TCONS_00016035 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00016035
Unique Name	TCONS_00016035
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	5041

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000225:43600..94821+
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transcript sequence

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TACAttccttatttaaaaacaaacaagacAAGATATGTGGAGTTATTGGT
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TTTTGGAGAGAATGCTTAACGCACTTGGTCAAGTCGATCTGtcTTACCAA
GCCATCAATATTCGATTAGTTTTGACCGCTCTGGAAATTCAAACAAAAGA
TCGTttccaacgttcatctaatggtGGTGGAGAGTTATCGAATTATGCTA
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TGGAATGGCGTACGTTGGAGGTGTTTGCAGCAGCTCTATACAATACTCCG
TCAACTTGTGGTCGGCCAATGCGATCAGTGGACCAACAGTCATCCTTGGA
CACGAACTTGGACACAATCTCAACTTCCCACATGATTCGGATCAATGCAA
ATGTTTGACACCAAGAGGATGTTTCATGGGTGGATCAAAatCGAGCCGAC
CAGGGTTCAGCAATTGTTCATTAAGTCGATTGGCTCAAAAAGAATTTGCT
TGTATTGACAATGCTCCTAAAGCTACAATGTTACGTCGATGTGGGAACGG
TATCAAAGACCCTGGAGAAGAATGCGATTGTGGTACCGAGGAGAATTGCA
AGAAAAGCAATGATCATTGCTGTGAACCGAAATCGTGCAAATTGAAAGCG
CACGTGCAGTGTAGTCATTTCAATTACCCAGGATGCTGTTCGGAAACGTG
TTATTATCGTAAGGAGGGTACATTGTGTCGAAATGCTGATGGTAATTGTG
ACGTAGAAGAATATTGTACTGGTGATTCCCCTGCGTGTCCGGCCAATCGT
TACATGAGAAATGGTATAAAGTGCGAAGAAAGTATCAAGATGCTTTTCGG
AACCAAATCGAGATATGGTGAAACAATCAATCAACTTTCACATCAAGTGA
TCGGtagatatttcaaaattgaaacaaaaaaatgggGTGCAGGAAACTGG
GCTTGTTTGAGGATGGAAATGTATGGTTGTCATGCCAACAGAGCCAATGT
ACCTACACCAATTTCAACGGTCGATTTATATTATCACAAACGAATGTGCG
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AATGTTGTTCGACTATAACGCAGATGGATCATTGATTCATCATTGTAGTG
GAAAACGAATTTGTCTCGATCAAAATGGCTTTTTGCAAGTATCTTCTCAA
TGTGGTATCGAAGAATCCAAGTTTGAAAGAACAGAGGCATTGTCGGTCAA
ACAGAACGGTAAATGTTGGCTCGCTGAAAGAAAATGGCCGTTCCCGAATA
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TGGGAAATTACCTGACTCAGCATTTTCCGCAAGTTCTTTTGCTGTTGGCG
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AAAGCAGGTATTGGCGGATGGTTGAAAATCGATTTAGGTAAACAAGTTAA
AATTACAGCGATTGGAATTAGTTCTGGATCATATTGGAATTGGGTTACAG
GCTACCATCTTTATTCATCAGATGATGGTAAACATTGGACACCGTTCAAA
GACTTAAGCGATCAAAATTCAAATGTCAACAATAGCATGTGCTTCAATGG
