XLOC_029558 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_029558
Unique NameXLOC_029558
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_108:384255..396900-

Legend: gene
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>XLOC_029558 ID=XLOC_029558|Name=XLOC_029558|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12646bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_108:384255..396900- (Clytia hemisphaerica)
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AAAATCCCTGGACATTTAACAAGAAATCGCTCGACTGTCTGGAATATCAG CATGGTCATATACCCCTGTAAATTGATTACAAATGGAATAGCCCATTGTC AACAATGTTATCTCCCCAACCACTCCCTGTATTTATCTTTTGCATAGTCA GGCAGCTGAGGTCACATAAAAATGAACGGGGTGCAAACAATCTAATAAAA CCATTTTTAAATTATACAGCCCAGATATCTATCAACTGGACCTATCCAAA TAGTTGTTATGGAGAATGCAACAATCTATTGAATAACAAATAACTCCACA TACATTATTTTCCCTTAGCAATCGCGTTCTCCTATTCTCTTATTTACATG TCATCCTCGTTAACATTTTGGGTCCCAGATGACGTCATATAGGCCCAAGA TGATAGAATCCAATAACCATTCAAAAGCTCTCAAAAATCAATATAGAAGA AGACTTTTAAGAGGATATGTATAATTTCTCAATATAACTCAAGAAAATTG ATTCTGAAAAAGGGGCAAAATTTCCACATTGTGACGTCATTAGAATTACA AACCGTTATTAAAATTTCCAGGTGAAATTTGGAAATTTTATGGTTTTAGG TGGGAGAAACAAGTTAAGGTGGGGATTAATTTCTTTAGGTGCGATTTTTA GTGTTTTGGTAAAAGTTAATGTTAGTTTTTTCTTCTTTCCAATTTAATAA TAATTTCTTCTAAATTTTATATTCTAAATAATTATTTTACTATCTATACT AAACTTTTCTCCTTTTTATTACCGGGTGTCTCTGAAAAAACTTCCCCCTG TTTGATTCAAAATTGCGAAAAAGTGAAAAAATATATTAGCTTGATTTTTT CGAAATCGTTTAGAGGATGGTTTAACTTAAATTTTGGTATATCAAACTTT AAAATTGCTTCATTAGACCAAAAGTTATGACAAAAAGAGTAAAAAATCTT TTTTCAAAAAGAGCGAAAAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNTTTAGAGGAGGGTTTAACTTAAATTTTGGTATATCAAACTTT AAAATTGCTTCATTAGACCAAAAGTTATGACAAAAAGAGTAAAAAATCTT TTTTCAAAAAGAGCAAAAAAAGACGAAAAAACAGGGTATAGTTACAGCTA ATATATTTTTTCACTTTTTCGCAATATTGGATCAAACTAGGGGGAAGTAT TTTCAGAGACACCCGGTATTATACTGTAAGAATTTTTGTTTCGTTCCTCA AAATAGTATAATTTTTCGTGGGGATAGCATTTTTAGCTGGGATCTGGGAG TTTGGATTGAGGTTAGGAATTTTAGGGTTAGGTGGGACCTAAATTTTTAG GTGGGACCTGGAATCCCCTTGCACACTATGTAGTATCTTTTGTACTATGC TGGTCAGTGCTTGTTAAAACTATGTAGAATGTTTGGGTAATGTTTGGATT GTAATCGGTAAATATCCAGCAAAATATCAAAATTAATAAAGTTTATCAAA AATTCAGCAAGACTAATTTAACATGTTTTTGTTTTCCATCTCAGTTTAAA TACAAACACAAATGGGTGATCCCGTCAGTTATGGTGCACATCAGGTATTA ACTTCAGAGTTTTTCATATATCATAGTTGAGTGAATGAAAGTATTTCTAA TATATTTAGTTTTATCTTAAATGATCGCCAATCAGTTGCAAAAGTTTATA TTTTTATGGAGAGCAAGTACTCCAATGTTAGCAAAAGAAATTCTCTCTGT