XLOC_007658 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_007658
Unique NameXLOC_007658
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000171:247416..255381-

Legend: gene
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>XLOC_007658 ID=XLOC_007658|Name=XLOC_007658|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7966bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000171:247416..255381- (Clytia hemisphaerica)
CGACAGCAACTTTTATGATTTGAACTTTGCCGCTTAACTAGACAACAACG TATTTGAGGCTCTCTTCCAGCTAGTTTTTGTATATTGTTCATTCTTTGGA AAAATGTAACTTTACTGTACAGACTTTAAATGGCTAATTCTCCTGTATAT AGGGTGGTGGTTTTTTAAACTGTATATTTTTGCAAGATAGAAGTTTGTGT GTTTGTTATGAAATCTTGGTCTGATGATGGTTTATTTTCATCCTTTTTAG ATATATTTTTATAACATCATATGAATTTAAATGAACTTATAATAACACAT AAACATCAAACATCATGCCACAATTACCAACTTCTACAGCAGAGGAATAT GGAGCCGAGGATGAAATTAAACAATACACACAGGAGGAAGGGGAAGAATC TGACAGTTCCACAGTCGATGTAGTCAATGATATTAAAGACGATTTGCTAA ATGAAGATGGGCGAGAATCGGTATATTAGTTTTTTGTCTCATTTTCTTGA TACGGTTGGCGTTGACTGGTTTTGAATTAAAATTTGTATCATAGATGATG CAAGTTATATATAGACCTTTTGCTAGGTCCGATCAATGCAATGTTGGTAT GTTGGATTATAAACTCCAGCATAAATCACGATAATTTCAGGTTTGAATGG ATAAAAGGAAAACGTTGGTTATTTTTGTTGTTTCCCTCACATTTAATCTA TTGATTGAAACATAGAAGTATCACGATTTAATGCTGAAGTTTTTAACTAT CCAACATGACATCGCGCCTAGGAAAAGGTCTATGCTACCGCCAAAACAAG ACCTGGAATTCCAGGGAATCCTTTATTCCCTCAATTTTGAGGGGTACACT TATTCTATTCATCAAACTAAACACTTACCGTAAGTTGGTCTAATGTCGAC ATCCGTCTTCTAATTTTGACATCCTTCTTTATAGATAGGAATAATTAGAA 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GGTCAGTCTCAATCATTTATTAATGATATTATGTATCTTTCTATATGTGT CCTAAATTCGGCTTTTTTCTTCTCTATGTTGAATATGTATTTAAATTTTG CAGACTCATTCACATATTTTAGTTCAATGCTTGTGGTTTTCTCACTAAAG ATTTCCTTATTTTCTTTCAATCAGTGATTGCATTATTTTCCTTCTTTGAA TGCTGTTTAGTTTCTATTTATATTTCCCTGCCAGTTTTTGAAGATGAATA AATTGTGCAATGTACTCATTTGGGCTGCATAAAATTTTTCTTTTTTCCTC TCTCCCTTGGTAAACATTTGCCAAATTGTTTTTAAGAAATATTTCAATGC TTACTATATCCCAATTTTTAGGACAAATGGGAATGTTTTCCATTTCATGA TTAAATATTTTCTAGGATAAATAGAATAAAAACACAAACATGGTCTATGT TTTTTCTTTTGATGCAAATATTTTTAGAGTCTATACAGCCTCTGTTTATT GCCTGGTTTTTCTTTAAAATTTAAAAACAAAAAACCCACTTTAGGTATAA ATTTTTCACATCTTTCATAATTGGTTATTTGAAAATATTTGAATTCCTTT TAATTTTGAGGCCAGCCCACTTTTGACTTACCTTGGGCGCAATTCTTCAA ACAAAAGGAATGAAAGTTTAAAAAAATTACAAATGACTCACATCTTTTAG