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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00019332 ID=TCONS_00019332|Name=TCONS_00019332|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1932bp
taatcttggtagaaatcaaacattttggaaagctttttggttcagATATG
AATCGTCTATTGTTATCGGAATCGACCTTGGACAGTATAAATACTGCTCC
ATTTACACAGGGCCAAGCAGAAGCTGGTATCAACGCCTTTGGTTAAGGCC
CCGTCTCAATTTAACAAGATGTCAACGACAAAAGTGAAGATTGCAAAACC
ATTCGTGAAGGTTGGACTCTCCGTAACGTTTGCGTTAGGGCGTCTAGCGT
TGCGCCTACCATTTATCAGACGCCCCTTAGTTGAGAAATTCGCTAAAATC
AATAGGCTACCAGCAGACATGACTGAGGAATCGTTATTCTCAAAAGATAT
GCAAAAAACGTTGATGAAATGTCAGATCACTTATTTATCGATCAAAGTAA
AGAAAGGAAAGCCTATCAAAGATTATAAAGCGTTGAGAATGTTGGATGAT
GGAAGTTATGAAGAAGTATCTTTACACAATATTCAAAGACCGGGTGTACC
ATTGGTTATCAACTTTGGTAGCAACAGCTGACCCCCGTTTATGGCAGATT
CTCGTTCGTTCTTGGAACTGAAAAATCAGTATGAAGAACAAATGGATTTC
GTCATCATTTACATTGAAGAAGCACATCCAACTGGTGAATGGGTCTTTAA
GgaTCAAGAGCAAATTACACAACACAAAAGCATCGAAGATCGTATCACAC
AGGCAAGTAAGCTACAAAAAACATACCCAACAATCTCTATCTATGTGGAT
CAAATGAGCAATAAACTGAACAATGCTTTTGGAGCTTTCCCAGAAAGACT
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TAAATTATTCATTAAAAGATCTTGAGAAGTGGATCGCTAAATATGTATCT
AAAATGGAAAGACCTGAAAAGTCAATGTTGCCTTTGTagagaatttttat
tttaattcaaATCAATTTTACCACATTAACTTCATACCCTAGCTAGCAAG
TAAATCGATCCGATGTTTGGCCACGGAGGATAAATTTGACTCGTTCCTGA
GAGGAGAGCTAGGATTATAAGATACCATTTCGAAAATCTTCCCtaacact
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ccccggcgagccattttgagtgagggggccaatgttttggaaaaaaatgt
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AAAACACCTTAAAACAATATCTAATTGGGGAGAATAATAGTTTTTGTGGT
TTGATTGGTCTCAAACCAGCTTAAAATAGTTACTTTTAAAAACGTATGAC
ATGGTCTACCAAAAAGTGGGGGTCATGGCTCCGGCCCCCCCTGTTGATGG
GGCCGATGTAAATCAGCTCATAAGGTGCCGAAATTGATTGGGAATCGAAA
TATTGTATATATATAATATTGAATATTAATTTGTATATAAATGGTTTGTA
AATATAGTTATATTTAAATTTTTCTAAGGAAAAACGAAATGTTTTAGAAA
ATAGGGGTTAATTAGACATTTAACCAACCTCGTGTCCAGGAAATTATTCT
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aaatattatttttgcaCTTACACACatacacaaaagattttttcaaatta
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GATAGGAAATTGTTTAATTGTAAACAACTTAttaaatatgatatttttgt
attttttatgtacaataaatttttcattggaATTTATAAAGCTTGCTAAA
ATAAAATAcgcaaaatgaaattttgttttttc Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000325:102749..116023- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00019332 ID=TCONS_00019332|Name=TCONS_00019332|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13275bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000325:102749..116023- (Clytia hemisphaerica)
