XLOC_008234 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_008234
Unique NameXLOC_008234
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000197:65892..95575-

Legend: gene
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>XLOC_008234 ID=XLOC_008234|Name=XLOC_008234|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=29684bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000197:65892..95575- (Clytia hemisphaerica)
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GAAAATTTAACTTCCTATGTATTCAAAGCATTCCGTCTTAACGTGGGAAG GGTTTTATGTGATTGCGTGATTAAAACTTACCCTATCTTAAAAATACCGA TCCCCTATAATTACTTCGTTACATGTTTTTTTATAAGAAGAAACTATATA AGAGCATTATTAGGGTTAAAAAGTTTGAAACATCCGAAGGCTTCCAATAT TTTGGACGCTCTTATAAAAAAACGTGTAGCTTACAAAGCAAATCGAAAGA ACCTTTTCAACTGGCCAATGATATCTCTTTCTGTATGCATTAAATCATTT TCCTTGCTCCGTATTATTTACTTTTCGCATACAACGGACCGCTATCAAAG CCAGCATATGTTTCGAGTCAACACCCACTGAATTTTTTCCTTGTTTCGAA GCTATCATTAAAATCAAAGAAAACTGAAACACGGAATCATTTTTTCACTT TTGTTTTTGGTTTACGAAATCTTCTTTTGCCAGGTTTTTTACATGTCTTC CAATCTTCAGACTTGTAACATTTAAAACTCAATTTTGTTGTTAAATCTCT TGGGCCTTTTCCGGCGTGAAATTCGGCACAAATTCACTAAAATTGCAATG TCTTTACTTTTTTGACCATAATTTTGTTGATTTTCTAGCGGAACATGGTT CTCCGGACCCATGGGGCCATCACATGACTAGTTCCAGACCACCTCCAACG ATATCGGCTGTATACTCTTCATTACCGCCTGAAATTGTGAGTATATTTTT CATAAATTTATAGACCTATTCTTATCCTAGGCCTAGACTTTAGCGGCTTA TAAGTTTAGGTTGATTCTCGGATTAAACTTGATGCAAACTCAAACTATCT CATTTTTAGAACTATAGAAACATTTAGCCTTTAATGCGACCGAGGATAAG TTCAAATTAAGGAAGAAAGCCAGGTGTATCTGACTTCAAGTTTCCTTTTT TTCTTTAGCCCGGATCAGCGACCTCTCAATCAACTGCACAATTCATGCAA GCGTCACCCACCATACAAACTGGTATGTACATGATTTTTTCACTGAAATT TCTCGCGTTTTTTTAATGATTTCAATATAGAGAAATGTAACTTTTAATCG GATGACTAGATATCCATCGAAGAGAAACTGAAGAAAGAAAACCGTTTCTT CAAAAAAAAAAAACACGTTTTTTCAGATGTTCTCTAGACTTTTGTGTTGT GTTTTTATAGTTTTATATTTTTCAATTTACTGACTCGTTTAGGACTTCAC AGTCACTCAGTTTTATTGAAAAAGGTATTTTCGGCAAACACTAAATTTTC ATAATAAGCTCTATCAAAACTGAATCAGTCAAGACCTTAGATATGTCCTA AATTCTAAAAGTCGAGGGCGTTTCGAACTTAATAAAGTATATCAGTTAGA TTTTTACGTTGTTTTATTGATAAACTTAACATAAATGTGCTTGTCGATGT AAAAGAATGCGGCTATTATATTTTGATTTTAATTAACACAAATATGTAAC GACCTAATTACCCTGAGGTATTTTGAACTTGCAAAACAGCTGATAATGAA GAAAAAGCAAATTGCTTTTATCGAAATTTGAGATGGGGTAACCATGTCAG GGCATCAATCTCAAATGTGAGCTTTATTTGTGTCTCTCCGGGTATAGGTT TATTAGGTTGTCCATTCGAGAACTCGCGAAAGCAATATCATATTGAAAGC GATCGTCATGACGCTGTTAAAACTTAATCTTCTCTTATCTTATCAACGTG CGAAATCTATGTATCATTTAATTACGAGTAATACTCATTTGTTTACCTTT TAGCTCCGCCCCGCGTCACAGATTCTTCTGTCCAACCTCCGCCTGCGAAT GGCGGTAGCACGCAGACAGCCGACGCCCTCGGAAAAGCACTTGCATCCGT