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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00019333 ID=TCONS_00019333|Name=TCONS_00019333|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1898bp
tcgaagaggagtatttcacctttcaaagccctaatcttggtagaaatcaa
acattttggaaagctttttggttcagGGCCAAGCAGAAGCTGGTATCAAC
GCCTTTGGTTAAGGCCCCGTCTCAATTTAACAAGATGTCAACGACAAAAG
TGAAGATTGCAAAACCATTCGTGAAGGTTGGACTCTCCGTAACGTTTGCG
TTAGGGCGTCTAGCGTTGCGCCTACCATTTATCAGACGCCCCTTAGTTGA
GAAATTCGCTAAAATCAATAGGCTACCAGCAGACATGACTGAGGAATCGT
TATTCTCAAAAGATATGCAAAAAACGTTGATGAAATGTCAGATCACTTAT
TTATCGATCAAAGTAAAGAAAGGAAAGCCTATCAAAGATTATAAAGCGTT
GAGAATGTTGGATGATGGAAGTTATGAAGAAGTATCTTTACACAATATTC
AAAGACCGGGTGTACCATTGGTTATCAACTTTGGTAGCAACAGCTGACCC
CCGTTTATGGCAGATTCTCGTTCGTTCTTGGAACTGAAAAATCAGTATGA
AGAACAAATGGATTTCGTCATCATTTACATTGAAGAAGCACATCCAACTG
GTGAATGGGTCTTTAAGgaTCAAGAGCAAATTACACAACACAAAAGCATC
GAAGATCGTATCACACAGGCAAGTAAGCTACAAAAAACATACCCAACAAT
CTCTATCTATGTGGATCAAATGAGCAATAAACTGAACAATGCTTTTGGAG
CTTTCCCAGAAAGACTTTACGTTCTTTTGGATGATGTTGTTGTATATCAG
GGAGGATCTACACCGATAAATTATTCATTAAAAGATCTTGAGAAGTGGAT
CGCTAAATATGTATCTAAAATGGAAAGACCTGAAAAGTCAATGTTGCCTT
TGTagagaatttttattttaattcaaATCAATTTTACCACATTAACTTCA
TACCCTAGCTAGCAAGTAAATCGATCCGATGTTTGGCCACGGAGGATAAA
TTTGACTCGTTCCTGAGAGGAGAGCTAGGATTATAAGATACCATTTCGAA
AATCTTCCCtaacactttttctcaaaatcatAAGCTTACGTTTTTCGCTG
TTGTTTAAAtcatgggccccggcgagccattttgagtgagggggccaatg
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CACTTTTTACACCCTCAAAACACCTTAAAACAATATCTAATTGGGGAGAA
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TGATTGGGAATCGAAATATTGTATATATATAATATTGAATATTAATTTGT
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AGATCATTATTGTATCTTTGCTCCTATTCCTGGGAACGAGGATATCTTTT
GGTTaggttaaaataaaaatattatttttgcaCTTACACACatacacaaa
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aatatgatatttttgtattttttatgtacaataaatttttcattggaATT
TATAAAGCTTGCTAAAATAAAATAcgcaaaatgaaattttgttttttc Run BLAST on NCBI protein sequence of Deiodinase >TCONS_00019333-protein ID=TCONS_00019333-protein|Name=Deiodinase|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=164bp
EEEYFTFQSPNLGRNQTFWKAFWFRAKQKLVSTPLVKAPSQFNKMSTTKV
KIAKPFVKVGLSVTFALGRLALRLPFIRRPLVEKFAKINRLPADMTEESL
FSKDMQKTLMKCQITYLSIKVKKGKPIKDYKALRMLDDGSYEEVSLHNIQ
RPGVPLVINFGSNS Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000325:102749..116054- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00019333 ID=TCONS_00019333|Name=TCONS_00019333|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13306bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000325:102749..116054- (Clytia hemisphaerica)