TAATCTTGGTAGAAATCAAACATTTTGGAAAGCTTTTTGGTTCAGGTGAT
GTATTTATTTTGTATCTAAAAATACAATTTCGGAAAATTTTTGTGAAAGT
ATCTTTCCTTTAAAATCTCCAAAAAAACCCTTTTTTGGTAATTTTCTCCA
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AAGGCATTTTATTTAGACTTATTTTATAGAAGGGAGACCGCTTTAAATTT
AATCATCTAAGCAGCTTGCTTTATGGTATTTTTTGACCTACTTTGTTTGA
GTTTAGCCCCTGTCAATACATGTGGAAAATAATATTATTGCAAAAAAGAC
AAAATATTAGTATAAGTTAAACCTAACTTTATTTACTGTACCTAACCCGA
GTCTGCTAAATCGTGTGCCTTTCGGGCATTCTTGCTTTAATATTTTATAC
GCCCTCCACGCCTCATGCGCCTCCGTGCCCTCGTTGTTTTGTGCCACAGC
ATCTTACACGTTCTTCAAATTCTTTTTGTCTCGTAATATTCCTAGCAGGA
AAAAACAAAAATAGTATTTTCTCTCGTGACTCTGTTCGCGTGATGAAAGA
TATAAAGATATCATAATCCAGTCATCGACTTTATATCCAGTTTTTGTCTT
GATTTTATATTAGATTAATTTACTTTCCAAAAGATTATCAGTGTTTGAAT
TCGATCATCTAAATATAAATTTCTTATGAAATGAGACCACCCTGAACAAG
GAAATGAATGCACACGGCTATATTCAGGCTGTGTCATTTATACATTATGG
TCTCGTACCTCATTTCGGCTGAGTGATTAGGTCGATTGTTTAAAAGTCCC
GAATTTTCAACTAAAGACTATTAAAAAGAATAGCTTAATCCGCATATTTT
GATACATAAAAGTAATACCTCGCTAGAAAGGTAATTCTGAGTGGATGAAT
TTCAAACATAAAAATTAAGAAAAACTATTTTTAAAAAGTTTCTTTTATAT
TGCCAAAAATCCTGAGATTAATTATTATACTCAGCAGTAACTTAGCTAGA
CTTTACTGATTGCAAAGATATTTATATATTTCTCATATATCGGACGGAGG
ATCGAGACAAAAATACCATTAGATGCTAGAAATTTCCGTATATTTCTCAT
AAATTTACAGCCCTTCAAACAGGGTACATTGTTCTCATTTTCTACCCATT
TATGGCCATTTTTGGTCATTTCTGGGCCTAACCGTCCATAACGAATACTT
CAATACCATATGGAAACACCCCTGTCTCGCAACCCCAGTGGAACTTTCTT
CTCATGGACAGATAAAACTCCAATTGAAATCCCAATGGGGATAGAAATTC
TATTGTTCCAAGGTTAAAAAATTAAGTGGAGATTGTTTTGGAGTGAGTTC
CCTTTTTTCTCAAATATTTTGTCCATGATTGTAGTTCATTACCTATATAG
GTTTGGACCTGAAATGACGCTACACACCCACGTCCTTTTCTAAACCTAAT
CGAATAAGGGAAGAAACGACGCATTGCGAACAAATAGTCGACTATTGCTA
TGTTGCTGGGCCCGGGGGGACACTGACCTTGACGGCTGACAGGAACGTGC
CGCTGGGGTTTGAAAAGTTGACCCTGCCAGATATGAATTTTCGGTAAAAT
GGTGACCCTGTCAGAACGAAACCCTGACAAGTGGTAAAAGTAAAAATGAC
TAAAAGTAGACGAAAAATGAAATTTTTTATAATTTTTACACTGAAAAATT
GTACAAATAACCAAAAGTGGACCCTGTCAGATACACATCTTGAAAATTAA
TAGATTTGGAACCCTGTAAGATATCTTCAGAGCCTGAAAAAGGGACCGTG
ACCAGCGGCACGTCCATTACCAAATATTGCCTAAGTGCCCCCCCCCCCCA
ATTGCTCCATGCCACTTTGGCTACTGTTTAATTCAAGCCGAAAGTATCGA
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TCTTATAGCCAAAAACGATAAGGTTGGAAAGGTAGAGTTTTAACTATAAG
TTACACTAAAGACTTAAAGATTCAAAAGTTTGAGAATGGTCCAATAGGGC
TCAGAATATTGCCTGGAAGTCTGTAATATAAACCCCTCCTGAATCGAAAT
ATTTGATTAAATTGAACATTAAATTATTAATAATTATTAAATTGAAATTA