AAGTTTTTTCAAATTCATGAATGTTTATAAAAAAACTGATGCCCTATTCT AATACAATGCTANGTAGATTTCATTTAAAATAAAATTTTAAGCATGCAAA ACGAGGCGTGTTCTCATCGATCTCAAAAAGAATGCATTATTTTAATTTCT CAACAAAATGTCAAAATATGTACAAATAAATCTAACCGCAATATCTTTGC TTCAAACTTCAGGTTCTGAGAAAAAATCAAAAGTCAAAGTAGAAGGGAAA GGCAAGAAACGTTCAAAAGATTCTATTGATGACGATCTCAATGACGAGCC CGGAAACGAAGAAACTGGGGGCACAAAAGTCGTCCGCGAGTCCGAACGAC GACACGCGAACAACGCCCGTGAAAGGATACGAGTGCGAGATATCAACGAA GCTTTCAAAGAACTCGGGCGAATGTGTTCGTTACACCTCAAAAACGAAAG TCCACAAACGAAGGTATTTGAAAATTTGTTTTCTGAATTTTAACTGAATT TTAAAAATTTGCTTATATGTTTGTTCCCGTTAAGTTCCCAGACTTAATTT ATGAATTCTTTTTTTTTTCAGTTGACGATTTTACATCAAGCAGTCACAAT TATTACTAGTCTCGAATCACAAGTTAGAGGTATTGCCAAGTTCGATTATT TTTTAATTTTTACCATATGGCATATCTTTGCATTTGCTAGCTTTGNCAAA CATCTGGAAACCCTTCTCCTCCCTTCGACAGCATGCAGCAACTAGTGAGT ATTTTTTTAATACAATAATTTTATTTTGCATTTTTCATAATTTTGACTTA ATATGTATGCTATATTTACCACCTTTGAAATCTACTATTCTAGTTTTCAA AACGGATTTTCTAAACAGAGCTGAACTATATTACCAGGAACACTTAACAA ATGACCATCACATTTATTACAATTTGTTTTAAATATTTTTTGTTCTTTCG TTTTATAGAATCGAATGCAAGAAAGTTTAGACGACGCCATCTGGGTATTG AAAAGTCACGCAGAAAGCACTTCACAACGCAATCAAAACATGCCACCCAA CGCCCAATACCCGTCCACCCCACAATTTCCACCCGGTTTAACAGATCAGT TACAAAACTTACAAAACTCTGTCCTGGATACACCAGGAGGTTTGGAAGCT TCCACGGCTGCTCTCTTAAACTCAATGAATACAATTCGAGAAGGCGGTAT GCTAGGTAGGCTTTCTCACCATACTCTATTCATATTAATGGTCACATGAC CATCCATTGTGAGCCTTTGTTTGACGAACAGGAAGTCCAGAATGTTCGAA CTACAGAGAGATTCGAATCATAGAGACAAGTAGCTCGAATTAACGAGAGT CCACCGTAACTGCCTTTTTGAACAATGCCTTTCTATAAATTTAATGTTAA ATAGTAGTTTTAAGCATGCAAAACGAGGCGTGTTCTCATCGATCTCAAAA AGAATGCATTATTTTAATTTCTCAACAAAATGTCAAAATATGTACAAATA AATCTAACCGCAATATCTTTGCTTCAAACTTCAGGTTCCGAGAAAAAATC AAAAGTCAAAGTAGAAGGGAAAGGCAAGAAACGTTCAAAAGATTCTATTG ATGACGATCTCAATGACGAGCCTGGAAACGAAGAAACTGGGGGCACAAAA GTCGTCCGCGAGTCCGAACGACGACACGCGAACAACGCTCGTGAAAGGAT ACGAGTGCGAGATATCAACGAAGCTTTCAAAGAACTCGGGCGAATGTGTT CGTTACACCTCAAAAACGAAAGTCCACAAACGAAGGTATTTGAAAATTTG TTTTCTGAATTTTAACTGAATTTTAAAAATTAGCTTATATGTTTGTTCCC GTTAAGTTCCCAGACTTAATTTATGAATTCTTTTTTTTTTTTCAGTTGAC GATTTTACATCAAGCAGTCACAATTATCACTAGTCTCGAATCACAAGTTC GAGGTATGGCCAAGTTCGATTATTTTTTAATTTTTACGATATGGCATATC TTTGCATTTGCTAGCTTTAGTTTAGGTGTCATTGTCATTTGGAAAGTCTT GTTAATCGTGGAAGCTCTTATGAGATTTATGAGAATCATTTTATCAATTG AACTTGTTCAATAACAATGTTTGGACATAGTGATTTAAATTGACAGAACT TTGGAACAATACAAAACATTATGTGCCAACACGTATGTATGTGCGCATGA GCTGTTGCACTAGTAATGCGAAAGTCGTGAGTTCGAATCTCACTTCAGTC CTCAGTTTAGTAGTTCTCTATCAAACTGAGTTCAATGTGCACATACATAC GTGTTGGCACTTAATGGTAAGTCGTTGATAATGATATCGTTGAATAACAA