|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00017941 ID=TCONS_00017941|Name=TCONS_00017941|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3826bp
tttagATATGAATCCCTGAGAAGGGGAGctacaaaaaaacgaaaaatttt
aaaatgctaCTGGCGAATGCTAATTGCGAATAAAAAATGCGAAGCCGAAT
CACTTTGGTTTCCAACCCTTTTCAATCAAGATGGACAAAGATAGTAGCGT
GTTCTATTATGACCATTGTTGTCCTTGTCAATCTGAATATCTTGTCATGG
AGATCCAATAGTACTACAGCTgttgaaattgttcaaaaagtgaaatgtGA
AAGTGCTACAAAGACGTTGGCGTTAGCCGAACTAGCTGCATATTATGAGA
AGTTATTACTGGAGAAAGGGGTTAATACAAATACGATTAAAGACGCTATT
GCTTCGAAAtctggaaaaatatttaatgTTTTCTACGACACAAAAGTAGG
TGCAGACAAGAAAATGATAATTGAGACAATTCCGCCAGCACAAAATGTAC
CTCCTCCGTCACCCTCAACCACGCCAGATACTAGATTCAAAGGAGATACC
AAAATAGTATTCAAGGAGCTGGGCTCTACCAATATTTTAAAAGGTGTCAT
GATGGATTGGTGGTTTGACTTTTGCATGGCGCGAGAATCTACGGAGGTTA
TCTGGCATCCACTGTTACCTAGAGTACCACAACTAAGCGCTATTACATTA
ACCTTGGCTGATAAAGATAGAACTGTTGGTTCAAACTTATACAGGCGAAT
GTCAGGTTATTTGTTTGTCAAAGAAACTGCTTCTTTTGATTTTAAACTAT
TGTCGAGAGACGGTGCTGAAGTGTTAGTGTACGATACAGGGCTGACGTTA
TccaaaatcaatgaaattaaTCCTAAAATGAGGTATGATtcgaaaaaaga
attatttcattcaaaattaacaaaagcTACTATGGATGCTCAGGATAAAG
TGATTCCGTTATCTGCCATGTTCCAAATTGAAAGTCAAAATATTGAACTA
AAGAAAGACCAAATTTACGCTCTTGAGATCATTCAAGGTGGTAAACATTT
CACTAAATATAGTTTACAATGGAAACCATTTGGATCTACTTTTAATAGAT
ACACAGCTATTGgtcaagaaaatctttttcatcaaGATGGGAAAATGGTA
CCAGGccttttgaaacaaaaatatgATCCAAAACCTATATATTCACCTAA
TGATAGCGAGCTACGCAGATTATCTTTCTATAAATTACCAATGTTAGAAA
GCAGACATTTGATCGACGAAGCTGGTCTATATTGCGAGGAACGCGAAAAG
AGGTATATAAAAGTTGACCAATTATATCAAGGTTATAACGAATACACAGA
CAATGTTAAAAGTTATCCGCAAGAATATTTTAAGTTCGGTTTAGATAATC
GATACACTTTATTGGATAAAGCAACGGCTCTTCAAATTGCAGATCGTACA
TTCAAGAAATTGTCAAGGGCACATCAAAGCACCCTGGAACTTGTCAATGT
TGTTTACGTAATGAGTAATTTTGGTCCACTTCACAATCAAACTATTACAT
CAGGTCCTAAGTACTTTTTCGTCGAACTAGACGTTCGAAATAAAAGCCAT
GGCTCGAAAGTATTCAGGGCGTCGCACTTTGTTGAACCGATCAATGAACC
TACAAAAGATTTATGTTTTGTACGTGAATGGGCGCCAAAAGGTCATGGAC
AAGTTGAAATTAATTTAATGACAGCCATTAAGAATCAAAGGGCGTGGTTG
AATTATTTGATCTTAATGTTGGAAGAGTTATTGGCAGAAATCAAAGATAC
AAACgttattttgaatttgattgatTACAACAGTACGGATGGTGATTATG
AGCAGATCTTGAAAGCCAGCAAATTGAAATTTAAGTATTTGAACCCAATA
CGGGATAGCAAATTGTCTACTAAATTTAGCAAAGTCAAAGCATTGAATTA
TGGGATCAAAcatgttcaaaatgaaaatagcaTTGTTTTTATACTGGATT
TACATTTGCAGTTACCGTTGAATATCTTTGATCGAATCAGAAAGTTGACC
ATTCAGAATCGTACAGCTTACAATCCAACCTTAATGAAGCTGGGATGTGG
TGACCATGAGCAATATACACCAAAGATGAAATCAACCATTTGGTTAGATT
ATGGTACTGGCATGATGTCCATGTACAAAAGTGATTGGATGAAGGTTGGA
TGTTTTAATGAAAAGCTGTTTAAAGATAAATGGGGCGGAGAAGATTGGGA
AGTAATGGATCGAATGGTTGGTAATGGGATACAGATCATTCATCAAAGGT
TACCAAGGTTTTATCATATTCACCACGATCGAAAACACATGTGGAACAAA
ACCTGATAGGTGGTGATTTGAATAAAGTGAAAAGAATACATTCTATGTCT
GTCTATGGCGCTGTATGCGGAACAATAGCTTGGTAATGTTTGATCAAAGA
CATACAGTAGGATCTATAATCCGTCGGAATTGGACTTGAACATATTTTGA
ATACCTTATCCTGCATTATCGGccttttttacgccggccctaataaCGCC
ACAGCCTAAaattttccatcgaaaatcactgatttttaaatataataaat
atttcactgaagtttcaaatatggagtaaaacaatggataattttcgtct
tcgaatcatatctaaaatcctttaaattgagaaatcatGATAAATgatta
acgccgcttttaggttaaaattgcaaaatcttggccctttttacgccggc
cctgattacgccacgagcccaaaagtAACACCAATAAgagccggtgtaaa
aagggccgataaggtaatatgaaagtataatgttGAGTTATGGTTAATGT
TGATGGCGTTAAGCTTGAAATCATGGATGGCTTATTGAACAACGATACTG
TTAGAAATTTTTAAACCGAATTGAACAATGATACTGTTAGAAAGAGGAGG
CGAaatgtttaaaacaaaattgataatATATTATGATGGATGGATATAGT
TTGTGAAAGACTGGTTGCATGCcttttaatttgtaatttcagtggtttag
cGATTGCTCCATCTAGCGTTCGATCTTTTCGGAAAAGTGATGTTGACCAT
CAATGGATCGCCCgataccttatcgggaaaaaaatgtcggggtttTAATT
agtcggggaaaatttcgtcaaccCCTCAAAATTATCGTCAAAATCTTTCC
CTGATTAGGTATTTGGCAACTGGTTGCTCGTATACCGCTTGACTTCATGC