AATTATTCGCCTGAGCTTTAAATGCTAAAAACGAGGAATTAAAGCTAAAT
TCTCCATATCTTTTGACCGAAATTGTATGTTCTACACAAAAAAACAGACC
TATAAAAAGCCATCGATGCTTGAATATACCTGAGGAGTATATACGTTTGA
AACGAAATTATTCTTATTGAAATTTCAATGTTACAGATGATTGTGTTTTT
TAATAAGTTAATGGGATGATCAATAAGAAGTTTCACTGTCACTTCTATGA
TGTTGGTCTTTCAATTATCAGTGAGGGTGGTCTGTTGTAATGTTATGTAA
AACTTAATCAGCAGATTTTTCCCGCGTAGGATCAGGAGAGGTTTTAGACA
TTGACTTCAGTAGCGTAGACAAGGAGACGCAAAATTTGTGTATGAGAGAG
CAGATATTTATAACACAGCAATTATCTCCTGCACAAACTAATGGACTTTG
AGGCTCGAAGGGGCTACAGAGAAATTATCAACCTTTCTTAGACTAGAAAA
AGTGAAGCCTTAAGTTTTCCCCACATTTAGAAATTTTGTAGACAAGAAAG
CCTAAGTGGCGTAAAAGCCCAGCAGTGTTGGAACTGTCAGCATATTTTTC
CGCTGCAATGATTATTTCAAATAAAGGTGCTAGCAGTTAAAAATTCCAGT
GGCAAAATCATAGTGCATTTCTTTCACAGTAAGGTTGAGCCTTTTTTTAT
TCTAGCGATTCTAGCGCATGGTAACTTTTGTAACTTTAGTTGGTATCTAA
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AATTTCTTTGCTTATCTCGTAGTGTCATTTTTGTATATAATTTTTTCCCA
ATTGCAACATACTGAGAAAAAAAAGAGACAAATGTTTAAAAAGATTACAG
AAAGCTATATGATAAATCCAAGTCACGCAATTTCATTTAACTTATGTTTT
TAAAACATTCAAAAAATGTCAAATATCGATTGTCTTACCATAGAGTTTTA
TTTTGAATAATTTCTACTCGTGATAACGTTGTCACGCAATCCATGTCATT
TGTCCGGCTTATTGCTCAACTCAAAGCACAAGAGTCGGATGTGGGTAGGG
GCTCCTAGGCAAATTTGTCTTCCATGTACAATCAGTGACAAAATACTTGG
CACAAAAGGGAAATTCACCGGGTTGTTTTGAAACCACAATCGATTTGTAA
GTGCTCTAAAGTAGGTTGGAATGGTAGAGTTTTAACTCTGAGTTTTAACG
CTAGACTTAAGACTTATGACCTTAGGATGTGAGGATCCAAAAGTTCAAAA
ATGGTCCAGTAGCGCTTGAAATATAGCCTAGAAACCAATAAATCCCTCCC
AGATCGAAATAATCGATGAAATCAATTTTCGAAAAATGGTAAATTAGCCA
AAAGTGCAAATATATTATGGCACGGATTGTAAGTAACAAGGGATCCTTAG
AATCGAAAAAAAAGAAGACCTTAGGATCTGAAGATGCAAAAGTTCAAGAA
TAGTCCAATAAGGCTCAGAATATAGCCTGGAAAAACCGCAAAAACCAAAA
AGTGCTGACGTCAACAAAATTAGTTTTTTAAATAACTCCAGTTTGAATAA
AGGTAGAAACATGAAATTTGGATCGGATCAACGGTGTATATCATTGAAAG
GGTCATTTTACAAAAAATAATTTTTCGAAATTTTGCTGTCGTCAGTAGAA
ATCAGCAAAATACAAAACTTTGCAAAGAAATGCTGATGTCAGCAAAATTT
CAAAAGACTTTTTTTGCAAAATGATCCTTTTAATAATATACACCGTTGAT
NTGATGTCAGCAAAATTTCAAAAATTATTTTTTGCAAAATGATCCTTTTA
ATGATATACACCGTTAATCCGCCGATCCAAATTTCATGTTTCTACCTTTA
GCCAAAGTGGAGTTATTTAAAAAACAAGTTTTGCTGACGTCAGCCCTTTT
TGGTTTTTGCAGTTTTTTGCGAAAATGAGGGCGTAAACAATTAGGTAACA
CCCCTACAGGGAAACTTCAACATGGTGCTCTTCTTATTAAATCATTTGCT
CCTTTTCTGCCGGCTAATGTTCTTTAAAAATTATGGTAATTTTCATGTTT
TTGAGACATGCCATAACTTACCTGAGAACAAATTATATAAGAACATAAGA
TTTTGATGGTCAGAATTTTAAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAGGCTTCG
CAGACTTGAAAACAGCCAATTTCTTATCAAAATGGACAAAAATACATAAA
