XLOC_005860 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_005860
Unique NameXLOC_005860
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000106:46088..70075-

Legend: gene
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>XLOC_005860 ID=XLOC_005860|Name=XLOC_005860|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=23988bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000106:46088..70075- (Clytia hemisphaerica)
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TTATTTGCTTGATAAAGTATAAAACACGGTACCAAACTAATTCAAGACAC TTTCTCCTACAGCTAGCATTTTATTGTTTTCTTGTTTTTGATTTTTGTTG TTTTTGCCAATGAAATATTTGACCAGATTTATCATAATTGGTCGGTTAAT CCACAGCATTTAAAGATTTTTGTGAAACAAATCTCCTCTTTATATTTTCT TTCGCTTAGTGAAAAATTCTGTAGTTGATAACATCATAATAAATTTTAAA CTTTTTAACAATACCGCAAAAAGTGCCACAAAAATGTTTGTCTTTTCTCA GGACCACCTTCTTTTCCTTATCGTTTTTTGATTGGATTTTCGCACTTTAA CCTACATTCTATATATGTGATGCATCGTAGATAAAGTTTCTTTCGACATT CAGTCTAGCCCAAATTATTTAATTGAAATTAAAATTCCAGTCAATAGTTT CGAATCAATTTGCCAGACGAAACTGGACGAAAGTGTTTTTGTAAATAAAC TACCTTGTGGTGTGACAAGGAGAAGATCTCTATCGCGATTTTCGAGACAT CGTTTCATTTCAAAAGCAAAACTAATATTCTAATGCCTGTTAGTTTTCAT GAGTTGCGTAACTTTAACTTTAACCTACAGCTATAGCGGGCCGTCCCCAT TGCTTTTCATTGCAAATAAATTTTGCTTGGTGATCGAGGCAACGACAGAA GAGTTCTGGATACTGCGCTTGTCAGCTATGTATGGTCTGTACCGACTACT TTTGAGAAAAAATCTTCTTCGCCAATATCTTCTAAGATTTCTCTACCTTT ACATAAAGTTTTTTCACAAACCTTTCATGCAAAATCATGGAGTGTAAAAA AGAGAAACCAATTTTAAGCTCTCTTGTCTTTCAGCCATTGCATTTTGCAC TCAGCATTCATTTTTCGAAGTTTCATCAGTGCTGAGTGTTATATAGAACA TCAAACAGTTACAAATTCGACGAGAAAATCATTTCGATCAGAAGTCAACT ATGTTACACTTTTTCATCATTGAAACCTTGGTCAACTCTTTCACAAAAAG GACCATTGTCTATTTTCAAACTCCCACGTTAAATCTGTTGTTTTGTGGTG AGTCAGAGGATGAAAAGAAAGCAAATTGGTCACTTTTCCTGATTTCGACA TACTTTATTAAGAGTGATTAAGTTTTAGGTTAGTTATGGTCAATTAGATC TTATTGAGGTTTGATGTTGATTTGATTGATTTAGATATCCATCTATCTTT CACCGCGACCTTTGACTCTCTACATTTGGATTTACTTCAAGGATGTTCGC CGTAGTTACGCTCGTCTCTAAAGAATCCGTAAAACTTGCCAATCGCTCAT CTGAGGGTTGTTTTTATGATTTAGCAAAATTGTTTTCAATTTTCTTTTGA AATAATCACTTTTTTTGCTCTGAGTATTTGGTTCTTCTCAGAGTGTTGCA GCAAAGGGAAATATGCATTGCTATTTTTTCATGTCTTCACGTCACACAAA CCTTGGCTTCGGTTTCGTTGATGGATTTTTAGTCGTCAAAAAGTTGTTTT TGACCATCTATGGTTGGAGTAACCAAATCATGTGTTACACTGCCTCCTCT ATGTTTTTGATACACTGTTCAAGTAACCACACTTCAAAAATGTTGCTTAT CTTGTATCTGTATATTTCGTCATCATTTGTCTTTAAGTAGTTGGTTTATG AGTCAGTCCAATTTCTTAATTTTTAAATCTGCCTTGGAACCTTATCGAAT TGACTCACAATACCTTACTTTGTCACTTTATATAGTATCTTTTTGTTTAT TATTAGATGGTTTTGTGCAAAAAAGTACTGATGGTTTTTATAATGTCTCA TGAATAGATTTAATATGACCTCCAATTTGTCACATCTGACAACATTCTTT AAATATGTGAACGACACAAACTTGATGACAGTATTTTTGCTCTCGCTGCC