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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00013407 ID=TCONS_00013407|Name=TCONS_00013407|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3368bp AGCGAATGCAATGCACCTTCTTGAAATGTCAGATGCAAGGGTCACTAGGA CTAGAAGGTGGGTGGGCAGATTGACTTGGGAGGGACACAGAGACAgagtt gttttcattttattaggtatttatgattactttttttttcaatatcatga taatCAATAATATAATGTATAAGTATAGTCCGGTGTTTTGTCTGGTGCCA AAAGTATCCCTCTCAGCCACACCAGATCAGAAACCTTTTGTTTGGTGTTA TAGTCCagtgttaatttttcgaagttCTGGATACTGTGTGTTTCAAAATA ATGCTCACCGGACTCAAGTCCACTGTTGCAGAGGTGCCAACTCTAAAGTA GTGCTGAAAAACACTTTTCAAAACActtttcaaagagagaaacttttttg tggcgcacccggtagaaagTTTACACACAGCCTAAATCTGACCTTCAGAC CAGTTCAGACCGATAATTCCtgaaaaattcttataagaGAAATGTGCATT TACAATACAGTAGCTTCAAACTCTTAAAGAGAAATATTAATAAAGATAAT TCTCATACATAATTGTATATGTGAGTATTATCTTCTTTATAGTGGAGGTA AACTGTTTTTCGGTCGTGTTGTTTTTTGTaatcttttaactttttaagcA GACTTACAGTACCtgttaaaatatcaaatttcttttgatagatTTAACTG ACATAAAAATGGCGCAAATTGGCGAGCTCAGCTTAGCTCCTACTCGTGCT CCTGTATGCAGTGGAAGTAGTTGTGAAACAATTGACGCGCTTCACAAGAC GTTTTCCTCATTATCATTGATTGGAAGTTTTGTTGTGTTGGTCTTAATTC TCATCCTAAAAGAATATCACATGGATGCTCAAAAGATGATCTTATTCATG GTCTTGTCAGCTTTCATTGATAGTATTGCTTATTTAATGGGTGACGCTGA AACAACACATGGTGCAACCTGTGAAGCTCAATCATTTCTCATGCAATATT TTGATTGGGCTACGTTATTATGGGTGACGATGATCacaacaaatttgatt ttaatcataaaaaataaacagtcacctaaatattattatatttaCCATGC CGTTGTTTGGCTTGGTGCTTTGTTTTTTGCTATTGTCCCTTTCTTTGAAA ACACATACGGTCATGCAGGACTTTGGTGTTGGATCAAGAGAGAATATACA GGATATAGGTTTGGAACATGGTTCGGACCTCTATTTTTCATATGTTTTGG AATGTGTATCACTCTTGGCTATGTCACCTATTCAGTATATCAGGCTACTC AAGCCCAAACTGGAGTCTCTGTTGCAACCGAAAATATCAACAGAAGCTAT CGAAATGAATTGAAACGACTTGCTTTTTATCCATTGGTTTATATCATTTT GAATATTCCAACCTTAGCTTATCGAATCGAAGATGCTTCACATCCTAATA AGAAACCCAATTATGGCATCTTGGTTGTATCTTCAATATTTGGGCCTTCA GTAGGAGCTGCTAATGCTATCATCTTTGCTACAATCAATTTAGGTTCGAT TCGGAACCTAACATGGCCAATGATCAGAAATAATGTAATATTGTTGTTCA AACGTGAGACGCAAACGCAAATCGAACATAATGTTGTTCTTGAAGAAGGT CCACAAACAAGTGATTCATCAGAGCAATATCAACCGAtgccttgattttt ttttggcaaaatctaATTCAGAACAGTACAGCTTCTGGTTACACGAAAtg ttgttcttatgaaaaaggtCCAGAATCAACTGAAGCCAGTAGGCGATATC AACTGATACCTTGATTTGCTCTGATAAAAACTGGTGATGAACAGTATCTA CACTGAAATGACAGTGTAATCTTAAGATTTATATTATAAAGCTataatca atatattttataattataataaaGGGTAGTCATAGTCAGCAAAACTCTAT TGAAGTTAGAAGTCTATTGAAGTTAGCTCTAGAAACGGTGAATTAGCCCG ATTTTCTACTGAAGGTCTTTCTGATCTTTTTTTCGGACAATAATTGGAAA ACTATTGCCCactaaaaattttgtttcattataagcattttgtttatTTG GCTTATCTGATAATGTTTagtaataaggtccgggggttggaaaattttcg aaaaattaacaagcgggaggccgtttatttggaacctaggACTACcatat