XLOC_008278 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_008278
Unique NameXLOC_008278
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000198:56431..66156-

Legend: gene
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>XLOC_008278 ID=XLOC_008278|Name=XLOC_008278|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9726bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000198:56431..66156- (Clytia hemisphaerica)
CTTTTTTTCGCATGGTATTTATCGCTTGATTACTCCACAACGTGAATCAA ATAGGCTGGAAGTTGATTTGAATTTTTTTAGAAATCCCTCAAAGAGGGGG ATGAAAGCCTTGCGACGTCACCAAGTCAAAATACTGTATAGATTGCCCAC TCTTTTTTGTTCACGTGGTCAAAAAAATAGAAATTATTTCAAATTCTACG TTCTCGTTTCCAGACCTATTCTTTATTGATATTTCCAGATGAAAACCATT TCATAAATGTGTTGGATTTTTTAGATGTTGATCGAGTACACAGGGGAAGG AGCGCAGTGTCAAGCGGCTAAGTTGTTAGAAGTCATTGTTTTGCAATACC GTGGTCATTTGGATAGCGTAAGTATCTCGTATTGTATATTGTTGATTTTT CATAACTTAGTGTCAAGCCTGTGGCACCGTTAAACGGAGTCTTTAATGGG TTTTTCTTAGTTTAAACTTACGATTGTCAACTGAAACTCACTGTAATCCT TAAATGAAGCTTACATAAAGCTTTCCGAATGTTAAAAATAAAGTATACGT CATACCACCTGATATCCAGCCAATCCCTCTCAACCATTACACGTCATAAC TTACGTGCGTAACAAAACACATCTCAACTCAAGAAAGAATTGGTACCCTC GACTTTAGGCTCTCCTAGTCCCAGATTTATCGGTACTACAATACATGAAA ATCGGGCGATCTCATATCATATGATACCACTGGTATATATGATAGTTTAA CGTGCNTTACCACTTATTGTAAGCGAGTTTATGTATTTTTGAGGACGGCG GAGGAGTGACTGAATTGACTGACCAACAGTTCTGACCCGCAAAATTGAGG ACGGTAAAAGTGTTTTACCGTCGTCCTCAGTCAGTCAGTATGTAGACGTA GATGTAGATGTAGAGGGTCTCTTTTTTTCGCATGGTATTTATCGCTTGAT 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TTAAGTTTGGCTTACAATCTTTAAGTTTTGTTGGCTCCCTCATTTGGGAT CGCCTCTCTAAGGATGTGAAAAGCTCTGCAACGTTTAATACATTTAGGGG CAAACTAAAAATGTTGCCAAACGATTTTTGCACCTGCCCAATATGTAAAT TGTGGTAGATATTTAAGACTATTTTTATAAAAGTTGGATTTTACTAGTAA CGGTTTAAGGCTGTAACTATTTAGGACGTTAGGTCCTTTACTTTGTGTAC CAACTGAAAATAAATTAATAATAATAATAATTAAATGTAACAAAAATAGC ACAAAATCATTACCTTGTATTTCTCTCATTTTTAGAATTGAACGATTCGG ACNTAGCACAAAATCATTACCTTGTATTTCTTTCATTTTTAGAATTGAAC GATTCGGACGATGAATATGATGAAGAAGGAACACAATACGTCGAAATGCT CAACCAGAAACGAGTGAGATCTTTGTTTTTAAAGAGGTTATTGAACGATT ATCCCTCTTTAGGCGTGCTTTTAAGTTTAGTTTAAGGCTTGAATCCAATT TCTGTTTTTAAGTTTGTTTGCGACTCCTCATTGCTACTTCTCATTACGAC AGTCTACCTTTCCGCCAGTAATCATTTGTGCTTTTTGTTCTGTATATTGT ATTTCGAATACGTCGGTAAAATTCGTTCACGTTATTCGCCTTGGTTGAAT TTTTGCAACCTTCTTTTATGAACCTTTGTTTTCATTGTCTCGATAGCGGA AAAAAAGGTTAAAGAGCCGCTAAATCATTATCGGAATTAAGATTTAAATT CATTTAATATTCGTTTTTGTTTTTTTATAGGATAAAGGCTTCGACTTTTT CGACGATGACGAATTTGCGAACGAACTTGAAATGTTTACGACACCACTCG ACGATAACCCTTATGTTGACGAATTCATTACTTTCAAAAACACTTTTCAA GGTATCGTTCACTACGCAAGAAATCAAACCTTTATTTCACTGCTTACGTA AACTTACGCCTCGGACAGAAAAAAAGGGGCTTTCTTAAAATTCTGCAAAT TTGACAAATCTCGCGAATTTTTTAGGTCAATATGACAAGAAAAGCGTTGC TTTGGCACTAACTAATATGGTATTAAGCAGGCGCAGTAGTGTAGTGGTTA