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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00021755 ID=TCONS_00021755|Name=TCONS_00021755|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1658bp
GTGATCTTTTTCGCAAATCAAAACCTTAACTTAACTACCTAAAGTGTCTT
TTCTATCGATCACTTTAAAACCAAGTATGTTTCAAGATACACCAAGGTCT
TCATCTCCAATCAATAATGAGAAAAACACAACTTTTGGAAAGAGTCAATT
GTCAACAGCCTTTTCATTTCCTGCTGGTGGAGGAGATAATTTATTTCAAG
AAACAGGAGACTCAACACGCTCTTTGCTTGCTCCAATATATAGCAAGCAA
GAAAAGGCTACTCTTGATATTTCTTCCAGTATTAAGACACCAAGGAATCA
CagtaaaaacagtttttccaatGAGAGGGTTGCATTGGTTACAGGAGGAA
AAAGTACTCCTGAAGATACCGGCAAGGAAAATGCTATAAACCAACATAAC
AGCGATGTAACGGACAACCTTCaagaagaaaagaacaaatcaaCAAAAGA
GAGATCGTCATCAGTGGAGAAAAACACACAGGAAGAAAAATCCAACAATG
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GCTTTTTATaacgaaaaatttatttttgaaaaatagcagCGAGTTTGCTA
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TTCCTTCTTCTTGCAACATTGACAATATAAAAGACACGATGTTAATAAGT
TCCCAAACATCAACATCTCCatcagaaagaaaaatagaagcaTACCAAAG
TCTATAGAGGTCAGGTTTTCCAGACTTCTGTTTGATTCATATGCACGAAT
GTATCTTACTCGCGATCTTGGTAAAAGAACGATACTTATAAACAGGATGA
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AGAAATGCTgtgctttttttgaaaactgcAATGTACCCTAAGGTGATATT
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AGAACACGCCAATCATATCATCTTTGAATTTTCCTCCGAATCCATAATAA
AGTGATCTTGCCATTATTGTCATAAAAACGAATACCATCAGTAAATGTGT
CAATACACGTTGTCTTTTCCATATTTTAAGTTCCTCAGTGTTTGAAAACC
GTTTGTCCATTTTTACGGTGAGATTGGAATATTTTATACTTCCTCCTTTC
CTTTATTGATTGTTGTTCGCCTTATTGTTAACTGCTTATTGGAAACCTTA
ACTCACTACGTCGAAATTAAAAGTTGGAGGATGGTAACCATTGTTGAACa
agtcattaaaaaataatgCGATTCATTAATTCCGTTTACATCGTTTTCAA
CATGATCATGTCTCTTCTATTTTTTACAAGAAGTAGACCAGCTAAATTTC
TTTAACACAACTGCACAATATCTCAAGAAGCATTCTCCTCAATAAAAATA
ACGTATATGTCTGATAACATACAAAACGAATTGTACGTTTAACTTCACAC
GATAacca Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000394:204442..210044+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00021755 ID=TCONS_00021755|Name=TCONS_00021755|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5603bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000394:204442..210044+ (Clytia hemisphaerica)
GTGATCTTTTTCGCAAATCAAAACCTTAACTTAACTACCTAAAGTGTCTT
TTCTATCGATCACTTTAAAACCAAGTATGTTTCAAGATACACCAAGGTCT
TCATCTCCAATCAATAATGAGAAAAACACAACTTTTGGAAAGAGTCAATT
GTCAACAGCCTTTTCATTTCCTGCTGGTGGAGGAGATAATTTATTTCAAG
AAACAGGAGACTCAACACGCTCTTTGCTTGCTCCAATATATAGCAAGCAA
GAAAAGGCTACTCTTGATATTTCTTCCAGTATTAAGACACCAAGGAATCA
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agcccttcgggctttacaaatctatgatgtcgacattagaccaagttacg
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aatttgaacaaaattttttttcaaaatcgaaaaagtgataataccttaag
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ttttaatttaatttaatttcaatttagtCTCAATTTcttgagtctgctaa
