TCONS_00016874 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00016874
Unique Name	TCONS_00016874
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	6852

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000253:124445..131647-

transcript sequence

>TCONS_00016874 ID=TCONS_00016874|Name=TCONS_00016874|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6852bp
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TTGAGTACTGACTGCACCCGTTTGTTGATTACTGGCTACTTCAGCTTGCT
GAGTTGCAACAGCTTCAGTTTGTTGCGTTGTAGCAGCTTCAGTTTGTCGA
GTACTGGCTGCACCCGGTTGTTGAGTACTGGCTTCTTCATTTTGTTGAGT
ACTGGTTTCTTCAGTTTGTTGAGTTGTAGCAGCTTCAGTTTGTTGTGTAC
TTGCTACTTCAATTTGTTGAGTGCTGGCTATTTCAGTTTGTTGAGTTGTA
GCAGCTTCAGTTTGTTGAGTTGTACCTGCTTCAGTTTGTTGAGTACTGAC
TGCACCCGTTTGTTGATTACTGGCTACTTCAGTTTGCTGAGTTGCAACAG
CTTCAGTTTGTTGAGTACTGGCTGCTTCAGTTTGTTGCGTTGTGACTTTC
TCTGTGGCTTCAGTTTCGGTTGGGACTGTTTTCTCTACAAGTGGTGCTAG
CGTTGCTGTAtcgtcatttttttctgtttgaatgtttGTTGTCGCAGATA
TTGTTGACTTTGTTGTTGATGTTGTCTGTTCAATCTGTTGAGTAGTGACT
GCCTCTGTTTGCTCAGTAGTTACAACTTCTTTCGTTGCTAAAGCCTCTGT
TTGTTCAGTGGTAGGTTCTTGTGTTGCAATTTCTTCAGTTTGTTGGGTAG
ACTTTACAGCTTCAGTTTTCTGAGTAAATGATTCAGTTTGCTCAGTGAGA
GGCTTTTGAGTCGTTGAAGTTATCGTTTCAGTAAGAGCAGCCGTAACCTC
CTTCATAATTGCTGTAGTGGATTGAGCTACGGTGTTTTCAGTTTGTTGAG
TTGTTTTAACACTTTCTGTTTCTGGTTCGACAGTCGTAGCCAGGTCAGTT
ATTTCCCTTGTTACAGCAACGGTAGTCTCAGCTTCAGGTTGTTGTGTAGT
CTTTACAACTTCTGTAATTCCGTTAGCTTCTGTGGTAGACGTCGTTGTTG
GAGCTACGGTCGTTTCTACGGCTTCAGTTTGAACTTGTTTTTCATCCGGA
AGTGTTTTAAGTGTTTCGGTAACAGCTTCTTTAGTGACGATTTTGACGAG
TGTTGTCGATGCTGTCGTGGTTGTTGTGGTGGCTTTTCCGACATTGTTGT
TATCTTCTCCTTCAACAATAACAATAGGAGAAACTGGTTCTTTTGTTGTG
GAAGTACGTGGTTCTTTCGTTACGACAGACTCCCCTGTTGTGATGTCTTT
GGTTACAATTGGCCCCTCGGTTGTGGCTGACTCCGTAGTTTCTGATTCTT
GCGTTACAGACTCTTGAGTTGTAGGAGATTCTGTTATTTTGGCCTCAGTC
GTGACTGATTCTTGGGTAGCAGTTACTTGCGTAGTTTGAGCTTCAGTTTG
TTGAGCAGTAACTTGCTCTTGTGTTGAGGCTGATTCAGTTTGGTGACTAG
TAACAGATTCTTGTGTCGTAACTGACTCAGCTTCCCGTGCTTTAGTTGTG
ACATCTGAGGCTTCTGTTTGAGTAGAAACAGCAGTGGGTTGTTGTGTTGT
TGCGGCGGTTACGTCTGGTTGTGTTACTTCTACAATAGTTCCTTGCGTTG
TTTCTTGTTCAGTACTTTCAGTTTGAGGGGTCTCAGTTGAAATCTCTTTG
