TCONS_00022549 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00022549
Unique Name	TCONS_00022549
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3426

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000427:13077..25845+

transcript sequence

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transcript from alignment at sc0000427:13077..25845+

Legend: exon

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>TCONS_00022549 ID=TCONS_00022549|Name=TCONS_00022549|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12769bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000427:13077..25845+ (Clytia hemisphaerica)
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tgaTTCGactctttctgtaattcgaactaaaggATCAGAATCCTCCTCCG
GGGTTCACTTATACTGGTA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_012645	XLOC_012645	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000427	supercontig	sc0000427:13077..25845 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.90745	0.956204	0.207865	0.549733	0.00290603	4.16107	4.63735	2.76527	0.862956	8.28317e-06	0.22147	1.3421e-06	1.82719	1.16112	1.14147	0.999944	0.000285511	3.88097	7.0542	3.70328	1.31242	1.19731	3.35597	3.5496	8.51625	6.86923	1.27612e-06	0.989913	0.579916	3.29741

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00022549 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00022549 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00022549 (transcript) - C. hemisphaerica