XLOC_009323 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_009323
Unique NameXLOC_009323
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000246:109861..130933-

Legend: gene
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AGGTACATTAATTCCATTAAGAGCCATTTTTTAAAATAGTCTTCAGGGTG TGATACCTCACCTTTTGGATTTTGCTGGAATTTGGGCCAAATGATCTATC ACACAAGAAAATAAGACCCTGAAAATTTCACCTTGATATCTCAAGTAGTT TTGCAGATATAGTGTCTCAAAGATAGGCTACTAAGCGAAAATTGACCCCT GAAAATCATGAACTCTTGTGGGGAGCAGATTTTGAAAGCCAATGAATTTT TATTCAAGTACATTAGAAAGCTGTTATTACTTTGTGTAATCTGGGTTTGG AAGCACTTTTAGCTGGCTGCTGATGGTCCTTGGGACTTTTTTGAAGCAAA CTTTTGACCTGGAGTGGTTTACTGGTGGGTTTTGGCCACAAAAATAATAT TTTCAGGTTTTCCATCTTTGCGTAACCGTCAAAAATGGCCGAAAAAATTG CTACTTTGGTAGATCTGGAGCAAAACTCAAGATGGCGTATTTTTTTGCGG CAACAAATTTTTTTTTGAAAATTTCAGCAAGGCTTCCTTAGTAGGTCTAG TTGATAGCCTCAAAAAATCTCAGTGGGTTTTGAAGTCTCTTAAAGATAAG ATCGATCGATCAAAAATTTGCTTAACTTTGTTGTTTTTCCCCTCTTAAAA TGCTAAATCAGGCCCACTTAAGAGCTCTAAAGATTAATTTTTGTCAAGAT ATTGGTTGATCTTCTCTAGCCAACTAATCATTGGCATTAAGGGAACATGA ACTTCTAACGAATTTAGACTCATTCAGAAATTCTACTTTGACATTAATTT GCGCTTTACCGCAAAATTTCTAAGTCCAAGTGTCGTGATTAACTTTTAGA CTGTCCAATATCTCTGTAAGCAACATTACTAGAGTGATATTTTATGAGAT ACTGCAAACAATGCTGTTTAAATCTTCTGGACAAGAAATATTGGACAGTC TAAAGCTAATCACGACACTTGGACTTAGAAATTTTGCGGTAAAGCAAATT TGGTCCAAATTTCATCAAAATCTAAGAAGGTGAGGTATCACACTTTCTTT ATTCTGAAGATTAAAAAAAATGGCTCTTAACCCATTAAGTGCCACTTCCA TGATATGAGATCGCTCCATTTCTTTGTTCCTATACCAGTAGGTCTGAATC TAATAGCGCTGCGACATGTCGCGCTGTTTGTTTACCTTGCCCGAACAAAA AAAACGACATTAGCATTGTTACCTAGTTTGAGGACGCATTGGAAATCAAA AAAATATTGCATTAATTGCATAAGATTTCTCTTAATAATGCCAAGTCGAT GTTAGAAAAACAATGACGTCATTCAAACAATAGCCGCTCCCTTTTGTCCA ACCCCTACCCTCCCCGTTTACTGTGTACGTATTATATGGATGGCCCCAAA GGGCACTGGATCTTTTTCTGAAACAATCCTAAAAATCAATTTTAATGATC CATTTAACAGGTTTTGTAATGACATTGAGTACATGACGAACAAACGACCG AACAAAATTTGGGTGATATGTTGGAAAATTATTTCACCAGCCCTCATTGT TTTTGTGCTCATCTTCAGCATAAAAGACCTCTGCACCAAATCACCTACCT ATCAAGTGTGGGTAGCACATATGGTAAGTTAGACTGTGATCTGCTCTGCT TTACACGTTTTTTTTCCCTGATCACGTCATCATAAATTGGCCCAAAATTG CGTAAAAAGGGCAAATTTGAGTGGGCCCCAGGCTAAAATCGTTTAGTAAG GTCTAAACTCGGTCCGTGCAAAAATTTCATGCTTTTAGCCAAATTCCATC AAAATTATGCACCAATTTTGCCGTTTCGTATGTATTTTTTGTTTGTTTTC TGCAATGTATAGCCACTATTTGAATGCCCAATACTCGCTCAGCTCAATAT CTATACACCAAACAAGTGCTTAGTATTAGCGGGAATAAAATTATGTTAAT CGTTCGTCCTTTCTTTCTTTATACAGGCAGAAGGGAAATACGTTGAGCTT CCACCCTGGGCAATCGTTTTTGCTGTTCTTCTCATGTTTTCTTCGCTCAT CATGATCCCTGTAGTCGCTCTTTTGAAATATTTCAAAATCATCAAGAAGG GAAGCAGCCCTGGGAGACTGGGACTTAGTTTAAGTAAAAAGACACGTGGT AGGAAACAGAGGAATGGTAACGATATAGCTTCTGTTCATCGGCCCCTTCA AGCCATGGAAAGTAATACGTTTTCAATGGCCACTGAGTTCTCTGACAACA TGTTCAAGTTGTGAGACCGCGATGCAATGAATGATGGGTAATATGGTAAC CTGTTGGTTGTTGGTGGTGCATGCTGGGAAATGATGTTCTCTCTGTTCAC GGCAAAATGAACTGATACAGTAGTCAGCGAGAATCTATGGCTGATGAAAA AAAAAATTCAATGTTGTGACACGTTTAAAAAGGGAATGTAACTAATGACG ATTTCATGAATGACGATTGATCACGTGGTCTGAGATGTTTTGCCTTCAGA AGCCCTGGTTATCTTCAGCAAAACCTGTAAATCTTTTTGCTTACCTATTA TCCAAAGTTAAGATATGGAAATCTCTGCAATGGGTTCTTCTACGGTTTTT ACAAGCTTTAATATCTCGACTTTTTGGAAAATAGTTAGTCGAAAAATTTT GGAGGTTTACTTATGGCAACGAAGGAATATACAGGCCAAAATATTCTCAA CCACCTGCGTAACCAAGTAAGATGACCCAACTCCCAGAAGGATTTATCGA CGCAATTAATATTGATAGATGATCACAAAAGAACTTTAATATCGATTTGG TGTTATTTTACAATGGAACTGAACCTTGAAAGCATTGCTGCATTTGGAAA TATTTCCATCTATCCACGGAAAGCTTTTTAAAACTTACGAATATACTCAG TAGTTTGTATTCCGTTGTTACAATCGTAAACTTCTTATGCGCATTGTCAA AGAAATTTGTCACCCAATATTTAATTTTTTTTGCTAATTATGTTGCCAAA ATGTCAGTTATGCTACTCTATTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016684TCONS_00016684Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016683TCONS_00016683Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016684-proteinTCONS_00016684-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000246supercontigsc0000246:109861..130933 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.47 0.58 0.31 0.17 1.82 1.11 10.73 12.23 10.26 10.03 7.33 7.16 4.98 4.82 2.5 2.38 2.52 3.84 9.82 12.15 4.93 5.69 1.79 2.79 3.39 4.85 2.45 2.23 0.59 0.5