ATTTCATCTGTTGTTTTTGAATCTGTTGCAAGCTCTGTTTGCCCAGTGGT
AGCTGCTTCTGTTTGGACTTGCTGAGTAGTGGCTGATTTAGTTTGTTGGG
TTAACACTTCTTCAGTTGTCGATTCTCGCTCTGGTAATGGAGTTGTTGTA
GCTTCAGTTTGTCCCGTTTTAGGTTCTTGCGTTGAAACCGATACAGTTTG
TTGAGTAGAaacatcttttgttttaagcTCTTCTGTACTAGCAAGTTCAG
TTGGTTTTTGGGTCGACAATGCAATGTTTTGAGTGCTTTCACTTTCAGTT
TTTCCTTCGGTACTTGAAACACTCTCTGGTGCTTTGGATGGTTGTTGGGT
TGTGGTGATCTGTTGAGTAATGACTGTTTCTGTTTGTGTGCTGACATCTG
TGGCGACTTTTTTGGTTGTAGAAACTTGTGCTTCTTCTGTCGTTGCTTTT
GGTTCTGGAGTGGTTCTTGTTTCAGTTTTTTCTCCAGTACTGCTAACAGT
CACATAGACAGTAACATCCTCTGGAGTTTCGGATGGTTTTGGAGATGGTG
TTGTTTGAGAGACTGTTGCAACTTTTTCTGTTGGTCCTGTCTCAGTTTGT
TCTGTAACGACCTCAACAGTTTGTCTTGTGCTAGCACTAGGATCAGTAGT
AGTAGTCGGTGCTGGTACTTGAGTGGAAACGACTAGTGGTGCATCAGTTT
CTGGTTGCTGTGTAGTAGCTGATTTGGTGATTTCAGTTATTTGTTCTGTT
TGCTGAGTAGTCATGACTTCAGTAGCTTCTGTCATTGTTTGTCGAGTCGT
TGGCGAGTNGCTTCAGGTTGTTGTGTAGTCTTTACAACTTCTGTAATTCC
GTTAGCTTCTGTGGTAGACGTCGTTGTTGGAGCTACGGTCGTTTCTACGG
CTTCAGTTTGAACTTGTTTTTCATCCGGAAGTGTTTTAAGTGTTTCGGTA
ACAGCTTCTTTAGTGACGATTTTGACGAGTGTTGTCGATGCTGTCGTGGT
TGTTGTGGTGGCTTTTCCGACATTGTTGTTATCTTCTCCTTCAACAATAA
CAATAGGAGAAACTGGTTCTTTTGTTGTGGAAGTACGTGGTTCTTTCGTT
ACGACAGACTCCCCTGTTGTGATGTATTTGGTTACAATTGGCCCCTCGGT
TGTGGCTGACTCCGTAGTTTCTGATTCTTGCGTTACAGACTCTTGAGTTG
TAGGAGATTCTGTTATTTTGGCCTCAGTCGTGACTGATTCTTGGGTAGCA
GTTACTTGCGTAGTTTGAGCTTCAGTTTGTTGAGCAGTAACTTGCTCTTG
TGTTGAGGCTGATTCAGTTTGGTGACTAGTAACAGATTCTTGTGTCGTAA
CTGACTCAGCTTCCCGTGCTTTAGTTGTGACATCTGAGGCTTCTGTTTGA
GTAGAAACAGCAGTGGGTTGTTGTGTTGTTGCGGCGGTTACGTCTGGTTG
TGTTACTTCTACAATAGTTCCTTGCGTTGTTTCTTGTTCAGTACTTTCAG
TTTGAGGGGTCTCAGTTGAAATCTCTTTGATTTCATCTGTTGTTTTTGAA
TCTGTTGCAAGCTCTGTTTGCCCAGTGGTAGCTGCTTCTGTTTGGACTTG
CTGAGTAGTGGCTGATTTAGTTTGTTGGGTTAACATTTCTTCAGTTGTTG
ATTCTCGCTCTGGTAATGGAGTTGTTGTAGCTTCAGTTTGTCCCGTTTTA
GGTTCTTGCGTTGAAACCGATACAGTTTGTTGAGTAGAaacatcttttgt
tttaagcTCTTCTGTACTAGCAAGTTCAGTTGGTTTTTGGGTCGACAATG
CAATGTTTTGAGTGCTTTCACTTTCAGTTTTTCCTTCGGTACTTGAAACA
CTCTCTGGTGCTTTGGATGGTTGTTGGGTTGTGGTGATCTGTTGAGTAAT
GACTGTTTCTGTTTGTGTGCTGACATCTGTGGCGACTTTTTTGGTTGTAG
AAACTTGTGCTTCTTCTGTCGTTGCTTTTGGTTCTGGAGTGGTTCTTGTT
TCAGTTTTTTCTCCAGTACTGCTAACAGTCACATAGACAGTAACATCCTC
