TCONS_00016943 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00016943
Unique NameTCONS_00016943
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1242

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00016943 ID=TCONS_00016943|Name=TCONS_00016943|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1242bp
CTAAAATGTATTTGCCGATCATAATTCAAATGGTCACTTTCTGGATGTCA
GTTGGTGGCAACAATGAAGAAATACTTCCACAAGGTGAATTGTATAACCA
GCAACGTAATATCAAGCATTACAAAAGATTTGATGAAACAGTCGGTAGCA
ACAATGAAGAAATACTTCCACAAGGTGAATTGTATAACCAGCAACGTAAT
ATCAAGCATTACAAAATATTTGATGAAACAGTCGGTAGCAACAATGAAGA
AATACTTCCACAAGGTGAATTGTATAACCAGCAACGTAATATCAAGCATT
ACAAAAGATTTGATGGAACAGTCGGCAACAACAATGGCGGAATACATCGA
CAAGATGGCGGCCAGCAAAGTAGTATAAAGCGTTACAAAAGGTTTGATGA
AAAAACTGGTATGGATTCATACAAAGAAGCAAAAGAAGCTCATCAACAGA
AAACGTTGAAATCTAGCCTGGATAAATTAAAGAATCAAGCATTAGACCCG
TTTCCTATTACATGGAATTATACAGATAAATATTCTAACCGAACATTTGG
TGTTACTCGAAACAGTATTGCGTTAAAGTCACAACCCACTGAATGTGTAT
ACGCTGTCAATAAAGTGAGACGTTTACACGGACTTCCAGAATTATCTTGG
GCCACAGATATCGCATATACGGCACAAGAATGGGCGCTCGCATTAGCCCA
GATTGATAAAGGTTGTGAAGCTACTCACGATGATTATCCAAATTTATGGT
TCAATGGAAAAGAAATAAGATTGggtgaaaacatttttctttcagatgat
aaattttttgatgattgtGCACAATCAATTGCTGCCTGGTACAAtGAACA
ATTCAAAGGTACCCATTACAACTACGATAAACCAGTGTACAACGTGGATG
CGAACGGCCACGGTCATTTTATAGCACTAATGTGGCCgacaacaaaatat
tttggtgtGGGAATATCTTATGATTACGATATCGAATGTACCTACACTGT
AGCTCGTTTCGATGGTGTTCCAAACgaaaatgatttttacaaaaGCAGCT
ACAGAATCCCGAAACCTAAAGAAAaggtGACTGTGACAGAGGCTTATTTG
ACACCGAAGAAGCAACCACCACCAGTCGTCTACTTTTTATACATCCCCAG
TGAAGGCGGATGGACAGAATGGATTGACGTCTCAACTTGTAGTACAACTT
GTGGCAAGGGATTCAAAGTTCAACGCCGTTTTTGCATCACTC
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000255:93364..110937+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00016943 ID=TCONS_00016943|Name=TCONS_00016943|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17574bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255:93364..110937+ (Clytia hemisphaerica)
CTAAAATGTATTTGCCGATCATAATTCAAATGGTCACTTTCTGGATGTCA GTTGGTGGCAACAATGAAGAAATACTTCCACAAGGTGAATTGTATAACCA GCAACGTAATATCAAGCATTACAAAAGATTTGATGAAACAGTCGGTAGCA ACAATGAAGAAATACTTCCACAAGGTGAATTGTATAACCAGCAACGTAAT ATCAAGCATTACAAAATATTTGATGAAACAGTCGGTAGCAACAATGAAGA AATACTTCCACAAGGTGAATTGTATAACCAGCAACGTAATATCAAGCATT ACAAAAGATTTGATGGAACAGTCGGCAACAACAATGGCGGAATACATCGA CAAGATGGCGGCCAGCAAAGTAGTATAAAGCGTTACAAAAGGTTTGATGA AAAAACTGGTATGGATTCATACAAAGAAGCAAAAGAAGCTCATCAACAGA