XLOC_011345 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_011345
Unique NameXLOC_011345
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000350:29785..49429-

Legend: gene
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>XLOC_011345 ID=XLOC_011345|Name=XLOC_011345|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=19645bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000350:29785..49429- (Clytia hemisphaerica)
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GCTCTGTCTTGAAAAGTAAGTAACCTTCTTATACACAGAGGAATGCTAAG ACTTTTACCCAATGAGTTATTAAAAAATGCTATAAAAGTCATTATCTACA AAACAGTATAAAGGTGTTATAAGGAACACGAATCTTTAGTGGATGCCAGC TGCCTATAAAGTCCTTTAAATTGATCAAGGTTACCTTTTGGCTCATATCC TCTGTGTTTTGATTGTTGTTCTTCTTCGCCTTTGATTGATAAAACAGTCA ATTGAAACCTAATGGTTTTCAAACACAAATTTTGATTGAAGTGGATTAGA ATTAATTACCAATCAGTTAGATCTTCTTAATTGTTTCGCTTCGTTTTCTG ATTAATTCATTTAATTATCGCCATCCACTTTCTTTTCATTGTTCAGGGAC AGCAACGTTCGCCCATCTGCTCTTGAGCTATTACGTCATCAGTTCTTAGT AGACCGATAGCCTTGGTATGAAGCGTGTAGCCTGACTTGAATGTGCGAGT TGTGGATTGGATATAGTGTCCTCAAAACAAGGAGGAGAGAAGAGGATGTC ACGTGACTCTCTCGTAATTCCAAAAAGATTCTTTCAAGGAGATACGGAAA TGAATATCGTGAAAGTTAAACCTTTTCAAATTAAAATCGAATGGAAATTC TCATTGAGTCTCCGAGTGTTATCAAACACCAAGAGATATGGTTTTTCACC GAGAACGCGATCCTCCAGGGATTTTGGCTTCCAATCTCTCCTGTTGCCAA TGGTCAAATTAAACATTGAGAAAACACGAATAAAGTCGATCGATTCAGAG AAAAGCTCCTTTTGAGGGGCAGTTTTAGATTCACCATTGGATGACGCTCG ATAGTTCTAAAAAGCGACAGACCTATGCAAAAATTGCGTTCGGACTTTTT GACGAAGCATTGTGAACGTATTTAAGGAAACAGTTTTTCAAAACGAAAAT TCCATCCGTTACCCGAACGAACGAACTTAAAGAGTATAATAAACGAAAAA TACATTAAATGATTTGGACTGAATGAAAAGATTTGATAAACAGACAGAAG AAGAAGGAACTTTAAGACTTGAGTTTTTATATTCCCGATGAGATAATTAT TAGACGATTTTTATGTGCATCGATAAACTACCGTTTGCACCGATCTGAAC TTTTGGTGGCAGAAAAATTATTTCATATAGTATATGACTTGTTTTGATTT TATCTGCATATAAACAAATATATTGTTAGAAAGCTTTTCTCGATAGATTA AAAAGTTATGGTCAAAAAGTGTCTTTACCACAACCCTACATATAGATTTG AGTACTATTTTTGCCAGAACTTTTTGGATACTTAGGTTTCACTCACAGGG AACGCTATCATACAGATGCAGGTCCGCAAATTCTTATCTGGTGCTTTCGG TAGTCCGCATTTTATGTCAACATTTTTATGTAAATAGCCAATCCCATGTG ATATATTTTTTCAATTTTCCTTTAGTTTTTTAAAGATTTGTTGTTTTTTT GTCTGTTTTCTTTACCGTCAATATGACATGATTAGTAAGAAATTTGATGA CTAGATAAATATATGCTCAGAATGAGCGCTAATTCGAATTAAATT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00020209TCONS_00020209Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020208TCONS_00020208Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020207TCONS_00020207Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020206TCONS_00020206Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020205TCONS_00020205Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020204TCONS_00020204Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020203TCONS_00020203Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020202TCONS_00020202Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020201TCONS_00020201Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00020207-proteinTCONS_00020207-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000350supercontigsc0000350:29785..49429 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
MAP3K2mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
28.65 25.42 15.28 10.67 41.88 30.99 46.73 49.23 32.31 35.19 32.59 25.26 44.54 43.51 29.71 43.33 40.84 51.09 54.94 55.19 42.28 44.75 41.47 48.78 56.25 53.12 40.62 31.88 45.7 42.06