TTGTGTAAAGGCAATATTAATTGCTATGAAATACAAAAAAGTGAATTTAA CCAGAAAATTTGCAGAAAAAGCAACATTTTCAAAATTTTCTGAGGCAATT TTGAGTGCAGACAAGAAAGCCTGCTGAAATTGTAATTTTTCAAGCTTAAG CTGATATAAACAAGATGTCATAGCTCACCCCTTTTGTCCCACTCATTTTG ACATTTTAATTAAGTGATTCTTGATAGACTGTGTTATCAAAACAATCAGT 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CCTGGAGTTGCATACTACGCACCAGGGTAAAAATAAATTTAGTCTTTTGT CATCAGTGATTTTTATAATAATCGGGTATAAATAAAAAGTTTGAACTGGT TTGAACCTTCATGCTTTCATATGATGCATTTGATTTAGAGTATGTGATTC TTAACTACCAAATTACTTGTTCAATGCCTTATATTCTTTTCTGAATCTAT TTTTTCATAATATGTAGACATGTTTCCCTTTATTTCTTTTTAGACATGGA TACCCAGGGATGACAGGAAGACCAGTAAAAGAACCGAAACGACCACACGT CAAAAAACCACTAAACGCTTTCATGTTATTCATGAAAGAGCAACGACCAA AAATTGCAGCTGAATATACATTGAAAGAAAGTGCAGCTATCAATCAAATA TTAGGGAAAAGGGTAAGTGATAGATTTTGAAATGAAGATAACAAATTTTA GGCTAGACATCGGACATTGCCCGACCCAAATAGCTTCTTGTCCGACCTGA AAATCATAATTTTTAAGCTAAAGCAACCCTGATCGAACATATTTTCCGAC CCACTTGAAATTGTTATTTCGAGCCTTAGACACATGCTGAATTTTGACAT ACTTGAGTACATAGGCATTAGTGTCAATCCGTATGATCTTAAATACATGT AACATTCTTTTTCAGTGGCATGCATTGGATAAGTCAGAACAAGCAAAATA TTATGAATTAGCAAGAAAAGAACGAGCAATACATATGCAATTATATCCTG GTTGGAGTGCCCGTGATAACTACGCTCAACTTGGAAGGAAAAAGAAACGA CCAAGAGATAAAAACGAAGGTATATTTTCATTTTTTTTGGAATCTATCAT TTTTTAAATCTTCTTGTCATAAGTATGACATGGTTATCTAAATTTCCAAC TATTCTAATGCAAAATGTTTGATTAGCTTTCTTCACAGTTTTCAAAGAAG TCAGAAGGATTTATTTTGTTTGGAGCTGCTACGTGATTGATTATCTTTTA TAATACTTTTCTTCTCTTAGAAATGAACCCAAAGAAATGTCGTGCACGTT ATGGTTTAGATCGTCAAGAACAATGGTGTAAACCGTGCAGGTCAGCTCAT AAACTTTTCATTGATTTCTATGTTTCTTTAAGCTTTTGATAACTCCCTAG ATTTTACAGTGTTCAAAAATTTTCCGTCTTAGCGAGGTGCCAAAAGAGGT TTTTCGTCTCCAAATTCAACAAAATTCTGCAAAACAATGAATTTGGCCAG ATTTGTTGTTTAAAGTCCATTTCCGTCTGTGATGAAAACTTCGCTTTGAC CACCAATTTTACCTCCAAAACCACTGTCATGACTTTTAGTTACAGCAGAG TTTCATTGTTACACTTTTCCTGAAAAATGGAGTAAAGCCTTGATCTTTTG TAAAGATATCAGAAAAATGGCACCAATATCATGCTTCGTGATTCCCCGGC AATTTGTCGTTATGAATACCCTGTATCAAATCCCTGGAGCTCGATTCTCA TCTGATTTCATTTCTGTCTATTTCTTACAGGAGGAAGAAGAAGTGTATTC GATTCATTGTTGGTGCTGATGGTGAAACTACTGAAGTACCTGATAAAGAA CAACAAACCGAAATAAATTCCGATTCAGATAATGAAAATACCAATGCAGA AAATCGTGCTTCTGCTCCTACTAACAATAATACTACAGACTCTTTGAAAG AAAATTTATCGGAGCGTGTANTTTAAATCTTCTTGTCATAAGTATGACAT GGTTATCTAAATTTCCAACTATTCTAATGCAAAATGTTTGATTAGCTTTC TTCACAGTTTTCAAAGAAGTCAGAAGGATTTATTTTGTTTGGAGCTGCTA