XLOC_007592 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_007592
Unique NameXLOC_007592
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000170:49107..61033-

Legend: gene
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>XLOC_007592 ID=XLOC_007592|Name=XLOC_007592|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11927bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000170:49107..61033- (Clytia hemisphaerica)
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TTTTGGGGGTAGGTACATTATGCACTAAGTGGAGATTTAAGTTGTAAATT TATTAAGGTATGGATGGATTTTTCAGGGAAACCCAACTACGCACAAAGGG GAGTGTTTCTACGGAAACTGTAATTTTTCAACAGAATGCTATGATAGAAA AGAAATTCATGATATGCACCATTGCAATGTCTTCCATTCCACCCAATAGC TGATTGGTTGTAAGTGACGTATTGACTGATTTTACGTCACTTACAACCAA TCAGCTGTTGGGTCCGTGATGTAATGTCAGAAGACATTGCAGTGGTGCAT ATCATGAATACCCCATTTCATTCACAGTCGAAATGAATCATGGGTAATCA GGACCACCACGCTCCGATAAGGACTTTCAATTGGTCTAAATTTTAGGATG TTTTTGTGTCTAGCCAACGAAAAGCTGTTATGGAGGCGCAATCATTCCTG ATTACCCATGATTCATTTAGACTGTAAAATGGCTTAGAGAGGCCTTTAAT ATATCCTTTTCTAACTTTTAAACATAACTTTTTTATTCTTTACTTTACCT CACAGGAGAAGTTAGCAAAACAACCGAAGGAAGAAGGCGTTAAAGAAACT GAAGAAGAAGAAATTGTTCACGAAGATAATGAATGGGGTATGTAAAGTCT ACTTCACTAGCAGGGAACAATAGCAAAGACTGTAATACTTTCGTTATAGT TTGTATTTGAATAACATTCTTCTGATCGTTGAAAATATTTTTGTAAGACC TTTGAAGTAAACCATTTTTCCTATGTCTGTAAATATTAATCTGTGAGTTC CCACGCGGTTTATTTTAAACATGGCAAACTGCTTCTTTGTCTGTACACCC AGTATCTACAGCTAATTCCAAAATTCATTGCCGTAGGGGATAAACGTACT CCGTACTACGAAGCGATAAACGTGAGATACACTCTGGTACATAGTAACTG 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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NAACTTTTTTATTCTTTACTTTACCTCACAGGAGAAGTTAGCAACACAAC CGAAGGAAGAAGGCGTTAAAGAAACTGAAGAAGAAGAAATTGTTCACGAA GATAATGAATGGGGTATGTAAAGTCTACTTCACTAGCAGGGAACAATAGC AAAGACTGTAATACTTTCGTTATAGTTTGTATTTGAATAACATTCTTCTG ATCGTTGAAAATATTTTTGTAAGACCTTTGAAGTAAACCATTTTTCCTAT GTCTGTAAATATTAATCTGTGAGTTCCCACGCGGTTTATTTTAAACATGG CAAACTGCTTCTTTGTCTGTACACCCAGTATCTACAGCTAATTCCAAAAT TCATTGCCGTAGGGGATAAACGTACTCCGTACTACGAAGCGATAAACGTG AGATACACTCTGGTACATAGTAACTGCTTCTATGCTTGGTGTTTAATAGG ATTTTTAATGGTATTAAAAATCTTTCCGAAGATAGTTAAAGAAGACTCTT TCTCCCTGGATTGCTCTACCTACCCTTAATCATTCTCTTAGTTGCTAAGC ATCAAGCAGAGAGGCGTCAAAGTACCATTTTGGGAATCTTTGGTATGATC CGGCTGGGGGTCGAACCCACAACCTTGCGCACCGTAGCCGGGTGCTCTAC CACTGCACTACGGTCTGAATAAACTGAAACATATTTAATGTACCTTTTAC TTGCACTTTTTAATCACCATAGGTATTTCATTGGTCGACGAGTCATCCGA TTTACGGGAGGACACACAACTACAAGAATTGACTACTGGACTTTCGTACG CATATACTAAACCTGCAGTGAGTCCTTTCTATGTATTAATGCTGACAAGC 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AAGTTTTTCTGGGTAGTGAGAAAGTTGAGTAGCATTACAGTACCTTTTAT ATAAGTTCTATAAGTTCTTTCTTTATCCCATAGGAAACAACAGAAGAACA GACTGAACCAGCCTCTACGACTTCAACGACCGAAGAAGGTGGCGAACAAA GTCTAGAGGATTTAATGAGACAAATGAAACAAATTTAGTTCTTTTTTAGA TTTAATTTACGAAAAAATCTTCTTTTTTAATTTTTTTAAGGGGGTTGGGT CTCTTCTTTATTTTTTTTTGCAAAAATCAACAGAAGCGAGGCGTGATCTT CTAGCTTTGAACAATTCATACCTTTTTCGCCCGGGCTTTTTCGTCAAAAA GTCTTTGAAATCCGACGTCGGAAAGTAGAAAACATTTATCTTTCGCTAGC TTTAATAATTATTGAATTTGAATTTTTGAACCAAATTTTTAAATTTCTTT TTATTTTTTATGTACTTAAGTGGTATAAATTTTATTTATTATACAATACT GAACAATGAAATTAAAACAGAAAATCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00013604TCONS_00013604Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00013601TCONS_00013601Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013600TCONS_00013600Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013599TCONS_00013599Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00013595TCONS_00013595Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00013593TCONS_00013593Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00013591TCONS_00013591Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013590TCONS_00013590Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013589TCONS_00013589Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013588TCONS_00013588Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013590-proteinTCONS_00013590-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000170supercontigsc0000170:49107..61033 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
UBA5ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5 isoform 1 Homo Sapiens
Expression

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Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
36.58 36.18 9.52 6.91 76.15 59.4 117.22 124.02 72.43 92.31 46.16 39.1 26.77 24.56 51.97 56.44 56.47 49.09 18.58 24.82 29.81 30.87 51.37 48.12 20.96 22.57 46.08 33.45 58.75 54.56