ACAAATAACTTGACAGCAAATCTATTTCTTCTTGGTAAAACCGAGTGATA TTTTTTGATCCACTGATCTTGTCAAGTTTGAATTTCTCAGCTTGACAACT AGTAATTTTGAGCTTATAACATATTTTTATGTAAATAAGTATCTACATCA GTTGGCAGTTGTATTTCAGCTTAGATATGTGGATTGATGTGTTTGAATAA TGTAAATGCAAACATTTGATTTGCTTGGTTGTATTCGAATTTTCTTGGTG AAAAACCTGGATTCCCAGTGAAAAAATACAGTGAACAATTGTTGGTGCGT TTATAATACAGGTTTATATAAAAAAATTTGCCATCCTACGTACTGAGTCA TTTTGGTTTTCCGGATTGAAATAAGTATCTACATCAGTTGGCAGTTGTTT TTCATACAATATTCATGCAGAATAAAAATTCTCTCTTTAAAAGCTGTTTC TTATCAATATGTTATTCATTGAGCTGGCTCGCTCGTCCTCAGTCCCCTCA CTCTCTTGTCTTGCAGGTTTTGATATCTTTTTCTCCTCTTTTTAAAACCA ATGTAAGTAATTAAGGAAGATCATCTCTGATAGACACATTTTTTGATACT AAACACAGTGTAGCTGTTCTATTACTCTCATTTTAAACACTGCTCGACTA TTGATATGACATTCAAGAAAATATGTTGTCTATTTGTGGAATATGCTAAA ACTTAAAAACAACTTTCTATTTTAATGTGGTTGGTTTTAGTTATAAGGAT AATATTGCTTACCAAGAAGTCATTAGACGAAGGTCCAAAAATTAAAATAA AAGTATAAAGTTTTGTATTAGCAACGAGAACGCCAAAGATAGACGTCCTA AACTGGCTCTTTTTAATCAAATGTTAGACCGGGATATGCATGGCCCTTCA ATGTCTTGTTCCTTAGGATATAACGGTTGTAATGATATTGTGTAATTGGT TCAAAGGAGTCTTTTTTTGTTCAAATTTCAATCAAAGGAGGTTACACACT TTGTCGAAAATTCTCATCCTTTAATAATTCGAGCATATTTTTGTAAGGAT TCCGTCTCTCAAGTTGTGGTTAGCGACCAAGATGACGTCACATAATCTAC CTTAAGAATTTGTAATCTCAGATGTGTGCGTCTGATTCGTGTCTTTTGTT TCTGAATCAGTTTATTGGATTTGTCTTCTATGAAATACNTCTCAGATGTG TGCGTCTTTTGTTTCTGAATCAGTTTATTGGATTTGTCTTCTATGAAATA CTCGTGAAGATGCAGTGTCGAGTTCTACATAGCTCTGAAGATATACACAA AAATCTGTTGCAGGCGTTCAGTAACTATGCCAATCATTAATAAGGCTAGG TTTTCAACCTCAAATAGTTGGTAGTAGGTGAATTGCTTTCATATTCAGTG ACCTTTATGGAGTTTTTGAAAAAGTTTTGAATTGCAAGCATTTATTAGAG GTGAGGTTTTGTACTGGAAGCTCTTGTCAACAGTAGACAGAATGAGATCA CATCGTGTAGCATGAATATTGTAAGAGTACTGTTGGTGTTCTTTGAACAG CATCCGATATTTGTTTGTCTATTTTTTGTACGGTTATCAATTAATTAGTT TTATTTCCATCGCTTAGTTACACAGATGGATTTAAACTATCGCCTTCGAA TAATTTCCTGCCTTTTCAATTCTGTAAAAAAAAATCTGTTTCTTGCAGAC TTTTCTCGTGTTTTATGCGTTAGAATGCTTTGGGAGGGAGATCTGTAACA ATTTCTTTGCGAGNTTTGCAGACTTTTCTCGTGTTTTATACGTTAGAATG CTTTGGGAGGGAGATCTGTAACAATTTCTTTGCGAGTGACATTCTCTTTT TGTGTGTCATCCTGACTTGTTTAGCACGGCATGTCAACGCACTGTTATTG TATTCAACTTTTATTAGCGATGTGAATTGTGGTTTAGAGCACAACAAGCA ACACTCATCATTTCTCATTATTCTTTTAACGTATCAGTTACGGAAAGGTT TTTTTATTTTCTCTCATAGATTGTTTCCTATAAAACGTCAGACGGAACAG ATAGAGAAATCAATGATACAGTGACATTATATGGTATGCGTTGTTCGCTA CACACCTTCACAAGATGGAAATGCAAGGATTGATTTTTCTCTTGATTTAC TCGACACGTCTTGTTGGTGGTTATGATATTTTCAGTCAGTTATATTACCC ATCTAAAGAAAACACTTTCTTGGAGGAGGAAATCACCAACGACATCCCTC GTCTTGTCAGTCGATACAGCCGGTATGAAATGAGGACCAGATTTACGGGA AATTATAATGGTTCTATGTACACATCACATGAAACGCTCGGTGGCTATGA ACAGGAGACGGACAACGAGTTATCGTACGAGACAACTGTCGTCAGGTCGG GAAAACGAATCGTAACATTTGTCGGCGTCGAGAAAAAGAAAGTTCAAAAG