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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00029276 ID=TCONS_00029276|Name=TCONS_00029276|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2205bp TNGTTCAAAGATGGTTACGACGATCTGTCAGACCTCAACTCAATGCAGaT GGACTCAGTTCTCGAATGGGAGATGCAATTCCAAGAGAAATACGTTCACA TCGGGCGCCTTTTGAAACCAGGTGAGAAACATTGCAATTATAAAGCAGAA GAATCGGAGGACGAAAGCAGAGGTGGTACACCAAACAAAAAAGAAGACTG AACGAACATGCGAATATAAGGAATATGCGAAAATCGAAAACGAAAATGAA TCAACTTTACGGAACGTTACAATTTATGATTTCCAATTCCAACATTCAAT ACGGCAAAGATAAGATACTAGTGATAGAAAAACATATCGTTTACATTCTG ATAAAAAGTGATGCTTAACTGCTATGACACGTACTGAGAACGGTAGCGCC GCGGAACAGTGGGAAGATCAACTCGCATCCAAAATGATGGAATCTAATAT GATTCATTCGAAAGACAATGATTTCCAAGGCTCAAAAGCTGAGATCACAC AACAAAACTCTGTAAATGTTTTCGAGCAAACCTGCAAATATTTACGACGC GCAGATCCTGTTACGATTGATTTACGACTTTTTATTTGCAGTATCGAGAG TATAAACACGTTACGGCAAGAGTTAGTTTGTGAATTTTTACTATCTGCTA ACTGGTTAGAGAAATTGGATGTCTGTAAAGTGGACGATAAAGGAAATGTG TCTTGGGAATCGATGTGGGATCCACGAATTTATTTTCCGAACGCCGTCGA GATGAAGAGCTCCATCAACAAACGTATCATATGTACCGATAACGTCAAAG GAACCGTAATGATACAATGGTCGTACCGCGTCAAAGGACGTTTCAAATGT CCGTTCGATATTACGACGTTCCCGTTTGACGATCAAGTCTTACGTATTCA CGTATCGTCGTATTGGAGTAACCGCGTAATACGTTTCCGTCAAGAACTTT CTATAGGAAATAACATATCAAGTGCGCTAGCAAATTTTGCCGACGGTGGT CAATGGGAGTTGCAAACGTACATTCTAAGCGACGTCGTCGAGCCGAGTGA CGGCGGCGCCTTTAGTAAAGAAATCAAAGAGCCGCTCTTCCAATTCCACG TGCATGCCAGGCGTAAATATAATTATTACCTCTGGAACATTGCAGCCATG GTGAATATGATAAGTTTCTTAGCGTTCACTTCCTTCGCTATCGAACGTAA TGATACGGGGAAACGGTTAAGCGTGAGCTTAACATTACTTCTAACCGTTG TTGCGTTTAAGAATTTTGTTTCGTCTATTTTACCAAAAGTATCATATTTG ACTCTAATGGATAAATACGTTTTATTTAATGTGGCGTTTATATTTTTGGT TTCCGTGCAAAACGCTGTTGTTGGAAAAGTCAGTGAGCCGTCTGAGAAAG AGTACTATGATGAAGTGTTTCTTTTTCTCTCCACATGCATTTATATTTTA TTCCAAGGTGGATTTGTTCTTGTGTCTGTAAGAGCAGTCAAAAAATCAAG ATGCCGTTTCCGAGAACGTTTCATTGGTGAATTCTCAATAATAAAGACTC TATGGAGAGCATCTGAGATTCTTAATTTTCCTGTCCGGAATACTAATAAT GGATTGACAAGTACGGACATCGAGTCTCAGATAGACGAAGAAGTTCTCGG ACAATCTGTTTCACATTCCGGACAGCTACCTCggaagaaatttgaaatga CTGCAGATAGCGCTATACGGAAATGTTATTCATTTTTTGATGCGCTACCT TTTCAAAACCATAACAATAATTATTCGGAGCCTTATCTGGCATCACCTAC GCTTTGTCTACGAAAGGATTTTGGTACTGATTCTGAAAGTGACGACTCTG ATGAGACTTTTCAGGTTCGTAGTGTCAGAGGTGCGTTTATCTCGTAAAGT ATTTTATTTtcgcaaattaatattttttttaaataacgtATGTCTGTTCC TAAGAGAACCCTGTTTTATTatacgaaaattttgaagatttcaattTTAC AGGGACTGTGGGGCTATGTTAAAGTGACAAAATAAGTACAGTGTGTCCAG AAAATAGTAGAACAGAATTTATGTCatgtaaaattctttaaacCATTCAT GATCAATACGCAAGGTAATTCAATAAGTTTGTTGAGAAAATAAAGCCGAG TTCAGTCGACTCTCTTGAATGTTCGttaaattacagaaagatttggaTAG CGGAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000735:72343..82351- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00029276 ID=TCONS_00029276|Name=TCONS_00029276|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10009bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000735:72343..82351- (Clytia hemisphaerica) TNGTTCAAAGATGGTTACGACGATCTGTCAGACCTCAACTCAATGCAGGT
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GACGCATTCTTTAAGTAACAAAATTGAATTATTGCTGGTTAACGACCAAC
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AAGTAAATGATGGAAAATAATATCGCATTAAAAAGATCTATTATGAAAAT
ATCAGCGGAAAGAGCAATTTCAAAGTGAATATCTGAAAATCCCTGAAGAA
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TTGATCCCTCTCTCTTTCTATTTTTCTTTTCTTAATTCTTCCTCGATCTT
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TGTTTTCATTTTGCGACTTATCGGGGGCGATGGTTGCGATAAAGTCTTTT