AAACGTTGAAATCTAGCCTGGATAAATTAAAGAATCAAGCATTAGACCCG TTTCCTATTACATGGAATTATACAGATAAATATTCTAACCGAACATTTGG TGTTACTCGAAACAGTATTGCGTTAAAGTCACAACCCACTGAATGTGTAT ACGCTGTCAATAAAGTGAGACGTTTACACGGACTTCCAGAATTATCTTGG GCCACAGATATCGCATATACGGCACAAGAATGGGCGCTCGCATTAGCCCA GATTGATAAAGGTTGTGAAGCTACTCACGATGATTATCCAAATTTATGGT TCAATGGAAAAGAAATAAGATTGggtgaaaacatttttctttcagatgat aaattttttgatgattgtGCACAATCAATTGCTGCCTGGTACAAGTAAGT TCGATCATTCTGTACGATATTGacctacacgcttttttctttataagaat gtaaATCCATTTTATCATAGATATTCCTAACTATAATCCTAAAgtattct tacaacattcttaggtaaggatcctaattcagactagatttaaacattta gtacatacgtctcaagcataaattggcatttttgtaaaaggagtgagcct tacttgggggtaattggtaatttataattgaaaaatggcattcttagttT GAGTAGCCAAATtcaatgatggtgatattcttagcatattcttaattttt tggcaattttcatcatggacattcttataaagtgtattcttataaaaaaa agcgtgtagctgGTCATTTTCACAGTTAACCTAAGTCCAAAATTATCAGT ATTTAGAGCTTCTTAACTTTGGTATAAACTGCAATTATGGACAAAAATGT TGACACAAAAGCGAATTCTAAGCTGCTTCCCCCTTTCCCCCATTTACAAT GTCCAATGCTTGGTGTGACGGCCGTGCGGACTGAACATTGCAGCTGGGGA AAGGGGGGAGacttttttctatatttttactACAAATTCCtgtgtttttc tcaaacatgTTTGTCCATGATTGTTTTCTCAAATTCTAAACCATTCTCCT TTTCTCAAATTAAGAGCTAAAAGTTGTCAGTTGATAATCACGAACCTATA ACCCTACACGAGAAGTGACTACAGTTGAGacctagtttagacggccgact ttctgccttGCCTTCCGTCGTTTATGACGAAAGTTGACAGTCAAAAGTCA ATACAATGCCTTCATTTGACGtctctttcaatctttttcaagcaaagatt tgaaACTGCAAATTTACCGTCAATCTTGTGCCGTCTCTCACATCGAAAGG AGGCAAGGCAGAAAGTCGACTGTCTAAACTAGGTCTGTCTCCCGCttatt cgaactcgaacgggaatGTTATTTGTTCGAGTTACAAAGAGAAAATACTT TATAGAAGGTACTAAATGGGGCTGGAAACaagatcgaattatagaaagat tcgcaTAAAAGAAGCTCGAATAAGCGAATGTTTGTATATCAACTGTCAGT CATCCCCGATTAGTGGCGCCACTTACTTTTAACATGTGAAATATTTCATT CTGTTTTTTATAAGTGAACAATTCAAAGGTACCCATTACAACTACGATAA ACCAGTGTACAACGTGGATCCGAACGGCCACGGTCATTTTATAACACTGA TGTGGCCGACAACGAAATATTTTGGTGTGGGAATATCTTATGATTACGAT ATCGAATGTACCTACACTGTAGCTCGTTTTGATGGTGTTCCAAACgaaaa tgatttttacaaaaGCAGGTACAGAATCCCGAAACCTAAAGAAAGTAAGT TCCAACCCAGCTTGGCACACAacgctgtttcaacgttcatctaacgttat atggacgttgtgaacattagatgacgttgaaacaacgttttgcaCCAGCT GGGAAACTACATTTTGCAATAAACACGAACAGAGTGCTAAAGACCCCCGG CCctaaaaattactaaaaaaacAAGTAACTTGGCTTACAAATATTGCCCT GAAACTAATTATGGACTGTGAAGGCAACCATAAgcaactaaaaataattt ttttttgttatccCGACATTAACATTATCAAAGTCGAGGTTAAAAAGTCA ATCTTGGTTAAATCCATCAGCGAAATTATAAAGGTTGATATCCTAATAAT CCTGAAAATCCTTAGCAACTCCACCTCTGAAAATTGGAgctgtttataaa aaatatgtacagGCATAAATCTTCGTATCCAGCGCTAAACTCGAAAAATT TTCATCGGCCATCCAaataaagttttatttcatactCTAACTTAAATTAA