ttcataaaatatatCATTTCTGATCATTTTGGTATTCTAACTTTCGCTTT CAAACTTTCGCTTTCAAACTTACAAAAGTACGAAAAGAAAAAGACAGGAA TTTTTAAATGAGAGTAAAATATAAAGtatgacatttttttaaaaatcgaa gaaaatttttcaagtaGGTCCTTCTAAGAATCAACTATTCAGCAAAAAtc ggtctctctaagggtcggttttcggaagtcccgtccgcacatacccctca tccacCAAACCTAGTACTCCCCCGGACATCATTCCATTTCATAAACAATG AAAAGACAATACTTCGCTTCCACTGtaagggacaagctggagtttttaca agctctcgtttgatttggttggtcgttaacctgtaataaaacaattttgt tactttttctaaagaacgcgtcatctctattacttcaaataaccaatcaa ttagtgaagtctcttAAAAAAACTCCAGCCCATCCCCACTGTAACGGGTA TGCAGGTTTATTATTTGACTTGTCACATGTTAACAATCTTAATATTAATA GACAAGTGTCGCTTAGCAATGCACTTTAAGTATTTAATTCAGGACTCAAA ACGTTTATAATTTCCTCTTATAATGATATATTTATTAACATGCAATACGG ACCACTCTTTGAAAGGATCAACCGATTTGATATCTATAGAGTCAAATTAA ACTTTCTAGACATGAGATTTTTATCCTAAAAGGTTAAGAAATGGACCAAA ACTATCCATAAACCCTGCGTTATGTTTTCCTTTTATGCTTTGAAACCATC TTTTTATCCTTGTGCTTTATCCAATTTGGAAAAGCACATTTTCGCACTGA TTTATACCCCTAGAAGttttttatttccaaatttGCTTGTAGATATTCTT CCACtgcattttttattatttataaaataaaaatttttttttataaaact cggtataaatattttcttgcatttttttatattttcatttctagatAATT ATtgcattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattga ttgattgattgattgattgattgattagcATATTATTTCATATTATCCAC GATTTATATTAAATTGAAAAtgtgtatttaaaaaataatttttcagttaa tCGGTAATAATAAGGCag Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000167:54013..57380- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00013407 ID=TCONS_00013407|Name=TCONS_00013407|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3368bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000167:54013..57380- (Clytia hemisphaerica) AGCGAATGCAATGCACCTTCTTGAAATGTCAGATGCAAGGGTCACTAGGA
CTAGAAGGTGGGTGGGCAGATTGACTTGGGAGGGACACAGAGACAGAGTT
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GATTTATATTAAATTGAAAATGTGTATTTAAAAAATAATTTTTCAGTTAA
TCGGTAATAATAAGGCAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00013407-exon-sc0000167-1575043694:54013..57380 | TCONS_00013407-exon-sc0000167-1575043694:54013..57380 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013407-exon-sc0000167-1510915933:54013..57380 | TCONS_00013407-exon-sc0000167-1510915933:54013..57380 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00013407-exon-sc0000167-1491911889:54013..57380 | TCONS_00013407-exon-sc0000167-1491911889:54013..57380 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000167 | supercontig | sc0000167:54013..57380 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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