TCONS_00019129 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00019129
Unique NameTCONS_00019129
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length3892

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00019129 ID=TCONS_00019129|Name=TCONS_00019129|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3892bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000319:329913..333804-

Legend: exon
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>TCONS_00019129 ID=TCONS_00019129|Name=TCONS_00019129|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3892bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000319:329913..333804- (Clytia hemisphaerica)
TCATGACAATTTTTTCAAAAATTCTTGCTAAAAACCTGTTGTTAGGCATT AAAATGGCAGCACAAAATTAACAGTTTTAACAGAGACAGATATATTCTAA AGATTTTTCTTTCAAATTTATACAGGAAAAAAGAGATAATGAAGGAGGTA AACAATGGTTCCATAAATGAAATGCAGCTCTGGCACGGTACCAATGAAAA AGCCATTTTTTACTCTTTATGCAAAACTTCACAACAATAAATGATTTTCA ATGGAAAAACAGTTTAGTTTAATACTGAAAGATTGCATTTTAATGTAAAT TTTAGTTAATATTTACTGTTTTGAAGCCTGAATGGCAATTTTTACAAGTT TTGGCGTCATTTACGGCCCTTATAATTGGCGTAAGCCCAAAATTAGGCGG TGGCATAAAAGGGCCGGCTTAAAAAGGGCCGATAAGGTATATCACTTTTT TTTAATTTCAATTAATTGATTAACTTTTACATTTTGTTTTACGTTTTTTA CGTTAATTTTTCAAATTAGTTCGATTGAGAATAAATTCAATTATCATAAC AATTTCTTCAAAAACTCTTGCTAAAAATCTGTAGTTTGGCATTAAATGGC AGCACAAAATGTAGAAGAAAACCCTCAACTAAGCTTTTCAATTTTTCTCA CCATGGATCCAAATTTTCGAAAATTTAAGGCTTTGTTATCCTTAAGCCCG ATTGTAAGAAATCCATGTCTTAACTAGTTTAATGGAGATGCAGCTTAATG ACTTTTATTATGAATATTTTTATTCGAGGTACTGTGATCGACATGGATCA TATAATGGCGGCAATTCCAGTGATTGGACCTGCAAAGAATTAATTTTGTA TTTTTAGCTTATATTTATCACTCTTTAATTTCAATCAATTGATTAATTTT TACATTTTACTTTGCTTTTTACTTTTTACGGTAATTCGCCAAAATTATTT CTAGCCAAAATTAAAAAAATTATCAAAAATAAATTTGTCTATCATTGACG CAGACGCAAAATACAACAACTGACCGCCTTGCGTACATCAATCAAGTTCG TATTCATTTTCTTATAAGCTTTCCCTCGCTTAAACTTTTGCCTTTATCTT GTGTTGTTTTAGGTAGTCATTAATCAACTGAGAGACCTCTAACTAACTAT TGATTTATTGTAAGAAGTGGATGTTTGAATTCGTCCTTTTTGATTTGTTG ACAGAAACATCTTCAGACAACGTAAATTCAACAATTCAAACCCAAATCAC TTAGATCTGGCACTAGAACTTGCAGCTTCAAGAAGAGCTGGCACAATGGC AGGATGAGTGTCGTTTTAGCCTGTACCTCTACCAAGTCCATGTAGACTTA CAGATCGACAAATCAAAACTCTCGTTTATTTGATAAATCGGATTTTACGA ACATAAACATTATCCATTTCGAACAAGCTAAACGGCCGATTCGTAACTCT GTACAGTAGTAGAATTTATATTCTAGTCTGTAAAATTTACTTCTTTTTAT TGTTTTATGATATTTTTAGTTTCATTTGTTGTTGTTTTTGCCGATTTAAA AAAAAAATTAATAAGCATGGTAAAGCAAAATTATTTAGATTTGGCCTTAG TGAGTACTTAATTAGACAATATCTTCTTTTTTGTTCATGTGACTGAAATT TAACATACGCGTATTATAGCTCGCAGTTATTCAAACTTTAAGACCCTTTT TGGCCATTTTTGTTGACGAAATTTTTACGATATAGGTAACAGTAGAACTA GTCTGAAAAGTCAATAAAAAAGATCCGAAAAAAGAGCGAAGTACTGTTAT CTGTTTTTTCTATTATTTGGCCAAAAGTTTAAACTGTTCGAGCTCATAGT TTTTTTTGGATTTTGAATTGTTATTTGATAACATTGACGAGGGCCTTCGT TTCATTTTGTAGGTCGAGAGAATCATATTTAGTGTGTTCAATGAGGAAAG TTTACGGGTATATGAAAACAAGATTACCAAAGTTAAACAAAATGACACAA CTTACACATGTCAGGTATCTCTTATCAAAATCCTTACCAACTTACTTTTG