TCGAAGAGGAGTATTTCACCTTTCAAAGCCCTAATCTTGGTAGAAATCAA
ACATTTTGGAAAGCTTTTTGGTTCAGGTGATGTATTTATTTTGTATCTAA
AAATACAATTTCGGAAAATTTTTGTGAAAGTATCTTTCCTTTAAAATCTC
CAAAAAAACCCTTTTTTGGTAATTTTCTCCACTAAATTTCCATACGAAAA
GAGCTATAACTTGGGATGTAGCCAAATAGAAAATTTTTCCGAAAAAATCT
AAATAAAGAAATCACTATGACCAGAGACCTTAAGGCATTTTATTTAGACT
TATTTTATAGAAGGGAGACCGCTTTAAATTTAATCATCTAAGCAGCTTGC
TTTATGGTATTTTTTGACCTACTTTGTTTGAGTTTAGCCCCTGTCAATAC
ATGTGGAAAATAATATTATTGCAAAAAAGACAAAATATTAGTATAAGTTA
AACCTAACTTTATTTACTGTACCTAACCCGAGTCTGCTAAATCGTGTGCC
TTTCGGGCATTCTTGCTTTAATATTTTATACGCCCTCCACGCCTCATGCG
CCTCCGTGCCCTCGTTGTTTTGTGCCACAGCATCTTACACGTTCTTCAAA
TTCTTTTTGTCTCGTAATATTCCTAGCAGGAAAAAACAAAAATAGTATTT
TCTCTCGTGACTCTGTTCGCGTGATGAAAGATATAAAGATATCATAATCC
AGTCATCGACTTTATATCCAGTTTTTGTCTTGATTTTATATTAGATTAAT
TTACTTTCCAAAAGATTATCAGTGTTTGAATTCGATCATCTAAATATAAA
TTTCTTATGAAATGAGACCACCCTGAACAAGGAAATGAATGCACACGGCT
ATATTCAGGCTGTGTCATTTATACATTATGGTCTCGTACCTCATTTCGGC
TGAGTGATTAGGTCGATTGTTTAAAAGTCCCGAATTTTCAACTAAAGACT
ATTAAAAAGAATAGCTTAATCCGCATATTTTGATACATAAAAGTAATACC
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AAAAACTATTTTTAAAAAGTTTCTTTTATATTGCCAAAAATCCTGAGATT
AATTATTATACTCAGCAGTAACTTAGCTAGACTTTACTGATTGCAAAGAT
ATTTATATATTTCTCATATATCGGACGGAGGATCGAGACAAAAATACCAT
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CAGGGTACATTGTTCTCATTTTCTACCCATTTATGGCCATTTTTGGTCAT
TTCTGGGCCTAACCGTCCATAACGAATACTTCAATACCATATGGAAACAC
CCCTGTCTCGCAACCCCAGTGGAACTTTCTTCTCATGGACAGATAAAACT
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AATTAAGTGGAGATTGTTTTGGAGTGAGTTCCCTTTTTTCTCAAATATTT
TGTCCATGATTGTAGTTCATTACCTATATAGGTTTGGACCTGAAATGACG
CTACACACCCACGTCCTTTTCTAAACCTAATCGAATAAGGGAAGAAACGA
CGCATTGCGAACAAATAGTCGACTATTGCTATGTTGCTGGGCCCGGGGGG
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GACCCTGTCAGATACACATCTTGAAAATTAATAGATTTGGAACCCTGTAA
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CCAAATATTGCCTAAGTGCCCCCCCCCCCCAATTGCTCCATGCCACTTTG
GCTACTGTTTAATTCAAGCCGAAAGTATCGAAACTTACAATGAAGGTCAT
AATATTTCAGAAAAAAGTTAAATTTTCAAAATCTTATAGCCAAAAACGAT
AAGGTTGGAAAGGTAGAGTTTTAACTATAAGTTACACTAAAGACTTAAAG
ATTCAAAAGTTTGAGAATGGTCCAATAGGGCTCAGAATATTGCCTGGAAG
TCTGTAATATAAACCCCTCCTGAATCGAAATATTTGATTAAATTGAACAT
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TTGAATATACCTGAGGAGTATATACGTTTGAAACGAAATTATTCTTATTG
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TCCCGCGTAGGATCAGGAGAGGTTTTAGACATTGACTTCAGTAGCGTAGA
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AATTATCTCCTGCACAAACTAATGGACTTTGAGGCTCGAAGGGGCTACAG
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CAGCAGTGTTGGAACTGTCAGCATATTTTTCCGCTGCAATGATTATTTCA