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AAAGGCTTTGGAACGTGTTCGCCAACAGCTAATACATCTTGTACGACAGA
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ATTATATTGACTATGGAACGCAATATAAGAAAATTGATAGCTCGTCTCAT
ACATGCAGTGCTGCGTCAATAACAGACAGTGAACAAGTTGGACTTGGAAT
GGTTCAAGATGGCACCAAATGCGGTGAAAACAAGTTTTGTATGAACCAAC
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GGTAAAGAATGTAATGGGAAAGGGGTTTGCAGAAATGGTGGTGTCTGTCA
ATGTGAAGGTCTTCTTAATCCATTGACTGGTTGTAAAACAGTCTATTCTC
CCATCGATGGTGGTTTCAGCCAATGGAATGAATGGACCACGTGCACAAAA
GGATGTGGCGGAGGAACACAGTCTCGGTACCGGCATTGTGATCAACCAAC
ACCGAAACATGGTGGCAAAAGCTGTGGTGGTGATTTATTAGAATCAAGAA
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AAAACCGATTGAAAGCCAACATTCGTTCCCAGTCTACTGTGATATGACGT
CAGATGGTGGAGGCTGGACTCTACTCGTTTCATCACACATGAACAATTGG
ACAGAAGCTAATGTTGTTTTGCGGAATCCGCAGACCCCATCTTTGAGTCA
TGATTATTCAATATTGAAACGCGGAGATGCaattaaaagaaattatttga
ttTCAGAACCCAATTTCGAATACAAGATTGAAGCACACACCAGagGACAT
TGGGGTGGTATATGGCGTGCACCTAACTCGTATTCCATAAGCTCATCAAA
CAGTTACCAAACTGACGTCACTTTGTTAAAGAAATTCAATGATTGGCAAT
ACCAGTCTCGCGGCCTACAAGAACGCTTACCATACCTCAATAAACAGCGA
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AGTACTACCAGCCAATTATATCTCTGGTGATCACATGATGGCTATGCCTG
AACACGTCTGGTATTGGATGAGAGAAGGCAAATACGCCTATCCTGAATCA
TGTCTCCAAATCATGCACCGTGGTTTCCAAGAAAAACAAACCTTCAAGAG
TGGTCTCTATAAGATTAAAGTGAAAGAAGAAATTGTACAAACTTATTGTG
ATTTTGATCGTCATGGAGGGGGATGGACTCTAGTCACCAAGGTTTCATCA
TCGAATGGTTGGACGAAAGAAAACTCGATTCTGCGCAATAAAGACGATGC
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aagatcCTGCTGagGCAACGTTTGATTACATGGTTGAAGCTGACGGAACC
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TTGTGCGCCAAAAGACAAGAAAccgattttgagaaaaaagttcgGTAATT
GGGACGAAGGGGTCgagaattttgcaaaaaacccAATAACTGCTGGATCG
AAGAACGGCATCTTTTTGTCGGCAAGTCGTTCAGATGATTCTTCGGATGT
GTTAGGAACCATCGTGTCTTCAGGCAATGGCAAATATCTATCAACACTTG
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TCGTGCAATGATATCAAGATCAGAGGCTATCACAAAGAAAAGACCGACTA
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TGGAAACCACCCCTAAAGAAGGATGGACTCTTTTAGTGTCTTCAAACAAC
AACGGATGGAGTGGAGACCAGGTCTTGGAACGTAATATCAATCATCCTGG
TTTACATATAGACTATTCCATCTTGGGACGTGCCAATCAAATGAAATCTC
TTTCAAAGAATAACACTTTCAAATATATGTTGGATGCAAAGAGACGTGGA
CATTGGGGTGGTATATGGTCCGCACCTATTGGATATTCGTA