AGATGGGGAAAATAAGAACATTTTTAGACTTGAAACTTAAAAAGTTAAGA
ACATCTTAAGGCTTAAAATACTTTTATGTTCTTAAAAAGAAACGTGTATC
CAGTCTTGAGCGTGTTCTGGAATCGTCCTCGCATTACCAACCTCTCCAAA
CCTACTCCAAAGAGACACCCCCTTCTCACAGGCCCACTTGGAACCCTTCC
CACTGGAAAAATTGGCCGAAATATTGTCCCTGTTGAAAATAATCAGATAA
GCAAATTCCCACTGCAAAATAAAGTGCCATTTTTTCCATCCCATCTAAAT
TTTCTGGCTAGAAAACAATGTATTTCAAATCCCCAGCAATAAAAAAATAT
TAGAATTTCAATCCCCATTGAGTTTTGGTCCGTTATTTTTACCCTCACTG
GATCATAAAATCCCACCGTCTGTGAGAAGGGGGTGTGCAAAGACCAATTC
TGCGATGAGACGAATTCCCTTAATCCAAACTAACAAAATGACTGATTTTA
TTTCTGCTTTAGAAAATTATCTACATTAGGTAACGGATAAAATAGAACTG
GAACCGAAACTATCATAACAAGGGTCAATGCAGGGAAAGGTTTAATGTCC
AGTATTTAGGAAGCACTGTAATGTACTCTGTACTCTGTAGTGAATTGTTT
AAACATTTATACACCTCTGTGTCACAGAACCAATGGGACCCCAGTCCCAC
TGGTCCCTATTGGAATATTTCAATAGAAAATTTTCACCGGGACTGTGAGA
CAGGGGTGTTTTCATGTTTTCTTATACCTGATTTATTTTGGTCTAGTAAA
ATTGTAACAATTTGTATGGAGGTCTTAGCCATATCCACACAGTTTCCAGA
ACTGAAATTTCAGTATTATAGAGTACGTAGTCAAAGCAATGTTGGTCTAT
TGAAATGTCAAACCAGCTCAGCCCACCAACAGAGTTATGTGGCTTCAAAA
ATATATTAGATGAAGTTTAATGTCTATTAATTTAACTTCAATTCTTTTCC
TAGTAATAAAGATACAATAAATCGCTAATGAAACTGGCCCCATGATCGAA
AACCGAATTGCGAATCTTTCATTTTAATTCAGTCGTTTTTCGTACATCCA
AAAAACGTCGTTTTCGAAATTTAGCCAGACATTGATAATTATAGACTTGG
ATTATGATAAAACCAAATGTCATTATGTAAAAATTGTATTTTTGCAATGT
GTCGTTTTAAAAGAAATATCTTTAAAAGAAAAGAAAAATCAGCGAATACC
GAATTTTTGATGCACGCGATGTTTGTCACGAAAATTTTGTAGCTTTGATA
ATTGTCCAACGTTTGTCTTTTGTCCTATCCTATGATATCGCTATTTGATT
GGTTGATGACAAAAGAATTTTCCCCTTGACATGACAACTGCGGTTTGATT
AGTTTATTTAGATCTTTATTATTTACTTAAATGACATGTCTATTGTGTCT
CTTCTAAAAGACAATAATTTCTATTATATGTAGATATGAATCGTCTATTG
TTATCGGAATCGACCTTGGACAGTATAAATACTGCTCCATTTACACAGGG
CCAAGCAGAAGCTGGTATCAACGCCTTTGGTTAAGGCCCCGTCTCAATTT
AACAAGATGTCAACGACAAAAGTGAAGATTGCAAAACCATTCGTGAAGGT
TGGACTCTCCGTAACGTTTGCGTTAGGGCGTCTAGCGTTGCGCCTACCAT
TTATCAGACGCCCCTTAGTTGAGAAATTCGCTAAAATCAATAGGCTACCA
GCAGACATGACTGAGGAATCGTTATTCTCAAAAGATATGCAAAAAACGTT
GATGAAATGTCAGATCACTTATTTATCGATCAAAGTAAAGAAAGGAAAGC
CTATCAAAGATTATAAAGCGTTGAGAATGTTGGATGATGGAAGTTATGAA
GAAGTATCTTTACACAATATTCAAAGACCGGTATGTTTAAAACACCTTTT
TTTATTTTTGACAATTTTTTTGTCGGATTCGAACACATACATTACACGTT
TTTCTTTTTGTAAGAACAAACTATATAATAACATAAGGCTTCGATGGCCA
AAATGCTGTTTGTGATTTTCTAATTGAATTACCATACATATGGGGAGCGG
AATCGGCCCTTTTTTCGGACGGAGTGGCGGAATTTGGCGAAAATTTAGAC
GGAATTACGGAAATTGGGTTCTCTGACGGAGACGGAAAATTAGACAATTT
TAGTGCGGAAAAACAGAATTTAGGAAAAAAAATTGCGGAATTTCGGAATT
GGTAAAAGATATTCCGAATTTGCGGAATTTTCGACAAAAATATTGAATTT
