XLOC_011973 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_011973
Unique NameXLOC_011973
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000385:462995..476599-

Legend: gene
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>XLOC_011973 ID=XLOC_011973|Name=XLOC_011973|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=13605bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000385:462995..476599- (Clytia hemisphaerica)
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NNNNNNNNNNCCAGGCGGGTCGCTCAAGGCCGCGCAACTTTGGTAGGATT TGTTGGCTTCAAATCCTACCAAAGAGATTGACCTCTAGCCCTTCGGGCTT GAAACTCAATGAGTCGAACACTCTACCTTTGTAATTTGTTGACTCATAAA ATGTAAAATGGTAAAGTTTACCTATTTTATCTATTTGGGAACGCTGTCAT GTGCCGGGGTAGTAACTGAATTTTCTGCGGTCTTTTACTTTAAAAAACTC GTGTCTAAGGCGAAAACAACTTTTCCTGAACGTATGACAGGGAAAACTGT TTTGTCAAGAGAGATTTCAACATTTTAAGAGTTTTCGGTACTTAGTTGGA AACTTTTAGAAGACCATTATTCAATTTTATCAAAACAAAAATATTAAAAT CCCAATTTGTAAATTTGAGGTTTTCGACCTACCTGGAGGTCCTACCTGGA GGTCCTATAAGTTAACCTGTGTTCGTCCGTTCGTCTATTACCAACTTTTC TCGGGATTGAATACATTGGATTGGTACAAAGGTGCAAAGACGTAGAATTA CAGTGTGCTAAAAATGTTGGGCCCTAAAAAGGGGTTTTTCCAATTCCTTA GTTACCGAGGGGGGGGGGAGCACTTCATCAAGATTAGAACAGGGACGTGC CGCTGGTCAGGGTCCCTTTTTAGGCTCTGAAGATATCTGGTGACAGGTTC CAAAATTTACTAATTTTTAAGTTGTGTTTCTTACAGGGTCGGCTTTTGGT AATTTTGGTCACTTTTCAGGGTCGAAACTTTTCGATTTTTCTTTCTGACA GAGTCACAAATTTACCAAATATTCGTATCTGACAGGGTCCGTTTTTCAAC CTCCAGCGGCACGTCCCCGTCGACCGTCAAGGTCAGTGCCCCCCTGGGCC TTAGTTGACATCTAACTTTAATTTGGTACTAAAAAAGGTACCAAAAAAGC 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TCAAAAGACTTGGAAAACATTCTTGATGGCAAGTTACAGGCCTATAATCA CGCGAACTACGTTTCAGCCATCTGGTGCGAAGAAAAAAGTTTAGAAGGGG TCGAATTACCAAATGGCTCGAAAGTCAGATTAAGAACGAAAGGAAACGGC TGTTATTTAGGTGAGTAATGCGTTATTTCTTGTTACTCACGCGAACCGAA CGTTCCTTTTTTGGTAGGTTGGTCTGTTAGCGCAAAAAAATAATTAAGAT GGTGATAAAAATATAACTTTTAAAAGCGCCTTTTTAAATAACTTGGGCGT TGATCATCTATTATTTATACAAAGAATCTCGTATAATATCATTTTGTAAC TAAAAATTTACACGTTTTCTTTTATAAGAACATCCAAAATTTTTGAAGCC TACGGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTCAAGCCTAAAAATTTTCTTAACA CGTTCTTATTTTTCCCACTTTTTATGTATTTTTGTCCATTTTCCTAAAGA AATTAGCTGTTTCCGAGTCCGCGAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTGTTC TTAACATTTTGGCCATCGAACGCAAGGCTTCTTATATAGTTTGTTCTTAT