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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00007265 ID=TCONS_00007265|Name=TCONS_00007265|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3813bp
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TCACTGGACTTGTTAATCTTTTAGACTCCCATGCAAAGTTATTAAAGGGG
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TGGGGAATTTCGT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000075:503403..509412+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00007265 ID=TCONS_00007265|Name=TCONS_00007265|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6010bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000075:503403..509412+ (Clytia hemisphaerica)
AATGTTATTGTTGAGCTTGTTTGCTTTATCGTTAACAggtatgtgttttt
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GAAAACTACATTTTTCTTATTTGCAATGAATGGTCCTTCCTTTAAATATT
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TTTCATGAGAGGCAACTGcatttgattggttcgaaaaagtagataggatt
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AAGTGTTCATATCTCAATCGACCGGTATTGATTCACTCAACTGTGGTACA
TCACAATTGCCATGCAAAAGCATTGAATTTGCCTTAAAGAAAGATGATCA
AATCTCCGTACTATCTTTAATGGAATCTTACCGTTCGATTGGTCCAATTG
CAATTTCGggaaatcaaattttgattcGACGCGCTACTCAAGTTAAAAGC
CCAATAACACTTTCCTTTAACGGTATAAGTTTATTCAACTATGAAAACAC
TACTACTAACAGCAGTCTTCGATTTTCATTCCAAAACTTAGAATTAAACA
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GCCTCCTCCTCGAACATGGACTTGAATTACATCAATTTCGTGGACAATCG
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TTACAAAATCCTAATAACACGGCGTATATTGTTAAATGCCCACCAAGCTA
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TACTATGTATACCTTGCTCACGTGGGACATATACGTTGGCACGTGGTTCT
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GTACTGCTTGTCCGGCAGGAGGAAATTGCACCTTTGGTATTAAAAGCCAG
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TTCGAATAATGAATGCACTGCTGTTAAGATGAGACGATTCTGGCTTGTTT
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AAACACCTGGTTCGATTAATTACAATGGTCATCAAATTATCAACGACTGT
CTAGCAGAGCCTGAAAAACCAAGACGTTTTATTTTCTCCGCGGTTCTACA
AATCACCTTAGCATTTTTCCAGATCGTTAGTTTAATCAAGTTACGTAACC
AATCGAATACGAGTAAAACCATGACCCGAATCTTCGACTTGTTCAATTTA
CAGATCGCGTTAGATGAAGCTGAAATTGTATGTCCATTTGAATCTATGAA
TGTTGTTTGgaaatatttcatcaaaaatgttcttttcaTCATCTGTATGG
TCATGTTTCTCATCATCGCTACCCTCATCAACCAATTCATCCGATTATTC
AAATGTAAAAGTATATGCAAATCGAaaagttttgaatatttttcaccACC
AGAACATCAACGTCTAAACTTTTTGGATAAACTTGTGGTTTGTTATACCA
AAGTTCTTGCGTTTGGGTACAAGAACATTTCATTATTTGCTATCATTTCG
TTAAATTGTGTTGAAGTGAACTCAGAATCTGTACTTTACATCTCAGGTAA
TATCAAATGCTTTCAAGGATGGCAGTATGCTGTCGCTTTACTACTGTTCC
TATGGATTATTCCCTTCCCAGCGGCTCTTGTTTATTCATATAAGCTATTC
GATCGAGGCTTAATTAgcgagaaaatgtttttgttgagCTTATGCTTTCC
GGCTCTTTCCGTatactttttcatcaaatacCGGAACAGTCATGACGGAC
GCTTCATAGAGCGACATGGACTAAAGGCTGTCTTGTACGATATATTTGAA
GAGCCATACCGGGTTATTTCCGTAAACGAATTCGGTGTACCGGCCACAAT
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TAGTGAACTTCTTTATTGAGCCGTTGCTTCGAATGTGTGTCATAGCCCCT
ATTATGATATTCCTATTGATGTTACACTATCATGTCAGACCGTATAAAGA
GACAATGACTCTACTATCGTGGCTTGATATTTCGTCATTCGCCTGTTTGT
CGTTTTACGTCGTTGATAACATGTTCCGGTCGTTTGCTTACATTTTTGAT
ATACCGTTGAAAAACCAAATTGCGAAAGCTTTGACAGTGTTGGAAATTTT
CGAAGCGATTTTAACACCTTTGACTGTCATTTGTATCTTTATTGTGACTT
TTGGCTTTGAAGCTGTTTATGAATTCACTAggaatttggccaaaaaaact
acgtgattttgttttaaaataatttagttTTTGGTGAACTATCTATAATT
CGCTTTCTAGTATTCTCTTACTCTTTAAATACTTTAACGATACAAACTGG
GGAATTTCGT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00007265-exon-sc0000075-1491911889:503403..503440 | TCONS_00007265-exon-sc0000075-1491911889:503403..503440 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00007265-exon-sc0000075-1510915933:503403..503440 | TCONS_00007265-exon-sc0000075-1510915933:503403..503440 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00007265-exon-sc0000075-1575043694:503403..503440 | TCONS_00007265-exon-sc0000075-1575043694:503403..503440 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00007265-exon-sc0000075-1491911889:505638..509412 | TCONS_00007265-exon-sc0000075-1491911889:505638..509412 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00007265-exon-sc0000075-1510915933:505638..509412 | TCONS_00007265-exon-sc0000075-1510915933:505638..509412 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00007265-exon-sc0000075-1575043694:505638..509412 | TCONS_00007265-exon-sc0000075-1575043694:505638..509412 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000075 | supercontig | sc0000075:503403..509412 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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