XLOC_006816 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_006816
Unique NameXLOC_006816
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000137:372716..384975-

Legend: gene
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>XLOC_006816 ID=XLOC_006816|Name=XLOC_006816|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12260bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000137:372716..384975- (Clytia hemisphaerica)
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GTATCTTTTTCATTTACATCCGCATACGCCCCTTTTATCTGTGGGCGTGA CACTCCTGTTCTTTTTCTCTCGGCATGGGCCCCGTCAACGGGGGGGCCGG GGGGTCCATGGCCCCCCCACTTTTTGGTAGACCATATCATACGTTTTTAA GAGTTACTATCTTAAGCTGGTTTGAGACCAAATCAAACCACAANCCCCCC CCCCCCGCTTATTAATTTTTGGGAAAATGTTTTTGAAAGTTCCCTCTTTT GTCCTAATTCAGCTGTATTAGCCTCCTTTTCAATTTTTTTTTACCCAGGA CATTTTTATTCCAACCCCTCTCCCCGCTTAATAAGTTTTGAGATTTTTTC CAACATCTCGCTTATTCCAACCCCCCCCCCCCGGCTATTAGGTACCCGAG AGTATATGTCGTCTCAGACCCCGTGAAACACCACAAGTTTTCCAGTTTTG AAGGATTTTGAAGCCTTATAAGTTACTGTCCTGATTATTGTTTTAATGCT CTTCAGCCCTTTTCCTTTTTAAGGTTTTGCACAGTGTGTTTTCCTGATGA CATCTCAATTTTTCCTATCCGGTTATTTTTTGACATCCTTAGACGCCCCT TTGTATGTTGAAGCAGGGCGTGTCTTTTCTGCTTTTGCAACACATGAAAT ATGTTGATCACGAGAATAACATTTGATAGTGATTAAAAACCTCAAACTTC CTTTTGTCTCTCTTTTCATTCTTTTGTTATAAGAACAAATTCTGTCTCTG TTTTCTTTCTCTTTTTTGTAAGAACCATTCTGCTTTGTGTCTTTGTNAGA ACAAATTCTGTCTCTGTTTTCTTTCTCTTTTTTGTAAGAACCATTCTGCT TTGTGTCTTTGTGAATGTTTCCGAGCTCTGTCTCTGCGGTTTACAAACAA TTTCATTTCCGTATCAAAATTTACTAGCCGGAACAATGTCTTATTTGAAT 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00012123TCONS_00012123Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00012122TCONS_00012122Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00012122-proteinTCONS_00012122-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000137supercontigsc0000137:372716..384975 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
PSMA5proteasome subunit alpha type-5 isoform 1 Homo Sapiens
Expression

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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
250.16 259.28 194.21 183.61 126.09 97.14 163.23 175.37 197.91 184.12 169.62 174 128.13 129.91 189.49 200.51 246.63 242.28 70.47 85.92 147.34 152.88 156.86 146.03 177.54 170.44 156.23 113.65 117.15 96.66