TCONS_00009520 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00009520
Unique Name	TCONS_00009520
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2565

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000095:326392..336299-

transcript sequence

>TCONS_00009520 ID=TCONS_00009520|Name=TCONS_00009520|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2565bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000095:326392..336299-

Legend: exon

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>TCONS_00009520 ID=TCONS_00009520|Name=TCONS_00009520|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9908bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095:326392..336299- (Clytia hemisphaerica)
GTGTATTTCGATCACGTGAACAACATAAACATAACATGGTAGCCGTAGTG
GCGAGAAAAAAATTTACGGAGGGTTTCGGTTGTTCGAAGAGAGAGGAAGT
TGTTTACTCAGAAACGAAACTGTTCAGTTTAGTAAACCAAACATTTTCAA
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CTCATGACGTCACCCGCGCGGAAAATTACACACTCGTAATTTGTTACATA
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TAAAATGTCCTATGCCTATGTCTGTTTAAAACTATTCATTACAAGTTCTC
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GAGTTAAGCTGTATATAATCTGTGATGTCACTTGTTGGAATTTACTTTTT
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CATGTACCTTTTTGACAATAACAATGGTTTGTTTATGCAGGTTACTGTAG
TTTTTGAAAAATCGTTCACCAAACTTATTTAGTTTTTTTAGAATGTGCAG
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GTCTATTCAGATTGCAGTATTGTGTCTCATACTATTACTAATCTTAGTTA
TTAAAGATTTTGAAATTATTTTAATTGATTTTTATAATCAAGTTTTTCTA
CGTAAATATTGATAAATGCTTTTTACTCGTGTACTTTTTTAAGCAAACAT
GGCAACCTACAATCGTTTGGAAATTCACACGAGTTAAAATAATCATTGTC
AGAACAGTCAATTAGATTTTGCTCACAAACACAATGGATGTACTAGTTTA
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TTGACTGACAGTGACTATCATTATTTTTCTCCTTTGTTCTAGTTTCTTCA
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ATGCGGACCCTGATGATGAAGTTGAAAGTCAGGATGAACAGGAAGAAAGT
CTCACAAAAGATCAATTAATGCAAGTCTTGGATGTCATAAAGAAAGAAGC
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TCAGTTGAATTTGATAATAGTATAGAAAAAGAAAATGAACTTATAAATAA
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CCAATACCAATCCACCGAAGCCTGCACATATTAAACAGGAGAATGTGGTC
AGTACAAAGCAAAATAAAGCTGGATTGGACCACGTGTCTTTCATTGGTAA
GAAACTTTTACGTTTTTTGTTTTTTTGATGAAGATTCTATAGAAGTCTTT
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TTGCTTTGTATAATCATGATACGGGACTCATAATCTAAGACAATTTTAAA
TCTTTTGATGGGTGAATATCAATGATTTACTTTTCTGGGCCATTCGGTTC
AATTGAACAACCCTACGCTCGCTCATGTTAAGGCTCTCTCTAATAAAATA
TTTTATTTCATTTATTTATCTTATTATTCTCTTTCATTTTTCATTTTCTT
TCTTTATTTTGATTAACAGCAGGTCCTTAATTGAACTCTACTTTTTCCCC
TCTCTTTCTTCTTAGAAATTTTCACAAACAGAATGAATTTCTGGAACGAA
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TTTCTTACTGGTCTAAGGTGAAGAGGAAAGAACAGTTTCTCTAGCTCCCT
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TTTCTTTTTCGTTATTGTTTTTCTTTTTCTCTTAAATGCTGTGATTCCTC
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GCTACTCTTTTTATATCTTCTACCTTATGCCTATCTACCTATTACTGTGC
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TTTTTAAATAAGAGTGATATCGTTTGCTTACTCATCAATTCTAATTTACA
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GCAGACACTGTCCTAATATGAAATATGTGTCTGATATGAAACGGGAACAC
TTGTGTAAAAATAAAACCTTTAAGAGGGATTTTAAAAATTTTATCTTCGT
AACCCTTTAAAACTTGAAAATTGTTGATACATATTCTTCAACAAAAAGTA
AACATAAAAAGTAGGAGGGACTTTGTCCGAAATCTTTCCTTTTAAAATGT
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ATTTTAAGACTCAAGCGATTTATTTTGATTTTGTTAGATTATAATAACTT
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GCTCTGAGAGGGGAAAACAGGCTGCCTTTTTTGTCTTAACCTCCGGTGAA
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TTTGATTTTCTAGATACGCTTATAAGCTATAAGCGTCATGCTTCAAAAAA
CGTTCACCCCCGTTCATTTTAGCTTTTAGTGTATTTTAAGGACCTGATTT
TTAAAAGATTGACTCTATTTACTACATTTTAAGCGAAATTCTTTAATCGG
CTTCAAACATTAGATTTCTTTCTAGATTACTTTCTTTTCTTATTTTTACA
