XLOC_007849 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_007849
Unique NameXLOC_007849
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000180:820..5111+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_007849 ID=XLOC_007849|Name=XLOC_007849|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=4292bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000180:820..5111+ (Clytia hemisphaerica)
TGATGACGAACAACAGACTGTTGATGTCACTGGTGGTCTAGAACCTGAAC
ATGATGATGGCAATGCTCTTCTTCAGCAAGATACAGAGTGAGTGATTCTT
ATAAATCCCTGCAGTAGCAatttttactgcaattgcggtataaaaaccag
gcgtagttaatcgatataatcgatgatcttgagtaatcgataaataattg
ataagtaatcgatggattagatattgattaaccgatagaattgataggta
atcgattttttcaaagctcaatcatttatcgatcaattttgtcatcgatt
gtttatcgattttATAGATCAattatacttcgattaaattaagtatcgat
taaaaatcgatcggctatcgatcacagcttttgatcAATTACATatcaat
caaaaattgattaatcatcaatcaaatagttaatcgatcaactatcgatt
cgtgatcgattatttatcagattttagggtCGATTGCGTtctcgatttgg
ttcgactggttccatcgtcgattccgttcgattgagattgtctgccctgg
tgaaattcccttagaaagtatgcgaaacatatgcaaaaaggaaGTATTAa
tgtaaaacttacatgcataattggcattatattaaagtaatCTTGttgaa
gaaagataaaaaatttccttctcttgaaatctaaaaatttaaaacggtaa
ttcggccaccatttcaccgaacctccaaagtcatttgatttgagttaagg
aacggcatatttaaaaatacaccatttcactttcaattttacagtaagtg
aaaatacagggctcgaaataacgatatttaggtggtcggacacactgtcc
gatcaaaaattgatttgggtcggacacgtcctaaggcttttaaagtaaaa
tgggtcagacatgtccgattgatttttatgtggagtatacttcaagtcta
atacaagcttctgatagaattttacattgatcacgaagaagctaaacaaa
tgtcaattaaggtatgtgttcacctttcttgacacattctctttaattga
tcatatctttagaacaacaaatttttatatatcaaaagtatatattttct
gaaagccaataatattctctttctaatggtaaaagttacAGCTGaattaa
aaaactgggcaggatataattaaaatcttaagaattttaaccttaccttc
ttcaaagaagttaaagtcacccatagcttttgaattttgaaaaaataatc
tcgatactatgttcccaatagattgaactaaaaaagtgtcttgggatttt
ctttgggattgactttaactctttaaatcctaaattctgtaaaaatatcg
ataaaaagtaaatttaaatgtgattttttcagttatctgtatagtaaatt
gaggaaaaacaactcggttagaaataaaatcctaagacactttttaagtt
tgatcttttgtgAATCTCattaaaaagaatgaagtcgatatctaaatgct
atgggtgactttaacttcgttaaaagtagtatggtgtggtaaaatttcgt
ttttttctacatcaatttgaaatttNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCATTGAGCACAGTCATCTGT
GAGTATAACCTTTTTAAACTGAAATTCTATTACTACACATTTTAATGGAA
CTGCTGTAAACAACGTCACTTCTCAGAGCTTAATGAATTACAAAATTTTT
CTAgctattttcattgaaaagtatgAATTCTGGCCCAAATACTTTTAAAA
GGCTTTTTCGTGAAGGTGAATGCCTCTTTATTAAATTAAGAATTCTTAAC
AAATTGCAAGAGTTTATGCTTGTATTCtcacattcaatttttttttaaat
ttgaaaatctttgaagctgtgaaatcaaaattttaaatgtcCCTAGTAGT
AAAATCAATCATTGCCTTAATTTTAAGACtgacatttttaaacattttta
gaaCTGCTGATAGTGAAAGAACATTGACTGAGAGTGTAAGAACATTGACA
GCATTAAACTTGTCAACATATGANTAGAACTGCTAATAGTGAAAGAACAT
TGACTGAGAGTGAAAGAACATTGACAGCATTAAACTTGTCAACACATGAT
GAAGGAAAAATGAGTGTGTTTTTACAGAAATGGCAATGAATGTGTCAAGG
AAATTTATTCAGACAAATAGAGGGAATCAGAATCAAGTGATGAAGAAAAA
TCTGCACTAAATGTAGCATCCTTGATGCTGGACAAATAAGTG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014030TCONS_00014030Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00014031TCONS_00014031Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00014032TCONS_00014032Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000180supercontigsc0000180:820..5111 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
5.81	13.99	2.97	2.99	6.47	3.07	0	2.79	20.67	16.85	17.8	16.44	13.9	21.3	25.51	27.65	20.34	27.02	10.81	18.67	24.95	14.14	13.66	10.75	2.06	5.52	13.34	14.47	13.23	10.46