XLOC_039358 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_039358
Unique NameXLOC_039358
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_372:183619..194529-

Legend: gene
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>XLOC_039358 ID=XLOC_039358|Name=XLOC_039358|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10911bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_372:183619..194529- (Clytia hemisphaerica)
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TATGCCCTCTTTAATTCACAATTAGAATAGGCAGGGCAAAAAGTGGGCCG TCTAAACTAGGGCTTGTCTAAACTAAAGCTTATATTCCCTCGTGTTCTCT CGTGATGAATATTGAAATCTTCATATATATTCATTATTGGAGTACTTGTA GATAAACAAAATATCGAGTCGAATTTTCGAGATTCAATTTTATTTGGCAT TATTTCGGGTGCTCTATATAATAAAATAGAATCCAAAATATAAAGAATAA AACAGAGCCTCGAAAATATCCATATATTTCATCGTAGTTCAGTAAATTGA TATGAATAAGCAAAATCTAACGTTTTTAACCTTTTCTTGAGATTTTGGTC AACAAAGCCTTAGTGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATATAAAAAAACCTG TATGTTTCTTATCTATTACACAGGTGAAGACAACGGCGCACCTTTAACCT GGTATCGTGTGAAAGAGGGAGCACAGTACCGCTTCCGTGTCATTGGTGTC GGCTCTATGTATCCAATACGTATCTCAGTCGATCAGCATCCGATCATGGT TATCGCCTCAGATGGTTATGATCTAAAGCCTATGATGGTTGAATCGTTCA TTATCAACCCAGGGGAGCGTTTTGACTTTTTGATTAATGCAACTCAGTCG GTTGGGAATTATTGGATACGCGGTGAAAGTATTGAGGTAGCTTTTAAAAC TGTTCTCATTCCGTCTCAGACGAGTGACTATCTAAACGAACTTAGATGAA ATAGCATTTCTGTCTTTAATTTTTAAAGTTTAGTTTTTCAGAATTTTAGT ATAATTTAGATTTTTTGAAAATGATATGATCCGTCAAAAATGAAAACGCG ACTGAAACAGTGTGAAATTTCTTCCCTTGATCTGTGACTGGACAGATACC TCAAAGACCTTTCAGTGAAACGAGCTTTCTTTAAAATAAATTATCTCCCG TACTCCTAAGTATGTATCCTCGAAAATTCTTATTTCATTGTCCTCTAGGT TGGAGTTCAACACCATTCCGTAGAAGCTATTTTCAGTTATGAAGGAGCTA ATAAAACAGAAGAGCCGAAAACAACAAAACGCCAATGTAGTTCTGATAAC CCCTGTATCGTTGCCAACTGCCCTTTCTATTACTACTTCGACCAAGACAA ACATTCGCATATCAAATGCAAGCTCATGTCCGACTTCGAAAACGCCGTTG AAACACCTGCTCCTGTTTTTGATGAAACTTCACAAGAACATTTCATGAAT TTCGCATTCCCTGGAGACGATGAACCCGGGGCAATCAATGGTCGTAAATT CGAATTCCCAGGGGTGAACTCATTGTTTCAATCAGATGAAATTGACAATT ATGATTGTTCGAAACACAAATGTGGAGACGGAGAAGTTTGTTATTGTCAT TATGAATTAAACGTGCCTTATGACCACACTATCCAGATGGTATGGGTCAA TAAAGGTAGCGGCGCCGGGTGGGGCCACCCGATTCACTTACACGGACATA GCTTCTACGTCGTCAAAATGGCTTATACCCAACAAAACATGACAACAGGT CTACTCCTTGGATCCAAAGGTGATTCCCTAGGGGAAAATCAAGATATCAC GTGCAGTAATCCAAATGGGCGCCGTTTTTGTAATACAGCATCATGGAAAA ATTCCACATGGGGAAAAAATAATATCCCCGGCTTGAACTTAAAGAATCCA