XLOC_013646 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_013646
Unique NameXLOC_013646
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000487:107557..126483-

Legend: gene
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>XLOC_013646 ID=XLOC_013646|Name=XLOC_013646|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=18927bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000487:107557..126483- (Clytia hemisphaerica)
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CTAGTTTAACAGAGTAGTATGACGTCATATATCTCTACTGCTACAGTGAG TATCACATTTCGGGCTTTCTTTGAAAAAGAAGCCAAGATCGTAAAAGCAT GTAAATTTTTTGTACCGGCATCAATTTGCCAGCAATCCAGTCTGTTCAAG TAAAGAATCCTGCATTATAACACGCATGCGTATAATTTGTCGTTCTTTTA ACCGTATGTTAATCTTTGTAATAAGCAAAGAAGAATCAATTCGGAGGGGT GGACAAACTAACCAGGTCGGGGTTGTGGACGGCGAAATTTATCGTTCTTT TTGTCTATTTTTCTTTAGTAAATGTAGCATTCTTTAGATTAACCCCCTTC AATCCACTGACCTTTATATATCCCAGGACCAAGGTATATCAGCCATCTTT GATTGGAGTTTTTTTGGAATTGGTACCCGAGAAGAAGCCATTGAAATGTT AGAAATTAAAACGTCTAACGGCGTTACATTAACAAAGATATTTGAGGGAA AGTAGATCTAGCGCTCTCGATGCATTTACACCGTTATTGAGTAGTGCCGC CATTAGGGTACCACTTTTCAAAAAACTCCGATCAAAGATTTTGCTTTGCC GGGATTGAGAAACTTGGTCCAGGGTATATAAAGGTCAATGCTTCAACCTC TTGCTTGATATTTTCAGATTGCAGTACGTGAATCTAATCGTGGGCAAGGT GCTCCAAATCAAGCTTATGAGGAGACTAATGTTAACGACGCTGGAAGTGA AGGGAATGTATTTCCAGAAATCGAAGAAGAAGTTCAGGCTTGAGAATTGG AGGAATTGAAATAAAAATGCATTATTACCCGGACACAAGTATCGTTAATT GGACGTTGAAGTCACGTTAATTGGACGTTATGGCACAAGTAACGTTAATT GGACGTTGTGGCACAAGTAACGTTAATTGGACGTTCAAGTAACGTTCATT GGACGTTCAAGTAACGTTGATTGGACGTTATGGCACAAGTATCGTTAATT GGACGTTTAAGTAATGTTAATTGGACGTTATGGCACAAATATCGTTGATT GGACGTTCAAGTAACGTTGATTGGACGTTATGGCACAAGTATCGTTGATT GGACGTCCAAGTAACGTTAATTTGACGTTATGGCACAAATGACGTTAAAT GGACATTATGGATGTCAAATGGACGGTGTTTTAACGTTGTGTGCCGGCTG GAATGTATCTTAGTATTTAAACGTTAAAATTCTTAGCTATGATGATCGTA GTAATAACAAAAGTATGAAATTAAAAAAAGGCGAAATGGCAGAGCTGAAC CAAGAAGCTCATGAACTTGAAAGATGTAATATTTTAATTCTGAATTTCAT GGATGATTTGACAAATCAAAAGCGAATGAGTTCGAAGTGGGATCTGGAAG GTTTATGATATTGGCTGAGATCAGTTTCAAAAATGAAAGGGGGTTTTGTG ACATTTTCTATGTTTGAACTTTGGACAGCTGTACAAGTGACAAATTTAGG CTTACTTTGTTTTTTTTTCGCTTTGAGCTCTTGGTTTTCCTTTGATGAAC AAAGTTCCAAAGAAACCATAAAAATAGACTTGCTTTATCAATAGTTATCG CCATAGATGTTAGGTGACTTTTTTAGACTTACTCTAAGATTAGACTTACT TTACTTGTAATATTCAAACAACCACCAGTGAATATTGGCTAATGCTAAGA CTGTCAAATTTTGGAAATAGGTCCAGAAAAGACTATACTTTGACTCTGTG ACAAAATTAGACTTACTTTAAGATTAATATGGTGACTTTATCAGACTTAC TGAATTAAATCCTAATTAGCAATGAAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00024335TCONS_00024335Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00024334TCONS_00024334Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00024333TCONS_00024333Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00024332TCONS_00024332Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00024333-proteinTCONS_00024333-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000487supercontigsc0000487:107557..126483 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.25 0.3 0.29 0.32 0.12 0.23 0.12 0.21 0.15 0.14 0.27 0.11 9.96 8.62 0 0.05 0.03 0.03 20 20.41 0.05 0.12 0.08 0.16 0.29 0.2 0 0 0.06 0