TGGAGTTTCGGATGGTTTTGGAGATGGTGTTGTTTGAGAGACTGTTGCAA
CTTTTTCTGTTGGTCCTGTCTCAGTTTGTTCTGTAACGACCTCAACAGTT
TGTCTTGTGCTAGCACTAGGATCAGTAGTAGTAGTCGGTGCTGGTACTTG
AGTGGAAACGACTAGTGGTGCATCAGTTTCTGGTTGCTGTGTAGTAGCTG
ATTTGGTGATTTCAGTTATTTGTTCTGTTTGCTGAGTAGTCATGACTTCA
GTAGCTTCTGTCATTGTTTGTCGAGTCGTTGGCGAGTCTGTTTGTTCTGT
GACTGTCTCCTGTGTGGTGACAATTTCTGTCTTTTCCGTTTGAGGCGCTT
GGGTCGTAGCAGATTCGGTAATGTCGGTAACATCTGTGATTGATTGAGTT
TGTGGAGCTGCGGATTGTTGTGTTGTAACTGAATCAGTTTGCTGAGTTAC
AGGTTGTTGTGTTGTGACTGAATCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCTCTTGTG
TTGTGACTGAATCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTAAA
TCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTGAATCAGTTTGTTG
AGTTACAGGTTGTTGTGTTGTGACTGAATCAGTTTGTTGGGTTGCAGGTT
CTTGTGTTGTAACAGAATCAGTTTGTTGAGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTA
ACTGAATCAGTTTGTTTAGTAGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTGAATCAGT
TTGTTTAGTAGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTGAATCAGTTTGTTTAGTTG
CAGGCTCTTCCGTTGTCTTTGGAGAATCGGTTCCCTTTGTTGCAGATCCT
GGCTGCTGAGTAATGATTTCCTCAGTTTGTTGAGTTGTATATTTTTCTGT
CGAAAGTTCTTTTTCTTGAGTGGTGACAACTTGAGGAGCATCAGTGACAA
TTTCTTGAGTTGTCGCAGACTCTGTTTGTTCTGTCTGTGGTTGTTGAGTT
GTGACTGTTTCAGTTTGTTGTTGCGTGACCACTGTGTTAGTTTGTTTTGT
TGGAACTACATCAGTTTCAACTTGCTCTGTGGTAACAATTTCTGTTTGCT
GAGTAACTGGCTCTTCCGTGGTGATAGATTCAGTCTGTTGAGTAACAACG
TCGGTCTGTTGAGTGGAAGGTTTTTGAGTTGTAACAAGGTCAGTCTGTTG
AATTCCTGAATCAGTTAAAGCTGCTTCAGTTTGTTCTGTGGATGGCTCTT
GAGTGGTGGTTCGCTCAGGAAGAGGCGTTGTAGAATCTGTTCTTTGCTCT
TCAGTTTGAACTTGAGGAGTAACTGAATCCGTTTGTTGAGTAGCAGGTTC
TTGTGTTGAAACTATTTCTGTTTGAGCTTGTTGAGTAGTGGCCGATTCAG
TTTGTTGGGTTAACACTTCTTCAGTTGTTGAATCTCGCTCTGGTAATGGA
GTTGTCGCAGCTTCAGTTTGTTGAGTTTTGGGCTCTTGCGTTGAAACCGA
TCCAGTTTGTTGAGTTTTTGTAGCTTCATTTGTTGAAACTTGCTCTAAAG
GTTGAGTGGAAACTTTGCCTTGCTTTTGTGTAGTGCTTGTGACAGATGCT
GTAACTGTTTCTTGAGTGGTAGAAGCTTCGGTTCTCTCTTCTAAGTCTCC
AGTGACCGCTGGTTGTCCTGTAGTAGATTTTGCTTTCATGGTGATTGGCT
TTTGCGTTGAATCTTGTTTTGTTGGAAGGCTGGTAGATTTTGGAGATTCA
GTTTGGATGTTTTTTGTGGTTTGTTGCTGTGTGGTAGTGGAAATAGAACC
CTCAACAAAATctgttgtttgttttgattctgtTGATACTTCTGGTGAAC