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00016035-protein

>TCONS_00016035-protein ID=TCONS_00016035-protein|Name=TCONS_00016035-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=1574bp
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TKQKEGNHDEFVSYRIPSIDKYIVLDLKKRKSHLTSGNVKIITHDEKGAQ
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EGQHRFTRVNDHLDEIYKSLQMSSFTESRVDDAPKIRKRRSTFNGNVPGL
RTFDLINVEPQYIPYLKTNKTRYVELLVSVGKGVTETYGNNYSLILERML
NALGQVDLSYQAINIRLVLTALEIQTKDRFQRSSNGGGELSNYATYVINT
IKKLDFYKDISFDHGMFMSKTGWNDGVVGMAYVGGVCSSSIQYSVNLWSA
NAISGPTVILGHELGHNLNFPHDSDQCKCLTPRGCFMGGSKSSRPGFSNC
SLSRLAQKEFACIDNAPKATMLRRCGNGIKDPGEECDCGTEENCKKSNDH
CCEPKSCKLKAHVQCSHFNYPGCCSETCYYRKEGTLCRNADGNCDVEEYC
TGDSPACPANRYMRNGIKCEESIKMLFGTKSRYGETINQLSHQVIGRYFK
IETKKWGAGNWACLRMEMYGCHANRANVPTPISTVDLYYHKRMCVTPKID
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DQNGFLQVSSQCGIEESKFERTEALSVKQNGKCWLAERKWPFPNKRITLS
DMCEDKTNSITVHQFYETDCKMPQGFMNGKLPDSAFSASSFAVGDEPFKA
RIGNAGKWCPHKAGIGGWLKIDLGKQVKITAIGISSGSYWNWVTGYHLYS
SDDGKHWTPFKDLSDQNSNVNNSMCFNGVCQKTLNHQCQSLWNVDTKSAP
NECWDKLNTEAKGFGTCSPTANTSCTTENVKCGQIQCQSPDDRPYYIDYG
TQYKKIDSSSHTCSAASITDSEQVGLGMVQDGTKCGENKFCMNQQCKTAK
DHGIKECFIVDGKECNGKGVCRNGGVCQCEGLLNPLTGCKTVYSPIDGGF
SQWNEWTTCTKGCGGGTQSRYRHCDQPTPKHGGKSCGGDLLESRNCNTDA
CPLGRSCLAIQLILQKEERPLYDGIYQIKPIESQHSFPVYCDMTSDGGGW
TLLVSSHMNNWTEANVVLRNPQTPSLSHDYSILKRGDAIKRNYLISEPNF
EYKIEAHTRGHWGGIWRAPNSYSISSSNSYQTDVTLLKKFNDWQYQSRGL
QERLPYLNKQRLTTSFGEWGSITDNEHAVLPANYISGDHMMAMPEHVWYW
MREGKYAYPESCLQIMHRGFQEKQTFKSGLYKIKVKEEIVQTYCDFDRHG
GGWTLVTKVSSSNGWTKENSILRNKDDASKDDFSIFKYIDELKFKDPAEA
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KVWVREGGSRSSCNDIKIRGYHKEKTDYKDGFYMLKDNLNVYCDMETTPK
EGWTLLVSSNNNGWSGDQVLERNINHPGLHIDYSILGRANQMKSLSKNNT
FKYMLDAKRRGHWGGIWSAPIGYS

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000225:43600..94821+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

