XLOC_009178 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_009178
Unique NameXLOC_009178
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000237:390918..398038-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_009178 ID=XLOC_009178|Name=XLOC_009178|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7121bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000237:390918..398038- (Clytia hemisphaerica)
CCATTTTCAATTTTGTATTTACTATCTTCTTGCCCTTGTGCTACTCAAGT GACTGCTGAATGAAAGATATGCGTGAAGCTCCATCTCCTAGTCAATTTAT CAACCAATCAATATCGTTTTGGAAGGAATTAGCCAATCAAATTACATCTT AAAACGCGCCACTGAAATAATTTGATCTCCTTCTCGGAGATTTTGAAAAA TTATTGATAATTCCGGTTTTTCCCGATCGGGCTACGTTTTCTATCAAATT ACTGATAAATAAAAAAAAAGGCATAGTTAAATGCTGAAATAGAGTTAAAG CTTGAAATAAGTATATATAATTTGTAGAAGCATGGTAAAATTTTACTGAT AAGTTAATCTAACACAAAAACAGAAAATTATCAAGAAAATCAAAGGAAGC CCGATAGCAATCCGATATTTTAAATCAAAACACAGGCTTTTGGCTCGTAG ACGTGTTCCACAGCACAAGAAAAAAAAAATTAAAATGGCGACCGAAGAAC GAAATATCGAAAACATTGACCTTGCTGAAGAATCAAAGGATATCAATGGT GTCCCTACAGATCCATTGACAGAAGAAAGGAGAGAAGAAATTATTGTTGA AGTAACTAAGGTGAAAATTTCGAATATATTTATCAATCAATAATTCCTGT TTGCAGGAATTTGCAACTTTTTTGAAAGTTGAAAGTGAACTTTAAAAATT TAATGCCGGGAAACAAAAGTAAGTTAAATTGGTGCAATAAAGTAGTGTCG ATAAAACCATTTAACCCAGGACATTTTATAATACTTTTCGCCACTGGCCA ATAATACCAGACAGTTGGATGCGTCGCCAGGCTAGAAATGGTGCACAGTA CACCGAATATATTCGNTCGGAGATTTTCAAAAATTATTGATAATTCCGGT TTTTCCCGATCGGGCTACGTTTTCTATCAAATTACTGATAAATAAAAAAA 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AGTTGGTCACTTTGAACTACCAGTCACATAGCCGACTAGATTTACGGGAC AAGATGGAGTTTTTACAAGCTCTTATTTTGATTTGGTTGGTCGTTAACCA GGTCGTTTACTTTTTCTGAAGTATGTTATAAGAACTCCATCTCATCGGAG ATTTACACTAAAATGTGAAAGTTCTGATAGAATAATCTAAAAGAATATTA GCCTTTTTTTTCTATGTGTGTGATTACAGGCTAAACTAACAGGAACTGGC CAAACTCAATCGCAAGAGGAGACGAACAAGGAGCCAATTGTTGATACTCC AACAAACACAAGGTAATGTACCTTAAGGGAACTATAGAAATTAGAAATCA TAGATTGGGTGTTAACCTTTACATTGTTGCAAAATCTTTATAAGTTTTAA AACAACTTTCTTTCACTTTTTAATAAGGGTGTCTTTGTAGACTTTGGTAG ATATCAATACTATACTTAAGTTTTCAAAAAGGTTTTCAACATTATTTAAT TCCTCAATCTTTTTTTTCAGCATATAAAGTTCTTTCGGTCGATCTCTGGT ATAATGTGATCATTGAGCAATGAAAGGTATCAACAAAAAACGTAAAATGA TATTTTAAATTTCACATAAATGTTTTCATCGTATTTGTTCAAATAAAATA TATATTTTTTACGAGTTCATTTTGACGGCTCATGGCATGGCTGCTAGTTC TTTTTGTAGATTCAATCTATTATCTAGCATCTCTGAGTGACTTGCAAGGC TTCTTTCAAGGTCTTAAAAGTTTTAAAAATTTTTGTAAAGATACCTTAAA GCGGCCTTTATTTTAGTTTCCAATCATAAAGCACATTTTGATGCTTTCTG TCAATTTATTCAATATTTTTCAGGGGAAGTGTTTTGCGTTATCAACACTT GTCTTTTTTTCGGATTTTTATAATAATGATACGTTTAGATAAATTTTAAG ATAAAATGATATTTTTGTAATATTTCTTCAATCAATAATCATTTTCAGAA TTCCTGATATTTTATTTTCATTTTTCCTTTGTTTGTTGGGTATTTAATTT GTATTTTTTGTTTATTTGATTTCTCAGTTCCTAGTTCCCAAACTCTTTGT TTTCTTTCATTAGTGTTTACCGTTTTCAGTATGAGTCAAAGGTTTTTTAA CAATAGAATTTTGCTGACTTTCGAAAGACCTTTTCCTTGCGACTGGGTTA AATTTATTGATGGAAATTTCTCTCTTTCCAGATAAATTTTTGGAAAGTTT TCGTAAAAATATTTTCTTAATTCTTTTTCCTGAACATTCGAATGTTTATC GTTTAGTTTTTTAATCAATTATTTCTTACGATAGTATGTAATATTTTTGG TATGGAGTATTTCTTATTTTTAGTGTTTCAACGGTAATTTATTGGATAAG AAAAAAAATGTTAAACGACAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016440TCONS_00016440Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016439TCONS_00016439Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016438TCONS_00016438Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016437TCONS_00016437Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016436TCONS_00016436Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016438-proteinTCONS_00016438-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000237supercontigsc0000237:390918..398038 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
274.15 303.14 388.77 409.51 296.24 231.84 476.82 458.2 468.86 432.6 260.2 313.31 160.54 140.69 227.68 233.58 239.84 209.54 138.07 266.13 150.24 140.06 192.02 193.77 228.62 221.11 287.79 195.75 258.18 199.19