TTGTTGTGGTAAGTTGAGGTGCATCTGTTTCAATCTTGTCTTTAGTTGTG
GTTTGTTCAGATTCTGAGTCGGTGGTGATTTCGTCGGTTGGTGAATCTGT
CGTGCGTTCACTGGTGGATCCTTCAGTGATCACTAAAGGAGTATGGGGAC
CTTCTGATGGCTTTGGTAAGGTTGACTTTGGTGAATCAGTAGTGGTTTGA
GCAGCTGTTGTAAGGACTTGTTCTGTGGTCTTAAAGTCTGGTTCTTGAGT
TGTGGATTGTTCAGTTCTAAAATCTGTGACAACTTTAGCGTCTGGGCCTT
CTGTTTGTTGTGTGGATAATACATAAAGGTCCTCAGTTGTTGAAACTCGG
CGTTGGTCAACATCGTCAACTGTTGTCTGTTGTTGCTGTGTTGTTGGTGT
TGCTTGAGTTGTGACAACAACTAGTTTGTCGACATCATGTGTTGTGTAAG
ATTCTGTTGTTCGCTCCTCTTCTGTTCGGATTGGATCTGTAATCAGGTCT
TTTGTTATCAGATCGTCAGTTCTCGTCTCTTGAGTTGTGGAGACATACTC
AGTTTGTGGCATTTGAGTAGTTATCTCTGTCTGTCGTTTTTGCTCAGTTG
TTTGAAGATCTTCAGTAGCAACCGTTGATCGTACAGATTCAGTTGACTGT
TCGCTTGTTCTAACACGATCAACTGGTGAAGAGGTCTTTGTGCTTAGTGA
TTCTGTGGTCGATCGCTCTGTTGACTCTGTTGTCTTGGCAACTTCTTCGG
TAGGTTGTGGACGGGCCGTGGCGACCTCTGGTTCATCTGTTTCGAGACCT
TCAGTGACGACCGTTGTTTGGCGGATTTCTTCCGTCGTAGGTTTCAATGT
TGTAGTAGTTGTAGACGTTTTCGTTGTTGAAGCGACAGTAGTGGCAACCT
TACCGCATCGTTGTTGACATTCGACCAAGGTGAAAAAGTTGTTTGAGTTT
CCATCGCAACCACCGTATGCAAACTGCTCACATTTTTGTGTCTCCACATT
GAAATAGTATCGAATCATATATCCAAAGCATTGTCCAGTATTCTTAGGCA
TTTCACAAATACTTTTAAATTTCGGACATAggacgccattttgttttggt
gTTATTCCATCTCTACAGCAGCCGAGATCACTTTTGCAGCCTGGGCGCGC
AACAACTGGTGTGTCAGTACAGAAGCCACATGATTTTGGACACATGGTAC
CCATGAAGGACTTGTAACGTTTGCAATACCCTGGGGATGCGTACTCCAAG
CATTTCACTGGTTGCTTGTCTTGGCAATTTGATTTGTATTGATCAACTGG
TC

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000253:124445..131647-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00016874 ID=TCONS_00016874|Name=TCONS_00016874|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7203bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000253:124445..131647- (Clytia hemisphaerica)
ACTTCAGTTTGTTGTGTGCTAACTGATTCAGTACCTTCAGTCTCCGTTTG
TTGAGTACTGACTGCACCCGTTTGTTGATTACTGGCTACTTCAGCTTGCT
GAGTTGCAACAGCTTCAGTTTGTTGCGTTGTAGCAGCTTCAGTTTGTCGA
GTACTGGCTGCACCCGGTTGTTGAGTACTGGCTTCTTCATTTTGTTGAGT
ACTGGTTTCTTCAGTTTGTTGAGTTGTAGCAGCTTCAGTTTGTTGTGTAC
TTGCTACTTCAATTTGTTGAGTGCTGGCTATTTCAGTTTGTTGAGTTGTA
GCAGCTTCAGTTTGTTGAGTTGTACCTGCTTCAGTTTGTTGAGTACTGAC
TGCACCCGTTTGTTGATTACTGGCTACTTCAGTTTGCTGAGTTGCAACAG