AATAAAGGTGCTAGCAGTTAAAAATTCCAGTGGCAAAATCATAGTGCATT
TCTTTCACAGTAAGGTTGAGCCTTTTTTTATTCTAGCGATTCTAGCGCAT
GGTAACTTTTGTAACTTTAGTTGGTATCTAATGTCTTGTTATAAAAAAAT
GAAAAATTTGATAAATTTCATAACGACATTAAATTTCTTTGCTTATCTCG
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AAAAAGAGACAAATGTTTAAAAAGATTACAGAAAGCTATATGATAAATCC
AAGTCACGCAATTTCATTTAACTTATGTTTTTAAAACATTCAAAAAATGT
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GTGATAACGTTGTCACGCAATCCATGTCATTTGTCCGGCTTATTGCTCAA
CTCAAAGCACAAGAGTCGGATGTGGGTAGGGGCTCCTAGGCAAATTTGTC
TTCCATGTACAATCAGTGACAAAATACTTGGCACAAAAGGGAAATTCACC
GGGTTGTTTTGAAACCACAATCGATTTGTAAGTGCTCTAAAGTAGGTTGG
AATGGTAGAGTTTTAACTCTGAGTTTTAACGCTAGACTTAAGACTTATGA
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AATATAGCCTAGAAACCAATAAATCCCTCCCAGATCGAAATAATCGATGA
AATCAATTTTCGAAAAATGGTAAATTAGCCAAAAGTGCAAATATATTATG
GCACGGATTGTAAGTAACAAGGGATCCTTAGAATCGAAAAAAAAGAAGAC
CTTAGGATCTGAAGATGCAAAAGTTCAAGAATAGTCCAATAAGGCTCAGA
ATATAGCCTGGAAAAACCGCAAAAACCAAAAAGTGCTGACGTCAACAAAA
TTAGTTTTTTAAATAACTCCAGTTTGAATAAAGGTAGAAACATGAAATTT
GGATCGGATCAACGGTGTATATCATTGAAAGGGTCATTTTACAAAAAATA
ATTTTTCGAAATTTTGCTGTCGTCAGTAGAAATCAGCAAAATACAAAACT
TTGCAAAGAAATGCTGATGTCAGCAAAATTTCAAAAGACTTTTTTTGCAA
AATGATCCTTTTAATAATATACACCGTTGATNTGATGTCAGCAAAATTTC
AAAAATTATTTTTTGCAAAATGATCCTTTTAATGATATACACCGTTAATC
CGCCGATCCAAATTTCATGTTTCTACCTTTAGCCAAAGTGGAGTTATTTA
AAAAACAAGTTTTGCTGACGTCAGCCCTTTTTGGTTTTTGCAGTTTTTTG
CGAAAATGAGGGCGTAAACAATTAGGTAACACCCCTACAGGGAAACTTCA
ACATGGTGCTCTTCTTATTAAATCATTTGCTCCTTTTCTGCCGGCTAATG
TTCTTTAAAAATTATGGTAATTTTCATGTTTTTGAGACATGCCATAACTT
ACCTGAGAACAAATTATATAAGAACATAAGATTTTGATGGTCAGAATTTT
AAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAGGCTTCGCAGACTTGAAAACAGCCAA
TTTCTTATCAAAATGGACAAAAATACATAAAAGATGGGGAAAATAAGAAC
ATTTTTAGACTTGAAACTTAAAAAGTTAAGAACATCTTAAGGCTTAAAAT
ACTTTTATGTTCTTAAAAAGAAACGTGTATCCAGTCTTGAGCGTGTTCTG
GAATCGTCCTCGCATTACCAACCTCTCCAAACCTACTCCAAAGAGACACC
CCCTTCTCACAGGCCCACTTGGAACCCTTCCCACTGGAAAAATTGGCCGA
AATATTGTCCCTGTTGAAAATAATCAGATAAGCAAATTCCCACTGCAAAA
TAAAGTGCCATTTTTTCCATCCCATCTAAATTTTCTGGCTAGAAAACAAT
GTATTTCAAATCCCCAGCAATAAAAAAATATTAGAATTTCAATCCCCATT
GAGTTTTGGTCCGTTATTTTTACCCTCACTGGATCATAAAATCCCACCGT
CTGTGAGAAGGGGGTGTGCAAAGACCAATTCTGCGATGAGACGAATTCCC
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TCTACATTAGGTAACGGATAAAATAGAACTGGAACCGAAACTATCATAAC
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AATGTACTCTGTACTCTGTAGTGAATTGTTTAAACATTTATACACCTCTG
TGTCACAGAACCAATGGGACCCCAGTCCCACTGGTCCCTATTGGAATATT
TCAATAGAAAATTTTCACCGGGACTGTGAGACAGGGGTGTTTTCATGTTT
TCTTATACCTGATTTATTTTGGTCTAGTAAAATTGTAACAATTTGTATGG
