XLOC_005314 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_005314
Unique NameXLOC_005314
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000095:326392..336299-

Legend: transcript
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_005314 ID=XLOC_005314|Name=XLOC_005314|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9908bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095:326392..336299- (Clytia hemisphaerica)
GTGTATTTCGATCACGTGAACAACATAAACATAACATGGTAGCCGTAGTG GCGAGAAAAAAATTTACGGAGGGTTTCGGTTGTTCGAAGAGAGAGGAAGT TGTTTACTCAGAAACGAAACTGTTCAGTTTAGTAAACCAAACATTTTCAA ACTTGTTAAAGTTTACACATAAAATGTAGAGACGAAGTCAATGAAGCCTT TACGTTTATTTCCAATAATATTTGTGGTGCTGTTTGCATTTTTTGCAGAA GGTAACTCTTTTTGTATGTCTTTGCTTTTTCCACCTACTAAAGTTAAAGA CTAAGTGCGCAGTCATAAGAGGTAATTTGGTGGCTGTTTGGACTGTACTG TAGTGCATTTGAATTGTTATTTGTTGAGCAATTTATATGTTAGAGTTTGT GAAAGAAACTTAGGCTTTTCATAGTGCAGTGACTAAATACTATAAAATTT TGGCAGCTTCCTGACACCTGATGTCAGAGAATGGCTTGTGTTATGAATAA CCCACAGTACTTGGCTATTTTGAACTTTAAAAAATCCCGCACCTGGCTTG TGCAGGTTCGGGTGTGTTTTGGTCAGGTTTTCGAGAGCAAAAATCCAAAG TTTTACAGCCTGATCATCAATTATTGTTAAGGCTAAATTTTCATGTTTTG CTATTTTGGCCCGAACATGACCCGTAAAATGTTCAGGTATGTTCAGGATA TCATGGGTTTTGTTATAATGGTAGATGTTCCATCCAATCATTGGGTATAT GACCCTGTTGGTGCACACCGGCCAGTCTGATCTGGTGCCGTTGACAAAAG GTATTCTTGGACTTCAGACATCATGTACACATTTTCGGGTGTTGAAGAGT ATTTGTGCAGTCCAGTTTACTGTGCGATTTTTGTAAAAAATTGCCATAGG GAACAAAACAAAATAGTCAAAGATCAAAGAAGTTTACCGTTTACTTCAAT TGCAATTGATAACAAGTTGTGGGGCTTTCAAAGTTTTTATATGAATGGGG GCTTTCATGAGTTAAATCTTGGTACCTACTATTTTCAACTTTCTTCCAAC TTGCCTTCCTTGAAAATAAAGAAGAAGAAATTGACAACATCACAATGGAG CTCATGACGTCACCCGCGCGGAAAATTACACACTCGTAATTTGTTACATA ATTTTTGGGTCATATTCGGGCCAAAACATTGTGATTGAGTCAAGTTTAGG GCTACAAAACTTTAGATTTTGACCTCCAAAAACCTGGCCTGAACATGGCC AGACCAGGTTCAGGTCATATTGAATTCATAATAAATTAGCGGTTAAAACA TTACATATAATGACTCCAATGAAACCTAATTTATCTAAATGAGTTTCATA AAAAAGAGTGCTCACACATCCTGCTTAAAAGTACACATATATGTAATCAT GTCTGTGAATGTAAGATACAGTAGCCTAATGTCTGTGTTTGTGCTTTCAT TCGCGAAAGTTTATGTTCGCAAAAAATGATTTTTTTGTCAAATTTGCAAA AGTAAAAATGTTGTAAATTTTGCAATATTTCAACCTTGCAAAGTTTCTGC TCACAGAAGTTTGTAAGCCTAAAGTACAAAAAGAATACCATAAATATAGA CCTTTTGCTAGTTAGGATGTCATGTTGATTAATTAAAAACTGAAGCATCA TAACAATGATAAGAAATAATAACTGAAACACACTTTGAAATGATTAAAAT GCATTTATGTGTCATTGTTTTAATGCTGAAGATTTGGTGCAAAAAAGTGA