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AGTGCCTCAAGTGCCCTAGTGCCTCACGTGCTctaaatttttcacattta
ctttttttttttcaagaaaaaaatccaaaatccaaaatccaaaatcacgt
gaaaattggcaaaaatcacaaaaaaatccaaaaaaacaaaaaagtctcgT
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ACGTAGCCTATTGTTTTTCACTTGTCCTCAATTCTCTGGTGTTAACAGGG
TTTTGCAAACTGAACGAAATATTActtacacctttactttacTTTAAATT
GCATTTTAATGCACAAAATTCTCGagttaaaagttaaaagttaaaagtgc
gagttgcaaattaaaaatgCTAGTTGCAAATTTAGTATAAAGTGATATac
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cattatcattatttttcaaagctatgtgcttttttttttttaaacaacaa
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GTTCTTATAGCTGTAAAAATTACAGTCGAAACAAGGGGTAATCATCTTGT
CACAAGCGAGTATAATACTTTTCAACAGCATTCGCTGACACTTTTTCTCT
CACTTTCTTTCTCTTTACTCGCAGGTGCCGAATAAACGGGAGGGGgtagg
gggcgtttattaatttttcgattttttttccaacTCCCGGACCTTACACA
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TTAACAATATTTTAATTAGCTAATTTCTGTGTTTAGAAAGGCAACATAAG
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ACTAGGGCACGGGAAATTTTAAGGCACTTGAGGCACGTGAGACACTAAAA
AAGCTGTCAATTACCGATACCGAGTACCTATCGACTTAATCCCGAAATAC
CGATAAGAAAGACCTCATATCGCTAAAAAAATTTAGGGCACGTGAAAATT
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AATTTTAGGGCACATGAAAATTTTAGGGCACTAGGGCACGTGAAATTTTA
GGGCACTAGGGCACGTGAAATTTTAAGGCACTAGGGCACTTAAGGCACTA
GGGCACTAGAAGCACGTAAAAAAAGTTAAGGCACTAGGGCACTTGAGGCA
cgtgatttagcagactccaaTTTCTCCCTTAAAGccttttttcttcgatt
ttcagctaaaatattgaaccAAAATGCGTCGttaattttcgccaaattta
gaaattttattaaatcgccaaaataaattcttccaaattgcaccaaaatt
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Aagctcttggtctataggcactgctataggcggccactagtaacccccac
cgggaatagcttattgattggttttaaacataatagacaactttcacaaa
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TCATACGAAGACTTTTTAGGACTTAATTTGGGTGTCTTTTTATTTAGAAT
TATCTCTAATCAATCGTACAGGTCTCTAATTTTACTTTGGTCTATTGGAT
ATTTTGGATGGAAATACTTGTGAGGGGAATAGTTTATTGTGATAAACCCG
GATTTTTCGCTGCGATCACTATGCAATGGTCATATACCGACTAATCTATG
AGCAGTACCTAATTAATTGGTCAACTGATAAttcaaatgatttttaattt
tcgataatattgaaaaatcAATCACAATCAATCAATTTTATTTAGCTTGT
CCTTATGTGATAATGCATTGGAGTCTTCATAGCTCAACACGTAAGGGGGG
GGGCACAAATTGTTCGActtatggaaatttcgagttatggagattggttt
ataaggcatttttaactgaagggaccaaaaaattttgttcgatttaacTC
GACATGGATGcgtacaaaaaaaattattgaaccCCGTTTTGATCAATGAG
TAAATGTAAGTTTTATACCAAAACTGTCTTTTTGCATAGGTTTTGCATAA
TATGACCACAGCAAATTTGCCGTCATGATTTCTGCTTAATAATCCAAGAT
GGTGGAAAGATCTATATGAAAGTCACGAGCCCTGCTATTCATAACTTGTG
TCGGTCATTCAAATCAGTATTTAAAAGTAGTTCTAACAAATTGTTGAGTG
TATTAAAAGTTATTGGTTTACGTTGTCCTTTCAAATCGGTTTGACTTTTT
CATCCACTTGTGATGATTTGAATAGTAGTTTTAAGTCCAGTTTCGGaatt
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TGTTGCTTGGTAAGACTTAACACATAGCCATTGTAATCgtattttgagct