AGGTCTTAGCCATATCCACACAGTTTCCAGAACTGAAATTTCAGTATTAT
AGAGTACGTAGTCAAAGCAATGTTGGTCTATTGAAATGTCAAACCAGCTC
AGCCCACCAACAGAGTTATGTGGCTTCAAAAATATATTAGATGAAGTTTA
ATGTCTATTAATTTAACTTCAATTCTTTTCCTAGTAATAAAGATACAATA
AATCGCTAATGAAACTGGCCCCATGATCGAAAACCGAATTGCGAATCTTT
CATTTTAATTCAGTCGTTTTTCGTACATCCAAAAAACGTCGTTTTCGAAA
TTTAGCCAGACATTGATAATTATAGACTTGGATTATGATAAAACCAAATG
TCATTATGTAAAAATTGTATTTTTGCAATGTGTCGTTTTAAAAGAAATAT
CTTTAAAAGAAAAGAAAAATCAGCGAATACCGAATTTTTGATGCACGCGA
TGTTTGTCACGAAAATTTTGTAGCTTTGATAATTGTCCAACGTTTGTCTT
TTGTCCTATCCTATGATATCGCTATTTGATTGGTTGATGACAAAAGAATT
TTCCCCTTGACATGACAACTGCGGTTTGATTAGTTTATTTAGATCTTTAT
TATTTACTTAAATGACATGTCTATTGTGTCTCTTCTAAAAGACAATAATT
TCTATTATATGTAGATATGAATCGTCTATTGTTATCGGAATCGACCTTGG
ACAGTATAAATACTGCTCCATTTACACAGGGCCAAGCAGAAGCTGGTATC
AACGCCTTTGGTTAAGGCCCCGTCTCAATTTAACAAGATGTCAACGACAA
AAGTGAAGATTGCAAAACCATTCGTGAAGGTTGGACTCTCCGTAACGTTT
GCGTTAGGGCGTCTAGCGTTGCGCCTACCATTTATCAGACGCCCCTTAGT
TGAGAAATTCGCTAAAATCAATAGGCTACCAGCAGACATGACTGAGGAAT
CGTTATTCTCAAAAGATATGCAAAAAACGTTGATGAAATGTCAGATCACT
TATTTATCGATCAAAGTAAAGAAAGGAAAGCCTATCAAAGATTATAAAGC
GTTGAGAATGTTGGATGATGGAAGTTATGAAGAAGTATCTTTACACAATA
TTCAAAGACCGGTATGTTTAAAACACCTTTTTTTATTTTTGACAATTTTT
TTGTCGGATTCGAACACATACATTACACGTTTTTCTTTTTGTAAGAACAA
ACTATATAATAACATAAGGCTTCGATGGCCAAAATGCTGTTTGTGATTTT
CTAATTGAATTACCATACATATGGGGAGCGGAATCGGCCCTTTTTTCGGA
CGGAGTGGCGGAATTTGGCGAAAATTTAGACGGAATTACGGAAATTGGGT
TCTCTGACGGAGACGGAAAATTAGACAATTTTAGTGCGGAAAAACAGAAT
TTAGGAAAAAAAATTGCGGAATTTCGGAATTGGTAAAAGATATTCCGAAT
TTGCGGAATTTTCGACAAAAATATTGAATTTCAAAGGAATTTTNAGATAT
TCAAAATTTGCGGAATTTTCGACAAAAATATTGAATTTCAAAGGAATTTT
CGGTGACGGAATTTTGGTTCAATTTAAGACGGTTTGACGGAAGTTGGAGA
AAAAATTGGTGGAATTGCGGAATCGGGTACCCCCCCCACATATGTTTGAA
ATAAAACCTTCCAGAAATATACCTCAATACAGTAGCAAAACATTGATGCA
GAATCAGATAGCAGACAGTTTGTTAGCTTTTGCAAGGCCTAAATTAGCAA
ACATGTGCTAAAACACAGCTTGTAAAAAACGTTTTTTCAACGTCCATCCA
AACTTAAATGGACATTGTGGAAATGAGATAAACGTTGATAAAACATTGTG
TGCCAGTTGAGAAGGATTTTTTCTTTTTGGTTTACCTTTTAAGGGTAGTT
TATTACAAGTATATTCTCTTCCAGGGGGCACTCGATTTCTAAACGACGAT
ATGTGCCGGGTGATATTAGTGCCCCGCCCCTCCCCCCGGAAGGGTTACCA
TCGGCTAGAATGTCCTAAAGAGTTTTTTTTAATCATNGTTAGCTTTTGCA
AGGCCTAAATTAGCAAACATGTGCTAAAACACAGCTTGTAAAAAATGTCC
TAAAGGGTTAACTAGTATATATTCTCTTACAGGGTGTACCATTGGTTATC
AACTTTGGTAGCAACAGCTGACCCCCGTTTATGGCAGATTCTCGTTCGTT
CTTGGAACTGAAAAATCAGTATGAAGAACAAATGGATTTCGTCATCATTT
ACATTGAAGAAGCACATCCAACTGGTGAATGGGTCTTTAAGGTATGGCTA
TGTTTACATTGTATTTTTATTTAATTCCTAACAATTAAAAATTGACAATT
TTAGGAAATTTTTTCTTCTCGGGGCCTCCAACTTTTTTGGTGAAAGCTAA
TAAGCTATTACACAGCTAAACTTGAAACCGGTATCCAGATAGATTATTGA
TTATCTTTTTTGTGGTATGGAATTGGGCATCTGTAAAAGTTTTCGGAGCG