AACATGGAACATTTTTTACTGTATTGGCTCCAAATTGAAATGGGCGATTT GGGAAAAGTTCTGTTTGTCTTTTGTACAAACCTCTGTAACAATGGGCGAG CACCCTGTTGCTAAGATGTTGGTTTTGAATAGAAAACGAAACCACTGAAA ACAATAATAAAGTAAGGTTCCCTGAAATCTCCTAATCCAGGGATCAGAGT TTTAGTCCAAGCTGACAGGTTATCTCAGTGTCTGGCCGGTGCATCAACAG GGTATATGACTAGGTGTGGTTGGAGGTGTCATATCTATCTATTTCAGTGC TAAAATGTCCTATGCCTATGTCTGTTTAAAACTATTCATTACAAGTTCTC CCGTTTCATAAATTCCAAGTTTAAGACCTTGAAATTTTAATCATGCTAAA TTTTGATAAGCGTATACATTTAGAATTTTCGACATGTGGACTTTATTTAC AGCTTTATAATTTTGTTAAATCTTGTACGTATTTTCAAAATAACCTAGCT AAAAAAGCAACATTTCCAAGGGTCTTGAAATAAGATCGGTACTTATAATA AAAAGATACTAAATATGAAGTTACTTTACACTTTTTACAAAATTTTTGAA GGCTTCAGGATGTTCTTAACTGTTTGAATTTTAAGCCTGAAAATATTCTT AACCATTTTCTTATGTTCACCATTTTGTGAGTATTTTTGTCCATAGATGT TTTAGGGTCGCCTTGAAGTCTCCTGTTTATTGAGTTAAAGTTAATTATAA ATTCACCTGAGATACCACCTGTTCACTAGAATTAGAAACCAAGTGAATTT TCAAGTACATAAAAATCCTTTCAAGTTATACTGGCAAATTTATCGGCATC TTACCAGCAAAACTCCTCGACAGCAATCTCTCAATTGAAACTGCTAATTA GCGGATGTAGACAGTTTGCCAGCAACCATTCTGTAAATTCTTCTTTTTAG AAAAGGATGACTTACAGGGAAACTTTTGCTAGAAACGAAGAAAAAAATCA CTGTTTTGTCAGCACTTCTTTCACCATATGTTATTAGCCAGCAACTTGCT GGTTGCTGTATAATTACATTTACATTTTGTGTCTTTTGAATGGCTTACTA TTACCTGGTCATAAAATTGTTTTTGTATCTGAGATTTTAGTATTGAATCT ATTTGATTGATAAAGATGCATTTGATTATTCAATTTAGTGAGGTTTCCAG CTCTTAAAAACTAGTAAGGGGATTGATTTATTAAAGGGTCTGCAATAATA ACAAGCTATAAAGTAATCACAAGTTTCTTATTCCTTTGTATCTTTAAAGT GTCATTGATAGCTTGCTCTGAATTCAATGTTGATGTTCAATGATGTTCAA ATCAATGCTTATAAGCTTTTTATTTATCCTTAAAAGGATAAATTTTACTC AATTTGGAATTGGCAGATTAATCATAAATATAGACATAAAAGCATTATAG AAATCAAAAAGGCAGAATAGAATACCAAAGCCTAGAAACAGTCGATCCAG GAGTTAAGCTGTATATAATCTGTGATGTCACTTGTTGGAATTTACTTTTT CCACCCATTTATAAACAGGATATTGTCTCCTACCACTCTTTTGATGTATC CACTTCAGAAAAAGGGGTATGAGGCCTCAGCAGCCTTTAGTGGGTTTTCT CATGTACCTTTTTGACAATAACAATGGTTTGTTTATGCAGGTTACTGTAG TTTTTGAAAAATCGTTCACCAAACTTATTTAGTTTTTTTAGAATGTGCAG GTATAAGTGCGAGTTAAAAATTACTAAAGTTTCTTGTTTAACTGGTTTTT GTCTATTCAGATTGCAGTATTGTGTCTCATACTATTACTAATCTTAGTTA TTAAAGATTTTGAAATTATTTTAATTGATTTTTATAATCAAGTTTTTCTA CGTAAATATTGATAAATGCTTTTTACTCGTGTACTTTTTTAAGCAAACAT GGCAACCTACAATCGTTTGGAAATTCACACGAGTTAAAATAATCATTGTC AGAACAGTCAATTAGATTTTGCTCACAAACACAATGGATGTACTAGTTTA CTAACAAACTAGCTTTCTGAAGAACTTTTATGAAGATAAGAAATATAGCA AGCTTGCTTTGTTTGTTGATCATTAAAATCCTTGAATTAGCTCAATATTT