CTTACAAGTATATTCAATTGTTTTTAAATAGAATTTCTTAAAATCGCGAG TAAAAGCGTCTGGAAGCAACTCAGTAAAAGGGATTTTCAATTTACCTTGT TAAAGCCTTTTTTGTGCAATGATTATGTTGGAAAATTTACCATATAATTG AAATGACGAGGCTTCTATTATCATCTTTTTTTATCAAAAGCAGCAAATTT TCTTTGAAGTTAATTCCCAAAATCTCTGGATGGCGAATAGGCAAATGTTT CAATTTGATGTGAGTCCACTAATTAATACCTTACCTAAATTTTGTCTGAG TTTAGAACCAATGACATAATAGGTTTGGCTTGCCTGGAAAACGAGCTTTT CTGAAAATCATTGTTCACTTGTTGCTGTTGTAATTGTTAGTAGTCTCATC TTGGAAAATAAAAACGGTCTTTTTTAAGGTCACGTGTTTCAAATAAAACA AACAACAGAGCGAAACGGGAGCTTCGTCGTTTGTCGAAAACTTGACGATT GAATGTGTTCTATTATATTTCTCAGTATATTTTAGAAGACGGCTACACAC GTCTCAATATACACTGCAGTCGAATGGAGCACCACCACACCGTTATTTGT ACCAGGGTAAGATAACAATATCAAATTTACCTTGTCGCTTTACGAAAGGG ATTTTAACTCTGAAAAAAATGGATACATAATTTTCCAATCAAACGCTAAT GATTGTGTTAAAGCGCTGTCGTTATTACCTATGCTTGTGCTCCATATTTT TTGGTTATTGGGTCAAAGCCAAGCTACATTTTTTTATAAGAACCAATAAA ATCTAGTTAAGGCTCAGCTGTTAGTTTTCTTGTTTGACACCTTTGAGCTT CGAATCATTCTTATATTGTTCTTATTATTAGAGTAAAATTAAGCTGTCGT AGAACCCAAACCCTTGGTTTGCTAGAAATCTAGCCATTCCAAACCTTTTC AAATTGCTCCCATTTTTCAGTAAGAATTGACTTTGGATATGAAGATTGAA ATATGCAGCAGTGCCAAAGTTTATCTCATCCGTTTGAAACCCAAAGATCG TTTTATTTCCCCAAATCCAATATTCATGTTATTATGTTGACTAGAAAGCG TTTACCTTTGCTAGGATATAGGAACGCAAGAACTGTACTAAAAAAAGTTC TCACAAAAAAAGATATATTTGATACTTTACAAAATATATGGCATGCTATT ATTCTTTTCAATGGCTGTAAACTCACGGTATAATCATATGTCTTTAGATT GTTTTTATATCGATTGATTTTCATTCAATTTTACTGACAGGTTGGATGGA TTAACTTCGAAACCCTGGTGGATCTGGATGCCATTCCGGCAAGGGATGGA TCAGTCCGGAGAACCCATGTCTTAAGACAAAATGGAAATCNATCTGGATG CCATTCCGGCAGGGACCACCCATATCTTAAGACAAAATAGAAGTAAGTTG AATTGTGAAGTTCTTATGGTGGGTTAAATTATTCTTACTATCCTTAATGT TAGATAAAAAGTGAATGTTATGGGAAATTAGGATCTTACGTATAACTCGT TTTTTAATTTCCTTTAGAAACCCTGTGTCACAGACCAGCTGGAACCCCAG CCCCACTGGAAAATTTGGAAAGAATTTCGTCCCCGATGGGAAATTACCCT GAACTTCAGTATTCCAGTGAGTTTCTAATTTTGAATAAGGCTAAGGATTT TTGGGTTTAGGGTACACGGGAATATATATATATTATAGTAAAGGAGTATA AAACCTTCAACTACTTAAAATGGAAACAATAAAGACAAAACTCACAAAAC AAAAAGACAATATAAATACAACAAAAATCTAGAATGAACATT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_010726XLOC_010726Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00019129-exon-sc0000319-1575043694:329913..333804TCONS_00019129-exon-sc0000319-1575043694:329913..333804Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019129-exon-sc0000319-1510915933:329913..333804TCONS_00019129-exon-sc0000319-1510915933:329913..333804Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019129-exon-sc0000319-1491911889:329913..333804TCONS_00019129-exon-sc0000319-1491911889:329913..333804Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000319supercontigsc0000319:329913..333804 -
Expression

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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00019129 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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