CATCTCTATAAATTCCATCAGAAAAGGCGTTTTCTACCGAAATCTGTTTA
ACTCTGTGCCCTTTGAAAGGTTTTTAATCCCTATTTTATCTTAATTGATA
TTTTAGTATAAAATTCAATGCACCGAATTCTAAAATATATTCTTTGATTG
GTATACTCTCTAAATCGATCTTCAAGAGACTAAAAATtgttttcgaatta
cagagagtaatttaaaccacttttcaACTGAGggaaccaatattttagtt
agaattacagaaagattcgtaATTGAGAGAGTTGATTGAATatagcaaaa
atttatttgaatttttctcatGTGTTCCGCTACCATTTTAAGACCCGGCT
GGCTGAAACTTTGGTATATATTTGGTGAATACGTGGCTTACTGTTTTGTT
AACTGTTTTTGTTtggtttattttttaacttttttagttttaagattttt
aaattcGAATTTTAGATTTACGCATTATAATAACACATTTTTAAACTATT
ATTTAAACTTTATTACATCAACATATAATTTAAAATCAACAtaatactct
aggggctgagttaggtcccgtatgcgcatcggcgtatagtcattttttct
tttgataatgaAAGTaaagtccttga Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00017941-protein >TCONS_00017941-protein ID=TCONS_00017941-protein|Name=TCONS_00017941-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=739bp
MRSRITLVSNPFQSRWTKIVACSIMTIVVLVNLNILSWRSNSTTAVEIVQ
KVKCESATKTLALAELAAYYEKLLLEKGVNTNTIKDAIASKSGKIFNVFY
DTKVGADKKMIIETIPPAQNVPPPSPSTTPDTRFKGDTKIVFKELGSTNI
LKGVMMDWWFDFCMARESTEVIWHPLLPRVPQLSAITLTLADKDRTVGSN
LYRRMSGYLFVKETASFDFKLLSRDGAEVLVYDTGLTLSKINEINPKMRY
DSKKELFHSKLTKATMDAQDKVIPLSAMFQIESQNIELKKDQIYALEIIQ
GGKHFTKYSLQWKPFGSTFNRYTAIGQENLFHQDGKMVPGLLKQKYDPKP
IYSPNDSELRRLSFYKLPMLESRHLIDEAGLYCEEREKRYIKVDQLYQGY
NEYTDNVKSYPQEYFKFGLDNRYTLLDKATALQIADRTFKKLSRAHQSTL
ELVNVVYVMSNFGPLHNQTITSGPKYFFVELDVRNKSHGSKVFRASHFVE
PINEPTKDLCFVREWAPKGHGQVEINLMTAIKNQRAWLNYLILMLEELLA
EIKDTNVILNLIDYNSTDGDYEQILKASKLKFKYLNPIRDSKLSTKFSKV
KALNYGIKHVQNENSIVFILDLHLQLPLNIFDRIRKLTIQNRTAYNPTLM
KLGCGDHEQYTPKMKSTIWLDYGTGMMSMYKSDWMKVGCFNEKLFKDKWG
GEDWEVMDRMVGNGIQIIHQRLPRFYHIHHDRKHMWNKT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000279:170556..176713- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00017941 ID=TCONS_00017941|Name=TCONS_00017941|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6158bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000279:170556..176713- (Clytia hemisphaerica)
TTTAGATATGAATCCCTGAGAAGGGGAGCTACAAAAAAACGAAAAATTTT
AAAATGCTACTGGCGAATGCTAATTGCGAATAAAAAATGCGAAGCCGAAT
CACTTTGGTTTCCAACCCTTTTCAATCAAGATGGACAAAGATAGTAGCGT
GTTCTATTATGACCATTGTTGTCCTTGTCAATCTGAATATCTTGTCATGG
AGATCCAATAGTACTACAGCTGTTGAAATTGTTCAAAAAGTGAAATGTGA
AAGTGCTACAAAGACGTTGGCGTTAGCCGAACTAGCTGCATATTATGAGA
AGTTATTACTGGAGAAAGGGGTTAATACAAATACGATTAAAGACGCTATT
GCTTCGAAATCTGGAAAAATATTTAATGTTTTCTACGACACAAAAGTAGG
TGCAGACAAGAAAATGATAATTGAGACAATTCCGCCAGCACAAAATGTAC
CTCCTCCGTCACCCTCAACCACGCCAGATACTAGATTCAAAGGAGATACC
AAAATAGTATTCAAGGAGCTGGGCTCTACCAATATTTTAAAAGGTGTCAT
GATGGATTGGTGGTTTGACTTTTGCATGGCGCGAGAATCTACGGAGGTTA
TCTGGCATCCACTGTTACCTAGAGTACCACAACTAAGCGCTATTACATTA
ACCTTGGCTGATAAAGATAGAACTGTTGGTTCAAACTTATACAGGCGAAT
GTCAGGTTATTTGTTTGTCAAAGAAACTGCTTCTTTTGATTTTAAACTAT
TGTCGAGAGACGGTGCTGAAGTGTTAGTGTACGATACAGGGCTGACGTTA
TCCAAAATCAATGAAATTAATCCTAAAATGAGGTATGATTCGAAAAAAGA
ATTATTTCATTCAAAATTAACAAAAGCTACTATGGATGCTCAGGATAAAG
TGATTCCGTTATCTGCCATGTTCCAAATTGAAAGTCAAAATATTGAACTA
AAGAAAGACCAAATTTACGCTCTTGAGATCATTCAAGGTGGTAAACATTT
CACTAAATATAGTTTACAATGGAAACCATTTGGATCTACTTTTAATAGAT
ACACAGCTATTGGTCAAGAAAATCTTTTTCATCAAGATGGGAAAATGGTA
CCAGGCCTTTTGAAACAAAAATATGATCCAAAACCTATATATTCACCTAA
TGATAGCGAGCTACGCAGATTATCTTTCTATAAATTACCAATGTTAGAAA
GCAGACATTTGATCGACGAAGCTGGTCTATATTGCGAGGAACGCGAAAAG
AGGTATATAAAAGTTGACCAATTATATCAAGGTTATAACGAATACACAGA
CAATGTTAAAAGTTATCCGCAAGAATATTTTAAGTTCGGTTTAGATAATC
GATACACTTTATTGGATAAAGCAACGGCTCTTCAAATTGCAGATCGTACA
TTCAAGAAATTGTCAAGGGCACATCAAAGGTATGTGCTTTCAAAATCAGT
TATTTTCTAATTTCTTCATTCACTCTCTTCTGAAGTATTTTGCCTTAAAA