TCTTACTTTTGATCATCTTTTGTAACCAATGTTGATTATCTGATCTGATC AATTATTTATTTATTATATTTTAGTCCAATTCAGAAGCTGGCCAATTGTT GGCAACCTACTGGCCACGTGTCATGGCTGATATCCGGACCAAACCATTTT TGCAGAAAACTGTAAGTTGTATGATTTTATTATTCTATAGTCAAATTCAC TTAAGCAAACTCACCTTTAAAATCATGTCAATATGTCAATTTTTAAGTAT TGTATGTTATATAATATGTCCCAGGGGGCACTCGTTCTGAAAACAACCAT ATATTCGGCCCAAAAATTGACTTTTAAAATCAGACGCTTACAGTGCAGGA ATAAGCTACGAAAATTGAAACCCTTACAGTGTGGAAACTGACAAAAAATA CACCCTTACAGTGCATCATTCTTTTCATCAGACCTTTTCAATGGAACACC TCCCTTTCAAAAAGGTAATAAGACATATAGGTATCATTCAGTGTGTTACT TCTTCTTTCGGAATTTATTTTTTGGACCTACCTGGAGGTGCTCTGGAGGT GCTATAAATTAACCCATGTTCTTAGTTAGTTTGTGCGTTCTTTTATTACA GTACCAGATTTTCTCAATATCGATTTTTTGCACAAAAATGTGCATTAATT CAAATGAGAGACCAGATCCAAAAATGTCCCATAAAAAACTGTTTTTTGGG ATTATTTTGAGAATTAATCAAAAGTTTTTCCCTCGATGGGTATTAATACT ACCAACAACTGTCTGTAGAACCAGAAATTGCTGTTTTTTGCATTTCCATA AATTTTGCATATTCAAGAATTCACGTAATTATTGTTATTAAACACAATTT TTTTGTTAATGGGTTAATGATATTTTCAGGGAAAGAAAGATGAACCAATT CAAGAACTTCCGCTTGCAAGAATCAAGAAAATAATGAAACAAGATGGTGA TGTGAAGATGATAAGTGCTGAGGTATTTGCCAATGTTCTTTTTAATCAGT TCTTTTAAAGGTTGCAATTCAAATCATGGTTTTCATTTTATCAAAAATTG ACTGTTTTGCTGCCAACCATATTTTTGTTAACGAAAAAAAACAGCTAAAT 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ATATCAGTACATCATAAACTCAAAACAGATTTATGTTGTAAACTTCTGCC TAGCAACCTTTCTTTGCATTTAACGTTTTTCTTTCCTCTTTTTAGAGAAA TGATATAGCGATGGCAATAACAAAATATGATCAATTTGATTTTTTAATTG ATATTGTTCCAAGAGATGAACTGAAACCTGCAAAGCGACAAGTAAGCGTC AAAACCTCCGTCCAGTTTCATTTGGATAATTGTTACCGACTATCAAGTGA AAACCTTTCCTTTTCAATATCAGAAAAAATGAAAATAAATTGCTTATAAA AAACAGTACCAGATGATATAATAGTGGTTCTTTGGCTTTTCTTCAGTCTG ATGTTTCATATCAGACATATTTTTATTTTATATCAGGCCGGGTACTTGTG TTTTATTGTGTTCTTATTTTGTGTCGTGTAAACAAATAAATTGATTTTCT TTCCTTTCTCTATCTAAAATTGCCCTATTTTGAGTCCAATCATGCATGGC GTTCTAAATCTAGATTGAGAACGGCATGAGTCCAATCAATAAAAAGAACT TATGATCTCAAATTGAAGAATCTTGCAACTAAAAACAAGATTACTTTTTA TTAAAAACAAAACTTTTATCATTAACAGGAAGAAGTTGTCCGTCAACCTC CGAACGTGATGGCACCAGAGCAAGTCCAATACTATTTCCATTTATCACAA CTTCAATCAAATGCAGCAGCTGCAGCAGGGACTACCAACTCATCTGCAAC TCCTGTTCAAGCAACCGCCAACACGCCACAAATCACCCATTTACCACCAG GCGCACATGTAATCCAACAGAACGGTCAATTCATTATTGCCACACCTCAA CAATTAAGTGGTCTACAATCAACCGGTGCAACTCCAGCACAAACTGCCAA CGTAAGCTCATCACAATAGTATGGTAGAGTTCATTCCATTCATAGTTTTC TTTTGATGCGCTTAAAATGTCATCAAAGTTGACAGTTGACGCTCTCTAAT TCGATCTTCAAGGGGAATTGAATTTTCATTGAATAAGGGAGCTTATCGAA TAAAGGAGCGTCGTTTATGAGAGTTTCTTGTTGACGGGGACTTTAAATTT