TAAAAAAAAACGTTTACCCTTTAAGAATCAATCATATGCTTGGATGAAGA ATTAACGACTAAACAGAATTTCACAACACACGATTCAGTGGGTGGCTCAT GGACTGACAAAGTGTTGAATACCAAAGATACCAAGGGTGCGCAATCACAT TTAAGTCAAGAGAGTGAGGCCGTTGATGATGACGAATGGGTAAGTGTGTT TTATTTACCTTAAAGGAAAAACATTTATTTTGGGGAACATAGTCTAGCAA GCTAGACGCCTAATTCCTACATAGTAGAAATAAAGCAAAAAGTAACGGGA GTCAGTGAACAAATTTTAGTTTATACAAACTAAATTCTGTAACAATAATC GTATAATCATATAACGCATATACTACTGTATTTTATAAACGACTCCAGTC TACGGACGGCTTGAAAATTAGCTTTGGCGGGAATTTAATTTGGTGGACAA AGGATATTTTTTGCCCAAGAACACTATTTAATATGAAAACCTGTTTTAAG ACATGAAATAGCACACAATACGGAGAATGAGTATAATAATTTAAATTTGG CGGACATTTGATTTTGCAGATGGCGGGAAAAAATTAGATTTGGCAGGAAC TTGATGCCAAATTAAGTTTCTGCAAAAATGTTTTCCTTTAAAAGGTATTT TATCATGATCTGAAGTTGATCGAGATTATTATTGCAATTGACCCTCCCTA ATTCGATCTTCAAGGGACCAAAAAGAATTTTCTTCGAATTAGAGACAGAT TCGAATAACAGAGAGTAATTTATACCAATCCCCAGCTGGGGTAGCATTTT TTTTAATTCGAATAACATGAAGATTCGAATTAGAGAGAGTTGACTGTACT TACGAGCAACAAATTTTCATTATTCTAGGACTATAAATCTTCACCGTATC CACTCTTGCTAGATCTGTTCTACTCCCGCATAAAATTTTTCTAGCAAACC ATGGCAAACATTAGTTTCATCAAAGCAGTTGCCTAAAACAACGTTTCCAC CAAGCTCAAAAGCAAAGAAGCTTGCCTAAAATCAGAACATGAAAACAAAC TCGTATAGAATTTTTAACTTCATGTCGAGTTCTAATTAAAACTTAAATGC AAAAAGAATTCCCAAAGCATTGTCATGTTGTTACAAGACTGTAGAGGAAT TAAGAAATTCAACAAACAAAGTTCTGCAAGAGGACTGCATTTTCTTTCAA TTATTATATATCTTAAAATGGTAGGACAACTTTACACTGATAAACTCGAC ATTTAAACTAATCCTGAAATAGTAATTAGTGATAGTTATGAAATATTTTC 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TCGTACTGTTTGTTGTATTTACGGTGGTCATGGTGACTCTGGTTGACTGA CCTTCTCTTCTCACCGATCTATTTCTTATCTTTGAAACCTCGACTTTATC TATCTGTAATTTGTACTGAAATGTCAAAAGTGTTAGTTAAGATTTGAATT TCCAACCCCACAAACGGGACCAGGTTGAGTTTACCAGTAGGAGAATGACG TCATACATAATGATATCATTAGAATATCAACGAAACGAATTTCATCTGAC GTCAATTCCTCAAGTTAAACTCGAATCCAGTTTCCTAACGTGTTAAGGAT TGATCATATCGTTGATAGGGTTGATAGGATTCATTGGAGAAATGGGATTT TCCAGAAAAAAATTTGAATATTACAAGTTACCCCCGGACATTGTGAATTT TGACAACCCCCCCCCCCCCCGAACAAGCGTCAGTTGACCCCGTGTGGACA TTAGAAATAACCCCCAGACAGAGCAAGTTTACCCCCCGGACAGGTCAAAT TTTGTAGATTTTTCACTACCCCCCCCTCCCGGACATTTTCTGGAAGAGCC CAAAATTCGACTACCCCTTATCATAAACTAGTCCCAATTTGAAATGAGGA GCATTTGCATCGTCCATGATAAATACAGCATCAAAAATCTTCAAAACGCT GTGAAAGTATATCAATGTATTTTACTGATAATGTATATCAATTTGTTACT GATGATATATTTTTATCAAGCATTTTTTTTTCCGTTCCCCATTTAACTTT