CCTTTTATGTTTTTGTTCAAATTAGTATGAATGCAAGTCCGGGGGGGGGG
GGTACTTATGCAAAATCGGTGCCGTCTACGTGCGAGCCACAAGGGGTACA
AGAACCAATAAAAAGCAAATTGAGTCTCTGTAAGGGTGCAAAATTCACGA
AAATCGAAATTTACTCTCTCAAAAGCGTCGTGATTTTCCAAAATTTGGTC
AAAAGTCGAGTGACAATCGACAAAAATTTTTAGAAAAGTCTCTCTAACTA
AGGTTCCCAAAAACGCCAATTTTTCCTCTCTCGGGTCGATTTTCGAATTT
TGGCTCGACATACCCGTCATCTCGCAAACCTTGGATACAAGTTAATACTC
ACTTGTTGATTTAAAACATCCAACTTTTTCCCGCCCTAATAATCTGTTGT
ATGTTTTGGACACAAAATAGGCCAATCACAGTCATTATTCAAAAAGTCAT
AGGAAAAAGACTTAAATCAAGGTTTAACAACATTTCTAATGTTTACTAGA
TCTAGAATAACCATGCAATATTCCATTTTTATAAACCCCTTTTTCCCTTT
CCTTTAAATTTTAGCACCCTGGAACTTGTCAATGTTGTTTACGTAATGAG
TAATTTTGGTCCACTTCACAATCAAACTATTACATCAGGTCCTAAGTACT
TTTTCGTCGAACTAGACGTTCGAAATAAAAGCCATGGCTCGAAAGTATTC
AGGGCGTCGCACTTTGTTGAACCGATCAATGAACCTACAAAAGATTTATG
TTTTGTACGTGAATGGGCGCCAAAAGGTCATGGACAAGTTGAAATTAATT
TAATGACAGCCATTAAGAATCAAAGGGCGTGGTTGAATTATTTGATCTTA
ATGTTGGAAGAGTTATTGGCAGAAATCAAAGATACAAACGTAAGAATTAG
ATTCCTGTATTTTATTGTTTGTAACGAAATCACCCTGGAGATACGTACAA
GCAACCTCCAAAATTACATAATTTCCAACATAGTAACATGACGTTCGATT
TCAACAAAAATGATCCCTTTTAGAGGCCCTTCAACAGTTTGTGTGATGGC
GTGAAAATTTGAGGTGCGATGCGTGATTTTGCTATTTTTGACTATTTTTT
GCGTGATCAACAATTTTGGGCGATTTTAGTGACTAAAGTTTGCGTGATCA
CGTGATTAGATGGTTGGGGGGGGGGGGGGGCTTTCTTTAAAATCAGTAGA
GATGTTTTAAAAAAAGATACTTCAATAATTGGTCATTTGAAGTAATAAAA
AGGACGCGTTCTTTAGAAAAAATTAACAAAATTGTTTTATTATTGGTTAA
CGACCAACCAAATCAAACAAGAGCTTGTAAAAACTCCATCTCGTCCCTTT
AAAATCGAATACTTCCTTCCTTAAAGAAGGAATTTGCAAACTTGGAATTT
TTTTCCTTTTCAGGTTATTTTGAATTTGATTGATTACAACAGTACGGATG
GTGATTATGAGCAGATCTTGAAAGCCAGCAAATTGAAATTTAAGTATTTG
AACCCAATACGGGATAGCAAATTGTCTACTAAATTTAGCAAAGTCAAAGC
ATTGAATTATGGGATCAAACATGTTCAAAATGAAAATAGCATTGTTTTTA
TACTGGATTTACATTTGCAGTTACCGTTGAATATCTTTGATCGAATCAGA
AAGGTGAGTTTTAAATTCCTTCATTTTTAATATTGAGCCTGTGGCGGTTG
CCTGTACACAGACCCAGTATCTACGGCTAATTTCGAAATTCATTGCCGTA
GAAGGGTCTGTTGTCATTGTCCCTTCTCATTAGAGATTTTTCAAACCGAC
TGCTGCGATGGAGTATTGGTGAGAGAGGGGAGATGATGAGAGAAGTGTTG
CTATTTATAAATCATGTTTTATTGCAGAGGTCTTCGTACGGGAATTTTTT
TACCAAACAATCAATGCGCACAGAGTGTACTACGAAGCGATAAACGTGAG
ATACACTCTGGTACAGAGTAGTGGCTGGTAGCTCAGTCGGTAGAGCATTC
GCTTTACAATCTAAGAGTTGTGGGTTCGATTCCAGGTAACCGTCAACTCA
GTGAATGAGTAGCTTAGATTGGGCATTCTGATCTAGGTGTAAGTTATTGG
GAGCTGAGAGTAGGTGTGGCGCTCCACCTCAGCATTCGAGCTCCCAGATC
TACGACCGCTTCATTATCGTTTTGTTCATTCTATATTTTCTTTATATTAC
CAGTTGACCATTCAGAATCGTACAGCTTACAATCCAACCTTAATGAAGCT
GGGATGTGGTGACCATGAGCAATATACACCAAAGATGAAATCAACCATTT
GGTTAGATTATGGTACTGGCATGATGTCCATGTACAAAAGTGATTGGATG
AAGGTTGGATGTAAGTAGAGTTCCACGCTTAATTATTTTGGCCAACAGTA
AAGCTAAGGTTCAACTTATTGAATATATAAGTATATATTAAATTTTATAG
GACGAAATAACTAGAAATATTTTTTTCCAGGAGCAAAATCATTTTTTTAC
GGGTCAAATATTTACGAGAAGGGGTTAGAGGATTTTCAGGTTGTAGCTGG
AAGATTGTCAAAAATTAACAAATAACCATTTTATCTTCTACTCATTTGAT
TAGGTTTTAATTAGAATCTATTTAAGGTAAATAGGATATGAGATCCATCA
AGATAAACCCTGCACGTTTTTTTATAAGAAGATAAGGCCTCGCTGGCCAA
AATGTTAAGAACAAGTTAAGAACATTCAAAGGCTTTCTGAACTCAAAAAC
ACCCTATTTCTTAGGATAATGGCCAAAAATATTCACATAATGGTCAAAAT
AGAACTAAATAGAACATTTTCAGGCTTAAAACTTAAAAAGTTAAGAACAT
CCGAAGGCTTCAAAAATTTTGGATGTTCTTATAAAAAAACGTGTAGTTTA
CTCATATTTTGATTCAAATCTGCATGCTGGATGATTGTCATAAACTAACA
AATAACCATTTTATCTTATACTCATTTGATTAGGTTTTAATGAAAAGCTG
TTTAAAGATAAATGGGGCGGAGAAGATTGGGAAGTAATGGATCGAATGGT
TGGTAATGGGATACAGATCATTCATCAAAGGTTACCAAGGTTTTATCATA
TTCACCACGATCGAAAACACATGTGGAACAAAACCTGATAGGTGGTGATT
TGAATAAAGTGAAAAGAATACATTCTATGTCTGTCTATGGCGCTGTATGC
GGAACAATAGCTTGGTAATGTTTGATCAAAGACATACAGTAGGATCTATA
ATCCGTCGGAATTGGACTTGAACATATTTTGAATACCTTATCCTGCATTA
TCGGCCTTTTTTACGCCGGCCCTAATAACGCCACAGCCTAAAATTTTCCA