CTGAGGTTGTGATTTTAATTACAGTTGAGCCTGTTTTAACCTTGAACACA
GGTTTTCTCATTCCTTAAGTTAACAATATGTCTTATTAGAAACCTTACTC
CATAACTCGAAATTTCCTTAATTCGAACAAATTTGTTATGAAAACTACAC
TGTATTAACAAAACTAAAAAAAGCAAACGGTAGAATTTCCGTAGCAGAGA
TGTACTCGTGTTAATGACAAGCTTTGAGTAAACAAAATTTCACAATTTCA
AGGATATTAAGGAAGCTATTAGGGAAGGAAAATAAATTACAATTCTAAAC
CAAAAAAGAAAGATTTTTTCGCAATTTTAAAAGCTATTGGATCATTTTCC
CGGGGGGCACTCAAGGTAAATGACCTACCATACGTGCGGTTGTTAGGGAC
ATATTTTCCAAATATTTTCCCAAAGTGCACTCTAAGGGTGTAAAATTTCA
AAAATGATCAAAATTATTCAAGAAAATGCACCGTAAGGATCGATTTTTCG
CTCAAATTTGATCAAACTTTGCAAAACTTTCTCTGCACTGTAAGGGTCTG
ATTTCAAAGGCTTAATTTTGGGTATGGTCGTTTTTGAATTGAGTGNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCCCCCCCCCC
CCCCCCCGGATCATTTTTAACCAAACCTATAATTTTCCCTTGTCACGATA
TCAAACTACATCAGAATTGGTTTCTAAAACTTATCTGCCAATAATGTAAG
TATTGAGGAGGCAAATCACTACTAAATGTTGCAGAATTGATGCGGAAGTA
AGCAGAAAATTAATAGCTCTTTAAAAATAGATTAACACACATTGGACTGA
CTCCTCTTCCAATAATTTCGCAATCTCACAATTATGATGCGCTAAAGCAG
GGACATCAGAAACGTTTGTATGAAACTTGTTGTGCGAAAAAGGCAGCTGT
AACTAGACTTCGTTTTCAATCAAGTTTTCTGGTGAGATCTAAGTTCAAGG
GAATGTAAAAAGCTGACATAATTTCCCCATAATTTGTAAAAAGTGCGTGC
AGAAATTTCATATTTTGATTTCGCGCTTTCGTGATTACATGAGTTTGAAC
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TGTGTCAAATACAATGAAATTATCAAAAAAACTGAGCAAATTATGTATGA
GTTATATTGTTATATGGGTTATTGACGTCAGTTTTGTCCCGTGATCATTT
TCATATGTTGGTCACGCAATTTAAGGCTCAAACAACCTTCAAGCAACAAC
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AGAAACAAATTGTCCTGCAAGGGTCACGCAATATTTCAATAAACCCCCGG
TTTTGTAGCGATTGGTATGCTTGAATGCTTAGTTTTCCAGGGGGTTTGAT
GAGCTGAGTTGTCGTATTACCCCTAGTATCTTAAAGATCACGCAATTCTA
AAAAATGTTTTATTTCATACACAACTGCACGAAATTCATTCAAATATTTG
AATGTTTCGAAATACTGTAAAAAAACGAGGCTTTGAACTTTGATCATTTC
ATTCCTGTAATTCCGCATCTCTGAATCTCTGCATCAGGGTCCTTTAAGGT
AACAATTTGTTGATACATCTGACTTATTGCTCTAATGAAAGCATGTCTGC
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TTGAATACATTGCGAGTGCAATTGTTCCCATAGCATTATGTCAAAAACAT
TATGATAACATTTCTGTTGAGGTAGGAAGGTATTGAAAGGCAAATAAATG
GGGGGATTCTGGCAGTGTGTCCCATTTTGAAAATAAATCCCTGACAGTAT
TGTTCACATGAAATACTTTTTAAGCAAAGAAATTATTGTCTTCCTACGAG
ACTATGCATGACGTCAATAATCGAAAATCCCTATCTATTTAAACAATTCT
TTGGCATTTGTTATATTAATATACCTGACTTGGTCGTTAAGGAAATTAAT
AGCATCATTATCCCCAGCAAGAAGATGCATAAATTCTTTGGATGATGATT
AAAAGCATGTCCTTCCATATATCTTTATGCTTAAACCATTGAGTTTAAAG
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AAGCCAATTATTTCCCATCCAGAACGCGCTCAGAACGCGCCGCAATCATA
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TAAATCTAGTGATGGATTTTAGTGAAATTTCTTTGAAGATTTTGAATGAA
GTTGTTTTGCGATCAGTAAAGGTGGGGGTAAATTTGACTTTTTGACCTCT
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GAAATCAACGGGTGTTTTCATTAAAATTTGCATAAAAAAAATAACAACCA