TCAATTTTGACTGCCATCCAGAAGGTCGGGTTTCGATTCCCACTCGCTGC TGTGATTCACTTGACAAGTGAATGTACCTTCGCCCGGGCCGACCCATGCC ATTTGAGGGGAATTGGGAAGACAGAAACTCAGGAAGCCTGTCAGTGACTG TACTGGGTATCGATTCCATAATAATGGATGATTCAAGCTGTATTAACGCA CTTGATCCAAAAAACTGTGTGTCAGTGTCTCGCAAGCTGGCAGGCAGTAT AAACTACAGTGTAAGACGGTTCTAACGAGACGACTCCTAGACCGCTCAAT ACTGAACCGGGAATCCTCTGTAAGGAGAATACCATAAGCTCTTTTGCTTG AAAATTTTCCAGATTTTTAAGAGTATGCAATTTCATTGATATGCACCCTC TATTATTTTCTAGGCATCCAAGCAGGCGACGGTAAGCTGTTCACTGTCAT GACGCAATCGTTGAACGAGGAACAAAAGAATAATGTACAGTTTGTCATCA ATACCGGTATCAACAAACAAAATAAGCTCGGTAAGTTCAATTTACATTGT GTAAGCCTTTGTGTACTACTTTTAATTAACACAAAATTTCTTATACTCGT GTTAATTAATTACATGTTTACTTATTTTCGTGTAATAAGGTATTTTAAAA CAAATCTCAATGTAAATTCCGCCATTGTTAAAGAGGGTTATTATAGCAGC TTATTGTCCCTTATGCGGACACAACATTTATGTTTAAACCTATCAAAAAG TACTTCATCAGAATGAGAAAATTTACGTGTTTTATATTTTTCTCTGCAGA GTCGATGAAACTTGAAGAACAAGGAGGATTCCAATTCCAAGTTGCAAACG GCGGGGGTGGGGGTGCTGCACCAGAACAAAACTTCAACTTTGGAGGCTCA TTGCCATCAGCTTGATGAAGTGCTCTCAATACAAAAATATATTTTCCCAA AATGTGTGTATAGAGTCATCGCTGCTCGATGCACATTATTTGGAAGTTGA GAGAGCAAGCGTGCGCGTGCAGTGTGACTCCAAAGAGCGGACGAGTGGTG GTCGGATATCAGGTGTTTTTTGCATCCAAATTATTGCTTTCTTATCCAGT AGAAACTTTATTTGGAAGATACAGCCTGGAAGTTATGAACGTGAAGCTTA AAATGTACGATTGGGTGAAAATTTTATCAGATGCTTTAAAAAGAAATTTT TTTTTGGAATTATTAAATGGATGAAAATTTAAGTACATTATTACCACGTT TACTTTGAGGGAAACCTCTTTTCTGTTCTTTATAAAAATTGAAATTTATC AGAATATTAGAATTTACTGTCATTTAAATTTATAATTTTTTTACGACCTT CATAGATTTATCGTGTTCTTTTTGTTGTTCTTTCTGTTGTAGATCTGCTA GTTTTGACCATATTTATAATTATTTTTATACCTGGAGCTTTTTTATCTTT CAAAAATTGAATGCTTAACTTAGACTTAACTTAGACTCGTAAAACATTAA AGTTGCACTAGACCTTTTTTCTAAAAAAATACTAAAAATGAAATGACATT TCTAAATATGATATCGATAATATGATATAACAATGTAATAATAAAATGGA ACAATAAATTCTGTATAAGAAATTGAATTTGTCTAATATTTTTTATACCA GACTCGCCCACTCGATACAATCGATAACCTTTTCCAATCGATGACCAATC GATAATCAGGATTTCAAGGGAGGCTCGATTGCCTATCGATTGATCGATTA TTCATTGATTGGGTCTAAGATGATCATGATCGATTGATCACGATCGTTGT CAATTGATGAAAAAAAAGCAACAAATGATTAATCAATACTCAAGATTTTA GAATAGGCTCGATTACCTATTGATCATCTGAATTAATCGATATCCAATCA ATTGATCGGTTATCAATTGGTCATCG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014800TCONS_00014800Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00014799TCONS_00014799Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00014798TCONS_00014798Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00014797TCONS_00014797Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014798-proteinTCONS_00014798-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000198supercontigsc0000198:56431..66156 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
73.67 78.34 12.24 6.61 57.33 46.21 57.8 68.35 65.79 69 103.84 94.21 190.89 187.06 120.84 121.49 99.22 108.27 101.88 112.39 166 152.71 118.27 129.38 133.26 136.39 83.4 93.48 90.84 90.14