CACTTTTCCCTACGCTTTCTTAGCTAAGTCGCTCACTCTTTTCCCACGCT
ATCTTAAATCTTTATCAAAAATTTACTAGATGAAATTGAGTGGTTAGTTA
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TCTGTAGATAAGCTCCACTTCCTGAGGGGACGAATATTATAAATAGTCAA
AGGTATGAATTTAAGATGAAAGTAGTGTTTTATAGCAATAATATGTTGAG
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TATTCTTATTGTGAAAAAATGATTTTTCTATCGTACGAATATATTAGAAT
TTCTTTTTTTTATATTATTCTTTTTTCACGTTGACCCACGACTTTTCGCC
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TTTCTAGTTTCAGTATAATAATCATAAAACGATTCTAAATGTAACGTTTT
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TTGATTTTGTCAAATCAATTGAAAATTATCTTCTCATGATAAGGCCATCT
TTCAAGCATGGTTTTTAGGGTAAGTCTGTAAATTAAACTTTCAAATTTCA
GGAAGTCGAGGAGATTTCAGCTAAGGTGTGTGTAAAACGACTGACATAAT
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TAAACTAATTTTTCAATGAGGATACTCTTTTCCAACCTTTAAGATCCTCT
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CGTGTCGAAAAATCTATTCCTTTTTAGAATGGAAGACTTTTATATTTGAA
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TTCAAATATTATTTTTTTGAGATTCAAAAAAGGAGGACTCAAACTGTGGA
TGTTCAAGATGATTTATAGTTAAATCAGTAAAGAACTTTTTAGGAGGGTT
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TTTAAGTATGTTAAGTCATTTATGGTGTTCCTGTAGTCCGCTAGTCTTTC
CTCTTTCGAATTATCATTGTTTTAAGTTTTTTGATAATTTTGGTGCCAAA
TTGTCAGCATGATTTAAGGGATTTTTTTTTTTGCTAAATGAAAAGTAAAG
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ATAAAAAAAATAAAAAAGGGAGGAAGGATTGAAATATATTGATGGGCAAA
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CTCGCTTTTTTATGTTTATATTGAAGGTGCTCATCTTTTCTGTTATCTAC
CCCTCTTTTGCAACGTTTAGAATTAATTCGATCATTATATTTTTCCATGA
TTTTCTTAATTTTCCACTTTTTTCACTATATTTTTTCGACTTTTTTTGTT
TAGTCTAATATCATTTTTTCATTCCTTTTCTGTGTCTTAAAAAGGTCCTT
ATTTGGTAAAGTGGTCGTCCGACGCCAGGGTTGTAACCTAATTAGTAACA
CACAGGCTTGTAGGGATTGCATTCTACTAACGAGGCTTTACTGGATACTT
TGAAGCACCATTGATAGATTTTGAATTGCAATCACTCGGCTTTTATATTT
TCAAAGAAAAGAAAAATCGTAAATAAAATATTGTTGTTAAACCTTGACAA
CAAAACACCTGCTTAACAAAAAAAATTTGATTGTCTTTAAAACTATAACG
ATTTTCCTCTATATATGTTTTCATTTTTCTTTCTTTTCTTCTCACATCAC
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CTCTATATTTTTATTTCCTTATAGTTAAGGACTTTTTTTATTCTTCTATT
TTTTTCTCTTGATCTATTATTATGATTTTGTTTGACGGAACTCATAGTCT
TATAGTCATCAACCAGCTTTTTTATATATTTCTATACTTCATTTTTTTTG
GAGATTAAATGCTGTCGAAAGCTGGTTTCGCTTCTATATATCCATTGGCA
ATTCAATGACTTTTCACAAAAATTTGTTCTCTATATTTTTCCTTGATTTC
AGATACGGCAAAGATAAGATACTAGTGATAGAAAAACATATCGTTTACAT
TCTGATAAAAAGTGATGCTTAACTGCTATGACACGTACTGAGAACGGTAG
CGCCGCGGAACAGTGGGAAGATCAACTCGCATCCAAAATGATGGAATCTA
ATATGATTCATTCGAAAGACAATGATTTCCAAGGCTCAAAAGCTGAGATC
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ACGCGCAGATCCTGTTACGATTGATTTACGACTTTTTATTTGCAGTATCG
AGAGTATAAACACGTTACGGCAAGAGTTAGTTTGTGAATTTTTACTATCT
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TGGTTTCCGTGCAAAACGCTGTTGTTGGAAAAGTCAGTGAGCCGTCTGAG
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ATAGCGGAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00029276-exon-sc0000735-1575043694:82304..82351 | TCONS_00029276-exon-sc0000735-1575043694:82304..82351 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00029276-exon-sc0000735-1491911889:72343..74249 | TCONS_00029276-exon-sc0000735-1491911889:72343..74249 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000735 | supercontig | sc0000735:72343..82351 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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