TCGAAAATCACTGATTTTTAAATATAATAAATATTTCACTGAAGTTTCAA
ATATGGAGTAAAACAATGGATAATTTTCGTCTTCGAATCATATCTAAAAT
CCTTTAAATTGAGAAATCATGATAAATGATTAACGCCGCTTTTAGGTTAA
AATTGCAAAATCTTGGCCCTTTTTACGCCGGCCCTGATTACGCCACGAGC
CCAAAAGTAACACCAATAAGAGCCGGTGTAAAAAGGGCCGATAAGGTAAT
ATGAAAGTATAATGTTGAGTTATGGTTAATGTTGATGGCGTTAAGCTTGA
AATCATGGATGGCTTATTGAACAACGATACTGTTAGAAATTTTTAAACCG
AATTGAACAATGATACTGTTAGAAAGAGGAGGCGAAATGTTTAAAACAAA
ATTGATAATATATTATGATGGATGGATATAGTTTGTGAAAGACTGGTTGC
ATGCCTTTTAATTTGTAATTTCAGTGGTTTAGCGATTGCTCCATCTAGCG
TTCGATCTTTTCGGAAAAGTGATGTTGACCATCAATGGATCGCCCGATAC
CTTATCGGGAAAAAAATGTCGGGGTTTTAATTAGTCGGGGAAAATTTCGT
CAACCCCTCAAAATTATCGTCAAAATCTTTCCCTGATTAGGTATTTGGCA
ACTGGTTGCTCGTATACCGCTTGACTTCATGCCATCTCTATAAATTCCAT
CAGAAAAGGCGTTTTCTACCGAAATCTGTTTAACTCTGTGCCCTTTGAAA
GGTTTTTAATCCCTATTTTATCTTAATTGATATTTTAGTATAAAATTCAA
TGCACCGAATTCTAAAATATATTCTTTGATTGGTATACTCTCTAAATCGA
TCTTCAAGAGACTAAAAATTGTTTTCGAATTACAGAGAGTAATTTAAACC
ACTTTTCAACTGAGGGAACCAATATTTTAGTTAGAATTACAGAAAGATTC
GTAATTGAGAGAGTTGATTGAATATAGCAAAAATTTATTTGAATTTTTCT
CATGTGTTCCGCTACCATTTTAAGACCCGGCTGGCTGAAACTTTGGTATA
TATTTGGTGAATACGTGGCTTACTGTTTTGTTAACTGTTTTTGTTTGGTT
TATTTTTTAACTTTTTTAGTTTTAAGATTTTTAAATTCGAATTTTAGATT
TACGCATTATAATAACACATTTTTAAACTATTATTTAAACTTTATTACAT
CAACATATAATTTAAAATCAACATAATACTCTAGGGGCTGAGTTAGGTCC
CGTATGCGCATCGGCGTATAGTCATTTTTTCTTTTGATAATGAAAGTAAA
GTCCTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000279:170556..176713- >TCONS_00017941 ID=TCONS_00017941|Name=TCONS_00017941|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=11100bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000279:170556..176713- (Clytia hemisphaerica)
GTTTTAATGAAAAGCTGTTTAAAGATAAATGGGGCGGAGAAGATTGGGAA
GTAATGGATCGAATGGTTGGTAATGGGATACAGATCATTCATCAAAGGTT
ACCAAGGTTTTATCATATTCACCACGATCGAAAACACATGTGGAACAAAA
CCTGATTGACCATTCAGAATCGTACAGCTTACAATCCAACCTTAATGAAG
CTGGGATGTGGTGACCATGAGCAATATACACCAAAGATGAAATCAACCAT
TTGGTTAGATTATGGTACTGGCATGATGTCCATGTACAAAAGTGATTGGA
TGAAGGTTGGATGTTATTTTGAATTTGATTGATTACAACAGTACGGATGG
TGATTATGAGCAGATCTTGAAAGCCAGCAAATTGAAATTTAAGTATTTGA
ACCCAATACGGGATAGCAAATTGTCTACTAAATTTAGCAAAGTCAAAGCA
TTGAATTATGGGATCAAACATGTTCAAAATGAAAATAGCATTGTTTTTAT
ACTGGATTTACATTTGCAGTTACCGTTGAATATCTTTGATCGAATCAGAA
AGCACCCTGGAACTTGTCAATGTTGTTTACGTAATGAGTAATTTTGGTCC
ACTTCACAATCAAACTATTACATCAGGTCCTAAGTACTTTTTCGTCGAAC
TAGACGTTCGAAATAAAAGCCATGGCTCGAAAGTATTCAGGGCGTCGCAC
TTTGTTGAACCGATCAATGAACCTACAAAAGATTTATGTTTTGTACGTGA
ATGGGCGCCAAAAGGTCATGGACAAGTTGAAATTAATTTAATGACAGCCA
TTAAGAATCAAAGGGCGTGGTTGAATTATTTGATCTTAATGTTGGAAGAG
TTATTGGCAGAAATCAAAGATACAAACATGCGAAGCCGAATCACTTTGGT
TTCCAACCCTTTTCAATCAAGATGGACAAAGATAGTAGCGTGTTCTATTA
TGACCATTGTTGTCCTTGTCAATCTGAATATCTTGTCATGGAGATCCAAT
AGTACTACAGCTGTTGAAATTGTTCAAAAAGTGAAATGTGAAAGTGCTAC
AAAGACGTTGGCGTTAGCCGAACTAGCTGCATATTATGAGAAGTTATTAC
TGGAGAAAGGGGTTAATACAAATACGATTAAAGACGCTATTGCTTCGAAA
TCTGGAAAAATATTTAATGTTTTCTACGACACAAAAGTAGGTGCAGACAA
GAAAATGATAATTGAGACAATTCCGCCAGCACAAAATGTACCTCCTCCGT
CACCCTCAACCACGCCAGATACTAGATTCAAAGGAGATACCAAAATAGTA
TTCAAGGAGCTGGGCTCTACCAATATTTTAAAAGGTGTCATGATGGATTG
GTGGTTTGACTTTTGCATGGCGCGAGAATCTACGGAGGTTATCTGGCATC
CACTGTTACCTAGAGTACCACAACTAAGCGCTATTACATTAACCTTGGCT
GATAAAGATAGAACTGTTGGTTCAAACTTATACAGGCGAATGTCAGGTTA
TTTGTTTGTCAAAGAAACTGCTTCTTTTGATTTTAAACTATTGTCGAGAG
ACGGTGCTGAAGTGTTAGTGTACGATACAGGGCTGACGTTATCCAAAATC
AATGAAATTAATCCTAAAATGAGGTATGATTCGAAAAAAGAATTATTTCA
TTCAAAATTAACAAAAGCTACTATGGATGCTCAGGATAAAGTGATTCCGT
TATCTGCCATGTTCCAAATTGAAAGTCAAAATATTGAACTAAAGAAAGAC