CAAAGGAATTTTNAGATATTCAAAATTTGCGGAATTTTCGACAAAAATAT
TGAATTTCAAAGGAATTTTCGGTGACGGAATTTTGGTTCAATTTAAGACG
GTTTGACGGAAGTTGGAGAAAAAATTGGTGGAATTGCGGAATCGGGTACC
CCCCCCACATATGTTTGAAATAAAACCTTCCAGAAATATACCTCAATACA
GTAGCAAAACATTGATGCAGAATCAGATAGCAGACAGTTTGTTAGCTTTT
GCAAGGCCTAAATTAGCAAACATGTGCTAAAACACAGCTTGTAAAAAACG
TTTTTTCAACGTCCATCCAAACTTAAATGGACATTGTGGAAATGAGATAA
ACGTTGATAAAACATTGTGTGCCAGTTGAGAAGGATTTTTTCTTTTTGGT
TTACCTTTTAAGGGTAGTTTATTACAAGTATATTCTCTTCCAGGGGGCAC
TCGATTTCTAAACGACGATATGTGCCGGGTGATATTAGTGCCCCGCCCCT
CCCCCCGGAAGGGTTACCATCGGCTAGAATGTCCTAAAGAGTTTTTTTTA
ATCATNGTTAGCTTTTGCAAGGCCTAAATTAGCAAACATGTGCTAAAACA
CAGCTTGTAAAAAATGTCCTAAAGGGTTAACTAGTATATATTCTCTTACA
GGGTGTACCATTGGTTATCAACTTTGGTAGCAACAGCTGACCCCCGTTTA
TGGCAGATTCTCGTTCGTTCTTGGAACTGAAAAATCAGTATGAAGAACAA
ATGGATTTCGTCATCATTTACATTGAAGAAGCACATCCAACTGGTGAATG
GGTCTTTAAGGTATGGCTATGTTTACATTGTATTTTTATTTAATTCCTAA
CAATTAAAAATTGACAATTTTAGGAAATTTTTTCTTCTCGGGGCCTCCAA
CTTTTTTGGTGAAAGCTAATAAGCTATTACACAGCTAAACTTGAAACCGG
TATCCAGATAGATTATTGATTATCTTTTTTGTGGTATGGAATTGGGCATC
TGTAAAAGTTTTCGGAGCGCTGAGGTTGTGATTTTAATTACAGTTGAGCC
TGTTTTAACCTTGAACACAGGTTTTCTCATTCCTTAAGTTAACAATATGT
CTTATTAGAAACCTTACTCCATAACTCGAAATTTCCTTAATTCGAACAAA
TTTGTTATGAAAACTACACTGTATTAACAAAACTAAAAAAAGCAAACGGT
AGAATTTCCGTAGCAGAGATGTACTCGTGTTAATGACAAGCTTTGAGTAA
ACAAAATTTCACAATTTCAAGGATATTAAGGAAGCTATTAGGGAAGGAAA
ATAAATTACAATTCTAAACCAAAAAAGAAAGATTTTTTCGCAATTTTAAA
AGCTATTGGATCATTTTCCCGGGGGGCACTCAAGGTAAATGACCTACCAT
ACGTGCGGTTGTTAGGGACATATTTTCCAAATATTTTCCCAAAGTGCACT
CTAAGGGTGTAAAATTTCAAAAATGATCAAAATTATTCAAGAAAATGCAC
CGTAAGGATCGATTTTTCGCTCAAATTTGATCAAACTTTGCAAAACTTTC
TCTGCACTGTAAGGGTCTGATTTCAAAGGCTTAATTTTGGGTATGGTCGT
TTTTGAATTGAGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNGCCCCCCCCCCCCCCCCCCGGATCATTTTTAACCAAACCTATA
ATTTTCCCTTGTCACGATATCAAACTACATCAGAATTGGTTTCTAAAACT
TATCTGCCAATAATGTAAGTATTGAGGAGGCAAATCACTACTAAATGTTG
CAGAATTGATGCGGAAGTAAGCAGAAAATTAATAGCTCTTTAAAAATAGA
TTAACACACATTGGACTGACTCCTCTTCCAATAATTTCGCAATCTCACAA
TTATGATGCGCTAAAGCAGGGACATCAGAAACGTTTGTATGAAACTTGTT
GTGCGAAAAAGGCAGCTGTAACTAGACTTCGTTTTCAATCAAGTTTTCTG
GTGAGATCTAAGTTCAAGGGAATGTAAAAAGCTGACATAATTTCCCCATA
ATTTGTAAAAAGTGCGTGCAGAAATTTCATATTTTGATTTCGCGCTTTCG
TGATTACATGAGTTTGAACAAAAAAAAATTTAAAACTTTCATTAAAAAAA
TACATAATTTATTTCATCATGTGTCAAATACAATGAAATTATCAAAAAAA
CTGAGCAAATTATGTATGAGTTATATTGTTATATGGGTTATTGACGTCAG
TTTTGTCCCGTGATCATTTTCATATGTTGGTCACGCAATTTAAGGCTCAA