CATTCTAATTAAGCGTTGGTATACATTTTCCTCTCAATTAAAATGATTGA
TAATTCTCTTTTTAAGGTTTGTTTACCTTGCCCGATTATAATGACAAGGA
AATTTCGTAATACCTCAGGCTTATTAAAAGTATACCGATTCTGATAATTA
ACCTTTTCACCTTTCTTTTTAATCTACAAAGTTAAGAAAAATAGCCCCCT
CATTTTAAAGAATTATAAGAGTTTTACTACTGGACATCTGCCAACAATTT
TATGACTCAATATATTCAAAATAAATATACTGTATAACTCGAACCCAGTC
CTTTAGTCTATTTTCATGTTTCTGATATAGCGCTAACGGTTGAACCCGGG
GAACAAACGTCCATCAGCAAAATCAGAAAGTGGTGCAAGTGTCCCTGGGT
ACGAGATCGTAAAAGTCAGACATGTTGTTGTTTTTGTTTTTCTGAAAACG
ATTTTATAAGTATGCGTTGAGGCTTAATTTTGTTCATTTGATGGATCTTA
TAAAAAGATAAAATTTCCTGAACTCTGCGTCAAGTGACATCAAGTAGCTC
CTCAGACCACCAACAGTTAATAAGGAGTTAGTAGGATCACTTATCCGGCC
TATTGTTTCTTTTTTTTTATTATAAAAGATCTTAGAAGATTAGGGCCCAT
CTCAATTGGCTCATTATTAAAGGATTAGTAGGATTTGATGTTCGTGTGTC
CCAATCTTTCCACCAACAATAGATACAGGTTTTTTATAAGAATCGGCAGT
AAATCTCTTCTTATTGGTCTATACGTAGTTTCAGCTGAAATAGTCCAACA
ATAATTTTTAACACGCTGACTCGTTTATAAAATGCTTAAACGATCCTAAA
TTTAGAAAGTCTTTTATTTCCTTCTTCCATAGTATAAGAAAGCTGAAAAA
TTGGAGAAAAAAATCCAGAGGGGTCTAATTTTGAGCCTTTTCATTCCCAC
GATAACACTTCTTCCTATAGAAAAACAAAGCACAAAAGAAGAATTTGACT
ATGTTAAAAGTTGCATAACTATTCTTGAATGACCTAGCATGAAAAACTAA
TTGGCAAACCTCTTTAAGATAATAAGCCTTAATAAGCTGCCCTGGGTGGT
ATTAGCTGAATCGTGGTAGTCATAGTTACACAATCAAAGACAACCTTGCA
ATTTAATTCAATTCAATTATTTTTGACTGTCTTTTCGCCGATAAGTTGAA
AATATTCTATAAAAAAGTCAAAAAAGATTATTTCCAATTTTTCAGGACCC
TCTTGGATTTTTTCTCTCATCTTTTAGACTACCCTGAATTTTAGTCCTCG
TTTTACCTCCTTAACATAAGGGGACAGACTATTTCTGGAATAGCCCATTG
TTTTTATTATGAAACAAAGTGTGCAGATTTTAATAAATAACACCAATTTT
TGGGTTTCTCTTTATCAAATCCACAATTTAAGACAATAGAGAGCAAGTAC
GTCGGAAAAATGCGAAGGAGTGCAACGCTCGTTAAAAGACAACGAGATTA
CAATTACAAATGTCTTCCTCTGATAAGCTCAATATGGTCTAAAACCACCT
ATGAAATGGGTAGGGACAATGACTAAAAAATTATAAACTTGATTTTAATA
ACAAAAATATAATTTTTTTTGACAGGATCAAGAGCAAATTACACAACACA
AAAGCATCGAAGATCGTATCACACAGGCAAGTAAGCTACAAAAAACATAC
CCAACAATCTCTATCTATGTGGATCAAATGAGCAATAAACTGAACAATGC
TTTTGGAGCTTTCCCAGAAAGACTTTACGTTCTTTTGGATGATGTTGTTG
TATATCAGGGAGGATCTACACCGATAAATTATTCATTAAAAGATCTTGAG
AAGTGGATCGCTAAATATGTATCTAAAATGGAAAGACCTGAAAAGTCAAT
GTTGCCTTTGTAGAGAATTTTTATTTTAATTCAAATCAATTTTACCACAT
TAACTTCATACCCTAGCTAGCAAGTAAATCGATCCGATGTTTGGCCACGG
AGGATAAATTTGACTCGTTCCTGAGAGGAGAGCTAGGATTATAAGATACC
ATTTCGAAAATCTTCCCTAACACTTTTTCTCAAAATCATAAGCTTACGTT
TTTCGCTGTTGTTTAAATCATGGGCCCCGGCGAGCCATTTTGAGTGAGGG
GGCCAATGTTTTGGAAAAAAATGTCACCCACCATGGTTGGGCGACAAAGA
AAATTTTTCACTTTTTACACCCTCAAAACACCTTAAAACAATATCTAATT
GGGGAGAATAATAGTTTTTGTGGTTTGATTGGTCTCAAACCAGCTTAAAA
TAGTTACTTTTAAAAACGTATGACATGGTCTACCAAAAAGTGGGGGTCAT
GGCTCCGGCCCCCCCTGTTGATGGGGCCGATGTAAATCAGCTCATAAGGT
GCCGAAATTGATTGGGAATCGAAATATTGTATATATATAATATTGAATAT
TAATTTGTATATAAATGGTTTGTAAATATAGTTATATTTAAATTTTTCTA