CAAATTTACGCTCTTGAGATCATTCAAGGTGGTAAACATTTCACTAAATA
TAGTTTACAATGGAAACCATTTGGATCTACTTTTAATAGATACACAGCTA
TTGGTCAAGAAAATCTTTTTCATCAAGATGGGAAAATGGTACCAGGCCTT
TTGAAACAAAAATATGATCCAAAACCTATATATTCACCTAATGATAGCGA
GCTACGCAGATTATCTTTCTATAAATTACCAATGTTAGAAAGCAGACATT
TGATCGACGAAGCTGGTCTATATTGCGAGGAACGCGAAAAGAGGTATATA
AAAGTTGACCAATTATATCAAGGTTATAACGAATACACAGACAATGTTAA
AAGTTATCCGCAAGAATATTTTAAGTTCGGTTTAGATAATCGATACACTT
TATTGGATAAAGCAACGGCTCTTCAAATTGCAGATCGTACATTCAAGAAA
TTGTCAAGGGCACATCAAAGGTTTTAATGAAAAGCTGTTTAAAGATAAAT
GGGGCGGAGAAGATTGGGAAGTAATGGATCGAATGGTTGGTAATGGGATA
CAGATCATTCATCAAAGGTTACCAAGGTTTTATCATATTCACCACGATCG
AAAACACATGTGGAACAAAACCTGATTGACCATTCAGAATCGTACAGCTT
ACAATCCAACCTTAATGAAGCTGGGATGTGGTGACCATGAGCAATATACA
CCAAAGATGAAATCAACCATTTGGTTAGATTATGGTACTGGCATGATGTC
CATGTACAAAAGTGATTGGATGAAGGTTGGATGTTATTTTGAATTTGATT
GATTACAACAGTACGGATGGTGATTATGAGCAGATCTTGAAAGCCAGCAA
ATTGAAATTTAAGTATTTGAACCCAATACGGGATAGCAAATTGTCTACTA
AATTTAGCAAAGTCAAAGCATTGAATTATGGGATCAAACATGTTCAAAAT
GAAAATAGCATTGTTTTTATACTGGATTTACATTTGCAGTTACCGTTGAA
TATCTTTGATCGAATCAGAAAGCACCCTGGAACTTGTCAATGTTGTTTAC
GTAATGAGTAATTTTGGTCCACTTCACAATCAAACTATTACATCAGGTCC
TAAGTACTTTTTCGTCGAACTAGACGTTCGAAATAAAAGCCATGGCTCGA
AAGTATTCAGGGCGTCGCACTTTGTTGAACCGATCAATGAACCTACAAAA
GATTTATGTTTTGTACGTGAATGGGCGCCAAAAGGTCATGGACAAGTTGA
AATTAATTTAATGACAGCCATTAAGAATCAAAGGGCGTGGTTGAATTATT
TGATCTTAATGTTGGAAGAGTTATTGGCAGAAATCAAAGATACAAACATG
CGAAGCCGAATCACTTTGGTTTCCAACCCTTTTCAATCAAGATGGACAAA
GATAGTAGCGTGTTCTATTATGACCATTGTTGTCCTTGTCAATCTGAATA
TCTTGTCATGGAGATCCAATAGTACTACAGCTGTTGAAATTGTTCAAAAA
GTGAAATGTGAAAGTGCTACAAAGACGTTGGCGTTAGCCGAACTAGCTGC
ATATTATGAGAAGTTATTACTGGAGAAAGGGGTTAATACAAATACGATTA
AAGACGCTATTGCTTCGAAATCTGGAAAAATATTTAATGTTTTCTACGAC
ACAAAAGTAGGTGCAGACAAGAAAATGATAATTGAGACAATTCCGCCAGC
ACAAAATGTACCTCCTCCGTCACCCTCAACCACGCCAGATACTAGATTCA
AAGGAGATACCAAAATAGTATTCAAGGAGCTGGGCTCTACCAATATTTTA
AAAGGTGTCATGATGGATTGGTGGTTTGACTTTTGCATGGCGCGAGAATC
TACGGAGGTTATCTGGCATCCACTGTTACCTAGAGTACCACAACTAAGCG
CTATTACATTAACCTTGGCTGATAAAGATAGAACTGTTGGTTCAAACTTA
TACAGGCGAATGTCAGGTTATTTGTTTGTCAAAGAAACTGCTTCTTTTGA
TTTTAAACTATTGTCGAGAGACGGTGCTGAAGTGTTAGTGTACGATACAG
GGCTGACGTTATCCAAAATCAATGAAATTAATCCTAAAATGAGGTATGAT
TCGAAAAAAGAATTATTTCATTCAAAATTAACAAAAGCTACTATGGATGC
TCAGGATAAAGTGATTCCGTTATCTGCCATGTTCCAAATTGAAAGTCAAA
ATATTGAACTAAAGAAAGACCAAATTTACGCTCTTGAGATCATTCAAGGT
GGTAAACATTTCACTAAATATAGTTTACAATGGAAACCATTTGGATCTAC
TTTTAATAGATACACAGCTATTGGTCAAGAAAATCTTTTTCATCAAGATG
GGAAAATGGTACCAGGCCTTTTGAAACAAAAATATGATCCAAAACCTATA
TATTCACCTAATGATAGCGAGCTACGCAGATTATCTTTCTATAAATTACC
AATGTTAGAAAGCAGACATTTGATCGACGAAGCTGGTCTATATTGCGAGG
AACGCGAAAAGAGGTATATAAAAGTTGACCAATTATATCAAGGTTATAAC
GAATACACAGACAATGTTAAAAGTTATCCGCAAGAATATTTTAAGTTCGG
TTTAGATAATCGATACACTTTATTGGATAAAGCAACGGCTCTTCAAATTG
CAGATCGTACATTCAAGAAATTGTCAAGGGCACATCAAAGGTTTTAATGA
AAAGCTGTTTAAAGATAAATGGGGCGGAGAAGATTGGGAAGTAATGGATC
GAATGGTTGGTAATGGGATACAGATCATTCATCAAAGGTTACCAAGGTTT
TATCATATTCACCACGATCGAAAACACATGTGGAACAAAACCTGATTGAC
CATTCAGAATCGTACAGCTTACAATCCAACCTTAATGAAGCTGGGATGTG
GTGACCATGAGCAATATACACCAAAGATGAAATCAACCATTTGGTTAGAT
TATGGTACTGGCATGATGTCCATGTACAAAAGTGATTGGATGAAGGTTGG
ATGTTATTTTGAATTTGATTGATTACAACAGTACGGATGGTGATTATGAG
CAGATCTTGAAAGCCAGCAAATTGAAATTTAAGTATTTGAACCCAATACG
GGATAGCAAATTGTCTACTAAATTTAGCAAAGTCAAAGCATTGAATTATG
GGATCAAACATGTTCAAAATGAAAATAGCATTGTTTTTATACTGGATTTA
CATTTGCAGTTACCGTTGAATATCTTTGATCGAATCAGAAAGCACCCTGG
AACTTGTCAATGTTGTTTACGTAATGAGTAATTTTGGTCCACTTCACAAT
CAAACTATTACATCAGGTCCTAAGTACTTTTTCGTCGAACTAGACGTTCG
AAATAAAAGCCATGGCTCGAAAGTATTCAGGGCGTCGCACTTTGTTGAAC
