XLOC_033810 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_033810
Unique NameXLOC_033810
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_233:728247..737861+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_033810 ID=XLOC_033810|Name=XLOC_033810|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9615bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_233:728247..737861+ (Clytia hemisphaerica)
ACAGATGTAGACTATGGTGATCCTTTGGCCCTTTTACAACGTAGAACAGG GTGCCAAAGTGATCGCGGTGCCCCTGAATGGGAATGAGGTCAAAAGTAAA TGATTAAGCCCGTAAACAATCACTATCACAAATCCTGTGTTGAATTGgac aaaatgaacaaaatatgGAAATCAACTGACACACTACAATCAGTGTGAAG ATTACGTAATTGCCGAACAAGATCAACTAGCCGGTGGTGGatgtctttta aatttttcacgaGCTGTTCAAGTGAACACATACTACATTCAACATATTTC ACTGGATGACTTCATATTATGCAGTTATGGTGCTAGCAGTGGATTGTTAA CGTTGGAGTTGAAAATGATATGCCTTTTGAAGGGAACGTACCGAAGAACG TGGTAAGTCAGGTGACAACCTTTCTTTCTTACTGTAGtttcttcttaact tttaaaaaaatattgtttttattgattgcTAAATTACAAAACCGTTTTTT TGATATTCATACCATCACGGTGTTCTGTAAGCCTTTCCTTGACATGGCAA TACTTTCATTTCATTAATATTTTAAAGATATCATCCATCAACACAGATGT CAAGTTTTCTGTGAAGTGATATGGCGCTCACAAAACATCTGGTGATGGAA AGGTAATTTGAAATTCACGTCGTTGTGAATGTTGTTTAGTATTCCAATTG TATAAAACATTTatctgattttctgaaagagtCGGCGAACAtagaagtaa aaatttgatgttAGTAAAAGGCCTTGGTTACTTGGTCTATTTGTAATACA ATTGTAGTGATTTTATCGGGTGGTATTCTTAAGAACACTAAAGTGagtgt tttcaatattttattagaTGAGCAATGACATGCAACTCTCACTTATGGAC TGTATTGCTTTTGGTATGTTGTGGTGTTGGTACCAGTGATGCAAGATACA TCTATATTCATCCTTTTTGGGTGTGGATCCAACCAGAAGGTATGTCAATT TTCATCATTGAGTTACTTTTACATTTACTGCATAGTACAAAGTTGAACTC TATCTTAAGTTTCTTGCAGCTGTAAGAAATCTTATGAAGGGTTAATATCC GTTGCATGCAACAAGGatttcatgtaaaaaataaagttttgattacTCCA AGCAAACAGATTTGTTTGGCTATTAGATTTTCGACGAACGTATGAAATTA TCGTCGTCAATTAATCAAGCTAATTGAGCTAGCATTAACAAtctagacaa atgaaatttttaattgtttcgtttaATTCTGTAACCAGATGTTTATCATG CCATTTTAAAACTTGATAATGTAAGAATTGAAAACACCTGCGGGTAACTG CTGCCAATAAACTCGATGAATTACAGATAGACGCGTGCCAatgattagtt tgattagttAAAAGAGAATCTTGTCGACCTATGGGGATCAAAACCATCAT TCTGCCACTCAGATATGATCCACTGACACATTAGCACTGCAGTCTTATGA AAGAGCATAGaacataagaacattttaatacaTTTCGAGATGGGTAACCG AGTTTCAACGAGATATTCAACGAGATATCCTCATTTATACCGAGCGTATC TCAGAACGTTTGAAGGGAGCAACACAAATGGACCGGGTAAGTGGATTGCC ATCGTTTGCCATTTATAACAACACTTCTTCACATatgaattttcaatatt tcccATGTACAAGATGTAAATTTCTGCTTGATCTAGCCAACAGAACTACG