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>TCONS_00016035 ID=TCONS_00016035|Name=TCONS_00016035|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=51222bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000225:43600..94821+ (Clytia hemisphaerica)
ggaaaaataacaaataaaaaaagaatgaaagaaaTAGAGGAAACGTATCC
ATAATGAAATGCTCATATCAAATCGATCACTATTTAATAATACTGGATGG
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attaaaaatcgCCATTCTCGCCCAAACTATAAGTtcctaaaaacgttaaa
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TCTAAACATATCGGGATGGAGAGAGCGGTATGTAGTCTACTTCACTTGAG
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CCAATTTATACCTATCtagcaccaaaaataaagccCATCAAATAAAATGC
ATGAGCTGTCGAtacttgaaatttaatttttatactTAGTAAGGCGATTT
TTGTTTTCTAACGTTTTCTCAAAAACGGGTTCTTTGTAATTATGGCGCGG
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CTCTAGCCCCTGATAAGATAACAGCACTTATcttgttttgactttttgca
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ggactcagcgccatcaaaatcatcaggaAGCAAAGTTTAGTCAGATGATA
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ATTTACCCTTTTACAAATGATGAAACTTGTAAAAGAAAtagtttctttat
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ACTTGTAAAAGAAATAGGTTTTTAGATGTATACGCATATACAATTTAATC
AAAATTATATCATgcgaaaaaaaaatgaactcACAAATTTAATAGGTGCG
ACAAACAATAAAAGCGCGGTAAAGCTGTGACTTTATGCAAGGAGTTTAAT
AAAAGTTCCTTGGTTTATatgtaataaaaatatttaagttATAATTAATT
TGCCAGTTTCTGTTTCTGGATCCACGTGTGCATTACTTTGCTGTTTATTG
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GGAGTCGACAGAATTTCTTTTAGAATGCCTTAACAGGCCTTTTCATTCAA
CTCtcaaccacagatatctgtaaagcccgaagggctagataggcaacttt
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>TCONS_00016035 ID=TCONS_00016035|Name=TCONS_00016035|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=188880bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000225:43600..94821+ (Clytia hemisphaerica)
ATGGCCCAATTCTTGTGGCAAGTTGCTGTTATGGTGACGGTCCTACAATT
ATTTACACCTGTAGTTGgTAAGCCGTCATTTGCACAGACAGGTTATGAAC
TGGTTTACCCCGAAAGAATTCATAAGCATCGTTCGAAAAGAGATTTATCT
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ACAGTCTCGGTACCGGCATTGTGATCAACCAACACCGAAACATGGTGGCA
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TTGAATTGTGCGCCAAAAGACAAGAAAccgattttgagaaaaaagttcgG
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GATGTGTTAGGAACCATCGTGTCTTCAGGCAATGGCAAATATCTATCAAC
ACTTGTAAAGCCGAACGTTGTTAAAGTCTGGGTCCGAGAGGGTGGAAGCC
GGAGTTCGTGCAATGATATCAAGATCAGAGGCTATCACAAAGAAAAGACC
GACTACAAAGATGGTTTCTACATGCTAAAAGACAATTTGAATGTTTATTG
TGATATGGAAACCACCCCTAAAGAAGGATGGACTCTTTTAGTGTCTTCAA
ACAACAACGGATGGAGTGGAGACCAGGTCTTGGAACGTAATATCAATCAT