CGATCAATGAACCTACAAAAGATTTATGTTTTGTACGTGAATGGGCGCCA
AAAGGTCATGGACAAGTTGAAATTAATTTAATGACAGCCATTAAGAATCA
AAGGGCGTGGTTGAATTATTTGATCTTAATGTTGGAAGAGTTATTGGCAG
AAATCAAAGATACAAACATGCGAAGCCGAATCACTTTGGTTTCCAACCCT
TTTCAATCAAGATGGACAAAGATAGTAGCGTGTTCTATTATGACCATTGT
TGTCCTTGTCAATCTGAATATCTTGTCATGGAGATCCAATAGTACTACAG
CTGTTGAAATTGTTCAAAAAGTGAAATGTGAAAGTGCTACAAAGACGTTG
GCGTTAGCCGAACTAGCTGCATATTATGAGAAGTTATTACTGGAGAAAGG
GGTTAATACAAATACGATTAAAGACGCTATTGCTTCGAAATCTGGAAAAA
TATTTAATGTTTTCTACGACACAAAAGTAGGTGCAGACAAGAAAATGATA
ATTGAGACAATTCCGCCAGCACAAAATGTACCTCCTCCGTCACCCTCAAC
CACGCCAGATACTAGATTCAAAGGAGATACCAAAATAGTATTCAAGGAGC
TGGGCTCTACCAATATTTTAAAAGGTGTCATGATGGATTGGTGGTTTGAC
TTTTGCATGGCGCGAGAATCTACGGAGGTTATCTGGCATCCACTGTTACC
TAGAGTACCACAACTAAGCGCTATTACATTAACCTTGGCTGATAAAGATA
GAACTGTTGGTTCAAACTTATACAGGCGAATGTCAGGTTATTTGTTTGTC
AAAGAAACTGCTTCTTTTGATTTTAAACTATTGTCGAGAGACGGTGCTGA
AGTGTTAGTGTACGATACAGGGCTGACGTTATCCAAAATCAATGAAATTA
ATCCTAAAATGAGGTATGATTCGAAAAAAGAATTATTTCATTCAAAATTA
ACAAAAGCTACTATGGATGCTCAGGATAAAGTGATTCCGTTATCTGCCAT
GTTCCAAATTGAAAGTCAAAATATTGAACTAAAGAAAGACCAAATTTACG
CTCTTGAGATCATTCAAGGTGGTAAACATTTCACTAAATATAGTTTACAA
TGGAAACCATTTGGATCTACTTTTAATAGATACACAGCTATTGGTCAAGA
AAATCTTTTTCATCAAGATGGGAAAATGGTACCAGGCCTTTTGAAACAAA
AATATGATCCAAAACCTATATATTCACCTAATGATAGCGAGCTACGCAGA
TTATCTTTCTATAAATTACCAATGTTAGAAAGCAGACATTTGATCGACGA
AGCTGGTCTATATTGCGAGGAACGCGAAAAGAGGTATATAAAAGTTGACC
AATTATATCAAGGTTATAACGAATACACAGACAATGTTAAAAGTTATCCG
CAAGAATATTTTAAGTTCGGTTTAGATAATCGATACACTTTATTGGATAA
AGCAACGGCTCTTCAAATTGCAGATCGTACATTCAAGAAATTGTCAAGGG
CACATCAAAGGTTTTAATGAAAAGCTGTTTAAAGATAAATGGGGCGGAGA
AGATTGGGAAGTAATGGATCGAATGGTTGGTAATGGGATACAGATCATTC
ATCAAAGGTTACCAAGGTTTTATCATATTCACCACGATCGAAAACACATG
TGGAACAAAACCTGATTGACCATTCAGAATCGTACAGCTTACAATCCAAC
CTTAATGAAGCTGGGATGTGGTGACCATGAGCAATATACACCAAAGATGA
AATCAACCATTTGGTTAGATTATGGTACTGGCATGATGTCCATGTACAAA
AGTGATTGGATGAAGGTTGGATGTTATTTTGAATTTGATTGATTACAACA
GTACGGATGGTGATTATGAGCAGATCTTGAAAGCCAGCAAATTGAAATTT
AAGTATTTGAACCCAATACGGGATAGCAAATTGTCTACTAAATTTAGCAA
AGTCAAAGCATTGAATTATGGGATCAAACATGTTCAAAATGAAAATAGCA
TTGTTTTTATACTGGATTTACATTTGCAGTTACCGTTGAATATCTTTGAT
CGAATCAGAAAGCACCCTGGAACTTGTCAATGTTGTTTACGTAATGAGTA
ATTTTGGTCCACTTCACAATCAAACTATTACATCAGGTCCTAAGTACTTT
TTCGTCGAACTAGACGTTCGAAATAAAAGCCATGGCTCGAAAGTATTCAG
GGCGTCGCACTTTGTTGAACCGATCAATGAACCTACAAAAGATTTATGTT
TTGTACGTGAATGGGCGCCAAAAGGTCATGGACAAGTTGAAATTAATTTA
ATGACAGCCATTAAGAATCAAAGGGCGTGGTTGAATTATTTGATCTTAAT
GTTGGAAGAGTTATTGGCAGAAATCAAAGATACAAACATGCGAAGCCGAA
TCACTTTGGTTTCCAACCCTTTTCAATCAAGATGGACAAAGATAGTAGCG
TGTTCTATTATGACCATTGTTGTCCTTGTCAATCTGAATATCTTGTCATG
GAGATCCAATAGTACTACAGCTGTTGAAATTGTTCAAAAAGTGAAATGTG
AAAGTGCTACAAAGACGTTGGCGTTAGCCGAACTAGCTGCATATTATGAG
AAGTTATTACTGGAGAAAGGGGTTAATACAAATACGATTAAAGACGCTAT
TGCTTCGAAATCTGGAAAAATATTTAATGTTTTCTACGACACAAAAGTAG
GTGCAGACAAGAAAATGATAATTGAGACAATTCCGCCAGCACAAAATGTA
CCTCCTCCGTCACCCTCAACCACGCCAGATACTAGATTCAAAGGAGATAC
CAAAATAGTATTCAAGGAGCTGGGCTCTACCAATATTTTAAAAGGTGTCA
TGATGGATTGGTGGTTTGACTTTTGCATGGCGCGAGAATCTACGGAGGTT
ATCTGGCATCCACTGTTACCTAGAGTACCACAACTAAGCGCTATTACATT
AACCTTGGCTGATAAAGATAGAACTGTTGGTTCAAACTTATACAGGCGAA
TGTCAGGTTATTTGTTTGTCAAAGAAACTGCTTCTTTTGATTTTAAACTA
TTGTCGAGAGACGGTGCTGAAGTGTTAGTGTACGATACAGGGCTGACGTT
ATCCAAAATCAATGAAATTAATCCTAAAATGAGGTATGATTCGAAAAAAG
AATTATTTCATTCAAAATTAACAAAAGCTACTATGGATGCTCAGGATAAA
GTGATTCCGTTATCTGCCATGTTCCAAATTGAAAGTCAAAATATTGAACT
AAAGAAAGACCAAATTTACGCTCTTGAGATCATTCAAGGTGGTAAACATT
TCACTAAATATAGTTTACAATGGAAACCATTTGGATCTACTTTTAATAGA
