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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00019129 ID=TCONS_00019129|Name=TCONS_00019129|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3892bp TcatgacaattttttcaaaaattcttgcTAAAAACCTGTTGTTAGGCATT AAAATGGCAGCACAAAATTAACAGTTTTAACAGAGACAGATATAttctaa agatttttctttcaaatttataCAGGAAAAAAGAGATAATGAAGGAGGTA AACAATGGTTCCATAAATGAAATGCAGCTCTGGCACGGTACCAATGAAAA AGCCATTTTTTACTCTTTATGCAAAACTTCACAACAAtaaatgattttca atggaaaaacAGTTTAGTTTAATACTGAAAGATtgcattttaatgtaaat tttagttaatatttactgttttgaagcctgaatggcaatttttacaagtt ttggcgtCATTTACGGCCCTtataattggcgtaagcccaaaattaggcgg TGGCATAAAAGGGCCGGcttaaaaagggccgataaggtatatcacttttt tttaatttcaattaattGATTAACTTTTACATtttgttttacgtttttta cgttaatttttcaaattagttCGATTGAGAATAAATTCAATTATCAtaac aatttcttcaaaaactcTTGCTAAAAATCTGTAGTTTGGCATTAAATGGC AGCACAAAATGTAGAAGAAAACCCTCAACTaagcttttcaatttttctca cCATGGatccaaattttcgaaaatttaaggCTTTGTTATCCTTAAGCCCG ATTGTAAGAAATCCATGTCTTAACTAGTTTAATGGAGATGCAGCTTAATG ACTTTTattatgaatatttttattcGAGGTACTGTGATCGACATGGATCA TATAATGGCGGCAATTCCAGTGATTGGACCTGCAAAgaattaattttgta tttttagctTATATTTATCACTCTTTAATTTCAATCAATTGattaatttt tacattttactttgctttttactttttacggtaattcgccaaaattattt ctagccaaaattaaaaaaattatcaaaaataaatttgtctaTCATTGACG CAGACGCAAAATACAACAACTGACCGCCTTGCGTACATCAATCAAGTTCG TattcattttcttataagcttTCCCTCGCTTAAACTTTTGCCTTTATCTT GTGTTGTTTTAGGTAGTCATTAATCAACTGAGAGACCTCTAACTAACTAT TGATTTATTGTAAGAAGTGGATGTTTGAATTCGTCCTTTTTGATTTGTTG ACAGAAACATCTTCAGACAACGTAAATTCAACAATTCAAACCCAAATCAC TTAGATCTGGCACTAGAACTTGCAGCTTCAAGAAGAGCTGGCACAATGGC AGGATGAGTGTCGTTTTAGCCTGTACCTCTACCAAGTCCATGTAGACTTA CAGATCGACAAATCAAAACTCTCGTTTATTTGATAAATCGGATTTTACGA ACATAAACATTATCCATTTCGAACAAGCTAAACGGCCGATTCGTAACTCT GTACAGTAGTAGAATTTATATTCTAGTCTGTAAAATTTActtctttttat tgttttatgatatttttagtttcatttgttgttgtttttgccgatttaaa aaaaaaattaataagcatGGTAAAGCAAAATTATTTAGATTTGGCCTTAG TGAGTACTTAATTAGACAATATCTTCTTTTTTGTTCATGTGACTGAAATT TAACATACGCGTATTATAGCTCGCAGTTATTCAAACTTTAAGAccctttt tggccatttttgttGACGAAATTTTTACGATATAGGTAACAGTAGAACTA GTCtgaaaagtcaataaaaaagaTCCGAAAAAAGAGCGAAGTACTGTTAT ctgttttttctattatttGGCCAAAAGTTTAAACTGTTCGAGCTCAtagt tttttttggattttgaattgttatttgatAACATTGACGAGGGCCTTCGT TTCATTTTGTAGGTCGAGAGAATCATATTTAGTGTGTTCAATGAGGAAAG TTTACGGGTATATGAAAACAAGATTACCAAAGTTAAACAAAATGACACAA CTTACACATGTCAGGTATCTCTTATCAAAATCCTTACCAACTTACTTTTG CTTACAAGTATATTCAATTGTTTTTAAATAGAATTTCTTAAAATCGCGAG TAAAAGCGTCTGGAAGCAACTCAGTAAAAGGGATTTTCAATTTACCTTGT TAAAGCCTTTTTTGTGCAATGATTATGTTGGAAAATTTACCATATAATTG AAATGACGAGGCTTCTATTATcatctttttttatcaaaagcagcaaattt tctttgaagttAATTCCCAAAATCTCTGGATGGCGAATAGGCAAATGTTT CAATTTGATGTGAGTCCACTAATTAATACCTTACCTAAATTTTGTCTGAG TTTAGAACCAATGACATAATAGGTTTGGCTTGCCTGGAAAACGAGCTTTT CTGAAAATCATTGTTCACTTGTTGCTGTTGTAATTGTTAGTAGTCTCATC