XLOC_010975 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_010975
Unique NameXLOC_010975
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000329:151192..159759-

Legend: gene
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>XLOC_010975 ID=XLOC_010975|Name=XLOC_010975|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8568bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000329:151192..159759- (Clytia hemisphaerica)
ACAGCTAGTACTTTTTCAATACTGTAATAAAGTGCTTTTCAAATTAGCTG ACATTTTCAATTGTGTATTACTTTTGATAGATTTGGAATTGGATAGCAAT ACGCAATTGAAAATTTACTGACGGCTAATTTGAAAAGTACTTTAATTATG AATTGTATTTAATTATTTTTCATAAAAAGAAAACAGACACCTTGCGTTGT TTAAAATCTACATCTCATAAGGAATATAACGAGCATCAAAATGGAAACAA TCATTTTCTTTGTCTTGATGGTTATTTGCAATAATGTTGCTGCTCAAGGT ACAATTTACTTTATGTAATCCATTCGAGATTCGACGTCTTTTAAATGTTA TTCAATGCTGGACAAAAATTTTGTAGACTTCTGCAATATTTGCAAAATAC TTCAATATCGATCAAAAACAAGTTCTGGGTGCTTTCCAAACCTTTCCAAA GTCTTTAAAAGTCACCCACTGCAGTCTAACCGCAAGGGCAAACCACAAGG GCTTGATTAACTGGCTTACACCAGTATCAAAACGCTGATTTTTTGCTTGT GGTTCCCTCAAAAGCAATTCAAAAGCAATGCAACGACTTCAAAAGTGTTT CTCTTAATTTCCATTCCCTTTCAGACACATATTGAAGAGTCATTTTGCTC TATTTCTCATCATTTTTCACTTAAATTTCAATTGTCTACAACCTTTTGTC AAGCATTGTTCCACGAGTAAGTAAGACGTCTTATGTTTACTTGGATAGAT ACGTAAGACGGGCGTTAGATCATCGTGGTTGCTTTACTTTAGATTTTGTA AACTAATGTATGCTGAAAACATTGAGATTTAATGGCAGGAATTACACCTT AAAATACCAGCCCAATCACAATACAATGGAAATGCATTTCTATTTGTACT ACTAATTGCTACATACTTACGTGCTATTATCTTTAGATTATCTGAATAAA 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TTCCAAAATGATAAAATTTCGCAGCTTTCCCTTTAGATTCAAATGCTAAG GTTGATGACAAATAAAAAATAAAGCCAAATTTTGTATTTTATTTTTGGTA ATTTATTTAGTTACCATAATGGCATGATGAAATAATGCCAATTTTACATT ATTATTATTATTTTTATTATTTTTTATTCTTCTTTGTCATGATTTATTTT TAATATGAAGAATATTTATTTGTTTAGCTCCATCTTGTCCTTCTCAACGT TGATGAATCTGCAACAACTGATCGTATGTTGATTTGGGCTCAATTGTTTG AGGTATGATATTTCATCTAGCATTATTATTAATCTAGAACAAGATAGAGG AGAATTAATGAAATTGCCATAAAGGACGCCCTGATAAAATAGTTTACCAT TGATCGTCTGAATCTTAATTTTTGGTCTCCATGTAAACAAAAGCAGAAAT CAACCAATTCATATCTCCCTAGGTTAAGGACACCAGAAATGCCAAACTAG ATTCCATCGTCAATAATTTGCTGAAAGCCAAGAAAGTCGGTCAAACAGAT AACATACCTGCCTTCCTCCTGGAAGATTTATTGATAGATCAAGCAGCTGA AAAATATTACATGTACTATGGATCTTTTACGACTCCGCCTTGCTCTGAGA TTGTCAAGTATCTTGTTAGCAGCAAGATAAGTCACGTCAATGAAGTTCAG GTAAGAGTCCTTTTAAAAAGCATATAACGTTATTTCGATGTCTATCAGAT GCCAAAAATATTTTGAAAATACGTCAAACCACGCGATGTTGTTTCGACGT CAATCAGACGTTCACAACGTCGGAAAGACAACAAAACAACGTCTAACAGA CGTCAAAACAATAACATTTTACATCAAAAGGGATGAAATATGGATTTTTC CTTTCTAAAAAGCAAATTTTCCCCTAGCGTATTGATATTTAAGGAAGGCT ATTCTATAGCGAAAGTAAAAATTTGACCTGCTGTCGTGACCAACTGTAGC AGAAAGGAATACAGTTTTTCTTCCCCGTGAAATACTTGTTCTCGCACGAC TGCACTTTTTTGCCTGCGCATAATACGCATCTTTGAAAACTATAGAAAAA AATAGATTCAAGGCAACCATTACTGATGTGGGAGTTTAAAAGTGTAACTA AGCTACTACTATTCATAGAAAGAGTTGCTCAATACCCCATGGTTTTATTC TTATTATTCAATTTAATCCTGTCAACCCTATCCCCCATATTTTTTTCCAA AAAGTTTGCCCCCTTTTTCATAGGTGCTTTAAGACTACGTCGAAGAAATA CGATGGAGTGACTTTTAATTGACTTACAGTATCTTTTTACGAGGATTGCA CTCCATTATATTTCTCGACGTGGTTGCTCTATTGTTTTAGATCCACCAGT GTTTGTCGTAGGACCCTCTATTATTTGGGACCTCAGAATACTTATTTACT TTGTCATCAACAGCTCGAGGAATTCAGAAAATTGTTGGCAAGTGCTGACG AAAAAACTTCAATGTCCGACAACTACCGACCGCCACAGCCTATCAACGGT CGTACCGTTCAAAGTAACTTCGACTTGAACGAATCATCATCTGGAAGCGT TTCCTCGATCGCAAGTTTCTTCAATATGGTAATGGCACTGGCTGTGGGAT TTTCATTTATGATGAAAATGTAATATTGTTCTTCTTTTATATAAACCCAG ATTGACGCTTTTTAGCGAGGTCTGAATTGCTGTTTAAAAAATACTGATAA AGTAAAAATTTTGCACTTTTCTAAACCAATCATTAAAACAAAAGAGCGCA CGCAACGTCATTTAATTGTCCAATTAAACAATAGAATGTCCTCTTTCTAA AATTACATTTTAACGACCCGAAAGTTTGCAATGTTTTGACTTTTAAGAGA TGAATAAGAATTGGAATG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00019531TCONS_00019531Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019530TCONS_00019530Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00019531-proteinTCONS_00019531-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000329supercontigsc0000329:151192..159759 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CA13carbonic anhydrase 13 Homo Sapiens
CA8PREDICTED: carbonic anhydrase-related protein isoform X1 Homo Sapiens
CA2carbonic anhydrase 2 isoform 1 Homo Sapiens
CA1carbonic anhydrase 1 isoform a Homo Sapiens
CA6PREDICTED: carbonic anhydrase 6 isoform X2 Homo Sapiens
CA7carbonic anhydrase 7 isoform 1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.05 0.1 0.17 0.06 0 0.16 0.19 0.3 0.47 0.42 0 0.82 1.41 0.8 190.05 95.63 28.05 43.98 1405.68 939.37 3.38 3.54 23.29 33.35 0.43 0.15 22.24 1.33 0.45 0.11