TCTTCAATGTTTAATCAATACCATAACTTTTATAAAACGAAACAAATTAA AATCCCACAGAAGAGAAAACAGAAAACGAAGAAGCGTCGAGTGCGGAGAA ACGTTTACGGGCGTGATGATCGAACATTCATTCCAGTCAATAACAATTTC GGACTGAAGGAGCCCTATATATTCACCGTCCGTATCTCCACTGGATGTAC CGGTATTTTGATCTCGCCACGTCACGTCTTAACGGCCGCGCATTGCGTAC ACGATCAAAAGGATTACGTGAAACAAACCAAAGACTTGAAAATTGGTTTA CTAAAAGATAAGAGCACTTATGAATGGCTGGGCGTTAAAAACATTAAACT ATCCAAAGGGTGGATTGAGGGCGGTCAACGTAACGGGCCATTTTACGATT ACGCTTTACTGAAACTTTCACGTAAACACAGACGTCCGTACATACGTATC AGTATAAGTGAAGAGAAGCATCATGGATCGGGTGAACGGATTTCGTTCTC GGGTTTTGATGACGACAAACCAACGGGCACCATGTGGTACCGGTGAGTGA CTTTATTTATTTTTCATTCTCTTCTTATGGAATATCCTTTTTTTTTATCA GATACTTTTGATAAAGCCTCACACTGTGTTTTTCGATTTGTATATTGCTC TTATTTTCCTAAGGTAAAGGCCGGTCCCCACTTGCGCGCGCTGCGATCGC CTTTTTTCAAGCATAGCAATTGGTCAAAAGAAAATTGAAACAATTCCATA GGCACAATCTGACGTAACGGTTGAAAACAGTTGAAATGTATTCTTTTTTT TTCGAGCGCGCGCTACAATTTTTTTGACGTAATCTTTTTTCCAAGCAAAG AGGATTGAAACCAAAAGGTGCGATCGCAGTGCGCGTAAGTGGAGACCGGC CTTAAAGTTGGATTGCCAATTATTTTGACAAAACAGCTAGACGATGATAT AACGATAATAATGAAGTCATTTTTTCTTTATTTCTTCAGATCTTGCACCG TGGTTGAAGACGATCGGACATTTCTGTACCACTATTGTGATGCTCAACCG GGGTCATCAGGATCAGGTGTTTACTCATGGGTTTTCGACGAGGAAACAGG ACGATGGGAACGAGAATTGGTCGGTGTCTTCTCGGGAAACCGATGGCGAA CTTACGACGAATTTTATATTCGAGTGAAAAACTTCAATGTCGCTGTCCGT CTGACCAGGTATAAATATGCACAAATCTGTAAATGGCTTGGCTCAAAAAT GGCTGCCAAAATATGTAAAGATAAAATTGATAGAAATTAAATGAGAGCTT AATAGTATTAACGTTCCTCGTTATTTATAATAGTTAGGTTTAGATTACCG TGTTGTTATTAAAGATTATTACCCATAATAATTAATATATGTAAGTAGAG CTTTTTTGGTATATCTTGATGCTGATTGCAATCAGACCAATCTCGCATCG CAATTATTATCTCATCTCACAGATTCTCGTCAAAATCTTTTTTCATCTCT ATAAAGTTCTTTATCGGTTTGAGGCTCTTGAACAGTCG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00010426TCONS_00010426Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010425TCONS_00010425Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010424TCONS_00010424Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010423TCONS_00010423Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010422TCONS_00010422Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010421TCONS_00010421Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010420TCONS_00010420Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00010425-proteinTCONS_00010425-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000106supercontigsc0000106:46088..70075 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.49 6.78 3.37 3.67 9.27 8.63 9.46 10.72 9.84 8.91 6.68 7.74 28.06 26.43 13.43 12.98 25.36 31.35 30.25 29.51 34.74 32.42 35.84 45.15 105.65 66.62 13.37 22.02 10.91 10.89