ACAACCTTCAAGCAACAACAACCTGATCAATAAAATCAAAGGAGTTTTTT
AATCCACATTTTTGATAAAAGAAACAAATTGTCCTGCAAGGGTCACGCAA
TATTTCAATAAACCCCCGGTTTTGTAGCGATTGGTATGCTTGAATGCTTA
GTTTTCCAGGGGGTTTGATGAGCTGAGTTGTCGTATTACCCCTAGTATCT
TAAAGATCACGCAATTCTAAAAAATGTTTTATTTCATACACAACTGCACG
AAATTCATTCAAATATTTGAATGTTTCGAAATACTGTAAAAAAACGAGGC
TTTGAACTTTGATCATTTCATTCCTGTAATTCCGCATCTCTGAATCTCTG
CATCAGGGTCCTTTAAGGTAACAATTTGTTGATACATCTGACTTATTGCT
CTAATGAAAGCATGTCTGCTACAAAAAAGATTAACTTGTACTTTACAGAG
TTTAAGGCATTTTTAATGATTGAATACATTGCGAGTGCAATTGTTCCCAT
AGCATTATGTCAAAAACATTATGATAACATTTCTGTTGAGGTAGGAAGGT
ATTGAAAGGCAAATAAATGGGGGGATTCTGGCAGTGTGTCCCATTTTGAA
AATAAATCCCTGACAGTATTGTTCACATGAAATACTTTTTAAGCAAAGAA
ATTATTGTCTTCCTACGAGACTATGCATGACGTCAATAATCGAAAATCCC
TATCTATTTAAACAATTCTTTGGCATTTGTTATATTAATATACCTGACTT
GGTCGTTAAGGAAATTAATAGCATCATTATCCCCAGCAAGAAGATGCATA
AATTCTTTGGATGATGATTAAAAGCATGTCCTTCCATATATCTTTATGCT
TAAACCATTGAGTTTAAAGCCCGAAGGGCTAAAGTAGAATCTCTAACCTT
TCCCAGCCAAGAAAAAATGAAGCCAATTATTTCCCATCCAGAACGCGCTC
AGAACGCGCCGCAATCATAACGACGGATTGTATCTAGTGGTTCTTTTGTT
TTTGAAGACTGCATTTTTTTAAATCTAGTGATGGATTTTAGTGAAATTTC
TTTGAAGATTTTGAATGAAGTTGTTTTGCGATCAGTAAAGGTGGGGGTAA
ATTTGACTTTTTGACCTCTCCAATAGGAAAATTCCAATTAAAGATTTTTA
ACTAAGTTCTATCAGAACGGAAATCAACGGGTGTTTTCATTAAAATTTGC
ATAAAAAAAATAACAACCACATTCTAATTAAGCGTTGGTATACATTTTCC
TCTCAATTAAAATGATTGATAATTCTCTTTTTAAGGTTTGTTTACCTTGC
CCGATTATAATGACAAGGAAATTTCGTAATACCTCAGGCTTATTAAAAGT
ATACCGATTCTGATAATTAACCTTTTCACCTTTCTTTTTAATCTACAAAG
TTAAGAAAAATAGCCCCCTCATTTTAAAGAATTATAAGAGTTTTACTACT
GGACATCTGCCAACAATTTTATGACTCAATATATTCAAAATAAATATACT
GTATAACTCGAACCCAGTCCTTTAGTCTATTTTCATGTTTCTGATATAGC
GCTAACGGTTGAACCCGGGGAACAAACGTCCATCAGCAAAATCAGAAAGT
GGTGCAAGTGTCCCTGGGTACGAGATCGTAAAAGTCAGACATGTTGTTGT
TTTTGTTTTTCTGAAAACGATTTTATAAGTATGCGTTGAGGCTTAATTTT
GTTCATTTGATGGATCTTATAAAAAGATAAAATTTCCTGAACTCTGCGTC
AAGTGACATCAAGTAGCTCCTCAGACCACCAACAGTTAATAAGGAGTTAG
TAGGATCACTTATCCGGCCTATTGTTTCTTTTTTTTTATTATAAAAGATC
TTAGAAGATTAGGGCCCATCTCAATTGGCTCATTATTAAAGGATTAGTAG
GATTTGATGTTCGTGTGTCCCAATCTTTCCACCAACAATAGATACAGGTT
TTTTATAAGAATCGGCAGTAAATCTCTTCTTATTGGTCTATACGTAGTTT
CAGCTGAAATAGTCCAACAATAATTTTTAACACGCTGACTCGTTTATAAA
ATGCTTAAACGATCCTAAATTTAGAAAGTCTTTTATTTCCTTCTTCCATA
GTATAAGAAAGCTGAAAAATTGGAGAAAAAAATCCAGAGGGGTCTAATTT
TGAGCCTTTTCATTCCCACGATAACACTTCTTCCTATAGAAAAACAAAGC
ACAAAAGAAGAATTTGACTATGTTAAAAGTTGCATAACTATTCTTGAATG
ACCTAGCATGAAAAACTAATTGGCAAACCTCTTTAAGATAATAAGCCTTA
ATAAGCTGCCCTGGGTGGTATTAGCTGAATCGTGGTAGTCATAGTTACAC