CTTCAGTTTGTTGAGTACTGGCTGCTTCAGTTTGTTGCGTTGTGACTTTC
TCTGTGGCTTCAGTTTCGGTTGGGACTGTTTTCTCTACAAGTGGTGCTAG
CGTTGCTGTATCGTCATTTTTTTCTGTTTGAATGTTTGTTGTCGCAGATA
TTGTTGACTTTGTTGTTGATGTTGTCTGTTCAATCTGTTGAGTAGTGACT
GCCTCTGTTTGCTCAGTAGTTACAACTTCTTTCGTTGCTAAAGCCTCTGT
TTGTTCAGTGGTAGGTTCTTGTGTTGCAATTTCTTCAGTTTGTTGGGTAG
ACTTTACAGCTTCAGTTTTCTGAGTAAATGATTCAGTTTGCTCAGTGAGA
GGCTTTTGAGTCGTTGAAGTTATCGTTTCAGTAAGAGCAGCCGTAACCTC
CTTCATAATTGCTGTAGTGGATTGAGCTACGGTGTTTTCAGTTTGTTGAG
TTGTTTTAACACTTTCTGTTTCTGGTTCGACAGTCGTAGCCAGGTCAGTT
ATTTCCCTTGTTACAGCAACGGTAGTCTCAGCTTCAGGTTGTTGTGTAGT
CTTTACAACTTCTGTAATTCCGTTAGCTTCTGTGGTAGACGTCGTTGTTG
GAGCTACGGTCGTTTCTACGGCTTCAGTTTGAACTTGTTTTTCATCCGGA
AGTGTTTTAAGTGTTTCGGTAACAGCTTCTTTAGTGACGATTTTGACGAG
TGTTGTCGATGCTGTCGTGGTTGTTGTGGTGGCTTTTCCGACATTGTTGT
TATCTTCTCCTTCAACAATAACAATAGGAGAAACTGGTTCTTTTGTTGTG
GAAGTACGTGGTTCTTTCGTTACGACAGACTCCCCTGTTGTGATGTCTTT
GGTTACAATTGGCCCCTCGGTTGTGGCTGACTCCGTAGTTTCTGATTCTT
GCGTTACAGACTCTTGAGTTGTAGGAGATTCTGTTATTTTGGCCTCAGTC
GTGACTGATTCTTGGGTAGCAGTTACTTGCGTAGTTTGAGCTTCAGTTTG
TTGAGCAGTAACTTGCTCTTGTGTTGAGGCTGATTCAGTTTGGTGACTAG
TAACAGATTCTTGTGTCGTAACTGACTCAGCTTCCCGTGCTTTAGTTGTG
ACATCTGAGGCTTCTGTTTGAGTAGAAACAGCAGTGGGTTGTTGTGTTGT
TGCGGCGGTTACGTCTGGTTGTGTTACTTCTACAATAGTTCCTTGCGTTG
TTTCTTGTTCAGTACTTTCAGTTTGAGGGGTCTCAGTTGAAATCTCTTTG
ATTTCATCTGTTGTTTTTGAATCTGTTGCAAGCTCTGTTTGCCCAGTGGT
AGCTGCTTCTGTTTGGACTTGCTGAGTAGTGGCTGATTTAGTTTGTTGGG
TTAACACTTCTTCAGTTGTCGATTCTCGCTCTGGTAATGGAGTTGTTGTA
GCTTCAGTTTGTCCCGTTTTAGGTTCTTGCGTTGAAACCGATACAGTTTG
TTGAGTAGAAACATCTTTTGTTTTAAGCTCTTCTGTACTAGCAAGTTCAG
TTGGTTTTTGGGTCGACAATGCAATGTTTTGAGTGCTTTCACTTTCAGTT
TTTCCTTCGGTACTTGAAACACTCTCTGGTGCTTTGGATGGTTGTTGGGT
TGTGGTGATCTGTTGAGTAATGACTGTTTCTGTTTGTGTGCTGACATCTG
TGGCGACTTTTTTGGTTGTAGAAACTTGTGCTTCTTCTGTCGTTGCTTTT
GGTTCTGGAGTGGTTCTTGTTTCAGTTTTTTCTCCAGTACTGCTAACAGT
CACATAGACAGTAACATCCTCTGGAGTTTCGGATGGTTTTGGAGATGGTG
TTGTTTGAGAGACTGTTGCAACTTTTTCTGTTGGTCCTGTCTCAGTTTGT
TCTGTAACGACCTCAACAGTTTGTCTTGTGCTAGCACTAGGATCAGTAGT
AGTAGTCGGTGCTGGTACTTGAGTGGAAACGACTAGTGGTGCATCAGTTT
CTGGTTGCTGTGTAGTAGCTGATTTGGTGATTTCAGTTATTTGTTCTGTT