AATGTTATGATTCATTCTTCATTTCTATATTTTACAGAACGAAATTTGAA TCCTAAAGCAGCGTGTTTGAAGCGGCGTGGAGATGAGGAGAAGATGAATG ATGACGTGTCAGAAAAAAGGATGAACATGAATGGCTCTTTTGATGGCTCA AAGAGACCTGGAAACAAGAAACCTCAACAAGTTCGAAGGACGGGTACGTT TAAGTGTTGTGTTCTTGGCTAGCTACATTTGAGATTGGAAGGTTTTCACA GAGTTTTTCTTCTCTCTTTGCTTATATGTTGTTCAATGAAGGAGCGAAGC CTCATTTTTTAAGGATTGATCAAGAAGATCATTATAAATTTTCTACCACT ACTTGATAATCTTAGCCAAATTTTCTACAATAGCGCTCCAGCCTCGCACC AGTTTTAAACGCTGAATTTTGCTGGTTCTCAAGGACTGTTAGTTTAGCGA ATAACAATCCAAGACTGATCATATTTTTGCATTTTTAGGTTTTCCAACCG ATCAACTAGACGGCTCAGTTCAACCCATGGTACCGGATGCCGGCATTTTC TCTCATTAGCTTCTACACTTTCCGAATAGGCTGTGACAAATGACTAGAAG ATGTAGATCACTAGATCCAGTCTCCTCCCGAGTCTTATGCAGCTCTTTGA GCCATTGGAGTTGACAGACCTTTTTTTGAAAAAAAGACATTCATAAAAAA CCACCCATTCATTTTTCTATCCGGCTGTGCTTTTGTATCCGAGCTTCTGT TATTATGGAGAGATTGTTTTTTGTATATATGTCCCCCTGATCCAGTATAT GTGCCGCCGTCAAAAGTTCATTGGTTAGAGATATCTGGTTGAAACATTCA AATCAATGACAATGAAAAACATTTAAAAGGAACTTTCTTTTATTCCAAAG CGGCAAAACTGTAATCAAAGATACACCTAATTATTATTATTGTACAAAGT AGAATATTTGACCCAAGTTTTTTGAGAGAGATTTTTTTATTCGTATTGCG GACGATGTATGACGGAAAGTTTATTTTTTTCGGACAACATTTGGTTTTGA TGTAGATTTTGACGATTTCGCAAAATTTCTTGATTTCATAATATTGAGGA TTTTTGCAGTAAAAACAAAACAACCCTTAGAAATATTTATTATTATCTTG ATTAGAAGCAAAGTTATTGTTTTATTTTTAGACTGATTATTTTGGTTGTA TATGTTTTTTAAGGCAAATTTTATTTTGCTTTTTATGTTTCCATGAGCGC TCAAGTAACCTTATTTTGGTTTAGCAGATCTTCTGAAATTTATTTTCAAT TTCAAAGTTTCAAACTCATTACAGACCACCATTAGCCTCTGGTACAGTGT CTCTTGTGTGTATTGTTTAGGCTTTAGTTTTAATTATTGTATATTATGAC CCTATTATGGTTGTTATTTTAGCGAAGTAGTACAGTGTTTATTTTTGAAC 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014720TCONS_00014720Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00014719TCONS_00014719Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00014718TCONS_00014718Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00014717TCONS_00014717Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00014716TCONS_00014716Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00014715TCONS_00014715Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00014714TCONS_00014714Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014720-proteinTCONS_00014720-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000197supercontigsc0000197:65892..95575 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
29.04 25.99 91.69 109.73 123.87 100.78 94.48 100.71 39.86 55.58 42.69 35.51 49.71 60.31 31.11 35.99 84.67 88.43 61.76 58.93 81.54 88.5 61.92 63.16 70.74 77.6 308.85 246.25 39.19 42.52