XLOC_011828 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_011828
Unique Name	XLOC_011828
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000378:208606..217857+

gene from alignment at sc0000378:208606..217857+

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_011828 ID=XLOC_011828|Name=XLOC_011828|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9252bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000378:208606..217857+ (Clytia hemisphaerica)
TAAAAGGCCAACGAAAACTTTGTAAAACGCACTGAAGGAGTTCAAAGAAC
ACCGAAATGGCGTTAAAAAGATTTCAAGCGGTTTTTATGCTGATAATTCT
ACAATTAATCAATTGAGCAGAAGCAGCGCGTAATACCACAACAATCGATG
ACTTGGTTGAGCAGTCCATCTCAAATCTCCAACAAATCAAACTCAAGTAC
AAATCATTGGCACTCATAAGTAAACTTTACGGGCACTGTGGTCCCTGCAA
GCCGACCCCTAAAAGTGAATATTGTGACTGCACCAATGCCAACCCTATGG
AAGATTGTCTCAAATTTCTACAAGCTGGCTATAAAGTGAATGGTATCTAC
CGCCTGAAAGCTGCCGGATTTAACAGACCGCATGTCTTCTGTGATCAAAC
AACTCTTGGTGGTGGTTGGACAACTTTTTTGAGACGAAAGGATGGATCTG
TCAACTTCAAACAAAATTGGAAAATGTACAGGAATGGCTTCGGTGAATTG
ACCAGTGAGTTTTGGCTTGGAAATGAAATCGTCCATGGTCTGACCGAATC
ATCAGTTGCACCAAAAAAGTCCGAATTGCTTATCAATATGCAAATCAAAG
GAGCAAAGAGTCCCACTTATGCAAAATATGACAACTTTGAAATTGGAGAT
GAGGCAAGCAAATATATTTTGAAGTTCAGCGGTGTATCAGGCAATGCATC
TCATCTGACAGGAGACAACTCCCTAAATCACAGTAACAACAGGAGATTCT
CCACTATTGATGCTGACAACGACGACAATTCTAGCAGTTGTAGCAAAAGT
TATGGAAGTGTTGGATGGTGGTTCGGGAATTGTGTCTATACAGTGTTGAC
CGCCGACTACAAAAACATTTATTGGCACGGCTCTTCTGCGCTCGCAAACT
TCGCCGAAATGAAACTTCGCAGAAAGCTGTAATACTAAAAggtataaaaa
attatgttgacCGTCCGGTTACTCTGccttacttcccaattctatgaTTC
ACGCCCTACTTTAGTTAGAGAAATAATTAACTCGAAAATCAGCCCTATTC
CTAAAATTGAGTCTCCCGCTGATCCGAGCGACTACCGTCCAATCTCCATA
TTACCGATCCTTTCAAAAGTATACGAGAGACTGATTATGACACAAATGAC
AAACTATCTAGAAAGTGAAGAACTACTATCAAAACATCAATCTGGTTTTC
GAAAGGGTCACTGCACAATAACCACctgcatcaaaatcaaaaacgaCATC
CTGAAAGCGATGAATCGAGGCGAAATCACTCTTGCAGTTCTCGCTGACTT
TTCAAAAGCATTTGATACAGTTGATTTTGAACTCTTAtcaaactagccgt
attgtataagggttgcgaagcgatccagactccacctgaattcgcaagtt
gctagcaaaataagagacactctaaaaatcactctaataaagccgctata
gagacagggtcgtaaaagagccttaatgccaaacacaccacataacccac
ggcggcacaacacccacCGCCGCCCGCAAGTCACTcattttttccttcta
gttattctagtgtaaatagTGCCTTATTAAAATCGAGCGATATTCGTCGA
ATGATCGAgcatttttattcaaatcacgaatcgtctgtcgaatgaaatca
tcaaaacataaaaataaaacaaaaacaaaaatgtacaaaaatggtttgtt
ggttcttgggtAGTTTTGAtcgagggatgatgaagatcctttctgtcacc
gttcaaactaatttttttttccatttaacagcaaaataaacatttaaaac
cgaagaaccactgcttagattgcttagatgcgtgccgcccgcgcggcgaT
CTGaccaacttcagattctaagtacGTGTTTTCGGCATccggtaattttt
tttgctgttcactgctagggtacaccattttaaaacggcatttttcgcag
tcctagctaccaaaccgagaaagttttcNaagccaaaccattcaaggtca
ttttgataaaatcatcggtttgaagatgtgatttatatagcaaattttat
agaaaattttcgcttgggatagaagttaaaggtacgtgcacaatatagca
aaactgcttcgctcataaattcgcttcgcaaaaactTCACACACTACGAT
TCTTAAAAAAGTCACTCTATGTTATCTCCAACTATCTGAGCAATCGACTT
CAGTACGTACAGATCAACGACAAGAAGTCATCCATTCTCACAGTTACCAA
TGGCGTCCCCCAAGGAAGCATACTTGGACCCATTCTCTTCAACATTTACG
TGTACGACATGGCAACAAAAACCACCGCAAAATGTGTTCAATATGCTGAT
GACACGACTATATATCGAAACCAAACGAGCTTGAAAATTGTGTCGCTGAA
ATTAACTCTGATATTAGCGTAATTGAGAAATGGTCGCTGGATTCGAACTT
GATATTTAACGCCAGAAAAACTAAATCGATGCTCTTTGCCACATCTCAAA
TGGCAAGGAGGCAtaattttgaattcgaaatcAAGTCAAATAACGAAAAT
GTGATTGAGCGTGTTCCCTTATTCAAGCTGCTAGGAATCATCTTCACCAA
AAACCTAACATGAAATGAACATGTCAAAAAAATCGTCACTAAAGCATATG
GCACGCTGAAGAGTCTATCCCTCATCAAACGATATTTACCATACCGTGTA