AGGAAAAACGAAATGTTTTAGAAAATAGGGGTTAATTAGACATTTAACCA
ACCTCGTGTCCAGGAAATTATTCTGATGGTGTCAATCTACTCAGGGGCTC
ATTGATTCAGATCATTATTGTATCTTTGCTCCTATTCCTGGGAACGAGGA
TATCTTTTGGTTAGGTTAAAATAAAAATATTATTTTTGCACTTACACACA
TACACAAAAGATTTTTTCAAATTATTTCTTCAATACTTTAGTGAGATTTT
TTAATGACCAATTTATGATTATTTGATAGGAAATTGTTTAATTGTAAACA
ACTTATTAAATATGATATTTTTGTATTTTTTATGTACAATAAATTTTTCA
TTGGAATTTATAAAGCTTGCTAAAATAAAATACGCAAAATGAAATTTTGT
TTTTTC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000325:102749..116054- >TCONS_00019333 ID=TCONS_00019333|Name=TCONS_00019333|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=1485bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000325:102749..116054- (Clytia hemisphaerica)
GGTGTACCATTGGTTATCAACTTTGGTAGCAACAGCTGAGGCCAAGCAGA
AGCTGGTATCAACGCCTTTGGTTAAGGCCCCGTCTCAATTTAACAAGATG
TCAACGACAAAAGTGAAGATTGCAAAACCATTCGTGAAGGTTGGACTCTC
CGTAACGTTTGCGTTAGGGCGTCTAGCGTTGCGCCTACCATTTATCAGAC
GCCCCTTAGTTGAGAAATTCGCTAAAATCAATAGGCTACCAGCAGACATG
ACTGAGGAATCGTTATTCTCAAAAGATATGCAAAAAACGTTGATGAAATG
TCAGATCACTTATTTATCGATCAAAGTAAAGAAAGGAAAGCCTATCAAAG
ATTATAAAGCGTTGAGAATGTTGGATGATGGAAGTTATGAAGAAGTATCT
TTACACAATATTCAAAGACCGGAAGAGGAGTATTTCACCTTTCAAAGCCC
TAATCTTGGTAGAAATCAAACATTTTGGAAAGCTTTTTGGTTCAGGGTGT
ACCATTGGTTATCAACTTTGGTAGCAACAGCTGAGGCCAAGCAGAAGCTG
GTATCAACGCCTTTGGTTAAGGCCCCGTCTCAATTTAACAAGATGTCAAC
GACAAAAGTGAAGATTGCAAAACCATTCGTGAAGGTTGGACTCTCCGTAA
CGTTTGCGTTAGGGCGTCTAGCGTTGCGCCTACCATTTATCAGACGCCCC
TTAGTTGAGAAATTCGCTAAAATCAATAGGCTACCAGCAGACATGACTGA
GGAATCGTTATTCTCAAAAGATATGCAAAAAACGTTGATGAAATGTCAGA
TCACTTATTTATCGATCAAAGTAAAGAAAGGAAAGCCTATCAAAGATTAT
AAAGCGTTGAGAATGTTGGATGATGGAAGTTATGAAGAAGTATCTTTACA
CAATATTCAAAGACCGGAAGAGGAGTATTTCACCTTTCAAAGCCCTAATC
TTGGTAGAAATCAAACATTTTGGAAAGCTTTTTGGTTCAGGGTGTACCAT
TGGTTATCAACTTTGGTAGCAACAGCTGAGGCCAAGCAGAAGCTGGTATC
AACGCCTTTGGTTAAGGCCCCGTCTCAATTTAACAAGATGTCAACGACAA
AAGTGAAGATTGCAAAACCATTCGTGAAGGTTGGACTCTCCGTAACGTTT
GCGTTAGGGCGTCTAGCGTTGCGCCTACCATTTATCAGACGCCCCTTAGT
TGAGAAATTCGCTAAAATCAATAGGCTACCAGCAGACATGACTGAGGAAT
CGTTATTCTCAAAAGATATGCAAAAAACGTTGATGAAATGTCAGATCACT
TATTTATCGATCAAAGTAAAGAAAGGAAAGCCTATCAAAGATTATAAAGC
GTTGAGAATGTTGGATGATGGAAGTTATGAAGAAGTATCTTTACACAATA
TTCAAAGACCGGAAGAGGAGTATTTCACCTTTCAAAGCCCTAATCTTGGT
