XLOC_015857 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_015857
Unique NameXLOC_015857
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000661:24458..28625-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_015857 ID=XLOC_015857|Name=XLOC_015857|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=4168bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000661:24458..28625- (Clytia hemisphaerica)
AGTTGTCTTCGTTACGGATGGCTTTGCAGCTGGAGAGGTTTTTGTTTCGG TTGGTTTCGCTGTTAGAGTTGCCTTCGTTACGGATGGTTTTGCAGCTGGG GTTGCCTTCATTTCGGTTGTTTTTGCAGCTGGAGTGGCCTTCGTTACGGA TGGCTTTGCAGCTGGAGTTGCCTTCGTTACGGTTGTTATTGCAGCTGGAG TTGCCTTCGTTACGGATGGTTTTGCAGGTGGAGTTGCCTTCGTTTCGGTT GTTTTTGCAGCTGGAGTGGCCTTCGTTACGGATGGTTTTGCAGGTGGAGT TGCCTTCGTTTCGGTTGTTTTTGCAGCTGGAGTGGCCTTCGTTACGGATG GCTTTGCAGCTGGAGTTGCCTTCGTTACGGATGTTTTTGCAGCTAGAGTT GCCTTCGTTACGGATAGTTTTGCAGGTGGAGTTGCCTTCGTTACGGATAG TTTTGCAGGTGGAGTTGCCTTCGTTACGGTTGTTTTTGCAGCTAGAGTTG CCTTCGTTACGGATAGTTTTGCAGGTGGAGTTGCCTTCGTTACGGATGGC TTTGCAGCTGGAGTTGCCTTCGTTACGGATAGTTTTGCAGCTTGAGCAGT CTTCGTTACGGATAGTTTTGCAGGTGGAGTTGCCTTCGTTACGGATAGTT TTGCAGGTGGAGTTGCCTTCGTTTCGGTTGTTTTTGCAGCTGGAGTGGTC TTCGTTACGGATGGCTTTGCAGCTGGAGTTGCCTTCGTTACGGATGTTTT TACAGCTAAAGATGCCTTCGTTCCGGGTGGTTTTACAGCTGGAGAGGTTT TCGTCTCGGTTGATTTCGCTGTTGGAGTTGCCTTCGTTACGGATGGTTTC GCAGCTGGAGTTGCCTTCGTTACGGATGGTTTTAAATCTGGAGAGCTTTT CGTCTCGGCTGTTTTCGCAGCTGGAGTGGCCTTCGTTACGGATGGCTTTG CAGCTGGAGTTGCCTTCGTTACGGATGTTTTTACAGCTAAAGTTGCCTTC GTTACGGATGGTTTTACAGCTGGAGCGGTTTTCGTCTCGGTTGATTTCGC TGTTGGAGTTGCCTTCGTTACGGATGGTTTCGCAGCTGGAGTTGCCTTCG TTACGGATGGTTTTAAAGCTGGAGAGCTTTTCGTCTCGGTTGTTTTCGCA GCTGGAGTGGCCTTCGTTACGGATGGCTTTGCAGCTGGAGTTGCCTTCGT TACGGATGGTTTTACAGCTGGAGAGATTTTCGTCTCGGTTGGCTTAGCAG TTGGTGTTGCCTTCGTTACGGATGGTTTTACAGCTGGAGAGGTTTTCGTC TCGGTTGTTTCAGCAGTTGGAGTTGCCTTCGTTATGGATGGTTTTTCTGG TGGAGTAGCTTTCGTCTTGGTTGGTTTTGTTATTAGAGTATCTTTTATCT GGACTGGTTTTGCAGATGGAATAGTTTTGGTCTGGCTTGCTTTTGTTTGG TTTGGTTTAGTAGTTGAAGTGTTCTGCGTTGGCTTTTTAGCTTGAGTTGC CTTGGGCTGAGATGGCTTTGTAGCCGAAGCTGCTTTCGTCTTTGTTGGTT TTCCTTCTGGAGTTGCATTAGCTATGGTTGGTTTTGCAGATGTAGTTGCA TTGGTTTTGGTTGGTTTTGCAGATGGAGTTGCATTGGTTTTAGTTGGTTT TGCAGCTGGAGTTGTCTTGGTCTGGAATGATTTCGTAACTGGAGCTACTT TCGTCTGTGGTGGTACTGCATTAAGAGTAGTTTTCATCTGCGGTGGTATT GTACTTGCAGTTAGAATAGCTTTCGTGTGGATTGGTTTTGGTGATGCGTC TATTGCTTTGGATGGAGGTTCTTCAATTTGGGACGGCTGCGTGGTTTTAA CCAGTTTGGTATCAACTGGATTTGGCGTAGACGACTCCGTATATTTATTT GGTAGTGTGATTTTCTCTTGGACGGGTTGGTGAGGATCCATGGCTTTTGG TTCGCTTGCAGGCTGGAAAGATTTCTCTTTTGAAAGTTCTAAAGCTACTG AATCTGGATTCTCCACAAAGTGTTTACATTTGCTCTGAGTAGGTGAATAT TGTGGATTTTTTTCTGATGAATTAGGGGATTGGAAAATATCAACGTTACA TTGTGATGGCTTGACGGTCTTTGCCTCGATTTGATTGGGGGTCTTCTGTT GAACGTTTATCTGAGATATTTCCGAGATTTCACATGGAGTGGATATTTTC TGATTCAGAGGTTCAGACTTTTTTGCTTCTTCAGTTATTAGAGAGTCGGT ATCTAACGGTTCTGGTGAATCTGGAGTTTGTAATCTCTCATCAATAGCTG