TCONS_00020365 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00020365
Unique Name	TCONS_00020365
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2369

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000355:106639..115192+

transcript sequence

>TCONS_00020365 ID=TCONS_00020365|Name=TCONS_00020365|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2369bp
tgacgaaaatgcctctaggtgacgaaatttttccccgacgaaaaaaaaac
ccgactaaataaaactccgacatttttttccccgataaggtgcTCAATGA
ACGAATGTACAATAATAACGTTACGCAAAAATGcttcatatttcaaaatc
atgatacaaaaacaaaacaaaacaaaacaaatatcaaatatGGGAGATGC
CATGGAAAGAAAATGCgtaattaaaaaatactatgTTTAAAATATACTGT
TGAACAAGGAACATTGTACGATCCGCGATATTGCCCGTAGCGTTCCctca
acgtccatttaacgttataaGAACGTCATTTATGGACGTATGAACGTTAT
ATGACAGTCATGTGGGTAATAAAAAACAATTCTTAAGATTTCAATATTGT
AGTACGATAAACATTTGTATTTCGCACAGAaagagattaaatttcgcgag
gaTTAATTATTGgtgaatttagaattttttcgcgaaaattaaccCACTTA
ACTTTTTCAACAGTTATTGATAGTTTTGCCTCTGTTTTGTCCTTTTGATG
TATCCAGTGAAATCGCTTAACCGCGTAGTATAcattgcttttataagaac
agtaaCAGTtcacttgttcttataaaaaaggggaGCTTTCTGAAGAGCAA
CATCGCAGTATACCTTGGAGGAAGGGCAgataatattttagaaaaaaatc
taaatgacATTAGAAACTAACTAATTATTAATATTTGAATATAATACTAT
GAAATTGTCTgtcataaaaataaattaaacgTTGAGAATGCCTTATAAAT
GCCTTTTGATAGGTTCTTTAAAgctttttccaaatatttgtgaTACTCAT
GANTGCCTTTTGATAGGTTCTTTAAAGCTTTTTCCAAATATTCGTGATAC
TCATgaacgtaatgttttatacagaGGCATCCAGAAAAGACCGGatgttt
gccactaattttgaatttaccgTATTTACCaataacaatccaaaagctcc
ctcaacaatagaccttttcataaattacgtcacgaccAACGCTTACcccg
ttttcaaaatattgctaaaGTTTTCGATTACCAGAGGAATTCAGATGAAG
TTGACTCTACTTGAAAGTAATACTTGAAGACTCGagggatttaatcacct
tggcaataGTTTCAAAACGAAATAGTCGTTGTACTCAAAATATTTTACGA
AAAGACCTTATCAAAAGGGTCAAAATCGCAAAAAGGCTATACCACAGTAC
TATCCGAACTTTTGtgattttgattgttaagggaaTTTTCGGATTGTTTC
TGGTAAGTATGGTAACCAATAACATTAATGTGAAACGCCCCGTCTATTTT
GAGTGATTCTGTATAAAACATtatgtcattaatatcatgaatTACATAAT
TCCCAGACAACATAGCCCTCgatttattttttctgaatCATGGTTTGAAA
GAAAGCTATCAAAAGAAGAGTATGGGGTTTAAGTTCTTGAAAGCTTTTTT
AcgacaatttgaaaatatggtTTGTTGGAAATAAATGTCAATTACGGGCT
TCATTGAAATGTGATTCCGAGTTTGGTACAaaagcaaaacttgaaaaaca
aaatatacaaaattttaGGAACTTCTTAATTTTCGAAAGACTAAAAGTTA
CGGAACCGTAAGAATGTCGTTCCAGgttgcacacaacgttgttttaacgt
ttgtctaacgtccacaacgtccatataacgttacatgaacgttaaaacaa
cgtaaGGTGCTAGCTATAATTGTCTTAATATCTTCTCAAATGCATCAGTA
GAACAATACAACAAGATCAAAAGTTTTGATCTGATTTCAAAATAACGTTT
CTTGGTAACTAGTTATACGAGAAGACGGAGCCTCAAATATCTATAAAACA
CTAGACCAGGcttaatttcatcattgatgAAACAGAAtgatgaaataata
aaaaaaaaaaaacgagatCTTCAATTTGTTAGCAAGAGCAGCGAAAGTAC
TGAAGCCTGGTGTAATTACTGTGGTTCACTGTCGGTCACTTTGGTCGAAG
TTGGTGCATTATTTGTTTAGCTCAATGTCATGTTGTCATGTCACAAATCT
GTGAGCAAAATACTAGTCACCGAAAGACCTGGTAAAGGGTAAAGTTAAAC
ACACCCACCAATAACAAACTGTGATTTAGTCAGATGGAACACCATTATAT
CAGGAACGTAGACGACCTTTAGTAATGAGACCGTTCCTATTTGGACACTT
GTGACGGCTATGGTAGTTCTTTTAGATCAGAAGGTCTTCTCCATTCCGGT
TTCTTAACGTAATGGTCACACTTCCTCCATTTTGTTTCGCCAACCGATTC
AAATAATGAGAAACGCTCA