AGGCTAACTCTTCCTtgatctgaaaatttcaaaatcgcGATTTATAGAAC TGTTAAAGTCATTAATTCTTACTTACCCAATTCTTGTTGCAAGGATCTAT TTAAATTATTGGGTTATTCATTAGCCATGTCGCTGTCCGTCGTGCTGTAT GTCCATTTTTGAAGAAGCagcgctttgtcaattcaatttcattttggaaa aaacggCGCTTTTTAACAATCAGTAAATTTAATCAATAATCAATTGCTAT TTCGCTTGGCTTTCCTGCCGCTTCGATTTTTCATAGTTTTGttcaatctc gtacccagagcaccactttttgattttactgatgtaTGTGCGATTACAat cgtgagcgctatcagaattatcaaaaagcgaGCTAAAGGACTGGAATcga gtttgaatttttttgtctttgctTTTGACGATGGTATTAGTAGACCAGAT TTGGTCAAATGTTTGCTATAATTAATTTTCTGTGCTTGTCTCGTTTGGTT TACAGATGTATCGGTAGTAAGCGTGGATACGAAACGTGATCTCAATGGAC GCTTGCATCACACCGATCAATTCAAAACAGATGCCATGGTGGTTCGTCGT GGACAAGAATTCTTACTTGATGTCAAATTGTCGACCACCTTCGACCCCTC ACTTCACTCCATCTCGTTGGAATTACGAACAGGCTCCAGACCGAACACCT ACGAGCGAACGTTGGTCAAAATCCCCATGGTTAAATATTTGGACAAAATA AAATGGGGAATGAGAATTGTTGGAAAATCGGACAGCACTCTGCAGGTTTG TAAATTATTCTAAAAGTCAGCATATTTACTTATAAATTCTTCTCCTTATA TAATCCGAACTTTGAAACTATTTTTTAAacgggctcttccagaaagaaTT TGAATGTGGGGAAAGGAGGATATTTGGATATTTGGAaattaccccccgga cattgtgacttttaaCCCTCGGACAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNttaccccccccccccccggacaagcatcagtcgaccccctgga cattaaaaagtaccctcaaacagagcaaagtTACCCAAAAACAGAGAAAG TTTACCTTCCGGACAAGGccaattttgtagatttttcactacccccggac actatatcttccacccccattccccatgtacggacattttctggaagagc ccaatgataATGTCGACTTTTAGTTGATTTGACTTCGTACATAAAATATT AGATCAAAAATGACAGCTTAGCTTTTGATTTATTCTCTACTTCAGTTAAA GATCAACATTCCAGCCAGATGCTTGATAGCAAATTACGAGTTGAGGATCG TCAACAACTTGAGGAAGGTTCTGTACACACATAAACAGCCTGTGTATATC TTGTTCAACCCCTGGTCTACTGGTAATACATCCCTTTTTGCTTGTAATCG TGTCAGTCAAGGATGTGAGGGCTCCTTCGAAGTTAATTCTATATTTTAAG ATCTGTTATGGCAAAGATTTTCGTAGGGAGGCGGGGGTGTCAAGTATTCT TATATTGAGAGGGGGATGTTGGGGAAAATCGACAAGTTAATAAATGCTAT AGGACGGTTAATCGACACCTGTGAGAATTGATGATGTGAACTCTTGATTT GCAGAAGACGAAGTTTACATGCCCAATGCTTCCCATCTTGAAGAATACGT ATTGAATGATCAAGGGGTGTTGTTTCAAGGATCGGCCAACCATATTTCAC CTTTGAGATGGTATTTTGGACAGGTATAGTGCTTTTGATGCTTCTTCTAT GTGTGGTTTCGAAAAATATCTATTGGTATTAGGTGTTTCTATAGAATTCC CCATATACTTTAGAGATGTACGTTATATTTTGATACTTCAGAGCCTATTT ATTGAttgtctttttattttgcaGTTTGAGAAGATCAGCCTGGAGTCAGC TTTTGCTCTTCTATCAACGACAAAAATCCGGGAGAGAGATACAGCTCGTG ATATTTCCCGTCGCATTGCTGCTTTGGTCAGTCTTAATCTTTCAATAATC GATTATTTGATTTAATGCAGAAATATTTGATGTCTAAGGcgtacattttt