TTGGAAAATAAAAACGGTCTTTTTTAAGGTCACGTGTttcaaataaaaca aacaacAGAGCGAAACGGGAGCTTCGTCGTTTGTCGAAAACTTGACGATT GAATGTGTTCTATTATATTTCTCAGTATATTTTAGAAGACGGCTACACAC GTCTCAATATACACTGCAGTCGAATGGAGCACCACCACACCGTTATTTGT ACCAGGGTAAGATAACAATATCAAATTTACCTTGTCGCTTTACGAAAGGG ATTTTAACTCTGAAAAAAATGGATACATAATTTTCCAATCAAACGCTAAT GATTGTGTTAAAGCGCTGTCGTTATTACCTATGCTTGTGCTCCATATTTT TTGGTTATTGGGTCAAAGCCaagctacatttttttataagaaccaataaa ATCTAGTTAAGGCTCAGCTGTTAGTTTTCTTGTTTGACACCTTTGAGCTT CGAATCATTCTTATATTGTTCTTATTATTAGAGTAAAATTAAGCTGTCGT AGAACCCAAACCCTTGGTTTGCTAGAAATCTAGCCATTCCAAACCTTTTC AAATTGCTCCCATTTTTCAGTAAGAATTGACTTTGGATATGAAGATTGAA ATATGCAGCAGTGCCAAAGTTTATCTCATCCGTTTGAAACCCAAAGATCG TTTTATTTCCCCAAATCCAATATTCATGTTATTATGTTGACTAGAAAGCG TTTACCTTTGCTAGGATATAGGAACGCAAGAACTGTACTAAAAAAAGTTC tcacaaaaaaagatatatttgatACTTTACAAAATATATGGCATGCTATT ATTCTTTTCAATGGCTGTAAACTCACGGTATAATCATATGTCTTTAGATT GTTTTTATATCGATTgattttcattcaattttacTGACAGGTTGGATGGA TTAACTTCGAAACCCTGGTGGATCTGGATGCCATTCCGGCAAGGGATGGA TCAGTCCGGAGAACCCATGTCTTAAGACAAAATGGAAATCNATCTGGATG CCATTCCGGCAGGGACCACCCATATCTTAAGACAAAATAGAAGTAAGTTG AATTGTGAAGTTCTTATGGTGGGTTAAATTATTCTTACTATCCTTAATGT TAGATAAAAAGTGAATGTTATGGGAAATTAGGATCTTACGTATAACTCGT TTTTTAATTTCCTTTAGaaaccctgtgtcacagaccagctggaaccccag ccccactggaaaatttggaaagaaTTTCGTCCCCGATGGGAAATTACCCT GAACTTCAGTATTCCAGTGAgtttctaattttgaataagGCTAAGGATTT TTGGGTTTAGGGTACACGggaatatatatatattatagtAAAggagtata aaaccttcaactacttaaaatggaaacaataaagacaaaactcacaaaac aaaaagacaatataaatacaacaaaaatctagaatgaacatt Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000319:329913..333804- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00019129 ID=TCONS_00019129|Name=TCONS_00019129|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3892bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000319:329913..333804- (Clytia hemisphaerica) TCATGACAATTTTTTCAAAAATTCTTGCTAAAAACCTGTTGTTAGGCATT
AAAATGGCAGCACAAAATTAACAGTTTTAACAGAGACAGATATATTCTAA
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AAAAAGACAATATAAATACAACAAAAATCTAGAATGAACATT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00019129-exon-sc0000319-1575043694:329913..333804 | TCONS_00019129-exon-sc0000319-1575043694:329913..333804 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00019129-exon-sc0000319-1510915933:329913..333804 | TCONS_00019129-exon-sc0000319-1510915933:329913..333804 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00019129-exon-sc0000319-1491911889:329913..333804 | TCONS_00019129-exon-sc0000319-1491911889:329913..333804 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000319 | supercontig | sc0000319:329913..333804 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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