CCTGGTTTACATATAGACTATTCCATCTTGGGACGTGCCAATCAAATGAA
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GTGGACATTGGGGTGGTATATGGTCCGCACCTATTGGATATTCGATGGCC
CAATTCTTGTGGCAAGTTGCTGTTATGGTGACGGTCCTACAATTATTTAC
ACCTGTAGTTGgTAAGCCGTCATTTGCACAGACAGGTTATGAACTGGTTT
ACCCCGAAAGAATTCATAAGCATCGTTCGAAAAGAGATTTATCTACAAAA
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GGAAGATTCACATGCTTTCATCAGCACTTGTCATGGTTTAACGGGTACTT
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CAACATCGATTCACTCGAGTTAACGACCATCTCGACGAAATTTATAAATC
ACTCCAAATGTCGTCTTTCACCGAATCAAGAGTTGATGACGCGCCAAAGA
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TTCGATCTTATAAATGTTGAACCGCAATACAttccttatttaaaaacaaa
caagacAAGATATGTGGAGTTATTGGTCAGTGTCGGCAAGGGCGTGACTG
AGACCTATGGAAACAATTATAGTTTGATTTTGGAGAGAATGCTTAACGCA
CTTGGTCAAGTCGATCTGtcTTACCAAGCCATCAATATTCGATTAGTTTT
GACCGCTCTGGAAATTCAAACAAAAGATCGTttccaacgttcatctaatg
gtGGTGGAGAGTTATCGAATTATGCTACATATGTAATCAACACAATCAAG
AAATTAGATTTTTATAAAGATATCTCTTTTGACCATGGTATGTTTATGAG
TAAAACTGGGTGGAATGACGGCGTTGTTGGAATGGCGTACGTTGGAGGTG
TTTGCAGCAGCTCTATACAATACTCCGTCAACTTGTGGTCGGCCAATGCG
ATCAGTGGACCAACAGTCATCCTTGGACACGAACTTGGACACAATCTCAA
CTTCCCACATGATTCGGATCAATGCAAATGTTTGACACCAAGAGGATGTT
TCATGGGTGGATCAAAatCGAGCCGACCAGGGTTCAGCAATTGTTCATTA
AGTCGATTGGCTCAAAAAGAATTTGCTTGTATTGACAATGCTCCTAAAGC
TACAATGTTACGTCGATGTGGGAACGGTATCAAAGACCCTGGAGAAGAAT
GCGATTGTGGTACCGAGGAGAATTGCAAGAAAAGCAATGATCATTGCTGT
GAACCGAAATCGTGCAAATTGAAAGCGCACGTGCAGTGTAGTCATTTCAA
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CGAAGAAAGTATCAAGATGCTTTTCGGAACCAAATCGAGATATGGTGAAA
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TGGTTGTCATGCCAACAGAGCCAATGTACCTACACCAATTTCAACGGTCG
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GCAGAGTGTGCAAACATCCCCGATGGAACAAACTTAATATACAAGGAAAT
GCCGAATTTCGATTGTGACCACAAGCGAATGTTGTTCGACTATAACGCAG
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CTGAAAGAAAATGGCCGTTCCCGAATAAAAGAATCACACTCTCCGACATG
TGTGAGGATAAGACGAATTCCATAACTGTTCATCAATTTTATGAAACTGA
TTGCAAAATGCCACAAGGATTTATGAATGGGAAATTACCTGACTCAGCAT
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CTGGATCATATTGGAATTGGGTTACAGGCTACCATCTTTATTCATCAGAT
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CttggtcGATCATGCCTTGCTATCCAACTCATTCTACAGAAAGAGGAGCG
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GGATGCAAAGAGACGTGGACATTGGGGTGGTATATGGTCCGCACCTATTG
GATATTCGATGGCCCAATTCTTGTGGCAAGTTGCTGTTATGGTGACGGTC
CTACAATTATTTACACCTGTAGTTGgTAAGCCGTCATTTGCACAGACAGG
TTATGAACTGGTTTACCCCGAAAGAATTCATAAGCATCGTTCGAAAAGAG
ATTTATCTACAAAACAAAAGGAGGGCAATCATGACGAATTTGTTTCTTAT
CGTATTCCATCCATTGATAAATATATTGTTTTGGATTTGAAAAAACGAAA
