XLOC_007492 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_007492
Unique NameXLOC_007492
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000167:82405..93059-

Legend: gene
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>XLOC_007492 ID=XLOC_007492|Name=XLOC_007492|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10655bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000167:82405..93059- (Clytia hemisphaerica)
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GTTGGATACTTTGAGATACGACCAAAGCATGGTTCATAGGCCAGTCTATT GCCCAACACACTCACCAGAGGTTTTTACCTATTTTTGTGAAGTTTGTAAA GAACTGGTTTGTAAGGATTGTACCATTTTAGAACATCGTGGACATAAATA TGAAAGTAAGTAGCCGGTTTGGTTTGCTTTAATAATATATTTCATTACAC TTTAAGAGGGAAATTCTGGAAAATGGGCCAATTCGACAATATTTCTCTTT CCTTTAAGATTAGGCCTTGGCAAAAAAATCTATTTATGTTCCTTTTTTAC ATGCCTATCTTAGACTGGTAGATCTGCAAGACGTATGCGTAAATAATTTC AGAATGTTATAAACCATTTCTTGAATTCAGGATTGAGTGAGGCATTGGAG AATCAAAAACCATCAGTCATGAAACTATTGGCAACCAACGAGAAAGAAAA AATCCCGCCCATAGCGCGCGCACTTGATGATGTCCAAGATATGGCCGCCA GATTACACGCGCGGACGATTGCAACAAAACAAGCGGTCCGCTCGTGTACT GAACGTTGTATAAGAGAGATCGAAGAACGTTGTAAGATTTTGCTTTCAAA TATTGATAATTTGTATCGAGAGAAGAGCGACGTGTTACATAAACAACAGG AGGTATTACAAGGTAAGATAAAGTTGACAATTTAGCCTTTTAAATAGAAT TACATGGCAACTAAACTTGTGCCTAGTTCTCGATTTTTTCAAAACAGATT TTTTCAGAGAGGTTGATTTTTAGTGTTAAAGAATAATTGGAGGTCTCAAA GAAGATAATCATGTTCGTAATCATTTCAAGGCGAGACCCGAGGTGGTTCG TTACTTTAAAAGCCTATTTGTATCTGTCACGGGAAGTTTTAATCTTTTTC CGTTCTTTTAATAACTTTGAAAAAGTAATTTCTTTGTTTGGAGACAAGTC TGAGGATGTACATGATAAATTATTTCTCTTAATTTTTTTTTGCAGAAAAA CTGATGAAAAACAAGGCAGCGAATCAATTTGTGAACTATGCATTCCAACA CGGAAGCGAGGCGGAAATATTTGAATTGCTAGACCTGATGAAAACTAGAC TGACCGATCTCAATGATGAGGACTTAGGCTATGATGAGCCTGAAGAAAAT GACGTCATTGATCACCAGTTTGATTCCAAAGCTGTCGAACACATAGCTGA AAACCTCGGTAAAATTGCCACATCTAGTGTTTTCTTATCATACACAAAAC TCTATGGACCAGGTGTGCGAACAGCCAAAGCAGAGATCGAAACATTTTTT ATGATAGAAGTTTTTGATCGAAAGAAGGAGCGCTGTTGTGATCATTTCTC ACCGGGCGCCATTAAAGTTAAAATTCACGCACCAGAAGGGTTCTTAATCA ACAACAAGATCACTGATAATCGTGATGGTACTTTTACTGTTCGGTATACT CCTGTCACGAAAGGTCGATATGATGTTACCGTCAAAATCAGGGGCAAATC ATTTCCAAAGAATCAGTTCTCTGTCAGAGTATTCGAAGGCATTGATTATC TCAAGGTAAGCTTTTGTATATAATTCTAATATTAGAGAATCACGTTATAT CTAGCGAACGCTACCGCGGAACAATCTTAAGGAACTGCTCACTAATGAAA AGCTTTTTTTTGCTATTTAGGTTGTAGATTAAAATATACAAACATAGATG AAAGTTATAATTAAAGATCTAGTCAAAAACCTTGAAGTTTTGGGAAATGC TGCGAGCTTGAAAAACCACTATATACTTATTAATTAAGATTTGAAGTGGG GTTTCAAGCTTACAGCATTACCGAAAAATTGAATACACTCTTCTCGAGAT GCATAAATTTATTGATGTCCTCGTTTTCAAACAGATTTCATTGCTATAAA ATTACATATTCACAATGATAATTGTGTTGTTTACACCTCATGAGACATTT TGAATTTCAAGTACTTTTGTTTTATAGTTAATGTTTGCCTTTTGGGAATT TAAATTGGTTTAAATGTATAATCTCATAGCAATGAAATCTGTTTGAAAAC