ACGGGGGTATCGGTATCCGCTTGTTTATTCTTTTCAGGCTCTTGTTTTTC ATTCACCACTTCTCGGGGCTTTCACCTGCTTTTTCCCCCTCTCTCTCTCT TTCTTTAAGCTTTTTTCACATGCACGTTAAATCTTACTCAAGACGTTACG GAAAATCGTTTGTAAGGCCGTCTTTTGGGAATTTCCCCGACTTTACGTAG 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CGTTCAGGAAACGTCACATTTGAACATTGTCTTAGCGTTCAGATAACATC ATTTGAACATTGTTTTAGCGTTCAGGCAACATCATTTGAACATCGTTTAG CGTTCAGAAAACATCACATTTGAACATTGTTTTAACGTTCAGGAAACGTC ATTTGAACATTGTTTTAGCGTTCAGAAAACCTCATTTGAACATCGTTTTA GCGTTCAGGCAACATCATTTGAACATCGTTTAGCGTTCAGAAAACGTCAC ATTTGAACATTGTTTTAACGTTCAGGAAACGTCATTTGAACATTGTTTTA GCGTTAAGGCAACATCATTTGAACATCGTTTAGCGTTCAGAAAACGTCAC ATTTGAACATTGTGTTAACGTTCAGGAAACGTCATTTGAACATTGTTTTA ACGTTCAGATAACATCATTTGAACATCGTTTTAACGTTCAGGAAACGTCA TTTGAACATTGTCTTAACGTTCAGATAATATCATTTGAACATGGTTTTAG CGTTCAGAAAACGTCATTTGAACATTGTCTTAGCGTTAAGGCAACATAAT TTAAACGTTGTTTTTATTTTCAATTTAGACGTTAGTGGATAGCTCACCGA TCAACTGAATACTGCTTTCAAACATTTAAGCTGACTGGCGGACAACTGAC TTGACATACTGTAAACTTACACTGTTTGACTTTGGGACAGACTGACTACA CTACGCACTGACATTCTTCGGTTATAACAAAACTTGATTACTGTTCAAAC ATTCTCTATCTACAATTTATTATCCGACGCGCGTAAATAGCGGCATTTAA TTAACTTCTTTTCTTTCCAATATTTTCGAATATATAGCTTCCGTAAATTA AAAAAATTGGAATTATATTTGAAAACGAATAATATATAATTATTAGCAAT AATATTTTAGCAATGAACTGCTAATAAACCATTTATTTGGACGCAGTCTC ATCCGACATGAAAGATATTGGATTCAACTTTGTCTAATAATTGCTGGACA TAAGCAGAATAGAATTTCTAAATCATAAAATCCTCTGCTAAAACTCGTTG TCTTACTAGATTGAAACCCCGTACATTAAAAATCCTTTATTCGTTCAAAA GACATCTGATTCCCCACGCCCGCGCAAAACGCCGGATTGAAAGTAAAATC TATCGCTAGATTTCAAAATATGCAGTCCTCAAAAACTTAGGAACCGCTAG ATACTACAATCCCTCGTCGTGATTGGGGGCGCGTTCTAGGCGCGTTCTGG ATGGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00021388TCONS_00021388Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00021387TCONS_00021387Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00021386TCONS_00021386Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00021388-proteinTCONS_00021388-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000385supercontigsc0000385:462995..476599 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
28.31 28.67 18.86 16.51 21.45 14.76 26.99 29.94 22.16 22.33 17.01 15.24 15.82 15.96 18.7 22.21 26.94 25.76 8.42 9.35 24.69 24.79 24.16 21.96 16.99 19.16 15.34 11.35 16.26 15.96