TTGACTGACAGTGACTATCATTATTTTTCTCCTTTGTTCTAGTTTCTTCA GAGAGCCGGCATTTGTCGGGTCATGATGATCTTTTTGAAGATGCCATTCT TGAACATTTGAGGGATATCCGTGACGAAGAGGAAGAAAATGAACCTTACT ATGCGGACCCTGATGATGAAGTTGAAAGTCAGGATGAACAGGAAGAAAGT CTCACAAAAGATCAATTAATGCAAGTCTTGGATGTCATAAAGAAAGAAGC CCACAAAAGACAACTGGAACGATTACAATCTGAAAAGGAACTCACAACCG AAACACAAGATGATAAAAATGATAAAAATCTAAACATAGATTCTAAGGAT AAAAAAGACTCAATGAGTAAATCACCTTCTAACAAGGACTCTGAGATAAA GAAAGATGAGTTGGCGCTGAATGTAAACAAAAGGGCTGACAGCGTCAACA CTAATGCTGAACCGGTCAAAGTCAAACGCCAGGAAAACGATCAAGTTGCA TCAGTTGAATTTGATAATAGTATAGAAAAAGAAAATGAACTTATAAATAA TATCGACCTTCGAGATGTATTAGGTGCAAAAGATGAGGGGGATGAATCTA CCAATACCAATCCACCGAAGCCTGCACATATTAAACAGGAGAATGTGGTC AGTACAAAGCAAAATAAAGCTGGATTGGACCACGTGTCTTTCATTGGTAA GAAACTTTTACGTTTTTTGTTTTTTTGATGAAGATTCTATAGAAGTCTTT ATCCTGGGGATGTTCTCAGACTTTGACTTTGTGGCCCTGATTTTCGATAT TTTATTAATAATAAGGCTTCAATAAGGCCCATATAAAAAATATCTTAAAA TTGCTTTGTATAATCATGATACGGGACTCATAATCTAAGACAATTTTAAA TCTTTTGATGGGTGAATATCAATGATTTACTTTTCTGGGCCATTCGGTTC AATTGAACAACCCTACGCTCGCTCATGTTAAGGCTCTCTCTAATAAAATA TTTTATTTCATTTATTTATCTTATTATTCTCTTTCATTTTTCATTTTCTT TCTTTATTTTGATTAACAGCAGGTCCTTAATTGAACTCTACTTTTTCCCC TCTCTTTCTTCTTAGAAATTTTCACAAACAGAATGAATTTCTGGAACGAA TTCTCTTTTTTTTCAATTTCTCTGATAAATATTTTAACAGGAATAACCTT TTTCTTACTGGTCTAAGGTGAAGAGGAAAGAACAGTTTCTCTAGCTCCCT CATGAGATATTTCTTTAAAACCCAGATAACTTGATACAAAAGTAGCTCTG TAGCTATGCAAAAAAGCATAATACCCCCTACAAAAATGACAGCTATTTTA AATATATCACTTTGAATTACACCTTTTTAAACCATTTACATGGGTTTCTT TTTCTTTTTCGTTATTGTTTTTCTTTTTCTCTTAAATGCTGTGATTCCTC TTATGTTATAAAACACCTTTTTGCCATATTTTTTTCTTTAAACCTAACCT TATGAGAATATCAGAATTCCTGCTTGTGTATTCTTATTCCCCACCTGCCT GCTACTCTTTTTATATCTTCTACCTTATGCCTATCTACCTATTACTGTGC CTCTTAAAAGTAGTTTTACATATGTATATCTTAGTCTTTTTAGACTTTTA TTTTTAAATAAGAGTGATATCGTTTGCTTACTCATCAATTCTAATTTACA AGCTTTTTCACATTGGATTGACACGGATGTGGAGCAACATTGGTCAAAAA GAGGAAAAAATAAACATTTTTTTGCTTATATCAGCAAAATATAACAATAG GCAGACACTGTCCTAATATGAAATATGTGTCTGATATGAAACGGGAACAC TTGTGTAAAAATAAAACCTTTAAGAGGGATTTTAAAAATTTTATCTTCGT AACCCTTTAAAACTTGAAAATTGTTGATACATATTCTTCAACAAAAAGTA AACATAAAAAGTAGGAGGGACTTTGTCCGAAATCTTTCCTTTTAAAATGT AATATATTAAATAAGTCTCAAATACATCAGGTTTCTTTGAAATAAGAGTG AACTTTTTCAAAAGGTTTTTTATGTCAAATACTCCATTTTGTTAAATAAT TTGAACATCATAATTATTCAATATTTCGAAATGAAACTTCCATAAGGAAG