tttaaagtaAGAGCAAATAGttcttttcgaatgttttaatgATCATTTTA
TTTCATCATCCCATTTTTTTCGTTATTCGGTCCTCTTAAACCTCTTTACT
ACACTGTCAAACTGGGTTTTCCGAACTTACTGTATACGCGTAAAAGTTGT
CTGCAGTAGGAGCAGAAATCATcaatctatatttttatttcaaatctaGT
ACTCCTGAAGATACCGGCAAGGAAAATGCTATAAACCAACATAACAGCGA
TGTAACGGACAACCTTCaagaagaaaagaacaaatcaaCAAAAGAGAGAT
CGTCATCAGTGGAGAAAAACACACAGGAAGAAAAATCCAACAATGCCCAC
AACACAACAATGACAACAGACAGTTCATTTGCTTCTTCTTCCAACGACCA
CCAAACGGCATCATCTTCAACATCCTCCCTAAACAATGTCAGGTAATGCC
AATTCCTTTTTACACAGGGAAAGTATTTCTTTGTGTCCGAAACATGCTTT
TTATaacgaaaaatttatttttgaaaaatagcagCGAGTTTGCTATAAAT
GTTTGATTacataaagtaaaaacaaatcttaagatgaataaaaaattatt
ttacacgAGCCCCTTCTTCTCGAAATGGATGAGTTGATGATCATCTTCCT
TCTTCTTGCAACATTGACAATATAAAAGACACGATGTTAATAAGTTCCCA
AACATCAACATCTCCatcagaaagaaaaatagaagcaTACCAAAGTCTAT
AGAGGTCAGGTTTTCCAGACTTCTGTTTGATTCATATGCACGAATGTATC
TTACTCGCGATCTTGGTAAAAGAACGATACTTATAAACAGGATGATCGCT
GAGCGGTTGGCCAGTTGAAACGCATCGAAACCTAACTTGATGGAAAGAAA
TGCTgtgctttttttgaaaactgcAATGTACCCTAAGGTGATATTGATGA
TTAAAGATAAATGTGTCCATGCTGGGAATGTGTTGTATGTTTGCAAGAAC
ACGCCAATCATATCATCTTTGAATTTTCCTCCGAATCCATAATAAAGTGA
TCTTGCCATTATTGTCATAAAAACGAATACCATCAGTAAATGTGTCAATA
CACGTTGTCTTTTCCATATTTTAAGTTCCTCAGTGTTTGAAAACCGTTTG
TCCATTTTTACGGTGAGATTGGAATATTTTATACTTCCTCCTTTCCTTTA
TTGATTGTTGTTCGCCTTATTGTTAACTGCTTATTGGAAACCTTAACTCA
CTACGTCGAAATTAAAAGTTGGAGGATGGTAACCATTGTTGAACaagtca
ttaaaaaataatgCGATTCATTAATTCCGTTTACATCGTTTTCAACATGA
TCATGTCTCTTCTATTTTTTACAAGAAGTAGACCAGCTAAATTTCTTTAA
CACAACTGCACAATATCTCAAGAAGCATTCTCCTCAATAAAAATAACGTA
TATGTCTGATAACATACAAAACGAATTGTACGTTTAACTTCACACGATAa
cca
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00021755-exon-sc0000394-1491911889:204442..204795 | TCONS_00021755-exon-sc0000394-1491911889:204442..204795 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021755-exon-sc0000394-1510915933:204442..204795 | TCONS_00021755-exon-sc0000394-1510915933:204442..204795 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021755-exon-sc0000394-1575043694:204442..204795 | TCONS_00021755-exon-sc0000394-1575043694:204442..204795 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021755-exon-sc0000394-1491911889:208741..210044 | TCONS_00021755-exon-sc0000394-1491911889:208741..210044 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021755-exon-sc0000394-1510915933:208741..210044 | TCONS_00021755-exon-sc0000394-1510915933:208741..210044 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021755-exon-sc0000394-1575043694:208741..210044 | TCONS_00021755-exon-sc0000394-1575043694:208741..210044 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000394 | supercontig | sc0000394:204442..210044 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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