XLOC_008852 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_008852
Unique NameXLOC_008852
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000217:97476..125791-

Legend: gene
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>XLOC_008852 ID=XLOC_008852|Name=XLOC_008852|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=28316bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000217:97476..125791- (Clytia hemisphaerica)
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TATGCTAATAATGCCATCATGGGGTATGGCAACTGAACCTAAGAATGCCA TTTTTAGAGTATTTTACCTGTAAATTACCAATTATTCCCCATCAACGCTA AAAAGTTTCACAAACTGAATTCCAAGTCTTTGCTTGAGCTATGCATTGCA TGTTAAATTCAGGCTGGGTTTGGATCCTAACGTAAGAATACTGTAAGAAT ATTTCAGGATAATTTTCCCAAAAAGCTAAAAATATTCACGATGAATTGAA AAACACCATTCTTATAAAATAAGTGTATGTATCCGAAGCCCATCCGAAGC TGTGAAAAATTATTGTTAATTTTTCGCCTTCACAAATGTTCTGGAGATGT CCATTCCAGTCTTAATTTTAGAGTTCAGTGATTGAAATCTTCTGTGTGTG TTTTAATGTCTGGTTCTGGTTGGTTAGTTTTAGTTTCGATTTCACGGTTG AGTAGTTTAAAGTTTAACAAATGTTTATAATTTCATTTTATTTCTTTGTT TATGTGATTTCTAATTTCTAAAAATTTGATTATGTTATTAAATATTTTGA ATAAACTTTTAGAAAGTTTGAAAATTCAATTTTTTTTGGTATTTGAATTT TCTGAAAAATTTCGAAAAAATTGTTGAAATATTATGGAAATGTTCTTGAG ATTAGCTTGATATTCTGTACGTATTTCTCGGATTTTAATACAAATTTTAT CATTATAAAATTATTATATTCGTAATATATGACAAACAATGTCACATATA AGTTTTTACACAATGGTTGTGAGAAATTAAATATTGATCAAAAAATTATT TTCATCATAAAAAAGGATATTTATTTATATACAAAATGTCAATAAAGTTA TGTTGAAGTGTCAAAGAGCTTTAATAAAAACACTTAACTTCTAAAAAGGA AAAGACGTAAATCGAAAAAAAAAGTCATAAAAAATTTTATGTGTATGTTG 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AACAATTTTGTGCATAATGAATATGGATACTCTTAGGTGCCAAATAAACG CCCCCCCTGCTTGTTAATTTTTCGAAAGTTTTTCAACCCCCCGGACCTTA TTAGGACCACCCCCTCTTTATTAATTATTACAAGAATATTTTCAGTTGGC AAAAAGAAGTCCCTTATTTTGCTTTTACTTATGTACCATTTAAAGTGCTT TCGCGGTCGTATTGGGTCTAATCATCAGCAAGATATCTGTTAACAACGTC ATCTAATTCAAAATCAACCTTGTGTAATCGAACAGGCTACATCGGTTATT TCAAAAAATTTTACTTTATTTTTTTAGTTGGAGATGCAACTTATGAAAGT TTGGTCCGAGAAAACTCACGCAAAGAAGATGAACTCAGAATTTTGCATGG TATGTGATCTTGTCATTGATTTTATTCGACAATGATATTGTCCGTAAAGA TCAGTTAATATTCATGATATACACCCTCCCACTGGCCTATATTGACACCT TTTTAACTTTTAGCCGCTATCTCTGATCGGAGTTTCTACAAATTGGCCCT TTCATGGTCGGNAATGTCACGTAATCTTAGGCCAACTTACTTATGTACCA TTTAAAGTGCTTTCGCCGTCGTATTGGGTCTAATCATCAGCAAGATATCT GTTAACAACATTGTCTAATCGGTTATTTTAGAAAATTTTACTTCATTTTT TTAGTTGGAGATGCAACTTATGAAAGTTTGGTCCGAGACAACTCGCGCAA AGAAGATGAACTCAGAATTTTGCATGGTATGTTTGCTGTGATCTTGTCAT TGATTTTATTCGACAATGATATTGTCCGTAAAGATCAGTTAATATTCATA ATTTACACCCTCCCGCTAACCTATATTGACTCCTTTTTAACCTTTTTAAC CGCTATCTCTGATCGGAGTTTCTACAAATAGGCCCTTTCATGGTCGGAAG GAATCATAGGTAGTCAATACCACCGTGCTCTAATAACGACTTTCTATTGG