AATCAAAGACAACCTTGCAATTTAATTCAATTCAATTATTTTTGACTGTC
TTTTCGCCGATAAGTTGAAAATATTCTATAAAAAAGTCAAAAAAGATTAT
TTCCAATTTTTCAGGACCCTCTTGGATTTTTTCTCTCATCTTTTAGACTA
CCCTGAATTTTAGTCCTCGTTTTACCTCCTTAACATAAGGGGACAGACTA
TTTCTGGAATAGCCCATTGTTTTTATTATGAAACAAAGTGTGCAGATTTT
AATAAATAACACCAATTTTTGGGTTTCTCTTTATCAAATCCACAATTTAA
GACAATAGAGAGCAAGTACGTCGGAAAAATGCGAAGGAGTGCAACGCTCG
TTAAAAGACAACGAGATTACAATTACAAATGTCTTCCTCTGATAAGCTCA
ATATGGTCTAAAACCACCTATGAAATGGGTAGGGACAATGACTAAAAAAT
TATAAACTTGATTTTAATAACAAAAATATAATTTTTTTTGACAGGATCAA
GAGCAAATTACACAACACAAAAGCATCGAAGATCGTATCACACAGGCAAG
TAAGCTACAAAAAACATACCCAACAATCTCTATCTATGTGGATCAAATGA
GCAATAAACTGAACAATGCTTTTGGAGCTTTCCCAGAAAGACTTTACGTT
CTTTTGGATGATGTTGTTGTATATCAGGGAGGATCTACACCGATAAATTA
TTCATTAAAAGATCTTGAGAAGTGGATCGCTAAATATGTATCTAAAATGG
AAAGACCTGAAAAGTCAATGTTGCCTTTGTAGAGAATTTTTATTTTAATT
CAAATCAATTTTACCACATTAACTTCATACCCTAGCTAGCAAGTAAATCG
ATCCGATGTTTGGCCACGGAGGATAAATTTGACTCGTTCCTGAGAGGAGA
GCTAGGATTATAAGATACCATTTCGAAAATCTTCCCTAACACTTTTTCTC
AAAATCATAAGCTTACGTTTTTCGCTGTTGTTTAAATCATGGGCCCCGGC
GAGCCATTTTGAGTGAGGGGGCCAATGTTTTGGAAAAAAATGTCACCCAC
CATGGTTGGGCGACAAAGAAAATTTTTCACTTTTTACACCCTCAAAACAC
CTTAAAACAATATCTAATTGGGGAGAATAATAGTTTTTGTGGTTTGATTG
GTCTCAAACCAGCTTAAAATAGTTACTTTTAAAAACGTATGACATGGTCT
ACCAAAAAGTGGGGGTCATGGCTCCGGCCCCCCCTGTTGATGGGGCCGAT
GTAAATCAGCTCATAAGGTGCCGAAATTGATTGGGAATCGAAATATTGTA
TATATATAATATTGAATATTAATTTGTATATAAATGGTTTGTAAATATAG
TTATATTTAAATTTTTCTAAGGAAAAACGAAATGTTTTAGAAAATAGGGG
TTAATTAGACATTTAACCAACCTCGTGTCCAGGAAATTATTCTGATGGTG
TCAATCTACTCAGGGGCTCATTGATTCAGATCATTATTGTATCTTTGCTC
CTATTCCTGGGAACGAGGATATCTTTTGGTTAGGTTAAAATAAAAATATT
ATTTTTGCACTTACACACATACACAAAAGATTTTTTCAAATTATTTCTTC
AATACTTTAGTGAGATTTTTTAATGACCAATTTATGATTATTTGATAGGA
AATTGTTTAATTGTAAACAACTTATTAAATATGATATTTTTGTATTTTTT
ATGTACAATAAATTTTTCATTGGAATTTATAAAGCTTGCTAAAATAAAAT
ACGCAAAATGAAATTTTGTTTTTTC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00019332-exon-sc0000325-1575043694:115979..116023 | TCONS_00019332-exon-sc0000325-1575043694:115979..116023 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019332-exon-sc0000325-1575043694:109594..110040 | TCONS_00019332-exon-sc0000325-1575043694:109594..110040 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019332-exon-sc0000325-1575043694:108414..108572 | TCONS_00019332-exon-sc0000325-1575043694:108414..108572 