CCACGTAAAGACACATTGATTATTCCCACCGGTGGATATGCAGTGATCCG CATCAGGACCGACAACCCTGGGAAATGGTTTTTACATTGCCACGTGGAGG AACACATGTTAGACGGTATGGCAATGATCATTAACGAAGCTTCAGATCGA GTACCAAAACCACCAGCTGGTTTCCCTATTTGCCAGAACTTCTATAATGA TCCAACAAGAGATATGTCATACATCAGAGCTAAACGTAAGTACAATCAAA CTCTTTTTGAGATACATAAACCATGATGGACCTCGTTTTCAAAATGTTTT TTTATAAGAANCAAAATAGTAATGCCCAAAATGTGACGATTTAGCCCGAT TTCTGAGAAAAATTATTTTCTAAATTTGGGCCCAATAAAAAAAGGGTTTT TTGACTTTGTATGAAATTGCTTCATTAGTTTTTTCTGATTTTTGGCAGAA AGATAGAGGGCATGATTCCCTATACATTGACTGAAACCTTTTTACCTGGA TAATTTGTTCGTAAAAATTGGATTTTCGTTTTTGGGAAAAATTTGTTTCT GTCATTTTTTTTTCAAGTTAGCACTTCTGATTATTCACTTTGCCATTTTT CTTTCTATTTTTTCATTCAGGTAGGTCCATTCAGCATGTAGCTTGTTATA TTAAAATGTGACTGAATGAAGGAATGATTTCATTTGAAAATGGTACTTAC TTTGAACTGAATGAAAAATTGCAATGACCGCGAACCTCCGAATTTTGGCG CTGCGCCTTTGCCTCTAGACCATTTCTCCATCATGGGAGTGCGCCTTCTT ATCCCCCTTTTTCATGTTCATATTTTATTCACAGAGATCGAAGGAGAAGG CGAAACATGTGTCCAAACCGATCTTTTCGTTGCTGTGTGTTGTGTGTTGG GTGTTTTCGTTCTCATCCAATTCATAGTCATCGTTGTCCTGTGTATGAGA AGCAAATCAAGAGCTGCTGTTGAAAACATTGCAATGAAATAATCACTGGT GTGTGTTTTTAAACCTTAGAAAGGGCACCTTATGTGTGTAATATACAAAG CAATGTCTCATAAACAACTTTCGTCTTAAAAGTGAAGAAATGGTGATTCT TTTTATGATGTATGATATATATTCTTGACAATTTTTTTATGAAGTCTATG TACACGAGTTAACTCTTTGGAGTTTTAGGCCTACGTTAGTACAGGTTTGA AGCTTTTTGGACAATTTTAAAATCTTCATGATTTTTTTTTCTCATTTGTT AGTAATATTTTAGAATTAGGATTTAATTTTTTCAGTCGCCCAGCCAATTT TCACGCACCATTCTGTAACGATAATTTCGGCTACCGTTACCCAGCATTCA ACGTTTTCTCAACGTTCATTTAATCTTCATAACGTCTATATAGCGTTAGA TTAATGTTGAAACAACGTTATGCGGCAGCTGGGTAATGCTTTTTGAGTAC CTTATATAAAAGAGGCAAATATTGTTTCCCCAGTGCGTGCTATTTTGTTC GTGCGTGTTTTTTTAGAGTAAATCCTCTTTTAATATTTCATACAAACGAA TTGTATATAGAATGATAATAGAAAATAAAACCAATATTATTGTTGTAATT AATACCTGCAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062831TCONS_00062831Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062830TCONS_00062830Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062829TCONS_00062829Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062831-proteinTCONS_00062831-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_372supercontigscaffold_372:183619..194529 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.95 1.21 0.79 0.49 1.14 0.81 1.14 1.21 0.63 1.01 1.05 1.02 27.96 27.63 7.3 8.15 3.03 4.6 29.64 25.6 5.78 6.73 2.92 2.81 4.72 4.9 0.93 0.58 2.68 3.59