XLOC_007292 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_007292
Unique NameXLOC_007292
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000161:300762..316151-

Legend: gene
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>XLOC_007292 ID=XLOC_007292|Name=XLOC_007292|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=15390bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000161:300762..316151- (Clytia hemisphaerica)
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TTGGGTCTATTAACATTGCTTTCAAGTTAGAAGAATTAGCTTGATCTTTA TTTATAAGCATATTGCTAATTAATTATTCACAAGCTTTCTTGGTGATTGG CTCATTCTTATTTTCTAATTTTTTGCTCGATACCTAGCACTTGTTAAAAT TTCAAGTCTATAGCATTTTCCAATCACTAGATACCTGGGGCTGATATATA AGCAAAAAGGGCAAATTTTGATCGGTCTGTAAAATATACGATACCAGCAG ATAGCAATAATATACATGTCACGTGGAGTTGCCTTACAAAATTTGAGCAA AAAAAAGTTTTAGGGGATGGTCCTACTTTGGCATTTTCAAAGAATGATGA CGTATCAATTATGCCGAAATTTTCATTAAAGATGCCAANTACAAAATTTG AGCAAAAGAAATAGAAGTGAAAAAAAGTTTTAGGGGATGGTCCTACTTTG GCATTTTCAAAGAATGATGACGTATCAATAATGCCGAAATCTTCATTAAA GATGCCAATTTATATTTGGTGCACATTCATAAAATTTAAGTCAATAGGAT AAATACATCAAAAGTTTTCTTTATGGGGGCCTCCTTGCACCCCACCCACC CTCCAAGATGTGTTCAATGTTCTTTAGATTGACCAGGCTGGTCCATAAAA GTTACCCTTATTAGTTTTAAGAATTCCTTGACACAATTTCAATCAGATCC CATTGCATTTTTACCATGCACCTTCTTCATTGAGAATGATGGCATCCCTG CTGCAATCTTCCCTACCATGGAAAAAGACAAATTTGTTGAGAAAACTGAA GAGCTAATGGCGGTATGTAGCATTTTTTGGGTATAATATAACTAGCCTTC AATAGCTTTCATTTCAAGTTATTGGAAACTCAGAAGTGTTCCAACTGTTT CAAGTAATATTCCGCTACTCGGGTCCCCTCTAAAACCACGAGTTCCTCCT 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TAATAATTTATCAAATGGAAAAATTGGTTGAAAACCCAGCGACATCCGAA TTGGCCAGTGTTGGTAAAAGGGAGTTGTTGGTTCCATTGGATGCTGAAAG ATTGTTAAAGACAATTAATGGTAGTTTGATTTTTAGATACATAGAACACT CTTCCATTATTTTGAAATTTGAAGGAATTGGGCCGTTAAAAATCATGAAA TAATCTCTTTGGAGACTTTTTGAAACTTACTACCTACTGTTAATGAATAA AATGATATAATGCTACCCAACAAGACATTTTTAACTGAAGATTAAAATGG CGACAGAAATTGAGGAACCAATTGAAGCAACCAAGGTCAAAATAAGAATA TATTAAACTCCTGAAAATTGGACAAAATCGCACGGTTGTCTATACGGTAT TAAGAATTATTCGTTGTGTAATGGTTTATGAAACTTCGAGGTTCGATTTT CTGCGAATGCAAAACACTCTTTAAACCTATTAAAAACCATTATGAACATT TTGTATCTTTATCAATAAAATATGCAGTAGATGTTGGTTTCCAAATTTAT CATTATTTATATTTTGAATTTTACGGTATAATTATATTAGCATATAATAT AAATTTTTACGTTATATTTTGGAAGTTTTTCTCGCCTTTCGTAAAACAAA ATGATTATCCAATTATCGCAACAAATATGCGGGGAGCTTCTAAATGATCA TAATATGTATAGTGTAGAGAAGACTATTATTATGGATCTAACTTTTTTTT CCAAATTTCATAATGTGGCTACGTTGCGAGAGATTTATTTTGTATTTTCA GGTAGTTTTCATTTGCAGAACTTAGGTTATGTTTTTAAATAAACAACGTC AATTTTCAAGTCTAAGCCTAAACTTGAAAATTAACGCTAAAGGTTTTAGT TTTACATAACTTTCCCATTAATCTTCCACAAATTTTCTCCCCTTCGCTAT 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013013TCONS_00013013Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013012TCONS_00013012Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013011TCONS_00013011Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013012-proteinTCONS_00013012-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000161supercontigsc0000161:300762..316151 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
UBXN4UBX domain-containing protein 4 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
32.16 30.16 6.7 4.24 13.14 10.25 23.51 25.05 18.23 18.76 16.41 14.75 14.55 15.91 14.31 16.11 21.8 21.55 10.89 12.64 15.84 17.06 24.46 24.42 30.02 29.87 10.31 8.13 18.71 18.6