CGTGATTGATTATCTTTTATAATACTTTTCTTCTCTTAGAAATGAACCCA AAGAAATGTCGTGCACGTTATGGTTTAGATCGTCAAGAACAATGGTGTAA ACCGTGCAGGTCAGCTCATAAACTTTTCATTAATTTCTATGTTTCTTTAA GCTTTTGCTAACTCCCTAGATTTTACAGTGTTCAAAGTTTTTCCGTCTTA GCAAGGTGCAAAGGATTTTCCGTCTCCAAATTCAACAAAATTCTGCAAAA CAATGAAGAATATGACCAGATTTGTTGTTTAAAGTCCATTTCCGTCTGTG CTGAAAACTTCGCTTTGACCACCAATTTTACCTCCAAAGCCACTGTAATG ACTTTTAGTTACAGAAGAGTTTCATTGTTACACTTTTCCTGAAAAATGGA GTAAGCCTTGATGTTTTATAAAGATATCAGAAAAATTGCACCAATATCAT GCTTCGTGATTCCCCGGCAATTTGTCGTTATGAATACCCTGTATCAAATC CTAGAGCTCGATTCTCATCTGATTTCTGTCTGTCTCTTTCTTACAGGAGG AAGAAGAAGTGTATTCGATTCATTGTTGGTGCTGATGGTGAAACTACTGA GGTGCCTGATAAAGAACAACAAACCGAAATAAATTCCGATTCAGATAATG AAAATACCAATGCAGAAAATCGTTCTTCTGCTCCTACTAACAATAATACT ACAGACTCTTTAAAAGAAAATTTATCGGAGCGTGTAACTATGGCAACTAC AAAAGAAAACAATCAGAATCATCCACATCATCATCAACAACAAAACTCTT TGAATAATAACAATAATAATATTAATATTCTATCCGCTACTACTATGGTT AATGCTGCCGCCCCAGCTGTACCACAATCTTCAAATCCACACGCCCAATC TACACCTTCGACTTACCATCAAATGAAAACTGAAACACCCTTATATGCAT CTATAGGTCATAGCTCAACGTACACCTCGAGTGGGAATAACACTATTGGA TACTCAGCACCTCAACCTGGATCGCGGTCAGAGACGTCTACTATTGATTC GTCTGTTCTGAAAACAATATCCGCTCCTTGCTCTTAGCTGGTAAACAATA AATTGGTAGAAAACTTTCAATACGTACGATCTGCAGTATCACGAACTTTT TAACTCTAAATTATCTTTTTCTATTGAGGGACCAACTTTTTAGGAGACAG TTTTTCAATGAAGAACCCTTATCAGCTTTGTGTTTTCTTGACTTGAAATT TTACGATGAATGGGAAAGAGACAACCTAATTTGTGAATAATGACCTGATT TGTGTTCGTACGTTTTCTTGAAGCAAGGGTCTCAAAGCGTGAATGGGTTT TGTATTTCTACAAGTG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013718TCONS_00013718Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013717TCONS_00013717Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013716TCONS_00013716Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013715TCONS_00013715Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013714TCONS_00013714Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
HMG box containing transcription factor TCFTCONS_00013716-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000171supercontigsc0000171:247416..255381 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
13.42 11.78 4.35 2.91 39.98 32.51 69.03 75.54 26.6 61.75 24.26 24.25 39.63 33.05 24.95 33.17 31.72 38.79 37.07 47.47 20.77 24.88 30.15 30.5 19.72 20.45 40.58 44.35 37.71 40.56