CATCCAATAAGGGAGCCTATCGAATAGTAGAACGTCGAATTAGAGAGCGT CAACTTTATTTAAAAGGGTTTTATGTCATTTTTATTGGTTCATACGTTAT GCTCTATCTCACCGCCTTTTCGATATTCTAGATCCTTTGAGTGATTTTTT CAAAAATTTCCAAAATGTTTCATGAAATTCCACATTTTTTCTTTGTTTTT TTAATCAAATGCCTCAAAAATCTTTACATTTTTAGTCCTACTTTAGAGGT CTAAACTAACCTTTGTTCATTCGCCCGTTCGTCTGTTACCAGCTATTCTC GGGATCGGCCCATTAGTTTTTTCAGATTTTTTGCATAGTGATGCAAAATG ACAGTACCCAAAAAGTGAGTCCGATATACAAAAGAAATTTTTGGGTGAAG TGGAAAATATGGGCTAGATTTTGGGCTTTTGTCAAAATTCATTTGATTTT GTTGAGTTACTTAGCATGGTTTGACTTCCAAAAAAATGGGGATTCCTATC TCTAAAACATCGGAAATCCATTGTAAAACAAGTTTCTTCATGTTTTCAAG CTTACGCTTCTCTGTGCTATGCTGTTATTTTTCCTTTTTCGTCAAAATAT TTTCATTGCCAATCACCATGTTTTCGACTACCTGTATCAGGTCAGCATGT TGCTTGTCATTTTAAATTTAACCTCAATTAAATCTTTTTCTTCTGAAATT CCATTTTATACGGGCCCACGCAATCTAGAATTAGCTAATTTAACAACTAT TTAACAAATAGGGTGCAGTTCAACCACAGATTGTTCAGCTTGCCCAACCC CCGCCACAAGCCGCCCAACAGAATACATCAACAACACCTGCGTCAGCTGA GGGGACACAGAGTGCTGTGCAACAATCGACTTCAAATGTTGTGCAACAAC AATCTACTGAACTGAGCACAAGTCAAGCTCAATCAAACACAACTCAGGTA CAATGTTTCATATAGATTTTTTTTTAAGTTGTGCGACAAAAGAAAATTTG GGCGAAATATTTTGCTATTTCTGACGCACGTTGAAGCCGAAATTGTTATT TCAAAAGGTCAAGAAAGTCGATCAGATATTCTTCAACACCTCCTTG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00046301TCONS_00046301Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046300TCONS_00046300Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046299TCONS_00046299Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046298TCONS_00046298Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046297TCONS_00046297Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046296TCONS_00046296Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046295TCONS_00046295Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046294TCONS_00046294Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046293TCONS_00046293Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046292TCONS_00046292Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046291TCONS_00046291Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00046293-proteinTCONS_00046293-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_108supercontigscaffold_108:384255..396900 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
19.68 20.89 17.34 14.1 39.03 29.74 25.8 27.74 11.12 17.21 13.76 9.61 12.78 14.08 9.74 11.85 15.99 14.66 10.61 9.8 12.67 13.05 10.19 13.45 19.04 18.4 4.77 3.39 5.82 7.97