CATAATCAATCTTATTCCATTGTATATCTTTCACCTCTTTCGAACCGAAC TTAATTTCTTTAGCAACAACAGCAATACCATCCCAATAATACTCTAAATA TTCATTCATCAAAGCATATATCTGACAATATTTCATTTTATGTTCATTTA AATAATGATTAACAAATCGAACATTACAAAACCAAACATTGCAAATCTCA CATGGCAAAGGTGTGTGTATCCCACCATGGTTTACATTACAACGATAAAC TTGTTGCTGTTTGAGTGTTTCAAATGTCGCTATCTTAGTATCGTAATAGT GATAAAATGCTAAATGGTGTATCAAATAAGTCGCTAATGAGAAATATTGA CCTTCGCAATGAGGACATTGATAGAGAAATTTTGCTCCAGTCGTTCTTTG GATTGTCCTATGTTCAGTTGGAATGGAATCGAGTGAACAAAGCCCTGTTA GTGTGTGTGAATCATTCGACTTCAATTCTAATGTAGATAGTTTAACTCTT GCATTAGGTGGATTTGGAGGTTTCTTGTCTTTGGTAGCTAGTGGTTTGGT AGGATGTGAATCTTTGTTCGTTGGTTGTTCTAGAGGTTTTTTCAATACCG TTCCAGTTCGTTTTGCAAGCTGTACGACTTTGCCTGATGTTAGTTTTATA GTTGTTAAGTTTTTGACATTTGATGCTTGTGAAGGCTGTACGGGTATTTT TGTAGAGGTAGTGGAAGCATTTATAGATTGTTCGTCAGCTGATTTTGAAA CGTCCTTTAAAGGTTCGGTAACTTTTATCTGGTTCGATTTCGTAGGCTCA TGGTTAATTTGTTTTACATCTTGCTCATTAGATGCAGACTTTTGTAAATC AGTAAAACGTTTAGAACTTTCGGATGAATTTGTCACATTTACGGAATCGA TTACTTTTTCAGTTTTTGATTTCTTTGTTTGAATTTCTTCATCTTGAGGA AGAGAATCGATATCTAAATTTGCTCGTTTGCGAGTATTGATAGTTTCCTT ATCCTCCTTCTCACCATCCTCATCGCTACTCATAATCTCAATAACTTCAA TTTTAACAGTTGCAGGTTTTAAACGATTCTTGCTAATAATGTCAATATCA ACTGCTGAATCACTCGTTTCCCTGCTTTCGTTTATAGAGTCAGTCTTCTG ACCGATGTTCAACAGTGTTTTATTGATATTTGACATATCCTCAATCTCCT TTGCCATTTTTGCAATCTCTTCTGGCGATTTTTCTGGTGATACAGCTAGA GTTTCAGTTGCAGTTTTCTGTGCTTTCTCAGATGTCTTTCTAACCTCGTT TGACTGTTTCCCACGTGTAGCAACACCAGATTTAGTTTGCTCTTTTGTTT TTGTTGTCGTTGTCGTAGTTTTATGTTTCAATTTCGATTGGTTTAGCAGA TCCGTAGCTTTTCTTTTTAACTTCGATGGTCTAACCACAACATTTCCATA CTGGTCAAGTTTTTTGGCTGTGATTCTGTGACCTGCCCAATATTTCTGTA TCAAGTCTTTAATATCAGCTCCTATCATCGTCATACGATGTGATTTCTTG ATATGTTGAATAAGGGTAGGTTCACAAAGCCATATCTCGCAACGATCACA CGGTAGTATAACATGTTGCCCATGATGCTTAGCTTGACAGTGTTGTATAC ATTCCTGTTGCTTTTGTTCAAATCTAGCATTATGACGTAAATAATCATGC TCCAATTGTAAATGTCCCGTTAAGTCTGACTGCTTCTCCTGGCAGATATG GCACTGGAAAATCGCATCTTTCTTTACTTCGTTTTTGGTTTTCTTACGTT CATACTGATGCACCTTTTTCAAATGGTTTCGTAAGTCTGTTAGTTTCTTA TCACAAAAAGGGCATTTA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00028025TCONS_00028025Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00028024TCONS_00028024Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00028023TCONS_00028023Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00028022TCONS_00028022Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00028021TCONS_00028021Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00028020TCONS_00028020Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00028019TCONS_00028019Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000661supercontigsc0000661:24458..28625 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.74 1.19 0.54 0.4 0.55 0.58 1.48 2.02 1.1 2.02 1.85 1.71 1.03 0.71 0.72 1.55 0.79 1.07 0.18 0.23 0.4 0.45 0.76 1.05 1.28 1.76 0.09 0.13 0.67 0.98