gttttctaagTTCTACTCTACGAATCATGCGAAGTGTACGCTGTTGTAGT TTTACACGATactcactgggcgaaataagagatttccaattctggaaata tcttgaaaatatgatatttccatatacatttgtaaatatatgactttttt atatttacaaaGTTTAGGAAGtatcatatttcatgatatttccaggatta aaacatctaattttcaaaatattttcaaattttactgtttttaaATAGAA TGTTTTTGCGTATTTTCTCTTCATATCTAGGTTAACTCGAACGACGAAAG GGGCGTTTTACAAGGGCGTTGGGGAAGTGATTTTACAGGAGGAACCGAGC CATGGGCGTGGACTGGATCACCCGCCATTCTAGAAGAATACACGAAGACT AAACAACCAGTCAAATACGGTCAATGCTGGAATTTCTGCGGATTGACTAC AACACGTACGTATTCAAGATTAAAGTAATGGgtatattttaattttcttg tTTCGTAATGTTTCTTGGGTGTAATCCTCTTTGAGATTAACTTTCCATCA GATAAGGATAAGACTATCTGTTATTTATGCTAAACTTGTTGGTCGAAGCG GAAACGTAGAAGTGTTTTCATATGgttaaagcaaaaaatatttttaaagt ttccaAATACAACCATCTCCTTCCCTGGCCGAATATCTTTCTTTCTGGTT ACAGTATTGCGTGTTGTTGGTATTCCGACACGTGCTATCAGTAACTTCAA CTCTGCGCACGACACTGACGGTAATTGTACTTATGATCGCTTCTACGATC AAAATGGTGAATTCTTATCGCGGATGTCACGTGACTCTACTTGGTAAGCA TATTTTCTCTTACTTTTTATCGAAAGGGTTAATCAgataatttatgattt ttaaccTTCGGGTTTCTTCTATAACTCTAATACAACCATTTCTTGAAACA ATTGATCTTACTGCGACTGAACATTTCTTGCctgactacacgtttttttt ataagaacaaactatataagaacataagtttagaatattttaaggctttg tggactctaaaacacacaatttcttaggaaaaaggACAAAATCACTCACA AAATGGtagaaataaaaacatgttaagaacattctttggcttgaaactca aaaagataagaacatccgaagacttaaaaaaatttggatgctcttataaa aaaacgtgttgcTTTACAGCTTAATTATAGTAGGCTCATATGGCTATTTG AACTCAATAAGATAATTTCAATTACCTCAATGAATTTTGACCCGAATTCG TTCAAATGGAAACTTCTAATAAATTTTGAGCGTGTTCAATTCTAACAAAC TAAGAATGGGTGGTTGTAGGAACTTTCACTGTTGGAGCGATGCATGGATG GAGAGACCAGACCTTCCTCCAGGGTACGGAGGATGGCAAGCAGTCGATGG CACGCCGCAAGAACGAAGTAATGGTATGTAGAGTTACGACAGAGAGAATT CCAATTAAGTTTAACTTTGccatattttatatttttatcaaattgggttt ttccagaaaaacctttacccccactgttaaggatattgattttttccCCC TGGATATCATTCTTTATTATTAAATACCCTCTGGATAtacactcttaaaa atatgctcaaccccctggatatcctctcttataaagatgcttacccgtcg atatcgtattttttacttgaaaagacactttactccctggatatccgctc ccttgcagatatttaaccccctgaatATTCACTTTTGAACAAACATCGTT AACTCcttggatatccgatatccttaacagggggcacggactatttctgg gaACGCCCATTGAAGTAAGCAGGTTTGAACATGTAATACCAGAAGGAATC AAGGTTATATCCTCCTTATCTTCGAACTTAATAATTTTTCCATACTACAG ACCTGTTTTGTAGATATGCTACAAtgtcttttcttcttcttgtaTAGGAC GTTATCAAACAGGACCAGCACCTTTGCGCGCCATCAAAGAAGGGAATGTC AAATTGAAACACGATGTACGTTTCTTGTTCGCCGAAGTGAATGCTGATAC AGTCTACTGGTCTAGATTGTCACCTGATCAGGAGTTTCGACCAATCAGAG