TGCTGAGTAGTCATGACTTCAGTAGCTTCTGTCATTGTTTGTCGAGTCGT
TGGCGAGTNGCTTCAGGTTGTTGTGTAGTCTTTACAACTTCTGTAATTCC
GTTAGCTTCTGTGGTAGACGTCGTTGTTGGAGCTACGGTCGTTTCTACGG
CTTCAGTTTGAACTTGTTTTTCATCCGGAAGTGTTTTAAGTGTTTCGGTA
ACAGCTTCTTTAGTGACGATTTTGACGAGTGTTGTCGATGCTGTCGTGGT
TGTTGTGGTGGCTTTTCCGACATTGTTGTTATCTTCTCCTTCAACAATAA
CAATAGGAGAAACTGGTTCTTTTGTTGTGGAAGTACGTGGTTCTTTCGTT
ACGACAGACTCCCCTGTTGTGATGTATTTGGTTACAATTGGCCCCTCGGT
TGTGGCTGACTCCGTAGTTTCTGATTCTTGCGTTACAGACTCTTGAGTTG
TAGGAGATTCTGTTATTTTGGCCTCAGTCGTGACTGATTCTTGGGTAGCA
GTTACTTGCGTAGTTTGAGCTTCAGTTTGTTGAGCAGTAACTTGCTCTTG
TGTTGAGGCTGATTCAGTTTGGTGACTAGTAACAGATTCTTGTGTCGTAA
CTGACTCAGCTTCCCGTGCTTTAGTTGTGACATCTGAGGCTTCTGTTTGA
GTAGAAACAGCAGTGGGTTGTTGTGTTGTTGCGGCGGTTACGTCTGGTTG
TGTTACTTCTACAATAGTTCCTTGCGTTGTTTCTTGTTCAGTACTTTCAG
TTTGAGGGGTCTCAGTTGAAATCTCTTTGATTTCATCTGTTGTTTTTGAA
TCTGTTGCAAGCTCTGTTTGCCCAGTGGTAGCTGCTTCTGTTTGGACTTG
CTGAGTAGTGGCTGATTTAGTTTGTTGGGTTAACATTTCTTCAGTTGTTG
ATTCTCGCTCTGGTAATGGAGTTGTTGTAGCTTCAGTTTGTCCCGTTTTA
GGTTCTTGCGTTGAAACCGATACAGTTTGTTGAGTAGAAACATCTTTTGT
TTTAAGCTCTTCTGTACTAGCAAGTTCAGTTGGTTTTTGGGTCGACAATG
CAATGTTTTGAGTGCTTTCACTTTCAGTTTTTCCTTCGGTACTTGAAACA
CTCTCTGGTGCTTTGGATGGTTGTTGGGTTGTGGTGATCTGTTGAGTAAT
GACTGTTTCTGTTTGTGTGCTGACATCTGTGGCGACTTTTTTGGTTGTAG
AAACTTGTGCTTCTTCTGTCGTTGCTTTTGGTTCTGGAGTGGTTCTTGTT
TCAGTTTTTTCTCCAGTACTGCTAACAGTCACATAGACAGTAACATCCTC
TGGAGTTTCGGATGGTTTTGGAGATGGTGTTGTTTGAGAGACTGTTGCAA
CTTTTTCTGTTGGTCCTGTCTCAGTTTGTTCTGTAACGACCTCAACAGTT
TGTCTTGTGCTAGCACTAGGATCAGTAGTAGTAGTCGGTGCTGGTACTTG
AGTGGAAACGACTAGTGGTGCATCAGTTTCTGGTTGCTGTGTAGTAGCTG
ATTTGGTGATTTCAGTTATTTGTTCTGTTTGCTGAGTAGTCATGACTTCA
GTAGCTTCTGTCATTGTTTGTCGAGTCGTTGGCGAGTCTGTTTGTTCTGT
GACTGTCTCCTGTGTGGTGACAATTTCTGTCTTTTCCGTTTGAGGCGCTT
GGGTCGTAGCAGATTCGGTAATGTCGGTAACATCTGTGATTGATTGAGTT
TGTGGAGCTGCGGATTGTTGTGTTGTAACTGAATCAGTTTGCTGAGTTAC
AGGTTGTTGTGTTGTAACTGAATGAGTTTGTTTAGTTACAGGTTGTTGTG
TTGTGACTGAATCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCTTTTGTGTTGTAACTGAA
TCAGTTTGTTTAGTTACAGGTTGTTGTGTTGTGACTGAATCAGTTTGTTT
AGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTAAATCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCT
CTTGTGTTGTGACTGAATCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTA
ACTAAATCAGTTTGTTTAGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTGAATCAGT
TTGTTGAGTTACAGGTTGTTGTGTTGTGACTGAATCAGTTTGTTGGGTTG
CAGGTCCTTGTGTTGTAACTGAATCAGTTCGTTTAGTAGCAGGCTCTTGT
GTTGTAACTGAATCAGTTTGTTGGGTTGCAGGTTCTTGTGTTGTAACATA
ATCAGTTTGTTGAGTTGCAAGCTCTTGTGTTGTAACTGAATCAGTTTGTT
GGGTTGCAGGTTTTTGTGTTGTAACAGAATCAGTTTGTTGAGTTGCAGGC
TCTTGTGTTGTAACTGAATCAGTTTGTTTAGTAGCAGGCTCTTGTGTTGT
AACTGAATCAGTTTGTTTAGTAGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTGAATCAG
TTTGTTTAGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTAAATCAGTTTGTTGAGTT
GCAGGCTCTTCCGTTGTCTTTGGAGAATCGGTTCCCTTTGTTGCAGATCC
TGGCTGCTGAGTAATGATTTCCTCAGTTTGTTGAGTTGTATATTTTTCTG
TCGAAAGTTCTTTTTCTTGAGTGGTGACAACTTGAGGAGCATCAGTGACA
ATTTCTTGAGTTGTCGCAGACTCTGTTTGTTCTGTCTGTGGTTGTTGAGT
TGTGACTGTTTCAGTTTGTTGTTGCGTGACCACTGTGTTAGTTTGTTTTG
TTGGAACTACATCAGTTTCAACTTGCTCTGTGGTAACAATTTCTGTTTGC
TGAGTAACTGGCTCTTCCGTGGTGATAGATTCAGTCTGTTGAGTAACAAC
GTCGGTCTGTTGAGTGGAAGGTTTTTGAGTTGTAACAAGGTCAGTCTGTT
GAATTCCTGAATCAGTTAAAGCTGCTTCAGTTTGTTCTGTGGATGGCTCT
TGAGTGGTGGTTCGCTCAGGAAGAGGCGTTGTAGAATCTGTTCTTTGCTC
TTCAGTTTGAACTTGAGGAGTAACTGAATCCGTTTGTTGAGTAGCAGGTT
CTTGTGTTGAAACTATTTCTGTTTGAGCTTGTTGAGTAGTGGCCGATTCA
GTTTGTTGGGTTAACACTTCTTCAGTTGTTGAATCTCGCTCTGGTAATGG
AGTTGTCGCAGCTTCAGTTTGTTGAGTTTTGGGCTCTTGCGTTGAAACCG
ATCCAGTTTGTTGAGTTTTTGTAGCTTCATTTGTTGAAACTTGCTCTAAA
GGTTGAGTGGAAACTTTGCCTTGCTTTTGTGTAGTGCTTGTGACAGATGC
TGTAACTGTTTCTTGAGTGGTAGAAGCTTCGGTTCTCTCTTCTAAGTCTC
CAGTGACCGCTGGTTGTCCTGTAGTAGATTTTGCTTTCATGGTGATTGGC
TTTTGCGTTGAATCTTGTTTTGTTGGAAGGCTGGTAGATTTTGGAGATTC
AGTTTGGATGTTTTTTGTGGTTTGTTGCTGTGTGGTAGTGGAAATAGAAC
CCTCAACAAAATCTGTTGTTTGTTTTGATTCTGTTGATACTTCTGGTGAA
CTTGTTGTGGTAAGTTGAGGTGCATCTGTTTCAATCTTGTCTTTAGTTGT
GGTTTGTTCAGATTCTGAGTCGGTGGTGATTTCGTCGGTTGGTGAATCTG
TCGTGCGTTCACTGGTGGATCCTTCAGTGATCACTAAAGGAGTATGGGGA
CCTTCTGATGGCTTTGGTAAGGTTGACTTTGGTGAATCAGTAGTGGTTTG
AGCAGCTGTTGTAAGGACTTGTTCTGTGGTCTTAAAGTCTGGTTCTTGAG
TTGTGGATTGTTCAGTTCTAAAATCTGTGACAACTTTAGCGTCTGGGCCT
TCTGTTTGTTGTGTGGATAATACATAAAGGTCCTCAGTTGTTGAAACTCG