TACACAGCTATTGGTCAAGAAAATCTTTTTCATCAAGATGGGAAAATGGT
ACCAGGCCTTTTGAAACAAAAATATGATCCAAAACCTATATATTCACCTA
ATGATAGCGAGCTACGCAGATTATCTTTCTATAAATTACCAATGTTAGAA
AGCAGACATTTGATCGACGAAGCTGGTCTATATTGCGAGGAACGCGAAAA
GAGGTATATAAAAGTTGACCAATTATATCAAGGTTATAACGAATACACAG
ACAATGTTAAAAGTTATCCGCAAGAATATTTTAAGTTCGGTTTAGATAAT
CGATACACTTTATTGGATAAAGCAACGGCTCTTCAAATTGCAGATCGTAC
ATTCAAGAAATTGTCAAGGGCACATCAAAGGTTTTAATGAAAAGCTGTTT
AAAGATAAATGGGGCGGAGAAGATTGGGAAGTAATGGATCGAATGGTTGG
TAATGGGATACAGATCATTCATCAAAGGTTACCAAGGTTTTATCATATTC
ACCACGATCGAAAACACATGTGGAACAAAACCTGATTGACCATTCAGAAT
CGTACAGCTTACAATCCAACCTTAATGAAGCTGGGATGTGGTGACCATGA
GCAATATACACCAAAGATGAAATCAACCATTTGGTTAGATTATGGTACTG
GCATGATGTCCATGTACAAAAGTGATTGGATGAAGGTTGGATGTTATTTT
GAATTTGATTGATTACAACAGTACGGATGGTGATTATGAGCAGATCTTGA
AAGCCAGCAAATTGAAATTTAAGTATTTGAACCCAATACGGGATAGCAAA
TTGTCTACTAAATTTAGCAAAGTCAAAGCATTGAATTATGGGATCAAACA
TGTTCAAAATGAAAATAGCATTGTTTTTATACTGGATTTACATTTGCAGT
TACCGTTGAATATCTTTGATCGAATCAGAAAGCACCCTGGAACTTGTCAA
TGTTGTTTACGTAATGAGTAATTTTGGTCCACTTCACAATCAAACTATTA
CATCAGGTCCTAAGTACTTTTTCGTCGAACTAGACGTTCGAAATAAAAGC
CATGGCTCGAAAGTATTCAGGGCGTCGCACTTTGTTGAACCGATCAATGA
ACCTACAAAAGATTTATGTTTTGTACGTGAATGGGCGCCAAAAGGTCATG
GACAAGTTGAAATTAATTTAATGACAGCCATTAAGAATCAAAGGGCGTGG
TTGAATTATTTGATCTTAATGTTGGAAGAGTTATTGGCAGAAATCAAAGA
TACAAACATGCGAAGCCGAATCACTTTGGTTTCCAACCCTTTTCAATCAA
GATGGACAAAGATAGTAGCGTGTTCTATTATGACCATTGTTGTCCTTGTC
AATCTGAATATCTTGTCATGGAGATCCAATAGTACTACAGCTGTTGAAAT
TGTTCAAAAAGTGAAATGTGAAAGTGCTACAAAGACGTTGGCGTTAGCCG
AACTAGCTGCATATTATGAGAAGTTATTACTGGAGAAAGGGGTTAATACA
AATACGATTAAAGACGCTATTGCTTCGAAATCTGGAAAAATATTTAATGT
TTTCTACGACACAAAAGTAGGTGCAGACAAGAAAATGATAATTGAGACAA
TTCCGCCAGCACAAAATGTACCTCCTCCGTCACCCTCAACCACGCCAGAT
ACTAGATTCAAAGGAGATACCAAAATAGTATTCAAGGAGCTGGGCTCTAC
CAATATTTTAAAAGGTGTCATGATGGATTGGTGGTTTGACTTTTGCATGG
CGCGAGAATCTACGGAGGTTATCTGGCATCCACTGTTACCTAGAGTACCA
CAACTAAGCGCTATTACATTAACCTTGGCTGATAAAGATAGAACTGTTGG
TTCAAACTTATACAGGCGAATGTCAGGTTATTTGTTTGTCAAAGAAACTG
CTTCTTTTGATTTTAAACTATTGTCGAGAGACGGTGCTGAAGTGTTAGTG
TACGATACAGGGCTGACGTTATCCAAAATCAATGAAATTAATCCTAAAAT
GAGGTATGATTCGAAAAAAGAATTATTTCATTCAAAATTAACAAAAGCTA
CTATGGATGCTCAGGATAAAGTGATTCCGTTATCTGCCATGTTCCAAATT
GAAAGTCAAAATATTGAACTAAAGAAAGACCAAATTTACGCTCTTGAGAT
CATTCAAGGTGGTAAACATTTCACTAAATATAGTTTACAATGGAAACCAT
TTGGATCTACTTTTAATAGATACACAGCTATTGGTCAAGAAAATCTTTTT
CATCAAGATGGGAAAATGGTACCAGGCCTTTTGAAACAAAAATATGATCC
AAAACCTATATATTCACCTAATGATAGCGAGCTACGCAGATTATCTTTCT
ATAAATTACCAATGTTAGAAAGCAGACATTTGATCGACGAAGCTGGTCTA
TATTGCGAGGAACGCGAAAAGAGGTATATAAAAGTTGACCAATTATATCA
AGGTTATAACGAATACACAGACAATGTTAAAAGTTATCCGCAAGAATATT
TTAAGTTCGGTTTAGATAATCGATACACTTTATTGGATAAAGCAACGGCT
CTTCAAATTGCAGATCGTACATTCAAGAAATTGTCAAGGGCACATCAAAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1575043694:175285..176713 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1575043694:175285..176713 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1575043694:174325..174649 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1575043694:174325..174649 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1575043694:173561..173800 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1575043694:173561..173800 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1575043694:172854..173010 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1575043694:172854..173010 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1575043694:170556..172230 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1575043694:170556..172230 