CACAATGATCTCAGACTTgtcttaaaagaaaagaaaaattggaagctTAG CGAAAATTGGAAAGCTGAATAAATGATATACCGTTTAGTTGATCTCTATA TTTTAATTCATGTCAGCCATTTCGTCAGCCTTTGGTGATCTTTCAGCTTA CCAAGATCGAAAATATAatcagttttttattttaatctttcatctttttc atccTTAAATAAAATGACAGAGTTAAAAAAAGGCATCTGGAATTAGGACA ACAATACGGTAgttttctcttattttcacAAGGTTTTCCAACTTTCCCTT TGTTAATGATATAATTAAATATCatctttaatttattttatttttcagag gtGACTGTGACAGAGGCTTATTTGACACCGAAGAAGCAACCACCACCAGT CGTCTACTTTTTATACATCCCCAGTGAAGGCGGATGGACAGAATGGATTG ACGTCTCAACTTGTAGTGTAAGTGGTAGCCAATAAGAATTTTAACAACGC TGATTAAAGGCCAGTGTAAAGACCAGTGtccggtatcggaattgcaattg tttcaattgttttaaaagtttgttttggacacgtgattttaattgttctc tttaatgacacgtggtttgcgcaatgttatattttactacttttatatcc ctttaacgttagatggacgttgaaataacgttagGTGTCAGCTAGGCAAC CAACTTCCTTTCTCTTTTGCAGACAACTTGTGGCAAGGGATTCAAAGTTC AACGCCGTTTTTGCATCACTCCCGAATCTTTGAATGGGCATCCACCAAAT TGTGGTGCAGACAAAGAGAGAATGCAAATCATCATGTGCGAACGACAGGT TGTCTGTCCAGGGGATAACgatgaaagaaagaaagacgGTTAGTCACAAC TTTTTAACCCTTTTAACGATTGCTATTTTCTTGCTAGGTTCTTGGAATTC CTTTTAATTTTAGTTCAGTTTAGCTTTCAAACTCGGAGCCTCAAAGATTC TGGTAGAAAGCAATATCAGTACTTTATCCATGGTAGATAATACGTtgtca aaaagtgagcaaaatataACGTCAAAGTTTCAGAATACCACTGAAAATTG CTGGGAAAATAGGTAACCCTTTCCCCCAGCAGACGACCTCCCAACGACTT TTCACCGTTCTTTTAACAACGGCACTAGGGGAAAGAGTGGGAGGGGGAGT TCAAATCATACTCTTGTATCACCATTTAAGTTCAGGATTGTACCACAATA CAATTATAATCACAGTTATAAATACCTCTAAGTTAATCTAAGTTAAAACT ACTTATATGTTGATTTGTCTTCTGTACGTAGCACATTCACTGTACCCGGA AAAAACGGGGCATAATTTTATATGTGCTTAAGAATTCCATATACAAANTT TTCTCTTTTGCAGACAACTTGTGGCAAGGGATTCAAAGTTCAACGCCGTT TTTGCATCACTCCCGAATCTTTGAATGGGCATCCACCAAATTGTGGTGCG GACAAAGAGAGAATGCAAATCATAATGTGCGAACGACAGGTTGTCTGTCC AGGGGATAACgatgaaagaaagaaagacgGTTAGTCACAACTTTTAAACC CTTTTAACGATTGCTATTTTCTTGCTAGGTTCTTGGAATTCCTTTTAATT TTAGTTCAGTTTAGCTTTCAAACTCGGAGCCTCAAAGATTCTGGTAGAAA GCAATATCAGTACTTTATCCATGGTAGATAATACGTtgtcaaaaagtgag caaaatataACGTCAAAGTTTCAGAATACCACTGAAAATTGCTGGGAAAA TAGGTAACCCTTTCCCCCAGCAGACGACCTCCCAACGACTTTTCACCGTT CTTTTAACAACGGCACTAGGGGAAAGAGTGGGAGGGGGAGTTCAAATCAT ACTCTTGTATCACCATTTAAGTTCAGGATTGTACCACAATACAATTATAA TCACAGTTATAAATACCTCTAAGTTAATCTAAGTTAAAACTACTTATATG TTGATTTGTCTTCTGTACGTAGCACATTCACTGTACCCGGAAAAAACGGG GCATAATTTTATATGTGCTTAAGAATTCCATAtacaaattgtttttttct agGAATTTGCGAGGACAAGACTCCTAATTTTTGCAAGAGAAAAGTCACAC CAGGCAATGGTCGTAAAGAATGCCGACAAAAAGATACGAAAGAACAAATG ACACGTGATTGCAAGAAGACATGCCGTTTTTGCGAGCGTgagtctgtctg tctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgcgCTTTTGTAATAT CACACCATAACACAACCAAAACTGCAACATTGTctccgtgtattccaggc tttatctacgttactgattgacgccagagaatactaTCTAGCGCTATCAC TAAGCATTGAAAATGCTGGTAATACACACGGAACGAGGTTGCCaaaactg tttaacaatttCTATCCGTTTATGACATGTCCCGAGGATTGAGAATCTGT CGGTATAATATCAAATAGCAATTGTGGATCGACACAAAAAGCGTTCAAAG GGTGCAAGAATTGTCTTCAAATTTGAGAAACATCCAAATCATGGATATGG ACTATGGATATCGTGCATTCTTTCTTTGCGCATCATATTTAACTAGATCT AGAGcgataaattttactttcaatacaGCGTTTGTCTGAAAGCCACGTCG GTCACACTTCATTTCCTATCCAATAATTTCTCTCTAGCCATCTGCcttaa actgattttttttattttcagcttGTATGAATTACCACAGAGATTGTCCA GGTTACGCGTCCGTCAGTTATGGTTATTGCACTGATGATAAGTACAGTGC TTGGATGGAATGGAAATGTGCTAGATCATGTGGTTATTGTAACCAAAGTG AGTTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNTAACTTCTGATAAAAGAGAATCATGTTGAACCTTTCATCTCTTACC ATAACCACGGTCAGAGATAAGCAAGTACTTCCCATAAAACACGGTCAGTA TTACATGCATGAGAGatcaacaatgatagaaatCAATTTGATTTTCCTCT TAACtaatatatttaaatattttgactaaaagttcataatttttctttaa cttcTGATAAAACAGAATCATGTTGAACCTTTCATCTCTTACCATAACCA CGGTCAGAGATAAGCAAGTACTTCCCATAAAACACGGTCAGTATTATATG CATGAGAGATCAACAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNtgatttttcatggaaattcactgcactgt aagggtccgattttagaagccaaattttgggccgaacgtatggtcgattt cagatcgagtgccccccccgggggcaatgcttaagttttttttaagattt gagcatggatatgcttataagagtTATGGCTATCAATAAAAAGTCGTAAA GTGTGTATTATCAACTTCAATACTTATTTCACCCGACCAAAATTTGCCAC AACTTTTTTTCTAGTTCTGTTAGTGTTTATTTCGAAATATTAATCTAGTG CACTGTAACGTACAAATTCCCAATTATAGATACGATTTCTCAATATgagg aaaaaatccaaaaaaatttaaatccctTTTTTGGCAATGTCTATAGTTGA TAAAGAATTTACTGATTACCCGAGTTaggaaaataaaattcttaCTGTTA ATATATGCTGACGgtttaaatctttaatttacATGCGGTATTTTTTAGAG TGGCGGGACAAAGACCATAGTGCCTGTATGTGTATGTGATGGAGGGATGA ACAATGCGTATATCTCAGGTGACACAAATGTCGTTTCGACGCCCATCTAA CGTTCACGAGGTCCATTGACGTATATTCAACGTTCATTTGACGTCCAcag tagtctagcaagctacacgtttttttttttataagaacgtcaaaaatttt cgaagccttcggatgttcttagttttttggatttgaagcctaaaaatgtt cttaaaatgttcttaNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNacattttgatgtaatttcttaagaaaatgcatgtttttaagtctc caaagccttagaatgttcttagaatgttcttaaatttttgggcctcgaag ccttatgttcttatatagtttgttcttataaaaaaaagaacgtgtagacg actaatttatacatatagtagaaataaagcaaaaagtaatgaatggaaca attttagtcgtctagaaacctttgtgcactaactccaaacaaaaaaaaaa gagtcaattaatatcgcaattaaaattttttcctgctcaaaataattctt gagaaaaaaaaatatgtgtggatttgtgtattgaaagtttttcatttgag ttgatttcgttttgagagtttgttNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNtccagt cgtttatacaaactaaatcccgtattattattattattattattattatt