GTCACATCTTACATCAGGCAATGTTAAAATCATAACACACGATGAAAAAG
GTGCTCAGCAAGTTGAAGAACTATCACCAGAGGACTGTCATTACGTTGGT
CAAATCAGAGATGTGGAAGATTCACATGCTTTCATCAGCACTTGTCATGG
TTTAACGGGTACTTTGGATGATGGAGAAAATCGATATGATATTGTTCCTT
ATGATGACGAAGGCCAACATCGATTCACTCGAGTTAACGACCATCTCGAC
GAAATTTATAAATCACTCCAAATGTCGTCTTTCACCGAATCAAGAGTTGA
TGACGCGCCAAAGATTCGAAAACGAAGAAGTACTTTCAATGGGAATGTCC
CTGGATTGAGAACATTCGATCTTATAAATGTTGAACCGCAATACAttcct
tatttaaaaacaaacaagacAAGATATGTGGAGTTATTGGTCAGTGTCGG
CAAGGGCGTGACTGAGACCTATGGAAACAATTATAGTTTGATTTTGGAGA
GAATGCTTAACGCACTTGGTCAAGTCGATCTGtcTTACCAAGCCATCAAT
ATTCGATTAGTTTTGACCGCTCTGGAAATTCAAACAAAAGATCGTttcca
acgttcatctaatggtGGTGGAGAGTTATCGAATTATGCTACATATGTAA
TCAACACAATCAAGAAATTAGATTTTTATAAAGATATCTCTTTTGACCAT
GGTATGTTTATGAGTAAAACTGGGTGGAATGACGGCGTTGTTGGAATGGC
GTACGTTGGAGGTGTTTGCAGCAGCTCTATACAATACTCCGTCAACTTGT
GGTCGGCCAATGCGATCAGTGGACCAACAGTCATCCTTGGACACGAACTT
GGACACAATCTCAACTTCCCACATGATTCGGATCAATGCAAATGTTTGAC
ACCAAGAGGATGTTTCATGGGTGGATCAAAatCGAGCCGACCAGGGTTCA
GCAATTGTTCATTAAGTCGATTGGCTCAAAAAGAATTTGCTTGTATTGAC
AATGCTCCTAAAGCTACAATGTTACGTCGATGTGGGAACGGTATCAAAGA
CCCTGGAGAAGAATGCGATTGTGGTACCGAGGAGAATTGCAAGAAAAGCA
ATGATCATTGCTGTGAACCGAAATCGTGCAAATTGAAAGCGCACGTGCAG
TGTAGTCATTTCAATTACCCAGGATGCTGTTCGGAAACGTGTTATTATCG
TAAGGAGGGTACATTGTGTCGAAATGCTGATGGTAATTGTGACGTAGAAG
AATATTGTACTGGTGATTCCCCTGCGTGTCCGGCCAATCGTTACATGAGA
AATGGTATAAAGTGCGAAGAAAGTATCAAGATGCTTTTCGGAACCAAATC
GAGATATGGTGAAACAATCAATCAACTTTCACATCAAGTGATCGGtagat
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AATTTCAACGGTCGATTTATATTATCACAAACGAATGTGCGTCACACCAA
AGATCGATACTGATGCAGAGTGTGCAAACATCCCCGATGGAACAAACTTA
ATATACAAGGAAATGCCGAATTTCGATTGTGACCACAAGCGAATGTTGTT
CGACTATAACGCAGATGGATCATTGATTCATCATTGTAGTGGAAAACGAA
TTTGTCTCGATCAAAATGGCTTTTTGCAAGTATCTTCTCAATGTGGTATC
GAAGAATCCAAGTTTGAAAGAACAGAGGCATTGTCGGTCAAACAGAACGG
TAAATGTTGGCTCGCTGAAAGAAAATGGCCGTTCCCGAATAAAAGAATCA
CACTCTCCGACATGTGTGAGGATAAGACGAATTCCATAACTGTTCATCAA
TTTTATGAAACTGATTGCAAAATGCCACAAGGATTTATGAATGGGAAATT
ACCTGACTCAGCATTTTCCGCAAGTTCTTTTGCTGTTGGCGATGAACCGT
TCAAAGCAAGAATTGGCAATGCTGGGAAATGGTGTCCACACAAAGCAGGT
ATTGGCGGATGGTTGAAAATCGATTTAGGTAAACAAGTTAAAATTACAGC
GATTGGAATTAGTTCTGGATCATATTGGAATTGGGTTACAGGCTACCATC
TTTATTCATCAGATGATGGTAAACATTGGACACCGTTCAAAGACTTAAGC
GATCAAAATTCAAATGTCAACAATAGCATGTGCTTCAATGGAGTATGTCA
AAAAACGTTGAACCACCAATGCCAATCTCTATGGAACGTTGATACCAAAA
GCGCACCAAATGAATGCTGGGATAAGCTTAATACAGAAGCTAAAGGCTTT
GGAACGTGTTCGCCAACAGCTAATACATCTTGTACGACAGAGAATGTCAA
ATGTGGACAGATACAATGTCAATCACCTGATGATAGACCGTATTATATTG
ACTATGGAACGCAATATAAGAAAATTGATAGCTCGTCTCATACATGCAGT