GCTGTAGTAGCAGGATGCTGTGTAGCAGCGATCGCAGGATTGGGTCTTGC
AGCTTACTGCTGGTACAAGTAAGTACTTTTTATCAGAGCTATTGTATTTG
CATCGAAAAATCCCCCTTCTTTTGAACGCCCCTCCTTCAAAATTAAAATT
ATTTCACCCCTCTAGGGGGGCTGGTGTTTATTTGAAATAAGTAGCAATTA
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ATAAACGCCCCTTCTAAAAACCAAAGACTTCAACAATTCATCCGTAGCAT
TTATAGCACGAAGAAAGTTTACTTATGAATTAACTTTACCCTTACCCTCA
TTGGGCCAGGACACTTTTTCTCATAAATGAAACCTTGGCCAACGTTCCGG
TTTCTGTTCTGCAACCATCATTTTCCACACAATTTTTCTTCATTTTTATT
TCAGATTGAGAGTAGAGACAAAGGAAGATGTGGAAGACCCAAAAACTGTC
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ATTTCTCTACATTCCACCTTTTCGGCTACTGTTTTACTAAATTCGAGGAT
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CCTATTTCAATGACTCTGATAAAAGTTACGTAAAACTGATATAATTCATT
TGTATTATGTTGTTTTGGATTTAGTATAACTTTGGATATTATACATTGTA
CATTTTATTGGGGGTAATCTTTTATGTGAGAAGAGAAATTCTTATAAGAA
TATTGTCCCGTTCTTCTAAACTTCAGCCATTATCGAAAGATGAGGAGATG
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GTTCCCTCTGGGACTCCTTAACCATATGACTGGTCTTTATTGCCTTTGAA
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GTTATGCTCACTTTTATTTTGTATTTTGTCTGTGCGACCAAGAAAAGTTA
ACTTTTTGACTCCGTCTTTCGATTCCTAATATAAACTGACGACATCTGAT
AGAAACGCCATTTATTTCTCTCTTTTTTGCTTAGGGGCGATGCTAAGACT
GATGAGCGTGTCTTTTATTCCCTTAGACCGATCGGTTCTGATAAATTTGG
GACGATTGGAGGTGCAGAGACAACTGATGATGAAGATGATGATGATGATA
ATACGGTTTATGAATGCCCTGGACCCGGCGCTGTAAGTTATTTAAACGAT
ACAGTTAATTCCCTCTCTATTCTGAGCCTCTATTTCTGTAATTCGAACCA
AAACATTGGCCGACTCAAGCTGGAAAGTAGTGTTAAATACTCTCTGTACT
TTGAATTTTTCTCAAATTCGAATAAAAATTTCATGGTCCATTGAAGATCG
AATTAGAGAGAGTCAATTGTACTTTCTTTTTTTCCTATGAGGTATAGAAT
ACAGGGGTTTTCATTTGACCAGTTTATCTTAACTTTATGCTTGGGCGTAG
CAATACTCCTCCCTGTTGTTTGTTTTCTTCGTTCTGTTTTTCCCCGCTAT
TTTTTAATCGTCTTGCAGGCTGGGAATAATCTTGGAACTCGTGAAATATT
TATCGTATTTCGATAACTATAATATAATAGTTCTCTGTTTATTTTTAGTC
TGGAGATATGAAAATTGTCAACCCGATGTTCAGTGATGGTGAGAGTCGTC
ATAGTGACAAGACAAGCCATGATGGCTCCCCAACACCGCCAAACGAGCGA
GTTGAAGCCGTTACAAATAATAACAATAATCAGTAGTAAGATAATAAGAA
CAATAACATCGCAAATTTATAGTCCCATAGTGGCGCATAACGTCAGTTGA
ATGTTATCTGAACGTTTAAAGAACGTTGTGTGCTAACTCGGTAAGCTCTC
AGTTATCCGATTCTTTGTAGCTACAATTTTTGAAATATTTGATATTCTTT
TTAATATAAGTTTCCAACCACGATTCCAGTGTCTATACACGATTGAACCA
CTTCTATGGTTCTATCAAATGGTGCATGGGCTGCACACTCGTAGGACCCT
AATTGTCAGAAACTAGCGTGACGTAATGTACCCGGTCCTCTGGAATACCT
CTGCCGCTCATTCGATAACTGAGAATCTGCCTTGTACACTTTTTTTGTTT
CTATCATCTTTTAGGGGTTAAATTTATGTTTTAAAGGATCTATGTTCTGA
AAGGTGTCTTTTTAAAATATTCACGGACTTTCTCCTAAAGATCTGTAGAA
TGTCAGATACTTTACGTATGGTACCTTTCTAAGTTTTTACAATTATTTTA
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TATCCTAGCTAAAACAGTACCCAATTTAGACTCATTTCAAGATCTTTGAG
TTGCTTTTGCCAAGTTTTAGTTTCTTTCTGTTTGTTCAATGTTAGCTTGG
TAGTGTCACAAATCAGACTTTTACTAAGACTTCTTCCTTCCTTTTTTGGC
TTAGAATTTTAGATGTTTTATTTTTATATATTAATATAGCTTTATTAAAG
ATAGATGTTTTTATTTTTCCTTGGAATTTATTTTGTATTTAACTTAAATC
TATGCACTACTAATAAGTTTTTTTCTCTATTCATGCCTTCAGAAACCAAT
CAATTAATCTGAAAACGACATTAATTACCTGCGAAATTTCTCCGAGAACT
AAACTATTTTTTCCTTCTTTCGATTCGATTTCGGAATGTTCTTAGACAAA
ATTCACACAAAGGAATCGGGTCCTCCTGGTTGGGGTTGATCACTAACCAA
GCAAAGAATATACTGATTGAAGTAATAATTATAGGTGTGCTTCCATTTTA
TTATTGCTTACTTTTTTGTATCATTTTGCGGATAAATTATGTTATGATAG
AATTTTAATTATTGGAAGGTAAAATCTAAAATAATGGGAAAAAATTAAAC
AAAATCAT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_005314	XLOC_005314	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000095	supercontig	sc0000095:326392..336299 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
5.92494	5.48267	1.7732	1.10093	13.8787	13.6715	56.5879	61.2963	159.534	117.527	124.762	141.801	76.1249	71.7367	57.7437	43.3717	37.6259	48.5594	87.9869	104.712	86.9128	93.8367	63.6845	75.3543	64.0617	73.633	70.702	73.0795	67.748	71.1529

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00009520 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00009520 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00009520 (transcript) - C. hemisphaerica