TTGACAGAAAATTGATAGGTAAGTTTTAGATGTTTTACAAAATGAGTCTG CTTCTTATATCTAAAGattattggcccagcgcgcAGTGGAATGGGCTTTT AAAACACTGGTCGAAAAGATTTGACTTTGTTGGGGCCTATGAGCGCAAGT ATCAATGAACGAGTCCAGGCTAAAAATTGATGATTATAATATGAAGCGCA CGCATAAGAAAAAACCACATATTATTAATACCTCCGAGTGATATGGtcaa atctttttatttcaagcaatAAGAAATACTTATCACcaaaaaattaaagt aattaatTCTTTATTGCTCGCCCGACTCGAGTTGTTCCATATATAGAAAG AATTCCCTCCTGTAAATTAAGTTGTATAAGCTACTCtgcaatgaaaaaat atgttgaCACTACTAACACTGCTGGGCCTTTATGCCGCTTAGGTCTTATC TAGTCTAGTCTTATCTTAGGTCatatctttttattaatttatcaTCAGTC ACACGTTTTGATTGTGGATATAGTAAAGGTTTCTCATAGAACTGGCGAAT ACTATCTGGATAGTATAGAAGTCTGATATCTTCGTTTCGCCTTTTAAGTC cttaaaaatttcattcataGGTCAAAACATTAGCACTAAAGCTATCGGTC GCGAACAGTACAGACGTGTTGATATCACTGAAGATTATAAATACCCAGAA GGCTCTGCTTTAGAACTCATCACATCCCAGCGAGCATTGCATCTGACAAA CAACAAGATTGTTAGCGATACAGTGGACGACCTTAAGTACAGCCTGTATG CTCAAAATGAAGTGATGGTAGGGAAAGACGTGGTGTTGAGGCTACACATC AAGAACACGGCAGTCAACAATCGAAATGTTCAGATAATGGTTGGTGGTCA TGTTTTGACATATAATGGGATCGCTATCAAGAAGCTACCCATGCGTAAGA CACATGAAATGGTTCACAGACAAACAGGTAAGTTTTATTGTTGTGTGATT GTGTGACAATCAACCCTATCTAAAAATCCTTTTgttttcatcattgcatt gcaTTCTAATCATCTCTAAATCATCTCTAAGTTGTTCACATTGATTTTCA TTATTCTTTCTACTTACCAGTAAATACCCCTTAAACCCTACCAAGAAATA GAGGTAAACTCTGTCTGAAAATTTAGGTGGAATTTGAGGCTGAAAGTACG CTGTCTATGGTTTTCTTCCCTAGAGCAGTGACGTTTTGTAGAaaccagtt ttcagtttttcacgaggaaattaaaaaatgcgccTTTAGGctttagctat ttaccccttaaaacctacaagtttttctcgaataacTTACTATAAAATAC tccttttggtctcaaattCACTGCAAAGTTAATTATGTTACaattaaata atttcaaaactgtacgttaaaatcaaaatacaccttaaaacctacaaaca ttgACCCCTTGCTCACAACTTATTGAAACTGCGAATACAATTCAGGAACT GAAccgtgattcaattgatcaaatacttgctagaaatccattcccaaaac aaaattgtattttcagGATTGCATGCCCAAAATGCAATTGCGCCTGCTAT TTGTCAGAAAATGGCTTTGAAGGGTCAAAAGTTTAATTGATTTCATGTTT TTCagaatctccatcaaatttgtgatattttggtatgcaatatgaccacg ttttgagaaagttgattttcagattttataagCCACTACCATAAATGAGA TTTAGAATAGGACTTTGAGGGCCTTACGATTTCTTTGGAGTCTAACAATG ATTTTGCATATCTACCATAAGTATAGATACCTAAAAATacaggttttatg accttaaattcaattgtgtaatctATAGGTctaaaaaacttgattttttg aagggatttttgataaaattttgaataactttgcgaattttacgacactt tgcgataattaaattaattctcgaaattaggtattttatgaGCCTATGAA AGTACATTTATAAGAGATTGTACAAACaaaagtgaattatacaatattaa attaagtttggtggCTAAGAGAGCCCAAAGTGCAACTTaataggttttaa ggggtatccaatGGTATTTCATGATTTCCATTTCTTCTTTATTGTTGTCC