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1510915933:175285..176713 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1510915933:175285..176713 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1510915933:174325..174649 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1510915933:174325..174649 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1510915933:173561..173800 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1510915933:173561..173800 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1510915933:172854..173010 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1510915933:172854..173010 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1510915933:170556..172230 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1510915933:170556..172230 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1491911889:175285..176713 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1491911889:175285..176713 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1491911889:174325..174649 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1491911889:174325..174649 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1491911889:173561..173800 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1491911889:173561..173800 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1491911889:172854..173010 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1491911889:172854..173010 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017941-exon-sc0000279-1491911889:170556..172230 | TCONS_00017941-exon-sc0000279-1491911889:170556..172230 | Clytia hemisphaerica | exon |
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000279 | supercontig | sc0000279:170556..176713 - |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
| Term | Definition |
|---|
| IPR029044 | Nucleotide-diphossugar_trans |
| IPR008428 | Chond_GalNAc |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0008376 | acetylgalactosaminyltransferase activity |
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0032580 | Golgi cisterna membrane |
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
| Category |
Term Accession |
Term Name |
| cellular_component |
GO:0032580 |
Golgi cisterna membrane |
| molecular_function |
GO:0008376 |
acetylgalactosaminyltransferase activity |
Blast
BLAST of TCONS_00017941 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: B4GN4 (N-acetyl-beta-glucosaminyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylgalactosaminyltransferase 1 OS=Homo sapiens GN=B4GALNT4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 155.606 bits (392), Expect = 3.101e-38 Identity = 75/216 (34.72%), Postives = 127/216 (58.80%), Query Frame = 3
Query: 1653 VEINLMTAIKNQRAWXXXXXXXXXXXXXXIKDTNVILNLIDYNSTDGDYEQILKASKL-KFKYLNPIRDSKLSTKFSKVKALNYGIKHVQNENSIVFILDLHLQLPLNIFDRIRKLTIQNRTAYNPTLMKLGCGDHEQYTPKMKSTIWLDYGTGMMSMYKSDWMKVGCFNEKLFKDKWGGEDWEVMDRMVGNGIQIIHQRLPRFYHIHHDRKHMWN 2297
V ++ + +KNQ W+ + + L A D+ + L+D+ S D D E+ L+A++L +++YL + + F + L G+ V++ +SIVF+ DLH+ P NI D IRK ++ R A+ P +M+L CG +P+ W G G+ +YKSD+ +VG N + F+D+WGGEDWE++DR++ G+++ RL FYH +H ++ MW+
Sbjct: 822 VMVHFIVPVKNQARWVAQFLADMAALHARTGDSRFSVVLVDFESEDMDVERALRAARLPRYQYL------RRTGNFERSAGLQAGVDAVEDASSIVFLCDLHIHFPPNILDGIRKHCVEGRLAFAPVVMRLSCGS----SPRDPHGYWEVNGFGLFGIYKSDFDRVGGMNTEEFRDQWGGEDWELLDRVLQAGLEVERLRLRNFYHHYHSKRGMWS 1027
The following BLAST results are available for this feature:
|