GCGTTGGTCAACATCGTCAACTGTTGTCTGTTGTTGCTGTGTTGTTGGTG
TTGCTTGAGTTGTGACAACAACTAGTTTGTCGACATCATGTGTTGTGTAA
GATTCTGTTGTTCGCTCCTCTTCTGTTCGGATTGGATCTGTAATCAGGTC
TTTTGTTATCAGATCGTCAGTTCTCGTCTCTTGAGTTGTGGAGACATACT
CAGTTTGTGGCATTTGAGTAGTTATCTCTGTCTGTCGTTTTTGCTCAGTT
GTTTGAAGATCTTCAGTAGCAACCGTTGATCGTACAGATTCAGTTGACTG
TTCGCTTGTTCTAACACGATCAACTGGTGAAGAGGTCTTTGTGCTTAGTG
ATTCTGTGGTCGATCGCTCTGTTGACTCTGTTGTCTTGGCAACTTCTTCG
GTAGGTTGTGGACGGGCCGTGGCGACCTCTGGTTCATCTGTTTCGAGACC
TTCAGTGACGACCGTTGTTTGGCGGATTTCTTCCGTCGTAGGTTTCAATG
TTGTAGTAGTTGTAGACGTTTTCGTTGTTGAAGCGACAGTAGTGGCAACC
TTACCGCATCGTTGTTGACATTCGACCAAGGTGAAAAAGTTGTTTGAGTT
TCCATCGCAACCACCGTATGCAAACTGCTCACATTTTTGTGTCTCCACAT
TGAAATAGTATCGAATCATATATCCAAAGCATTGTCCAGTATTCTTAGGC
ATTTCACAAATACTTTTAAATTTCGGACATAGGACGCCATTTTGTTTTGG
TGTTATTCCATCTCTACAGCAGCCGAGATCACTTTTGCAGCCTGGGCGCG
CAACAACTGGTGTGTCAGTACAGAAGCCACATGATTTTGGACACATGGTA
CCCATGAAGGACTTGTAACGTTTGCAATACCCTGGGGATGCGTACTCCAA
GCATTTCACTGGTTGCTTGTCTTGGCAATTTGATTTGTATTGATCAACTG
GTC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_009445	XLOC_009445	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000253	supercontig	sc0000253:124445..131647 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.0446252	0	0.075458	0	7.55467	5.86143	5.80443	10.1788	1.88402	3.42231	3.36742	1.2051	2.85624	3.05962	1.84956	1.52615	1.91545	2.20471	1.85024	1.75252	2.1877	2.02076	0.881795	1.08708	3.51019	2.35603	0.217676	0.364667	5.22531	8.77525

Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR002223	Kunitz_BPTI
IPR003582	ShKT_dom
IPR020901	Prtase_inh_Kunz-CS

Vocabulary: **Molecular Function**
Term	Definition
GO:0004867	serine-type endopeptidase inhibitor activity

GO Annotation

GO Assignments

This transcript is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
molecular_function	GO:0004867	serine-type endopeptidase inhibitor activity

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00016874 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00016874 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00016874 (transcript) - C. hemisphaerica