CGACGCCAATTGGCAGAATCTCTTGTATTGAGTAAAATAGACTATGGTAA
TACCGTAATTCACAACGCACCACAATATCTATTCAACCAATTAAAACGAG
TCCAAAATGCCACAGCTAGCTTCGTCTGGAAGAGCTACTCTCGCAAGTCT
GACGTAATAGATATGAAATGGCTACCTGTCAAAGAACGGACCGAAAACAA
TTTGGCTGAACTTGCGTGGAAATCAGTGAATATGATTGACTGGCCCAAAT
TCCTTCCTATGGAGAAATATGTGCAAGCCAAGACTCGAACGGATGTAATT
GGTGGAACTAAATTGCGTGAAACCTGTAATGTTAGTGGTTCCTTTGAATC
TGAAGCttctaaaatttttaatgaaCTACCTGTTAACTGTAGTGACTCAG
AAACTTACAAAGCATTTTgtcaagaaacaaaaaaatattttttcgacaAA
GCCCTAGCTAGGAGCTTGCAGTAGTACCTCTTCAACCAATTGTAGTCCCT
GCGTCTCTACTCGCTATTTCCTAGCTGGTGCTTTCTATGTTATATTATTT
CTTAGACATAGTTTTAGTCTAATTCTCGATTTGATTCACgcgccatttta
gttttaattaattttgaCTTCAATTCTTCCAATATCGCTACTCGTAGCCT
TGGTTCCCTAGTCTCCATTCTGATCTTTAGATTTAGCTCATCTGTTCTTA
GGTTTACttagtttgtattttcttcagtgcaTATGACTTTATCATATTTC
TAGTTctatgaagtttttttttctatttgatgtttaattattttgtgttg
gacggtgaaaaagaatgcggctattatattttgatttttcccgacatgtt
tcggactcggtctgttctcaagggaatgataTTTCTATAGAAANNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNTTGGTTTGGTGGAAATGTTTACACGCTGGGATTGTCTCTTGTCGTG
GTCTGTATGCATTACTTCTATGGTTATTGAGTCTTTGATTGAATTGGGTC
TCGCTTTGTTTCTCGCAATgtttaattattttaaattaatttaatgcttt
acagtatgtggcccccaaaacggcgatcaaatttgaaatttctctcaaat
ctagaggaaaagagattttacaaaaatttttgctgaatgaaaacctttaa
catctctactttatttcctggaagttctttttcaaaattttcaatttcaa
caataattttcaatcgcttaaagataggtagcttttttctaatggccccc
aaaacggaggtttgaaattttagcgatttctcgagatatctttaacatat
gaaaacaaaattttgaccatagttttgaaatatgatttagagggtttggg
cataaatttatttgataaaatttttacagtatacccctggttgtcaaaat
gcaggtttgggccccccaaaacggaggtgtagttataatcaaattattaa
gcccagtggtaatagggggaaaaactatgaacatatttgtgttttccctt
aaatttacgacccgatggatgtaaaatttatgattNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNctagagtgagttatat
gcaatttttatctaattttggtgttaaaatatttcctttagacgcaaata
tgttattttgaatccgtctcaaaccagcaaaaacaggctcatttttaagt
ataatcatcattctttcaaaataaacaaaaatcgtttaattctgataaat
ctacaagtcagaatcttcatttcaatgaaaaccgccgttttgggggccgt
ctccgttttgggggccatatactgtacctCTAGCCACCAATAGTACTTGA
ACCTTAGTCTAGTCTAGCTTATAACATtatgttagtatttttttttaaat
atactcgttaattttttataacaGCACACATTGCGATGGCCTCAGCTAGC
ATACTCAGATACTTGGATTTGTTTAGGTTTTAGTCTAGCTCTATCACTAT
TCACATTTTACCCCTCATACTTCTTAATCCTAATCATTTTATTCATCATA
CTAGCCCACCGCTTCATCCCTATCTGCTTGTCCGCATACGGCCCCAATTT
TTCTTCAGTATACTACCaggttatttttcaatttttttttctagacattg
cgcacatatattatatacagaattttcaggtgaagagccaaatgtaaatt
ttggaaatgccagaaatatattTTCCCTTATAATCTCTTATTAAGACCGT
GTGACTATGTGACTCATTTGTTCTTGACTGAACAAAGATGTCAGTTCAAT
ACATTTTGCATACAGTATCCCGTTAAAGTTTGGTGTTTGCAGGATATAGA
TTATTTGTTATGAGACTTCTTAATATCCATCAACTATTTCTATCTATTTT
TTAGGAGCAACCACCGAACGAAGACAATCATAAAGAGGAGAAAAAtctca
ttttattttataaaagtcTTTGTTATTTGAATAAAGTTTCCTTGcataaa
aa

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00021097	TCONS_00021097	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00021098	TCONS_00021098	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00021098-protein	TCONS_00021098-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000378	supercontig	sc0000378:208606..217857 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.42	0.37	0.44	0.99	0.3	0.36	0.49	0.65	0.45	0.36	0.63	0.8	1.22	1.5	94.27	182.7	23.49	18.02	4.32	4.52	1.49	1.4	132.13	89.12	22.33	32.81	6.97	6.76	622.22	794.52

You are here

XLOC_011828 (gene) - C. hemisphaerica