GAGGACAGCAATAAATTTATGCATCTCGAGAAGAGTGTATTGGCTTAAGT GGCTTAATTATTCAGAGCTATTGAAGAATATCTCACACTCGGAGTTTCAT GACTCTGTGCCAATCTCCGGTGAAAATGAGCTCAAATCAACATATAACTA TGAGAAAATTAATCAATTGAACTAAATTAGAGTTTCCTACTTTCAGATCG GCAGCAATTTTTTATGTTTCGGTGAGCGTGGCGTCAAAAACGGTGAATTT AAACAACCCTATGGAATTGCAACAAATTCACAAGGTCAAATCTACGTGAC CGACAAAACTAACAATCGAGTACAAATCTTCGATAAATTCGGCACCTTTC TATCAGAGTTCGGATCACGTGGTACAAAACAAGGTCAATTTTCAGGACCG GAAGGAATAGCAGTTGATCAAGCAGGCATGATCTTCGTAGCTGATACAGA AAATCATCGAATACAAGCTTTCAATGCAAATGGAACATATCATTCAAAGT TTGGTACAAAAGGTATAAGATATATTAGTATCATGTTTCATTGATATTTA GTTTTTAGTTCCCTTCATAAATGAGGCTGTCTTTCTTCCTACAATATTTG ATTTTTAAACCTGATTTCCGAGCAGATTATGATTACTTCGCACTGGCACG TTTGCACGATAAAGGACATGGCTCTCGAAAAAGAATCTGCCCAGGTTGGA GCACAGCTTTGATATTTTTCATCAAGATTTGGATTGAATATCAAATGTGC TTTTGAGGGCGGTGATTTTCTAAAGGAAAATACATGCACCAAAATCAAAC ATCAATCATTAGAACCTAGTCGCTTTCGTATTCGTTTCAAAGCAAAATAC AGCGCAGTTTTGATTATTTTGGCTGAACAACCAGATCAGAACGTCAAATT TGCCATATCCCTTTATAACACAGCGCGGTATGCAGAGAATAAATGATCTG TTAATAAATCTTTAAACACGCAATTTCACAAGTTACTCTCGTAATGTTTC AACAAAGGAAAAAATATACCTTTTTAAAATTTCATTCCATTAGGTAGTGA AGAAGGAGAGCTTCTCAGTCCATGCGGTATTGCTATTGATAAGATCGGTA ACATATGTGTGGCTGATCGAGGCAACCATCGAGTCCAAGTATTCACACCA GAGGGTAAAAGTTTATTATCATTTGGTTCCTATGGTGACCAATACGGACA ATTAAATTCACCGAGTTTTCTCGCCATTAACAATGATAATTGGTTCATTG TTGCCGACAATGGGAACAATAGAATCGTTTGTTATGATAGCAATGGGTTG TATGCTCAAGAGACTGGTGCCAAGGGTTCGGACCCAGGCGAGTTTTCTAA ACCAAATGGTATTGTGGTCGATCAAGAAGGTTTTATCATAGTCTCTGATA CAGGAAATAACAGGGTGCAGGTGTTAACGCCAGATTTGAAATATTTCAGT CAATTTGGTTGCCATGGTAATAATGATGTTGAATTTAAACAGTTAACTGA TGTAGCTTTAACTCAAGATGGTAGAGTTGCAGTGAGCGATACAAACAATT ACAGGGTACAAGTGTTCTAGTATTATTCATTAATTTTAAAAAAAATTAAT ATTGGTATATTTTATGCGTATGGCTTTTGTATACTATTGAATATAAAAAC AATTAAAAATAACTGAAATAAAGGATTCTTTGTAAATATCTAATAAAGTT ATTAGTATCTTAAAAAATTTCGTATTTGCAATCTATAAACATTTTTTATA AGCAACCGAATTGCTAAGGCTCCAGCTCTGAAAGTAGCCACAAAATTAAG CAACTTGGTTTATTAATCTTAGTCCTGAAACGAATATGAACAAAGAAGTC ATCAAAAATGAAAATTGACATCGAAATACCTAACAGAGGTGTTATAATAT TACTTTATTTGAGGAGTTTCAGGCATAATATGAGGTGAAAAGTGAAATTT TTCGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013412TCONS_00013412Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013411TCONS_00013411Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013410TCONS_00013410Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013412-proteinTCONS_00013412-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000167supercontigsc0000167:82405..93059 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.09 0.03 0.09 0.05 4.26 3.63 17.01 17.48 4.41 3.19 11.29 10.27 12.8 9.92 12.62 26.94 12.42 13.26 2.85 2.48 6.13 6.71 5.64 5.86 9.23 11.07 1.97 1.22 0.04 0.06