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000355:106639..115192+

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00020365 ID=TCONS_00020365|Name=TCONS_00020365|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8554bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000355:106639..115192+ (Clytia hemisphaerica)
tgacgaaaatgcctctaggtgacgaaatttttccccgacgaaaaaaaaac
ccgactaaataaaactccgacatttttttccccgataaggtgcTCAATGA
ACGAATGTACAATAATAACGTTACGCAAAAATGcttcatatttcaaaatc
atgatacaaaaacaaaacaaaacaaaacaaatatcaaatatGGGAGATGC
CATGGAAAGAAAATGCgtaattaaaaaatactatgTTTAAAATATACTGT
TGAACAAGGAACATTGTACGATCCGCGATATTGCCCGTAGCGTTCCctca
acgtccatttaacgttataaGAACGTCATTTATGGACGTATGAACGTTAT
ATGACAGTCATGTGGGTAATAAAAAACAATTCTTAAGATTTCAATATTGT
AGTACGATAAACATTTGTATTTCGCACAGAaagagattaaatttcgcgag
gaTTAATTATTGgtgaatttagaattttttcgcgaaaattaaccCACTTA
ACTTTTTCAACAGTTATTGATAGTTTTGCCTCTGTTTTGTCCTTTTGATG
TATCCAGTGAAATCGCTTAACCGCGTAGTATAcattgcttttataagaac
agtaaCAGTtcacttgttcttataaaaaaggggaGCTTTCTGAAGAGCAA
CATCGCAGTATACCTTGGAGGAAGGGCAgataatattttagaaaaaaatc
taaatgacATTAGAAACTAACTAATTATTAATATTTGAATATAATACTAT
GAAATTGTCTgtcataaaaataaattaaacgTTGAGAATGCCTTATAAAT
GCCTTTTGATAGGTTCTTTAAAgctttttccaaatatttgtgaTACTCAT
GANTGCCTTTTGATAGGTTCTTTAAAGCTTTTTCCAAATATTCGTGATAC
TCATgaacgtaatgttttatacagaGGCATCCAGAAAAGACCGGatgttt
gccactaattttgaatttaccgTATTTACCaataacaatccaaaagctcc
ctcaacaatagaccttttcataaattacgtcacgaccAACGCTTACcccg
ttttcaaaatattgctaaaGTTTTCGATTACCAGAGGAATTCAGATGAAG
TTGACTCTACTTGAAAGTAATACTTGAAGACTCGagggatttaatcacct
tggcaataGTTTCAAAACGAAATAGTCGTTGTACTCAAAATATTTTACGA
AAAGACCTTATCAAAAGGGTCAAAATCGCAAAAAGGCTATACCACAGTAC
TATCCGAACTTTTGtgattttgattgttaagggaaTTTTCGGATTGTTTC
TGGTAAGTATGGTAACCAATAACATTAATGTGAAACGCCCCGTCTATTTT
GAGTGATTCTGTATAAAACATtatgtcattaatatcatgaatTACATAAT
TCCCAGACAACATAGCCCTCgatttattttttctgaatCATGGTTTGAAA
GAAAGCTATCAAAAGAAGAGTATGGGGTTTAAGTTCTTGAAAGCTTTTTT
AcgacaatttgaaaatatggtTTGTTGGAAATAAATGTCAATTACGGGCT
TCATTGAAATGTGATTCCGAGTTTGGTACAaaagcaaaacttgaaaaaca
aaatatacaaaattttaGGAACTTCTTAATTTTCGAAAGACTAAAAGTTA
CGGAACCGTAAGAATGTCGTTCCAGgttgcacacaacgttgttttaacgt
ttgtctaacgtccacaacgtccatataacgttacatgaacgttaaaacaa
cgtaaGGTGCTAGCTATAATTGTCTTAATATCTTCTCAAATGCATCAGTA
GAACAATACAACATGTGAAGAACAAAGATGAGTTATATAACTATAAGTAG
TCACGGGTCACGTGATTAGCACGTGACCCgctcttttattttttacagtC
CTCTTTTGTATTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAACAAG
ATCAAAAGTTTTGATCTGATTTCAAAATAACGTTTCTTGGTAACTAGTTA
TACGAGAAGACGGAGCCTCAAATATCTATAAAACACTAGACCAGGcttaa
tttcatcattgatgAAACAGAAtgatgaaataataaaaaaaaaaaaacga
gatCTTCAATTTGTTAGCAAGAGCAGCGAAAGTACTGAAGCCTGGTGTAA
TTACTGTGGTTCACTGTCGGTCACTTTGGTCGAAGTTGGTGCATTATTTG
TTTAGCTCAATGTCATGTTGTCATGTCACAAATCTGTGAGCAAAATACTA
GTCACCGAAAGACCTGGTAAAGGGTAAAGTTAAACACACCCACCAATAAC
AAACTGTGATTTAGTCAGATGGAACACCATTATATCAGGAACGTAGACGA
CCTTTAGTAATGAGACCGTTCCTATTTGGACACTTGTGACGGCTATGGTA
GTTCTTTTAGATCAGAAGGTCTTCTCCATTCCGGTTTCTTAACGTAATGG
TCACACTTCCTCCATTTTGTTTCGCCAACCGATTCAAATAATGAGAAACG
CTCA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_011441	XLOC_011441	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00020365-exon-sc0000355-1491911889:106639..108450	TCONS_00020365-exon-sc0000355-1491911889:106639..108450	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00020365-exon-sc0000355-1510915933:106639..108450	TCONS_00020365-exon-sc0000355-1510915933:106639..108450	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00020365-exon-sc0000355-1575043694:106639..108450	TCONS_00020365-exon-sc0000355-1575043694:106639..108450	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00020365-exon-sc0000355-1491911889:114636..115192	TCONS_00020365-exon-sc0000355-1491911889:114636..115192	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00020365-exon-sc0000355-1510915933:114636..115192	TCONS_00020365-exon-sc0000355-1510915933:114636..115192	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00020365-exon-sc0000355-1575043694:114636..115192	TCONS_00020365-exon-sc0000355-1575043694:114636..115192	Clytia hemisphaerica	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000355	supercontig	sc0000355:106639..115192 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.05568	0.744066	0.647138	0.43195	1.30212	0.92256	1.66654	1.85861	1.11894	1.00351	2.13284	0.949231	1.32536	1.09063	1.03012	1.13431	1.20999	1.06995	1.07306	1.48245	2.62358	2.10277	2.28054	2.20274	1.58662	2.80844	2.89282	3.45779	2.73905	2.17459

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00020365 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00020365 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00020365 (transcript) - C. hemisphaerica