TCCTCTCTCTCTCTCTGTTGGACAAAACGAGCTCTCGTTAATATAAATCA ACCGAATAATTATACTTAAGCAATATCCAAGGACGCCAATTAGATCTTGT TATTTTATTATTAAGATTCCCCTAGGTGCCATTAGAGGGCTAACGCCCCT TAAGAGCTCTTAAAAAAATAGAACATTAGGGGGCACAATCCATTTGACCG ATTTTAAGACTCAAGCGATTTATTTTGATTTTGTTAGATTATAATAACTT TTGGCAGATGTAATTGAGAAACTAAGCGGCCCAAACAATCCCACCAAACT GCTCTGAGAGGGGAAAACAGGCTGCCTTTTTTGTCTTAACCTCCGGTGAA TTAAAAAAAGTGCGTTGCCCATATTTTAAAGTTCTCAAGCCTCTTCTTGC TTCAAGAAAATCAAGGTCAACGAAGCCAAAACCTCCGTGATATATTTGAC ATATAAAAGGGAATGCAAAGCTGTAATTTTTCTTGTACTGGAAGTTGATT TTTGATTTTCTAGATACGCTTATAAGCTATAAGCGTCATGCTTCAAAAAA CGTTCACCCCCGTTCATTTTAGCTTTTAGTGTATTTTAAGGACCTGATTT TTAAAAGATTGACTCTATTTACTACATTTTAAGCGAAATTCTTTAATCGG CTTCAAACATTAGATTTCTTTCTAGATTACTTTCTTTTCTTATTTTTACA GCTGTAGTAGCAGGATGCTGTGTAGCAGCGATCGCAGGATTGGGTCTTGC AGCTTACTGCTGGTACAAGTAAGTACTTTTTATCAGAGCTATTGTATTTG CATCGAAAAATCCCCCTTCTTTTGAACGCCCCTCCTTCAAAATTAAAATT ATTTCACCCCTCTAGGGGGGCTGGTGTTTATTTGAAATAAGTAGCAATTA ACTTTATTAAAATAGCCTTGGTCAGAAATTATTTGATAAATACCTCCTTT ATAAACGCCCCTTCTAAAAACCAAAGACTTCAACAATTCATCCGTAGCAT TTATAGCACGAAGAAAGTTTACTTATGAATTAACTTTACCCTTACCCTCA TTGGGCCAGGACACTTTTTCTCATAAATGAAACCTTGGCCAACGTTCCGG TTTCTGTTCTGCAACCATCATTTTCCACACAATTTTTCTTCATTTTTATT TCAGATTGAGAGTAGAGACAAAGGAAGATGTGGAAGACCCAAAAACTGTC AAAAAATCTTCACTCAAGAAAAGCAAAGACCCTAAAGAAGAACAAGTAAT ATTTCTCTACATTCCACCTTTTCGGCTACTGTTTTACTAAATTCGAGGAT ATTCTTTCAAGTTAAAAGACATTAAAAATAAACAACACCAATAGAACCAG CCTATTTCAATGACTCTGATAAAAGTTACGTAAAACTGATATAATTCATT TGTATTATGTTGTTTTGGATTTAGTATAACTTTGGATATTATACATTGTA CATTTTATTGGGGGTAATCTTTTATGTGAGAAGAGAAATTCTTATAAGAA TATTGTCCCGTTCTTCTAAACTTCAGCCATTATCGAAAGATGAGGAGATG AACAGGAATGCTGAATATTACAATTACCAACATGCTAAAAACCAAATCAA ACAACTTGGACAGTAAGTTTTATACCCTTCTGCCTTGGTGTACGGATATA TTTAATACACTTAGTTAGTATGCATTTATTCGAACTAGGTTTCTATTGCA TTTCACTGGCTCCCCCGACTGGCTCCGCATAGCTCCGTTATATAAAATCA GTTCCCTCTGGGACTCCTTAACCATATGACTGGTCTTTATTGCCTTTGAA CTTTAACTCTGTTAGCCGCAGAATTCATTAACAAACAAGCTCTGGCGAAG GTTATGCTCACTTTTATTTTGTATTTTGTCTGTGCGACCAAGAAAAGTTA ACTTTTTGACTCCGTCTTTCGATTCCTAATATAAACTGACGACATCTGAT AGAAACGCCATTTATTTCTCTCTTTTTTGCTTAGGGGCGATGCTAAGACT GATGAGCGTGTCTTTTATTCCCTTAGACCGATCGGTTCTGATAAATTTGG GACGATTGGAGGTGCAGAGACAACTGATGATGAAGATGATGATGATGATA ATACGGTTTATGAATGCCCTGGACCCGGCGCTGTAAGTTATTTAAACGAT