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019332-exon-sc0000325-1575043694:102749..104029 | TCONS_00019332-exon-sc0000325-1575043694:102749..104029 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019332-exon-sc0000325-1510915933:115979..116023 | TCONS_00019332-exon-sc0000325-1510915933:115979..116023 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019332-exon-sc0000325-1510915933:109594..110040 | TCONS_00019332-exon-sc0000325-1510915933:109594..110040 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019332-exon-sc0000325-1510915933:108414..108572 | TCONS_00019332-exon-sc0000325-1510915933:108414..108572 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019332-exon-sc0000325-1510915933:102749..104029 | TCONS_00019332-exon-sc0000325-1510915933:102749..104029 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019332-exon-sc0000325-1491911889:115979..116023 | TCONS_00019332-exon-sc0000325-1491911889:115979..116023 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019332-exon-sc0000325-1491911889:109594..110040 | TCONS_00019332-exon-sc0000325-1491911889:109594..110040 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019332-exon-sc0000325-1491911889:108414..108572 | TCONS_00019332-exon-sc0000325-1491911889:108414..108572 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019332-exon-sc0000325-1491911889:102749..104029 | TCONS_00019332-exon-sc0000325-1491911889:102749..104029 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000325 | supercontig | sc0000325:102749..116023 - |
Blast
BLAST of TCONS_00019332 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: IOD3 (Thyroxine 5-deiodinase OS=Homo sapiens GN=DIO3 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 120.553 bits (301), Expect = 8.225e-30 Identity = 62/144 (43.06%), Postives = 93/144 (64.58%), Query Frame = 1
Query: 499 PLVINFGSNS*PPFMADSRSFLELKNQYEEQMDFVIIYIEEAHPTGEWVFKDQEQIT-QHKSIEDRITQASKLQKTYPTISIYVDQMSNKLNNAFGAFPERXXXXXXXXXXXQGGSTPINYSLKDLEKWIAKYVSKME--RPEK 921
PLV+NFGS + PPFMA +F L +Y+ +DF+IIYIEEAHP+ WV D I QH+S+EDR++ A LQ+ P ++ +D M+N ++A+GA+ ERLYV+ ++YQGG P Y + +L W+ +Y ++ RP +
Sbjct: 160 PLVLNFGSCTUPPFMARMSAFQRLVTKYQRDVDFLIIYIEEAHPSDGWVTTDSPYIIPQHRSLEDRVSAARVLQQGAPGCALVLDTMANSSSSAYGAYFERLYVIQSGTIMYQGGRGPDGYQVSELRTWLERYDEQLHGARPRR 303
The following BLAST results are available for this feature:
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