GCCAAAATTGCCGTTTTGGGAGTGCAGTTAGTCCTTATTACCCATGATTC ATTTAAACCGTGAAATGGTCTGGTGTTGCATTTGGTGGGTGTAGGTACAT TTTCCCATCACATTTAGGCAGCACTAACATTGAGAAGTGTCTTTTTCAAA GAATTCCTGTCAAAGATTTTATTTTGGTTGGCTGGGATTTAGATAAATCT TAGTGTATTTACTACTAGAGGGTACAACTCATTTTTTTTTCTGTTGTAGA CGGTTATCAACGTGAAATCAAGGATGAACGAAGTAAACGACAAACGGCCG AGCGAGTTTTAAACGAGTTGAAAGGTAAGAATGACGTAATCTTTCGGAAA CACCAAAAGCACCGCTATAAGGTAGTCCGAAAATCTATTTAAAATCCGGA GGCTGACTTTTCGAAAATGACGTCCTCAACAGGATGGAGCCGGATAAAGA GTTTCCTTTTTTTATTAATTCTATATAATTGTGGTCTTCTATTCATGATA TTCATGACGTAATGTTTTTTACGGAAATACCCCGATTTTAGCCAGTTGTG GTAAATTTAAACTAGACAAAAGTTGTATAGAATTTTCCACAACTGGCAAA AACCGGAGTCTTTCTGTAGAAAACATTACGTCATGAATATCATGAATTGA TAAGCTTGTACCAAGACAGCTGTTCTCAAAGCTGTTCTGATGCTCATTTT TTTCGACGTACAATATGCATAACCATTATAAAAACAGGAAACGATAATGG GGGCTATTAATATTAACTAAATGGGTTGTCAAATTTGTATTTGTTTGTCT CTGACGCGAAGAAAATTTCTGGGTCACGAATTAGACACTTTCTCGCCGAC GATGATAATATTTTAGCTATTTCGGACATAAAATGAAATAAGAGTTCTTA 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CTACAGTATGTCCAATTGATTTACAATCATTGATAATGAAGGTACTGGCA GCACTATCGTTCATTACAATGGATTACATAGTCAATAAAAACATTGAAAT ATGAGCGATGGGACATTTGTATCCTCGACAATGCCAAGGTAATCGATGGG GATTGTTTTGACAGAATTCAACTACATGCACAACAGTAGCGTGGTGGATC GACCAAAATTCGGGCAAACTGGGGAGGCAATTTCAGAAAATTTTGATTTT GGCGCTCTCTATCAAATGAAAATTATTATCTTTTTGATCGAAAACTGCCA GGTGTAAAGGTGTTTAAAAGCAAAGGGGCGCCGAAATTAGTAATAAGAGG CGTCGCCCTGCCCCCCCCCCCATGCCACCACGCTACTGACACAATATTTT TACCCATAAAAACGAAAACGTGGATTTTCTTTGAAGATTACGAAGAAAAC CCAATTTCCAGGTCACCACTAGAATTAACTGCAATGTTAGAACTTTCACA TACCCATATATTTCTATAGTTTATAATATCGTAGTTAAAGTAATGAAAAT TATTTTTTCAATACTGGCAGTTTCATGTTTTTACAAACAATCCTCAGTTG AAAATAATTTTTTTCAAAAAATTATTTTCAACTGAGGATTGTTTGTAAAA ACATGAAACTGCCAGTATTGAAAAAATAATTTTCATTACTTTAACTACGA TATAACGCTTCTAACTTCGGTTGGTTAAGCACTCTTTTGATGGATGAAAG CATTGCTTCAACAAAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00015839TCONS_00015839Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015838TCONS_00015838Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00015836TCONS_00015836Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015835TCONS_00015835Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015834TCONS_00015834Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015833TCONS_00015833Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015840-proteinTCONS_00015840-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000217supercontigsc0000217:97476..125791 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.02 2.44 0.9 0.75 3.59 2.83 9.73 10.55 3.59 3.48 3.27 2.39 11.89 13.44 11.46 19.37 4.35 3.86 1.59 2.5 1.48 1.41 3.06 3.36 1.74 3 0.24 0.43 1.51 1.79