agtattggtattattagtattacacgcattataaacgactccagtctacg tCCACAGCCATTGAATGGTTTTACCTGAAAGAAGAACATTTGAATTTGTT AAAGATTGACGTTTTTACTACTGGTATTAATAGAATTAACGTTCGACTAA TACTATCTGATGGATAAATGGCTCGTTAACGAAACTCAAATGAAACCATT GCTTGGTTGTAAAAATCATCATCTACTGTAAATGAAACAAATAATGGACG GATATTGCCTTGTTTACTTAAATAGGCAGCAACGCTCATTGCAGGACGGC ACTACATAGACCAAGCACGGCATTGTAGAGTTAAATATATCCTTCATCAG AGAAAGACAACAGTTATATTCCGTAATCCTTCTCCTGATTTAATTCATTA ATCTGCAAATTTACCGTCAATCTTGTGCCGTCTCTCACATCGAAAGGAGG CAAGGCAGAAAGTCGACTGTCTAAACTAGGTCTGTCTcccgctaattcga actcgaacgggaatGTTATTCGTTCGAGTTACAAAGAGAAAATACTTTAT AGAAGGTACTAAATGGGGCTGGAAACaagatcgaattatagaaagattcg caTAAAAGAAGCTCGAATAAGCGAATGTTTGTATATCAACTGTCAGTCAT CCCCGATTAGTGGCGCCACTTACTTTTAACATGTGAAATATTTCAttctg tttttttataagtGAACAATTCAAAGGTACCCATTACAACTACGATAAAC CAGTGTACAACGTGGATGCGAACGGCCACGGTCATTTTATAGCACTAATG TGGCCgacaacaaaatattttggtgtGGGAATATCTTATGATTACGATAT CGAATGTACCTACACTGTAGCTCGTTTCGATGGTGTTCCAAACgaaaatg atttttacaaaaGCAGCTACAGAATCCCGAAACCTAAAGAAAGTAAGTTC CAACCCAGCTTGGCACACAacgctgtttcaacgttcatctaacgttatat ggacgttgtgaacattagatgacgttgaaacaacgttttgcaCCAGCTGG GAAACTACATTTTGCAATAAACACGAACAGAGTGCTAAAGACCCCCGGCC CTAAAAATTACNGCTACATTTTGCAATAAACACGAACAGAGTGCTAAAGA CCCGGCCctaaaaattactaaaaatacAAGTAACTTGGCTTACAAATATT GCCCTGAAACTAATTATGGACTGTGAAGGCAACCATAAGcacctaaaaaa aaattttttgttatcCCGACATTAACATTATCAAAGTCGAGCGTAAAAAG TCAATCTTGGTTAAATCCATCAGCGAAATTATAAAGTTTGATATCCTAAT AATCCTGAAAATCCTTAGCAACTCCACCTCTGAAAATTGGagttgtttat aaaaaatatgtacagGCATAAATCTTCATATCCAGCGCTAAACTCGACAA ATTTTCATCGGCCATCCAaataaagttttatttcatactCTAACTTAAAT TAACACAATGATCTCAGACTTgtcttaaaagaaaagaaaaattggaagct TAGCGAAAATTGGAAAGCTGAATAAATGATATACCGTTTAGTTGATCTCT ATATTTTAATTCATGTCAGCCATTTCGTCAGCCTTTGGTGATCTTTCAGC TTACCAAGATCGAAAATATAatcagttttttattttaatctttcatcttt ttcatccTTAAATAAAATGACAGAGTTAAAAAAAGGCATCTGGAATTAGG ACAACAATACGGTAgttttctcttattttcacAAGGTTTTCCAACTTTCC CTTTGTTAATGATATAATTAAATATCatctttaatttattttatttttca gaggtGACTGTGACAGAGGCTTATTTGACACCGAAGAAGCAACCACCACC AGTCGTCTACTTTTTATACATCCCCAGTGAAGGCGGATGGACAGAATGGA TTGACGTCTCAACTTGTAGTGTAAGTGGTAGCCAATAAGAATTTTAACAA CGCTGATTAAAGGCCAGTGTAAAGACCAGTGtccggtatcggaattgcaa ttgtttcaattgttttaaaagtttgttttggacacgtgattttaattgtt ctctttaatgacacgtggtttgcgcaatgttatattttactacttttata tccctttaacgttagatggacgttgaaataacgttagGTGTCAGCTAGGC AACCAACTTCCTTTCTCTTTTGCAGACAACTTGTGGCAAGGGATTCAAAG