AGAAATCAAACATTTTGGAAAGCTTTTTGGTTCAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00019333-exon-sc0000325-1575043694:115979..116054 | TCONS_00019333-exon-sc0000325-1575043694:115979..116054 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019333-exon-sc0000325-1575043694:109594..109975 | TCONS_00019333-exon-sc0000325-1575043694:109594..109975 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019333-exon-sc0000325-1575043694:108414..108572 | TCONS_00019333-exon-sc0000325-1575043694:108414..108572 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019333-exon-sc0000325-1575043694:102749..104029 | TCONS_00019333-exon-sc0000325-1575043694:102749..104029 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019333-exon-sc0000325-1510915933:115979..116054 | TCONS_00019333-exon-sc0000325-1510915933:115979..116054 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019333-exon-sc0000325-1510915933:109594..109975 | TCONS_00019333-exon-sc0000325-1510915933:109594..109975 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019333-exon-sc0000325-1510915933:108414..108572 | TCONS_00019333-exon-sc0000325-1510915933:108414..108572 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019333-exon-sc0000325-1510915933:102749..104029 | TCONS_00019333-exon-sc0000325-1510915933:102749..104029 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019333-exon-sc0000325-1491911889:115979..116054 | TCONS_00019333-exon-sc0000325-1491911889:115979..116054 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019333-exon-sc0000325-1491911889:109594..109975 | TCONS_00019333-exon-sc0000325-1491911889:109594..109975 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019333-exon-sc0000325-1491911889:108414..108572 | TCONS_00019333-exon-sc0000325-1491911889:108414..108572 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00019333-exon-sc0000325-1491911889:102749..104029 | TCONS_00019333-exon-sc0000325-1491911889:102749..104029 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000325 | supercontig | sc0000325:102749..116054 - |
Blast
BLAST of TCONS_00019333 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: IOD3 (Thyroxine 5-deiodinase OS=Homo sapiens GN=DIO3 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 120.553 bits (301), Expect = 8.017e-30 Identity = 62/144 (43.06%), Postives = 93/144 (64.58%), Query Frame = 3
Query: 465 PLVINFGSNS*PPFMADSRSFLELKNQYEEQMDFVIIYIEEAHPTGEWVFKDQEQIT-QHKSIEDRITQASKLQKTYPTISIYVDQMSNKLNNAFGAFPERXXXXXXXXXXXQGGSTPINYSLKDLEKWIAKYVSKME--RPEK 887
PLV+NFGS + PPFMA +F L +Y+ +DF+IIYIEEAHP+ WV D I QH+S+EDR++ A LQ+ P ++ +D M+N ++A+GA+ ERLYV+ ++YQGG P Y + +L W+ +Y ++ RP +
Sbjct: 160 PLVLNFGSCTUPPFMARMSAFQRLVTKYQRDVDFLIIYIEEAHPSDGWVTTDSPYIIPQHRSLEDRVSAARVLQQGAPGCALVLDTMANSSSSAYGAYFERLYVIQSGTIMYQGGRGPDGYQVSELRTWLERYDEQLHGARPRR 303
The following BLAST results are available for this feature:
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