ACAGTTAATTCCCTCTCTATTCTGAGCCTCTATTTCTGTAATTCGAACCA AAACATTGGCCGACTCAAGCTGGAAAGTAGTGTTAAATACTCTCTGTACT TTGAATTTTTCTCAAATTCGAATAAAAATTTCATGGTCCATTGAAGATCG AATTAGAGAGAGTCAATTGTACTTTCTTTTTTTCCTATGAGGTATAGAAT ACAGGGGTTTTCATTTGACCAGTTTATCTTAACTTTATGCTTGGGCGTAG CAATACTCCTCCCTGTTGTTTGTTTTCTTCGTTCTGTTTTTCCCCGCTAT TTTTTAATCGTCTTGCAGGCTGGGAATAATCTTGGAACTCGTGAAATATT TATCGTATTTCGATAACTATAATATAATAGTTCTCTGTTTATTTTTAGTC TGGAGATATGAAAATTGTCAACCCGATGTTCAGTGATGGTGAGAGTCGTC ATAGTGACAAGACAAGCCATGATGGCTCCCCAACACCGCCAAACGAGCGA GTTGAAGCCGTTACAAATAATAACAATAATCAGTAGTAAGATAATAAGAA CAATAACATCGCAAATTTATAGTCCCATAGTGGCGCATAACGTCAGTTGA ATGTTATCTGAACGTTTAAAGAACGTTGTGTGCTAACTCGGTAAGCTCTC AGTTATCCGATTCTTTGTAGCTACAATTTTTGAAATATTTGATATTCTTT TTAATATAAGTTTCCAACCACGATTCCAGTGTCTATACACGATTGAACCA CTTCTATGGTTCTATCAAATGGTGCATGGGCTGCACACTCGTAGGACCCT AATTGTCAGAAACTAGCGTGACGTAATGTACCCGGTCCTCTGGAATACCT CTGCCGCTCATTCGATAACTGAGAATCTGCCTTGTACACTTTTTTTGTTT CTATCATCTTTTAGGGGTTAAATTTATGTTTTAAAGGATCTATGTTCTGA AAGGTGTCTTTTTAAAATATTCACGGACTTTCTCCTAAAGATCTGTAGAA TGTCAGATACTTTACGTATGGTACCTTTCTAAGTTTTTACAATTATTTTA AAACTTACTTTAGAATATTCTAGATATTATCTTCATTGATTAAAATGTCA TATCCTAGCTAAAACAGTACCCAATTTAGACTCATTTCAAGATCTTTGAG TTGCTTTTGCCAAGTTTTAGTTTCTTTCTGTTTGTTCAATGTTAGCTTGG TAGTGTCACAAATCAGACTTTTACTAAGACTTCTTCCTTCCTTTTTTGGC TTAGAATTTTAGATGTTTTATTTTTATATATTAATATAGCTTTATTAAAG ATAGATGTTTTTATTTTTCCTTGGAATTTATTTTGTATTTAACTTAAATC TATGCACTACTAATAAGTTTTTTTCTCTATTCATGCCTTCAGAAACCAAT CAATTAATCTGAAAACGACATTAATTACCTGCGAAATTTCTCCGAGAACT AAACTATTTTTTCCTTCTTTCGATTCGATTTCGGAATGTTCTTAGACAAA ATTCACACAAAGGAATCGGGTCCTCCTGGTTGGGGTTGATCACTAACCAA GCAAAGAATATACTGATTGAAGTAATAATTATAGGTGTGCTTCCATTTTA TTATTGCTTACTTTTTTGTATCATTTTGCGGATAAATTATGTTATGATAG AATTTTAATTATTGGAAGGTAAAATCTAAAATAATGGGAAAAAATTAAAC AAAATCAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00009520TCONS_00009520Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00009519TCONS_00009519Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000095supercontigsc0000095:326392..336299 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.27 6.14 1.77 1.1 29.85 22.91 95.45 97.68 209.44 160.08 158.76 176.69 87.55 79.72 67.66 52.43 52.51 64.54 103.59 125.77 100.77 104.19 68.48 86.94 79.59 90.74 83.18 80.24 78.63 82.66