TTCAACGCCGTTTTTGCATCACTC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_009492XLOC_009492Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016943-exon-sc0000255-1491911889:93364..94207TCONS_00016943-exon-sc0000255-1491911889:93364..94207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016943-exon-sc0000255-1510915933:93364..94207TCONS_00016943-exon-sc0000255-1510915933:93364..94207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016943-exon-sc0000255-1575043694:93364..94207TCONS_00016943-exon-sc0000255-1575043694:93364..94207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016943-exon-sc0000255-1491911889:109376..109605TCONS_00016943-exon-sc0000255-1491911889:109376..109605Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016943-exon-sc0000255-1510915933:109376..109605TCONS_00016943-exon-sc0000255-1510915933:109376..109605Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016943-exon-sc0000255-1575043694:109376..109605TCONS_00016943-exon-sc0000255-1575043694:109376..109605Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016943-exon-sc0000255-1491911889:110515..110633TCONS_00016943-exon-sc0000255-1491911889:110515..110633Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016943-exon-sc0000255-1510915933:110515..110633TCONS_00016943-exon-sc0000255-1510915933:110515..110633Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016943-exon-sc0000255-1575043694:110515..110633TCONS_00016943-exon-sc0000255-1575043694:110515..110633Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016943-exon-sc0000255-1491911889:110889..110937TCONS_00016943-exon-sc0000255-1491911889:110889..110937Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016943-exon-sc0000255-1510915933:110889..110937TCONS_00016943-exon-sc0000255-1510915933:110889..110937Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016943-exon-sc0000255-1575043694:110889..110937TCONS_00016943-exon-sc0000255-1575043694:110889..110937Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000255supercontigsc0000255:93364..110937 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0.0410985 0 0 0.0532952 0.0472531 0.365659 0.422216 0.446052 0.093096 0.905292 0.27992 0.436791 0.300515 0.455771 0.556087 0.0827652 0.0743908 0 0 0.188899 0 0.0459107 0 0.0439067 0.140931 0 0 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00016943 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top