TGTTTCATTGAGAGTAGTGACCATTGAACATTCTTTGTCGTCACTTTCAG ATACTTACCACACGGTTTCCTTCGCTGCTTCACAATATCTCTCTTTGCTG AAACAATCACCTCGACTGCGTTTCCATGTCTTCTCAAGTTGTTCTGAGAC AAGTCAGATCTACGTGACCGAAACTATCGTGACGTTAGGAAGGCCAGAAC TTGTATTTGAACAGTTGCCAAGTTACTGGAAGAAAGGAGAGGAGTTGCGG TTCACAGTTCGCGTTCAAAACCCACTTCGGCTGGAGTTGACTGATTGCGT TTTATGGCTAGATGGAAACATAATGGAAAGCAGGCTGTCGCTACCCCAAA GGTGAGTGATGATAGTCAGTGTCATATAACTATGAACCTTTTTGTCCCAT CtaattgaaacaaaataaagatCAACTTGCTTAACAAACGATGAAAACCA TTTGTTTAACTTTCTTTGCAGGAATATACCAGCTAATAGCTTCCACCAAG TGAATATTGCTTTGGTTCCACAGGTAACTATTCTATTTTGTTCTTTTGAT ATTGATTGAAACATTAGAACTGTTGCACGAAATTACTCTAAAAATAACTG AAGGTATATAGTGAATTTATCTGGGGAAAGAAAATAtgtcttaaaaacaa aactacaatctcaaatattgaaaaacatCACTTGAACGCCGTGTTTCTCG TTTCAAAAAGGCTTTCAGTTTTCTACTCAGGAAAATTTTGTCATACCGTA TatcttagactggagtcgtttataatgcgtgtaatacagtagtcaTATGA tgatacgattattgttactaaatttagtttgtataaactaaataGATatt actagacggttcccgtcgtcgcaaacgccggttaagcttgcgcatcaaaa gcccttaggatgataaagatggtattgctgatgctctctaactttatttt taaggggaattcaaattagttttcatcaACCACAGCTCGGCTACCATCTT GTGTTACACACATTTTTCATACTAAAAttttccctccattactttttgct ttatttctgcTATGTGTGAATTAGTCGTTTAGTTTGCTAGACTACATATA CCTAAGGAATTGTCCCCTCatatttggacaatttttccaccTTACAGAAC AGCACACAAACATGTTGAAATAAGTATCTTTTATTTTGTAGTACGAAGGG AGAAAGAACATGATCGTGACCTTTTCTTCTAAACAACTTGGTGGCTTTCG AGGTTCAAGCTTCATTGATATACGATCATAGAAGAGGTTTTACCGACGGT ATTCTGGTTATGTTCCATCGATTACGCCACATTGTAAAGAGAAAGTAATT TGTATTCGTTTCTTg
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053572TCONS_00053572Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053573TCONS_00053573Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053574TCONS_00053574Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053575TCONS_00053575Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053572-proteinTCONS_00053572-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_233supercontigscaffold_233:728247..737861 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
TGM7protein-glutamine gamma-glutamyltransferase Z Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
7.57 6.73 3.89 2.71 8.7 7.33 11.24 11.09 8.09 9.14 10.21 6.58 10.12 8.05 7.74 6.48 10.28 9.91 6.85 6.58 5 6.14 3.59 3.47 9.16 9.13 9.29 6.12 7.5 6.1