAATGGTGTTGTGTTGAGGGACTTGCTGTCATATGGGATCCTTATCACC
CATTattcTCATGCAAGGATCCTGTCGTAAATGTGAAAGAAACTGATTTG
TTGAAATTTGTATGCCCAGATAAAGATATCTCGTCCAAACCAAATGCACA
TTCTTCAACCCTTCATGAAGTAGCTTATCTTCTAGACTACACAAAAGAAC
AAGATTATGCAAATTGCGATGCTAGAGATCATCTATCTGTATTACTAAAC
TGTACAGCCGCATATAGAACTACACAACATCGCATCACTCAAAATGCTCT
TTCACCTGATGCACCCTCTTTCACACCTGGAAAGACATATTATGTGATAG
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