GCTGCGTCAATAACAGACAGTGAACAAGTTGGACTTGGAATGGTTCAAGA
TGGCACCAAATGCGGTGAAAACAAGTTTTGTATGAACCAACAATGTAAAA
CAGCCAAAGATCATGGAATCAAAGAATGTTTTATAGTTGATGGTAAAGAA
TGTAATGGGAAAGGGGTTTGCAGAAATGGTGGTGTCTGTCAATGTGAAGG
TCTTCTTAATCCATTGACTGGTTGTAAAACAGTCTATTCTCCCATCGATG
GTGGTTTCAGCCAATGGAATGAATGGACCACGTGCACAAAAGGATGTGGC
GGAGGAACACAGTCTCGGTACCGGCATTGTGATCAACCAACACCGAAACA
TGGTGGCAAAAGCTGTGGTGGTGATTTATTAGAATCAAGAAATTGCAATA
CTGATGCTTGTCCTCttggtcGATCATGCCTTGCTATCCAACTCATTCTA
CAGAAAGAGGAGCGTCCACTGTACGATGGGATATATCAAATAAAACCGAT
TGAAAGCCAACATTCGTTCCCAGTCTACTGTGATATGACGTCAGATGGTG
GAGGCTGGACTCTACTCGTTTCATCACACATGAACAATTGGACAGAAGCT
AATGTTGTTTTGCGGAATCCGCAGACCCCATCTTTGAGTCATGATTATTC
AATATTGAAACGCGGAGATGCaattaaaagaaattatttgattTCAGAAC
CCAATTTCGAATACAAGATTGAAGCACACACCAGagGACATTGGGGTGGT
ATATGGCGTGCACCTAACTCGTATTCCATAAGCTCATCAAACAGTTACCA
AACTGACGTCACTTTGTTAAAGAAATTCAATGATTGGCAATACCAGTCTC
GCGGCCTACAAGAACGCTTACCATACCTCAATAAACAGCGATTAACGACA
AGTTTCGGAGAATGGGGAAGCATCACAGataatgAACATGCAGTACTACC
AGCCAATTATATCTCTGGTGATCACATGATGGCTATGCCTGAACACGTCT
GGTATTGGATGAGAGAAGGCAAATACGCCTATCCTGAATCATGTCTCCAA
ATCATGCACCGTGGTTTCCAAGAAAAACAAACCTTCAAGAGTGGTCTCTA
TAAGATTAAAGTGAAAGAAGAAATTGTACAAACTTATTGTGATTTTGATC
GTCATGGAGGGGGATGGACTCTAGTCACCAAGGTTTCATCATCGAATGGT
TGGACGAAAGAAAACTCGATTCTGCGCAATAAAGACGATGCATCGAAGGA
TGATTTCTCCATTTTCAAATACATCGatgaattgaaatttaaagatcCTG
CTGagGCAACGTTTGATTACATGGTTGAAGCTGACGGAACCGATACTAAT
GGTGGCATTTTTTCGTTATCGGCTGATTTTACCCTCTTGAATTGTGCGCC
AAAAGACAAGAAAccgattttgagaaaaaagttcgGTAATTGGGACGAAG
GGGTCgagaattttgcaaaaaacccAATAACTGCTGGATCGAAGAACGGC
ATCTTTTTGTCGGCAAGTCGTTCAGATGATTCTTCGGATGTGTTAGGAAC
CATCGTGTCTTCAGGCAATGGCAAATATCTATCAACACTTGTAAAGCCGA
ACGTTGTTAAAGTCTGGGTCCGAGAGGGTGGAAGCCGGAGTTCGTGCAAT
GATATCAAGATCAGAGGCTATCACAAAGAAAAGACCGACTACAAAGATGG
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CCCCTAAAGAAGGATGGACTCTTTTAGTGTCTTCAAACAACAACGGATGG
AGTGGAGACCAGGTCTTGGAACGTAATATCAATCATCCTGGTTTACATAT
AGACTATTCCATCTTGGGACGTGCCAATCAAATGAAATCTCTTTCAAAGA
ATAACACTTTCAAATATATGTTGGATGCAAAGAGACGTGGACATTGGGGT
GGTATATGGTCCGCACCTATTGGATATTCG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_008961	XLOC_008961	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00016035-protein	TCONS_00016035-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000225	supercontig	sc0000225:43600..94821 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
19.501	16.5321	54.4768	52.7603	76.3004	56.4363	30.5938	34.4123	41.7756	48.5426	28.6761	18.743	2.11926	2.47371	1.10483	1.76729	3.24645	4.73421	0.827327	0.808567	30.1987	26.572	16.4581	26.3206	50.5382	27.1146	2.20482	1.34306	8.40992	9.28261

Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR001762	Disintegrin_dom
IPR000884	TSP1_rpt
IPR006586	ADAM_Cys-rich
IPR008979	Galactose-bd-like
IPR001590	Peptidase_M12B
IPR002181	Fibrinogen_a/b/g_C_dom
IPR014716	Fibrinogen_a/b/g_C_1
IPR000421	FA58C
IPR024079	MetalloPept_cat_dom
IPR002870	Peptidase_M12B_N
IPR034027	Reprolysin_adamalysin

Vocabulary: **Molecular Function**
Term	Definition
GO:0004222	metalloendopeptidase activity
GO:0008237	metallopeptidase activity

Vocabulary: **Biological Process**
Term	Definition
GO:0006508	proteolysis

GO Annotation

GO Assignments

This transcript is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0006508	proteolysis
molecular_function	GO:0004222	metalloendopeptidase activity
molecular_function	GO:0008237	metallopeptidase activity

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00016035 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: ADAM8 (Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 8 OS=Homo sapiens GN=ADAM8 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 197.208 bits (500), Expect = 1.675e-51
Identity = 165/533 (30.96%), Postives = 240/533 (45.03%), Query Frame = 3

Query:  330 LWQVAVMVTVLQLFTPVVGKPSFAQTGYELVYPERIHKHRSKRDLSTKQKEGNHDEFVSYRIPSIDKYIVLDLKKRKSHLTSGNVKIITHDEKGAQQVEELSPED-CHYVGQIRDVEDSHAFISTCHGLTGTLDDGENRYDIVPYDD--EGQHRFTRVNDHLDEIYKSLQMSSFTESRVDDAPKIRKRRSTFNGNVPGLRTFDLINVEPQYIPYLKTNKTRYVELLVSVGKGVTETYGNNYSLILERMLNALGQVDLSYQAINIRLVLTALEI-QTKDRFQRSSNGGGELSNYATYVINTIKKLDFYKDISFDHGMFMSKTGWNDGVVGMAYVGGVCSSSIQYSVNLWSANAISGPTVILGHELGHNLNFPHDSD--QCKC---LTPRGCFMGGS-KSSRPG-FSNCSL----SRLAQKEFACIDNAPKATML---RRCGNGIKDPGEECDCGTEENCKKSNDHCCEPKSCKLKAHVQCSHFNYPGCCSETCYYRKEGTLCRNADGNCDVEEYCTGDSPACPANRYMRNGIKC 1874
            LW +  M+  L    P   +P      YE+V P R+   R +R L +    G H E VSY + +      L L+K +  L SG  +  T    G++  E+   +D C Y G +    DS A +STC GL G    G + + I P D+  EG        +HL +   +  +S       DD+           G++ G RT  +    P     L + +TRYVEL V V     +  G+  + +  R+L  +  VD  YQ +N R+VL  LEI  ++DRF  S +    L N  T+      +   + ++    G+  + T      VG A V  +CS S   +VN   +    G    + HE+GHNL   HD +   C+C        C M GS  SS P  FS+CS     S L + +  C+ NAP  + L     CGN   + GE+CDCG  E+C+   + CC   +C+L    QC+H    G C + C  +  G LCR     CD+EE+C G  P CP + +  NG  C
Sbjct:    6 LWLLGAMM--LPAIAP--SRPWALMEQYEVVLPWRLPGPRVRRALPSHL--GLHPERVSYVLGATGHNFTLHLRKNRDLLGSGYTETYT-AANGSEVTEQPRGQDHCFYQGHVEGYPDSAASLSTCAGLRGFFQVGSDLHLIEPLDEGGEGGRHAVYQAEHLLQTAGTCGVS-------DDS----------LGSLLGPRTAAVFRPRPGD--SLPSRETRYVELYVVVDNAEFQMLGSE-AAVRHRVLEVVNHVDKLYQKLNFRVVLVGLEIWNSQDRFHVSPDPSVTLENLLTWQARQRTRRHLHDNVQLITGVDFTGT-----TVGFARVSAMCSHS-SGAVNQDHSKNPVGVACTMAHEMGHNLGMDHDENVQGCRCQERFEAGRCIMAGSIGSSFPRMFSDCSQAYLESFLERPQSVCLANAPDLSHLVGGPVCGNLFVERGEQCDCGPPEDCR---NRCCNSTTCQLAEGAQCAH----GTCCQECKVKPAGELCRPKKDMCDLEEFCDGRHPECPEDAFQENGTPC 498

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00016035 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00016035 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
ADAM8	1.675e-51	30.96	Disintegrin and metalloproteinase domain-containin...	[more]

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TCONS_00016035 (transcript) - C. hemisphaerica